Google Scholar : un moteur de recherche pour l'information scientifiqueJulien Sicot
Comment retrouver de la littérature académique, universitaire et scientifique sur le Web avec Google Scholar ?
- Présentation de l’outil
- Couverture et fonctionnalités du moteur de recherche
- Démonstration et évaluation de la recherche par Google Scholar
- Conseils d’utilisation
- Outils annexes à Google Scholar (Harzing Publish or Perish, Scholar Index)
Voir également le guide d'utilisation de Google scholar : http://bibli.ec-lyon.fr/documents/Google%20Scholar_support.pdf
Du bon usage de Google : la recherche d’informations sur le webJulien Sicot
- Présentation des différents types d’outils de recherche du Web (annuaires et répertoires thématiques, moteurs, métamoteurs, web 2.0 et outils sociaux)
- Couverture des sources explorées
- Notions sur l’indexation humaine et/ou automatisée
- Notion sur les opérateurs de recherche (opérateurs booléens, règles d’interrogation)
- Principes de la recherche avancée
- Les particularités du web (statique, dynamique, sémantique, invisible ou profond)
Google Scholar : un moteur de recherche pour l'information scientifiqueJulien Sicot
Comment retrouver de la littérature académique, universitaire et scientifique sur le Web avec Google Scholar ?
- Présentation de l’outil
- Couverture et fonctionnalités du moteur de recherche
- Démonstration et évaluation de la recherche par Google Scholar
- Conseils d’utilisation
- Outils annexes à Google Scholar (Harzing Publish or Perish, Scholar Index)
Voir également le guide d'utilisation de Google scholar : http://bibli.ec-lyon.fr/documents/Google%20Scholar_support.pdf
Du bon usage de Google : la recherche d’informations sur le webJulien Sicot
- Présentation des différents types d’outils de recherche du Web (annuaires et répertoires thématiques, moteurs, métamoteurs, web 2.0 et outils sociaux)
- Couverture des sources explorées
- Notions sur l’indexation humaine et/ou automatisée
- Notion sur les opérateurs de recherche (opérateurs booléens, règles d’interrogation)
- Principes de la recherche avancée
- Les particularités du web (statique, dynamique, sémantique, invisible ou profond)
Cours ressources électroniques sur l'Amérique du Nord et l'Amérique latine et...Françoise Gouzi
Cours méthodologique mutualisé aux trois écoles doctorales (ALLPH@, CLESCO, TESC) - Université Toulouse - Jean Jaurès. Formation dispensée aux doctorants (toutes années et toutes disciplines).
Ressources électroniques disponibles pour les doctorants en sciences et initation à la veille sur son sujet de thèse. Formation du 18 janvier 2016 à la BU Saint-Charles.
Support de formation : comment trouver des documents imprimés et électroniques, chercher dans les catalogues, interroger les bases de données, faire une demande de prêt entre bibliothèques (PEB) et demander de l'aide.
L’interface EM-Premium permet d’accéder aux traités de l’encyclopédie médico-chirurgicale (EMC), aux revues et livres numériques publiés par l’éditeur Elsevier-Masson.
Point fort : Référence française en matière de recherche d’informations dans le domaine médical
Recherche et veille bibliographique dans PubMed.
Une approche originale et iconoclaste s'appuyant plus sur les fondamentaux de la recherche que sur la navigation dans l'interface.
Cours ressources électroniques sur l'Amérique du Nord et l'Amérique latine et...Françoise Gouzi
Cours méthodologique mutualisé aux trois écoles doctorales (ALLPH@, CLESCO, TESC) - Université Toulouse - Jean Jaurès. Formation dispensée aux doctorants (toutes années et toutes disciplines).
Ressources électroniques disponibles pour les doctorants en sciences et initation à la veille sur son sujet de thèse. Formation du 18 janvier 2016 à la BU Saint-Charles.
Support de formation : comment trouver des documents imprimés et électroniques, chercher dans les catalogues, interroger les bases de données, faire une demande de prêt entre bibliothèques (PEB) et demander de l'aide.
L’interface EM-Premium permet d’accéder aux traités de l’encyclopédie médico-chirurgicale (EMC), aux revues et livres numériques publiés par l’éditeur Elsevier-Masson.
Point fort : Référence française en matière de recherche d’informations dans le domaine médical
Recherche et veille bibliographique dans PubMed.
Une approche originale et iconoclaste s'appuyant plus sur les fondamentaux de la recherche que sur la navigation dans l'interface.
Formations SCD - Bases de données en Histoire : American history and life et ...SCD Paris-Sorbonne
Présentation réalisée par Hélène Broms, responsable de la bibliothèque Serpente, sur deux bases bibliographiques d’histoire, l'une couvrant l'histoire des États-Unis et du Canada toutes périodes confondues et l'autre l’histoire mondiale de 1450 à nos jours.
il s'agit d'une présentation faisant partie d'une journée de formation a l'intention des étudiants en pharmacie sur le logiciel de gestion bibliographique Endnote. dans cette présentation des notions élémentaires sur le logiciel sont présentés, de sorte a permettre a l'étudiant et au future scientifique de prendre son envol en matière de rédaction
Support de cours sur le logiciel de gestion et de mise en forme de références bibliographiques et de documents EndNote, et de son outil en ligne de partage, EndNote Online.
Formation à la recherche d'information et aux outils documentaires.
Licence professionnelle Biologie analytique et expérimentale des micro organismes du végétal et de l'animal (BAEMOVA), Université d'Angers. 2014-2015
Guide d'utilisation de PsycARTICLES, base de données en psychologie, éditée par l’American Psychological Association (APA), sa maison d’édition Educational Publishing Foundation (EPF) et des organismes partenaires, la Canadian Psychological Association et le Hogrefe Publishing Group.
1. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis -
Décembre 2009
Interroger Pubmed
différemment :
GoPubmed
www.gopubmed.com
2. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
GoPubmed
Introduction - 1
GoPubMed est un outil qui, en plus de
retourner exactement les mêmes résultats
que PubMed lors d’une recherche, exploite
différents systèmes de classification
sémantique (thésaurus MESH; Gene
Ontology …) pour développer des analyses
statistiques des résultats, accessibles de
façon très conviviale à l’utilisateur.
3. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
GoPubmed
Introduction - 2
Les résultats de recherche sont :
triés selon un vocabulaire contrôlé issu du GO (Gene Ontology)
du MeSH (Medical Subject Headings) et Universal Protein
Resource ( UniProt).
analysés et clustérisés via un système de recherche
complémentaire aux mots clés selon 4 filtres prédéfinis :
What est un regroupement thématique,
When un filtre sur la date,
Who et Where permettent en quelques clics de cerner un auteur.
Le système est potentiellement capable de distinguer les
homonymes et de retracer plusieurs affiliations successives par
analyse sémantique. Cet aspect « Social Network »
potentiellement très intéressant permet de visualiser sous forme
de carte, les réseaux de collaborations d’auteurs.
4. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
En bref …
un "top 20" des auteurs ayant le plus publié sur le
sujet,
un "top 20" des publications classées par pays,
un "top 20" des journaux dans lesquels on trouve le
plus de publications en rapport avec le sujet,
une courbe temporelle vous permettant de visualiser
la progression (ou le recul) du nombre de
publications par an sur ce sujet,
une visualisation sous forme de graphe des réseaux
de collaboration entre auteurs (répondant à la
question "qui publie avec qui ?")".
5. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Les ontologies ?…
L’objectif premier d’une ontologie est de modéliser un ensemble de connaissances
dans un domaine donné (Définition Wikipédia)
C’est un réseau sémantique qui regroupe un ensemble de concepts liés les uns aux
autres par des relations taxonomiques (hiérarchisation des concepts) d'une part, et
sémantiques d’autre part.
Extrait de «Les ontologies en biologie … la fin de Babel ?»
Carl Herrmann – 2009
6. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
GO, MeSH …
Gene Ontology vise à construire une ontologie générique
pour décrire le rôle d’un gène / protéine («gene product»)
Fonction biologique (kinase, protéase, liaison à l’ADN …)
Processus biologique (signalisation, métabolisme)
Localisation cellulaire (noyau, cytoplasme, membrane …)
C’est l’ontologie la plus développée et la plus utilisée (depuis 2000)
MeSH (Medical Subject Headings) est le thesaurus de
Medline : un vocabulaire contrôlé et hiérarchisé qui
permet de décrire précisément le contenu d’un article
L’arborescence hiérarchique conduit de concepts très larges à des notions
très spécifiques. Les descripteurs MeSH sont choisis parmi un ensemble de
synonymes pour décrire un concept de façon univoque.
7. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
La requête de recherche (1)
1ère voie : Recherche directement issue de
Pubmed
(("Allergy and Immunology"[Mesh] OR
"Hypersensitivity"[Mesh] OR "Peanut
Hypersensitivity"[Mesh] OR "Food
Hypersensitivity"[Mesh])) AND ("Arachis
hypogaea"[Mesh] OR "arachis oil
"[Substance Name])
487 réponses dans Pubmed (le 20/11/09)
8. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
(("Allergy and Immunology"[Mesh] OR
"Hypersensitivity"[Mesh] OR "Peanut
Hypersensitivity"[Mesh] OR "Food
Hypersensitivity"[Mesh])) AND ("Arachis
hypogaea"[Mesh] OR "arachis oil "[Substance
Name])
Copier – Coller de la
requête Pubmed dans la
fenêtre de recherche
GoPubmed
9. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
2ème voie : Recherche par saisie directe
Par sujet, auteur, journal … : elle est exécutée (et
peut être saisie) selon la syntaxe de Pubmed
Par exemple :
Si l’on ne précise pas de champ de recherche, le terme saisi
est recherché dans l’ensemble des champs.
Pour rechercher un concept dans les champs Title et/ou
Abstract, utiliser [TIAB],
Pour rechercher un nom d’auteur, utiliser [AU]
Pour rechercher une affiliation (University, Institute, Company,
etc), utiliser [AD].
Pour rechercher un mot-clé, utiliser [MeSH]
La requête de recherche (2)
10. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Résultats
Clusters
selon 4
axes
Résultats : 2887 références
analysées de façon sémantique
Accès direct :
statistiques
générales
11. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Statistiques générales
Top author
Affichage de l’auteur
le plus représenté
dans le lot des 2887
références
Top Author
12. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Focalisation
possible :
Tous les éléments
sont cliquables
Statistiques générales
Statistics (1)
13. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Nombre de publications /
année
Localisation / monde
Statistiques générales
Statistics (2)
14. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Statistics (3) Cartographie : réseaux de
collaboration / auteurs
15. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Affichage des 2887
références résultats
Possibilité
d’affinage
selon 4
axes
différents
Statistiques générales
Documents
16. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
what ?
GoPubMed sélectionne les références
pertinentes pour la requête en cours
Il analyse les résumés des documents
sélectionnés et identifie les concepts
relevant de termes présents dans :
le Gene Ontology
les Medical Subject Headings (MeSH)
le Universal Protein Resource
Ces termes sont ensuite classés et
affichés dans le cluster what.
L’exploration du corpus de résultat est
ainsi facilitée : l’utilisateur peut
focaliser sur un concept en cliquant
sur un terme spécifique, il peut aussi
réduire ou étendre sa recherche
initiale en sélectionnant
/désélectionnant des termes (Top
Terms) ou des catégories
sémantiques (Knowledge Database).
17. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
who ?
Accès à différentes informations (3
onglets) sur chaque auteur identifié :
- en cliquant dans la liste
ou
- en faisant une recherche spécifique
sur un nom.
Le système exécute un algorithme
pour lever les ambiguités
d’homonymie.
19. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
when ?
Filtre sur les dates de
publications
20. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Affichage - Liste des résultats
Affichage plus détaillé (résumé)
Accès au menu export
Accès aux statistiques
(idem lien « statistics »
21. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Affichage - Référence
format réduit / format avec résumé
transfert dans un clipboard
passage en mode « curator »
accès au menu export
22. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
Quelle utilisation ?
Exploration d’un résultat de recherche issu de
Pubmed.
Quel est le bon mot ? : l’exploration facilite
l’identification de termes intéressants
Analyse rapide et conviviale d’un lot de références
Analyse statistique et mise en forme
Recherche de partenaires, de collaborations
Qui publie sur tel concept ?
Quels sont les thèmes de prédilection d’un
laboratoire ? et ses principaux partenaires …
23. INRA form@doc 2009 - D. L'Hostis - Décembre 2009
En savoir plus …
Doms, A.; Schroeder, M., 2005. GoPubMed:
exploring PubMed with the Gene Ontology.
Nucleic Acids Res, 33.