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Bases de données thématiques en médecine
Stage « Recherche documentaire en médecine : outils et ressources »
Mars 2017
Catherine Tellaa (catherine.tellaa@biusante.parisdescartes.fr)
 EM-Premium
* Présentation
* La recherche avancée
* L’affichage des résultats
* Présentation d’un document en texte intégral
 La Banque de Données en Santé Publique (BDSP)
* Présentation
* Accès à la base documentaire
* La recherche simple
* La recherche avancée
* L’affichage et l’exploitation des résultats
* Choix des préférences d’affichage
 Delfodoc
* Présentation
* La recherche simple
* La recherche avancée
 CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux
Francophones
* Présentation
* La recherche en langage libre
* L’affichage et l’exploitation des résultats
* La recherche en MeSH
* La recherche experte
 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
* Présentation
* La recherche en langage libre
* La recherche avancée
* L’affichage des résultats
* La recherche experte
* La recherche par mots-clés MeSH
* L’exploitation des résultats
 Kinédoc
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 2
ET / AND = Intersection
OU / OR = Somme
SAUF / NOT = Exclusion
Le document contient les 2 notions à la fois
Ex. : cancer du poumon ET tabagisme
Le document exclut la seconde notion
Ex. : addiction SAUF alcoolisme
En préalable...
Les opérateurs booléens
Le document contient au moins une des deux no-
tions
Ex. : anorexie OU boulimie
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 3
La troncature (*) permet de rechercher à partir de la racine des mots.
Ex. : therap* recherche thérapie(s), therapy(ies), therapeutic(s), therapeutical, thérapeute(s),
thérapeutiques(s)...
Les guillemets ("...") permettent de figer une expression ou un groupe de mots.
Ex. : "menace d’accouchement prématuré"
La casse : la plupart des bases sont insensibles à la casse (minuscules/MAJUSCULES). D’une manière
générale, il est préférable de saisir les termes de recherche en minuscules.
Les accents (à, é, è, ê…) et les signes diacritiques (ç…) sont à éviter de préférence
lors de l’interrogation.
Les mots vides (le, la, les, l’, un, une, de, des, the, a, à…) sont des mots ignorés lors
de l’interrogation. Dans certaines bases, il est possible de forcer leur interrogation à l’aide du signe "+".
Ex. : grippe +a
La ponctuation : les parenthèses servent généralement à combiner plusieurs opérateurs booléens.
Langue d’interrogation : anglais ou français selon le producteur de la base.
Langage contrôlé / langage naturel : certaines bases s’appuient sur un langage contrôlé ou
thesaurus. Dans le cas d’une base indexée à l’aide d’un thesaurus, une recherche complémentaire en
langage naturel peut s’avérer utile, voire indispensable, pour rechercher une notion récente, mal indexée
ou compenser une indexation insuffisante des documents recensés.
En préalable...
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 4
EM-Premium
Présentation
Producteur : Elsevier-Masson
Type de données : portail spécialisé dans le domaine médical et paramédical
 Contient l'Encyclopédie médico-chirurgicale (EMC), divisée en 45 traités thématiques
 Permet la consultation en ligne de 130 revues médicales françaises et 80 revues médicales anglaises
 Contient aussi des livres électroniques en français et en anglais
Le formulaire de recherche permet d'interroger simultanément les traités EMC, les revues et les livres.
Langues : anglais et français
Langue d’interrogation : français
Couverture chronologique :
 depuis 1970 (traités)
 variable (revues)
Couverture géographique : France
Interrogation : langage naturel
Consultation : sur abonnement, plusieurs formules possibles :
 Avec ou sans le traité de "Biologie médicale"
 Avec ou sans le pack "Univers infirmier"
 Sélection de revues
Avantages :
 Français
 Traités thématiques permettant d’obtenir une synthèse sur un sujet (utile pour débuter une recherche)
Pour savoir à quoi vous êtes abon-
nés, cliquer sur :
« Accéder à tous vos produits »
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 5
EM-Premium
La recherche avancée
Préférer la recherche avancée à la recherche simple.
Saisir les mots-clés dans la barre de recherche.
Le filtre "Titre, mots clés, résumé" permet de mieux
cibler la recherche.
Par défaut, l'opérateur booléen sous-entendu est OU.
Pour associer plusieurs mots-clés avec l'opérateur ET,
il est nécessaire de faire précéder chaque terme du
signe "+".
Limiter éventuellement les résultats à une
période chronologique précise.
« Dans un produit » : lance la recherche dans
l’intégralité de la plateforme.
« Dans mes abonnements » : limite les résul-
tats aux ressources auxquelles la bibliothèque est
abonnée.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 6
EM-Premium
La recherche avancée
Cliquer sur "Plus d’options" pour afficher
les différentes possibilités de recherche.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 7
EM-Premium
Rappel de la stratégie de recherche
Par défaut, les résultats sont classés par ordre de pertinence.
Un tri chronologique est également possible.
L’affichage des résultats
Tri des résultats par langue (français / anglais)
Possibilité de rechercher dans la
liste de résultats.
Résultats de la recherche
En passant la souris sur le titre de la
revue, le nombre de résultats dans
cette revue, apparait.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 8
EM-Premium
L’affichage des résultats
Titre du traité ou de la
revue
Cliquer sur le titre pour
limiter la recherche à cette
ressource
Indication du type
de document :
Indication du degré de pertinence
Traité
Revue
Livre
électronique
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 9
EM-Premium
Titre du traité ou référence de l’article
dans la base (voir aussi en bas de page).
Accès au document au
format PDF.
Accès direct à l’iconogra-
phies et aux documents
d’accompagnement
(autoévaluation, arbre
décisionnel, fiche
d’information patient…).
Résumé
Mots-clés
Plan cliquable
Bibliographie en fin
de document
Présentation d’un document en texte intégral
Il est possible de récupérer cette
référence dans Zotero mais la ré-
cupération du texte intégral peut
ne pas se faire de façon automa-
tique.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 10
Exercice : interroger la base EM-Premium
Dans EM-Premium, rechercher des documents sur la Borréliose de Lyme chez l’enfant.
Obtenez-vous des traités dans vos réponses ?
EM-Premium
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 11
Domaine : santé publique
Producteur : École des hautes études en santé publique (EHESP), avec l'appui du réseau BDSP qui est un
groupement de 40 centres de documentation et d'organismes spécialisés.
Type de données : environ 500 000 références d’articles de revues fondamentales, d’ouvrages, de thèses, mémoires et autres
travaux académiques, de rapports, d’actes de congrès, de retours d’expériences, à destination des professionnels de santé et des
patients. Un certain nombre de documents sont accessibles en ligne.
Le site propose également des bibliographies élaborées par des professionnels de l'information, un annuaire critique de sites, une
base de colloques, un glossaire multilingue et des offres d'emploi.
Langues : français et anglais
Langue d’interrogation : français
Couverture chronologique : depuis la fin des années 1970
Couverture géographique : internationale
Mise à jour : mensuelle
Interrogation :
 Langage naturel
 Thesaurus de la BDSP
Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.bdsp.ehesp.fr/base/
Avantages :
 Français
 Gratuit
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Présentation
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 12
Accès à la base documentaire
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 13
La recherche simple
La Banque de données en santé publique (BDSP)
La base s’ouvre par défaut sur l’interface de recherche
simple :
1. Saisir les termes de recherche
2. Valider par "Rechercher"
L’opérateur par défaut est ET
Penser à utiliser la troncature (*)
Affichage des résultats par ordre
de pertinence
Document disponible en texte intégral
Nombre de références trouvées
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 14
La recherche simple
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Il est possible de relancer la recherche à partir du nuage de
mots-clés, issus du thesaurus de la BDSP, qui s’affiche à
droite de la page de résultats.
Cliquer sur le mot-clé sélectionné pour :
«Lancer une nouvelle recherche sur le mot-clé choi-
si »
«Restreindre les réponses à ce mot-clé » : conserve la
requête en cours et y associe le mot-clé à l’aide de l’opéra-
teur ET
«Exclure le mot-clé de la recherche » : relance la
recherche et y associe le mot-clé à l’aide de l’opérateur
Cette opération permet de limiter le nombre de réponses de
façon rapide.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 15
La recherche avancée
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Elle permet :
- d’interroger la base via le thesaurus de la
BDSP
- de limiter la recherche à un type de
documents (articles, thèses/mémoires…) et aux
documents disponibles en texte intégral
- de limiter la recherche à une revue ou à un
auteur (consultation des index) :
Accès au thesaurus
(ouverture dans un
nouvel onglet)
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 16
La recherche avancée
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Le thesaurus n’est disponible qu’en consultation (pas de possibilité de construire une équation de recherche comme dans le
MeSH Database de PubMed).
Il est accessible dès la page d’accueil, à partir du formulaire de recherche avancée ou directement à l’adresse
http://asp.bdsp.ehesp.fr/Thesaurus/.
Il faut dans un premier temps rechercher ses mots-clés, puis dans un deuxième temps construire l’équation à l’aide du formulaire
de recherche avancée.
Accès via
l’arborescence
Accès à la fiche du descripteur :
- terme retenu
- termes rejetés
- termes génériques
- termes spécifiques
- termes associés
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 17
La recherche avancée
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Pour lancer une recherche à l’aide du
thesaurus, utiliser le formulaire de
recherche avancée.
Saisir le premier terme recherché dans le
champ «Mots-clés». Le système fait
des propositions au fur et à mesure de la
saisie et affiche en face de chaque mot-
clé proposé le nombre de documents
indexés avec celui-ci.
Sélectionner le mot-clé à l’aide de la
souris et valider à l’aide d’un clic gauche
ou si vous souhaitez sélectionner la pre-
mière proposition, utiliser la touche En-
trée directement.
Pour associer un deuxième mot-clé,
saisir un séparateur : , ; / ou un
opérateur booléen : ET, OU, SAUF.
Sélectionner le deuxième mot-clé et
lancer la recherche.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 18
La Banque de données en santé publique (BDSP)
L’affichage et l’exploitation des résultats
A l’aide du menu déroulant,
possibilité de modifier
l’affichage des résultats (auteur,
date de publication, revue…)
Afficher les filtres
Les filtres permettent de limiter la
recherche à une tranche
chronologique (utile pour isoler les
documents récents) et à une langue
(anglais/français)
Lien pour exporter la référence dans un logiciel de
gestion de références bibliographiques, ici Zotero
a été paramétré (voir page 21)
Les autres options d’export s’affichent
dans la colonne de droite.
Il est possible de se créer un compte
(gratuit) pour constituer un panier et
sauvegarder les résultats.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 19
La Banque de données en santé publique (BDSP)
L’affichage et l’exploitation des résultats
Détails d’une notice :
Résumé
Liens permettant de relancer la
recherche
Descripteurs :
mots-clés du
thesaurus de la
BDSP et de la base
Pascal
Centre documentaire
producteur de la
notice
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 20
La Banque de données en santé publique (BDSP)
L’affichage et l’exploitation des résultats
Le service de la BDSP ne détient aucun document.
Pour accéder au texte intégral de la référence trouvée, plusieurs possibilités :
-Accéder au texte intégral lorsque ce-
lui-ci est disponible en ligne.
- Identifier et solliciter le centre
documentaire qui a produit la
notice : accès via le lien, à ses coor-
données et aux conditions d’accès
aux documents.
- Localiser le document dans une bi-
bliothèque (SUDOC)
- Commander une copie auprès d’un
service de fourniture de
documents comme celui de la BIU
Santé ou le portail Refdoc (INIST-
CNRS).
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 21
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Choix des préférences d’affichage
La page de gestion de préférences est accessible en haut à droite de l’interface.
Cette page permet notamment de :
Définir un filtre par défaut
Définir un logiciel de gestion de références
bibliographiques par défaut
Modifier les paramètres d’affichage
Cocher la case "Utiliser ces options
lors de mes prochaines visites" et
valider par "Enregistrer mes
préférences".
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 22
Exercice : interroger la BDSP
Dans la BDSP, en utilisant le formulaire de recherche avancée et en vous servant du thesaurus de la BDSP, faites une recherche
sur la prise en charge de la maladie d’Alzheimer par les médecins généralistes. Limitez la recherche aux articles et aux
thèses/mémoires disponibles en texte intégral, parus depuis 2010.
Quel est le producteur de la notice de la première référence trouvée ?
La Banque de données en santé publique (BDSP)
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 23
Domaines : hôpital, soins, santé publique, sciences humaines et sociales, management hospitalier, formation continue….
Producteurs : association de 4 centres de documentation (par ailleurs membres du réseau BDSP) :
 Centre de documentation de l’AP-HP
 Centre de documentation de l’IFSI Pitié Salpêtrière
 Centre de documentation de l’IFSI Bichat
 Centre de documentation de l’IFSI Henri Mondor
Type de données : près de 100 000 références d’articles, ouvrages, rapports, mémoires, films… Un certain nombre de docu-
ments sont accessibles en ligne.
Langue : français
Langue d’interrogation : français
Couverture chronologique : depuis la fin des années 1970
Couverture géographique : France
Mise à jour : quotidienne
Interrogation :
 Langage naturel
 Thesaurus de la BDSP
Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.aphp.fr/ressourcesdocumentaires/base-documentaire-delfodoc/
Avantages :
 Gratuit
 Complémentaire de la BDSP (comprend des revues non dépouillées dans la BDSP)
Delfodoc
Présentation
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 24
La base s’ouvre par défaut sur l’interface de
recherche simple.
L’opérateur ET est par défaut.
La recherche simple
Delfodoc
Il est possible de limiter la recherche à une tranche chronologique pour isoler les documents récents.
Cliquer sur pour lancer la recherche.
La recherche avancée
Limitation aux documents disponibles
en ligne
La recherche avancée permet notamment d’inter-
roger la base à l’aide du thesaurus de la BDSP.
L’icône permet de consulter le thesaurus :
celui-ci s’affiche alors dans la colonne de droite.
Il est cependant préférable de connaître au
préalable ses mots-clés ou de consulter le
thesaurus à partir du site de la BDSP :
http://asp.bdsp.ehesp.fr/Thesaurus/
Limitation par type de documents
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 25
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
Présentation
Domaines : médecine et santé
Producteur : CHU de Rouen
Type de données : annuaire de sites Web et de documents en ligne, validés selon des critères de qualité, principalement
destinés aux professionnels de santé et indexés en MeSH
Langue : français
Couverture chronologique : à partir de 1990
Couverture géographique : aire francophone : France (70% des ressources), Canada (Québec), Suisse, Belgique, Afrique...
Mise à jour : hebdomadaire
Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.chu-rouen.fr/cismef ou http://www.cismef.org.
Interrogation :
 Langage naturel
 MeSH français via HeTOP (Portail Terminologique de Santé)
Avantages :
 Français
 Qualité et validité de l’information
 Point unique pour trouver des documents produits par différentes institutions (Ministère de la santé, HAS…). Le CISMEF
est notamment un outil adéquat pour trouver des recommandations de bonne pratique, des conférences de consensus,
des rapports, du matériel d’enseignement…
 Ressource utile pour trouver des informations à destination des patients
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 26
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
La recherche en langage libre
L’outil Doc’CISMEF est un moteur de recherche qui permet d’interroger l’ensemble des ressources du portail.
Le système accepte les opérateurs booléens (ET implicite), la troncature (*) et les guillemets.
Possibilité de limiter par type
de document
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 27
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
L’affichage des résultats
Historique de recherche (au cours
d’une session)
Relancer la recherche dans d’autres
moteurs et bases de données :
PubMed, Google...
Filtres permettant d’affiner la
recherche :
- par source : OMS, HAS, Ministère de la
Santé…
- par type de document : recommanda-
tion de santé publique, article de revue,
rapport, thèse ou mémoire, document
produit par une association profession-
nelle de santé…
- par mots-clés ayant servi à décrire les
ressources
- par niveau d’études (PACES, 1er
cycle…)
- par pays : France, Canada, etc.
- par année de publication.
Les résultats sont affichés par
ordre antéchronologique
Suggestion de descripteurs MeSH
pour relancer la recherche
Descripteurs MeSH en rapport avec
la recherche saisie en langage libre
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 28
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
L’affichage des résultats
Lien cliquable vers le document
Afficher la
notice complète
Attention, le CISMEF n’est pas compatible avec Zotero.
Afficher les mots-clés MeSH ayant servi
à l’indexation de la ressource
Type de
document
Afficher l’URL
de la ressource
Date de la ressource
Détails d’une référence :
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 29
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
La recherche en MeSH à l’aide du Portail Terminologique de Santé (HeTOP)
L’ensemble des ressources du CISMeF sont indexées en MeSH français. Il est possible d’interroger la base à l’aide du MeSH en
passant par le Portail Terminologique de Santé.
2. Cliquer sur l’onglet
"PubMed / Doc’CISMeF"
4. La recherche a bien porté sur les ressources indexées avec le mot-clé MeSH
"vaccins antigrippaux/administration et posologie"
3. Cocher éventuellement un qualificatif et lancer la recherche en cliquant
sur "Doc’CISMeF" en bas de la page
1. Lancer la recherche dans le Portail Terminologique de Santé et afficher la notice du mot-clé MeSH correspondant :
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 30
Dans le CISMeF, rechercher en langage libre des documents sur la prévention de la bronchopneumopathie chronique
obstructive. A l’aide des filtres, isoler les ressources produites par le Centre Cochrane français. Combien de résultats trouvez-
vous ?
Effectuer ensuite une recherche en MeSH sur le même sujet à l’aide du Portail terminologique de Santé. Combien de résultats
Exercice : trouver des documents dans le CISMeF
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 31
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
Présentation
Domaines : médecine et santé
Producteur : CHU de Rouen
LiSSa est un projet supporté par l'ANR avec 5 partenaires : Équipe CISMeF (CHU de Rouen) ; Équipe d'Accueil 2694 "Santé
Publique : épidémiologie et qualité des soins" (Lille) ; Elsevier Masson ; Alicante (qui développe SIGAPS/SIGREC) ; SenseGates
(société qui produit le dictionnaire Sensagent).
Le site actuel est un prototype, dont certaines fonctionnalités (recherche avancée, envoi des références par mail,
interface pour tablettes et smartphones...) sont pour le moment annoncées et en cours de développement, projet définitif prévu
pour mars 2018.
Type de données : plus de 865 000 références d’articles de périodiques (en février 2017), issues de 640 revues :
 Comprend le contenu francophone de PubMed
 Comprend des articles de revues non incluses dans PubMed
 Comprend les traités de l’EMC
Plus de 35 000 liens vers des articles gratuits sont référencés dans LiSSa. La liste complète des revues est disponible à l’adresse
suivante : http://www.lissa.fr/rep/revues
Langue : français
Couverture géographique : aire francophone : France, Canada (Québec), Suisse, Belgique...
Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.lissa.fr ou via la page d’accueil du CISMeF (http://www.cismef.org)
Interrogation :
 Langage naturel et MeSH
Avantages :
 Français
 Ressources francophones non incluses dans PubMed : si l’on considère uniquement les années postérieures à 2000, la
moitié du contenu de LiSSa est inédite
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 32
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
La recherche en langage libre
Saisir les termes en saisie libre dans la barre
de recherche.
Le moteur de recherche sémantique suggère le
descripteur MeSH correspondant ou
approchant, on le sélectionne avec la souris ou
pas.
Par exemple ici : vaccins antigrippaux, est le
concept qui a été identifié avec la notion de vac-
cin contre la grippe.
L’opérateur booléen ET est implicite, les autres
opérateurs sont acceptés ainsi que la troncature
(*), à droite, à gauche et au milieu du mot.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 33
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
La recherche avancée
La recherche avancée propose un formulaire
de recherche, composé de 5 lignes.
«Ajouter une ligne» permet de rajouter jus-
qu’à 5 autres lignes.
3 possibilités de saisie sont offertes, en fonction
de l’index sélectionné :
- Commencer à saisir (permet la saisie semi-
automatique avec suggestion du descripteur
MeSH)
-Saisie libre
-Choisir dans la liste
L’opérateur booléen ET est proposé par défaut,
entre chaque ligne.
Pour lier deux mots clé par l’opérateur OU, il est
nécessaire de cliquer sur le + en bout de ligne.
12 index de recherche
sont suggérés.
Un filtre est possible sur la période
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 34
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
L’affichage des résultats
Les résultats sont classés par pertinence, un
tri par année est possible
Indique si l’article est acces-
sible gratuitement ou non
A gauche, la rubrique "Affiner" permet d’appliquer des filtres à la recherche effectuée : type de document, statut du texte (accès au
texte intégral gratuit ou sur abonnement), année de publication, titre de revue, indexation.
Seules les 4 premières entrées sont affichées. Cliquer sur "Voir plus" pour afficher toutes les entrées.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 35
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
L’affichage des résultats
En cliquant ici, on peut vérifier la requête effectuée
ou rebondir sur le concept identifié dans HeTop.
Les résultats peuvent être envoyés vers Votre sélection et
retrouvés ensuite dans le bandeau de gauche dans la ru-
brique «Votre sélection».
Envoyer Citations (ris) permet d’intégrer plusieurs réfé-
rences à la fois dans un logiciel de gestion bibliographique,
de type Zotero (voir pages 38 et 39).
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 36
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
L’affichage des résultats
En cliquant ici, on peut vérifier la requête effectuée
ou rebondir sur le concept identifié dans HeTop.
En cliquant sur le titre dans la liste des résultats, on obtient
- la description du document
- le Résumé
- les Mots-clés attribués par les auteurs
- l’Indexation proposée par LiSSa
Un clic sur le + donne accès aux
termes retenus pour l’indexation
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 37
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
La recherche experte Des codes peuvent être utilisés pour une utilisation experte
du moteur de recherche.
Ce mode de recherche suppose :
 d’avoir identifié au préalable
- les abréviations utilisées par LiSSa
- éventuellement les mots-clés MeSH à utiliser, ainsi que les
éventuels qualificatifs, en utilisant par exemple le portail ter-
minologique HeTOP
 de maîtriser la syntaxe propre aux outils du CISMeF
La requête ci-dessus
vaccination.mc et 2014.an sauf
grippe.ti correspond à :
(vaccination (descripteur MeSH) sauf
grippe (dans le titre) et paru en 2014)
Liste des abréviations des champs utilisés dans Doc’CISMeF et LiSSa (extrait)
Exemple de syntaxe:
(douleur.mc ou morphine.mc) et (cancérologie.mt sauf adulte.tc)
sera compris comme
(douleur (mot clé) ou morphine (mot clé)) et (cancérologie (métaterme) sauf adulte (tous champs))
Pondération : pour restreindre un sujet à ses aspect majeurs : douleur.mc[majeur]
Explosion : par défaut dans CISMeF, il est toutefois possible de ne pas l’utiliser : douleur.mc
[nonexpl] ou douleur.mc[majeur][nonexpl]
Qualificatifs : La syntaxe doit être : douleur/diagnostic.mc. Il est possible d’utiliser les abrévia-
tions des qualificatifs : di.qu (explosion par défaut) ou di.qu[nonexpl]. Un qualificatif peut-être
recherché seul, on dit alors qu’il est « flottant » : diagnostic.qu. Il est alors recherché quel que
soit sa place parmi les mots clés.
Troncature (trois possibilités : droite, gauche, les deux) : rééduc*.ti, *rééducation.ti, ou encore
*réédu*.ti [attention !contrairement à PubMed, la troncature dans CISMeF, avec explosion par
défaut, est permise avec les mots clés et les qualificatifs : (*tumeur*.mc et *thérap*.qu)].
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 38
La recherche par mots-clés MeSH
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
Il est possible d’effectuer une recherche en mots-clés MeSH à partir du Constructeur de Requêtes Bibliographiques Médicales
(CRBM).
Cet outil est disponible en bas de la page d’accueil du CiSMeF.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 39
L’exploitation des résultats
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
Il est possible de récupérer les références obtenues dans LiSSa dans un logiciel de gestion de références
bibliographiques, et notamment dans Zotero.
Cocher les références que
l’on souhaite sauvegarder
puis, dans le menu déroulant
"Envoyer vers", sélection-
ner le format "Citations
(ris)".
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Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 40
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Bases de données thématiques en médecine
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LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
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LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
Exercice : interroger la base LiSSa
Dans LiSSa recherchez des revues de la littérature sur l’éducation thérapeutique des patients insuffisants cardiaques.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 43
Kinédoc
Domaines : masso-kinésithérapie et physiothérapie
Producteur : réseau de partenaires institutionnels et professionnels francophones.
Type de données : références d'articles, d’ouvrages, de travaux de recherche (mémoires et thèses), de manifestations
scientifiques et de textes officiels. Un certain nombre de documents sont accessibles en ligne.
Langue : français
Langue d’interrogation : français
Couverture chronologique : inconnue
Couverture géographique : aire francophone
Interrogation : langage naturel
Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.kinedoc.org/
Avantages :
 Principale ressource du domaine
 Français
 Gratuit
 Recensement de la littérature grise (nombreux mémoires d’élèves kinésithérapeutes)
Présentation
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 44
Kinédoc
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Il est possible d’utiliser les autres
opérateurs disponibles : pour cela,
saisir OU ou SAUF en majuscules.
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- au titre, au sous-titre, au résumé et
aux mots-clés ayant servi à indexer la
ressource
- aux documents disponibles en ligne
- à un type de document (utile pour
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- à une thématique : prévention,
rééducation...
- à un auteur et à un pays
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Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 45
Kinédoc
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Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 46
Kinédoc
Exercice : interroger la base Kinédoc
Dans Kinédoc, recherchez des références d’articles sur la prévention de l’ostéoporose. Limitez la recherche aux articles
comprenant le terme "ostéoporose" dans le titre et le sous-titre.
Combien de références trouvez-vous ? Combien d’articles sont disponibles en texte intégral ?
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 47
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/fr/
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Bases thématiques en santé

  • 1. Bases de données thématiques en médecine Stage « Recherche documentaire en médecine : outils et ressources » Mars 2017 Catherine Tellaa (catherine.tellaa@biusante.parisdescartes.fr)  EM-Premium * Présentation * La recherche avancée * L’affichage des résultats * Présentation d’un document en texte intégral  La Banque de Données en Santé Publique (BDSP) * Présentation * Accès à la base documentaire * La recherche simple * La recherche avancée * L’affichage et l’exploitation des résultats * Choix des préférences d’affichage  Delfodoc * Présentation * La recherche simple * La recherche avancée  CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones * Présentation * La recherche en langage libre * L’affichage et l’exploitation des résultats * La recherche en MeSH * La recherche experte  LiSSa : Littérature Scientifique en Santé * Présentation * La recherche en langage libre * La recherche avancée * L’affichage des résultats * La recherche experte * La recherche par mots-clés MeSH * L’exploitation des résultats  Kinédoc
  • 2. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 2 ET / AND = Intersection OU / OR = Somme SAUF / NOT = Exclusion Le document contient les 2 notions à la fois Ex. : cancer du poumon ET tabagisme Le document exclut la seconde notion Ex. : addiction SAUF alcoolisme En préalable... Les opérateurs booléens Le document contient au moins une des deux no- tions Ex. : anorexie OU boulimie
  • 3. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 3 La troncature (*) permet de rechercher à partir de la racine des mots. Ex. : therap* recherche thérapie(s), therapy(ies), therapeutic(s), therapeutical, thérapeute(s), thérapeutiques(s)... Les guillemets ("...") permettent de figer une expression ou un groupe de mots. Ex. : "menace d’accouchement prématuré" La casse : la plupart des bases sont insensibles à la casse (minuscules/MAJUSCULES). D’une manière générale, il est préférable de saisir les termes de recherche en minuscules. Les accents (à, é, è, ê…) et les signes diacritiques (ç…) sont à éviter de préférence lors de l’interrogation. Les mots vides (le, la, les, l’, un, une, de, des, the, a, à…) sont des mots ignorés lors de l’interrogation. Dans certaines bases, il est possible de forcer leur interrogation à l’aide du signe "+". Ex. : grippe +a La ponctuation : les parenthèses servent généralement à combiner plusieurs opérateurs booléens. Langue d’interrogation : anglais ou français selon le producteur de la base. Langage contrôlé / langage naturel : certaines bases s’appuient sur un langage contrôlé ou thesaurus. Dans le cas d’une base indexée à l’aide d’un thesaurus, une recherche complémentaire en langage naturel peut s’avérer utile, voire indispensable, pour rechercher une notion récente, mal indexée ou compenser une indexation insuffisante des documents recensés. En préalable...
  • 4. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 4 EM-Premium Présentation Producteur : Elsevier-Masson Type de données : portail spécialisé dans le domaine médical et paramédical  Contient l'Encyclopédie médico-chirurgicale (EMC), divisée en 45 traités thématiques  Permet la consultation en ligne de 130 revues médicales françaises et 80 revues médicales anglaises  Contient aussi des livres électroniques en français et en anglais Le formulaire de recherche permet d'interroger simultanément les traités EMC, les revues et les livres. Langues : anglais et français Langue d’interrogation : français Couverture chronologique :  depuis 1970 (traités)  variable (revues) Couverture géographique : France Interrogation : langage naturel Consultation : sur abonnement, plusieurs formules possibles :  Avec ou sans le traité de "Biologie médicale"  Avec ou sans le pack "Univers infirmier"  Sélection de revues Avantages :  Français  Traités thématiques permettant d’obtenir une synthèse sur un sujet (utile pour débuter une recherche) Pour savoir à quoi vous êtes abon- nés, cliquer sur : « Accéder à tous vos produits »
  • 5. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 5 EM-Premium La recherche avancée Préférer la recherche avancée à la recherche simple. Saisir les mots-clés dans la barre de recherche. Le filtre "Titre, mots clés, résumé" permet de mieux cibler la recherche. Par défaut, l'opérateur booléen sous-entendu est OU. Pour associer plusieurs mots-clés avec l'opérateur ET, il est nécessaire de faire précéder chaque terme du signe "+". Limiter éventuellement les résultats à une période chronologique précise. « Dans un produit » : lance la recherche dans l’intégralité de la plateforme. « Dans mes abonnements » : limite les résul- tats aux ressources auxquelles la bibliothèque est abonnée.
  • 6. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 6 EM-Premium La recherche avancée Cliquer sur "Plus d’options" pour afficher les différentes possibilités de recherche.
  • 7. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 7 EM-Premium Rappel de la stratégie de recherche Par défaut, les résultats sont classés par ordre de pertinence. Un tri chronologique est également possible. L’affichage des résultats Tri des résultats par langue (français / anglais) Possibilité de rechercher dans la liste de résultats. Résultats de la recherche En passant la souris sur le titre de la revue, le nombre de résultats dans cette revue, apparait.
  • 8. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 8 EM-Premium L’affichage des résultats Titre du traité ou de la revue Cliquer sur le titre pour limiter la recherche à cette ressource Indication du type de document : Indication du degré de pertinence Traité Revue Livre électronique
  • 9. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 9 EM-Premium Titre du traité ou référence de l’article dans la base (voir aussi en bas de page). Accès au document au format PDF. Accès direct à l’iconogra- phies et aux documents d’accompagnement (autoévaluation, arbre décisionnel, fiche d’information patient…). Résumé Mots-clés Plan cliquable Bibliographie en fin de document Présentation d’un document en texte intégral Il est possible de récupérer cette référence dans Zotero mais la ré- cupération du texte intégral peut ne pas se faire de façon automa- tique.
  • 10. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 10 Exercice : interroger la base EM-Premium Dans EM-Premium, rechercher des documents sur la Borréliose de Lyme chez l’enfant. Obtenez-vous des traités dans vos réponses ? EM-Premium
  • 11. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 11 Domaine : santé publique Producteur : École des hautes études en santé publique (EHESP), avec l'appui du réseau BDSP qui est un groupement de 40 centres de documentation et d'organismes spécialisés. Type de données : environ 500 000 références d’articles de revues fondamentales, d’ouvrages, de thèses, mémoires et autres travaux académiques, de rapports, d’actes de congrès, de retours d’expériences, à destination des professionnels de santé et des patients. Un certain nombre de documents sont accessibles en ligne. Le site propose également des bibliographies élaborées par des professionnels de l'information, un annuaire critique de sites, une base de colloques, un glossaire multilingue et des offres d'emploi. Langues : français et anglais Langue d’interrogation : français Couverture chronologique : depuis la fin des années 1970 Couverture géographique : internationale Mise à jour : mensuelle Interrogation :  Langage naturel  Thesaurus de la BDSP Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.bdsp.ehesp.fr/base/ Avantages :  Français  Gratuit La Banque de données en santé publique (BDSP) Présentation
  • 12. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 12 Accès à la base documentaire La Banque de données en santé publique (BDSP)
  • 13. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 13 La recherche simple La Banque de données en santé publique (BDSP) La base s’ouvre par défaut sur l’interface de recherche simple : 1. Saisir les termes de recherche 2. Valider par "Rechercher" L’opérateur par défaut est ET Penser à utiliser la troncature (*) Affichage des résultats par ordre de pertinence Document disponible en texte intégral Nombre de références trouvées
  • 14. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 14 La recherche simple La Banque de données en santé publique (BDSP) Il est possible de relancer la recherche à partir du nuage de mots-clés, issus du thesaurus de la BDSP, qui s’affiche à droite de la page de résultats. Cliquer sur le mot-clé sélectionné pour : «Lancer une nouvelle recherche sur le mot-clé choi- si » «Restreindre les réponses à ce mot-clé » : conserve la requête en cours et y associe le mot-clé à l’aide de l’opéra- teur ET «Exclure le mot-clé de la recherche » : relance la recherche et y associe le mot-clé à l’aide de l’opérateur Cette opération permet de limiter le nombre de réponses de façon rapide.
  • 15. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 15 La recherche avancée La Banque de données en santé publique (BDSP) Elle permet : - d’interroger la base via le thesaurus de la BDSP - de limiter la recherche à un type de documents (articles, thèses/mémoires…) et aux documents disponibles en texte intégral - de limiter la recherche à une revue ou à un auteur (consultation des index) : Accès au thesaurus (ouverture dans un nouvel onglet)
  • 16. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 16 La recherche avancée La Banque de données en santé publique (BDSP) Le thesaurus n’est disponible qu’en consultation (pas de possibilité de construire une équation de recherche comme dans le MeSH Database de PubMed). Il est accessible dès la page d’accueil, à partir du formulaire de recherche avancée ou directement à l’adresse http://asp.bdsp.ehesp.fr/Thesaurus/. Il faut dans un premier temps rechercher ses mots-clés, puis dans un deuxième temps construire l’équation à l’aide du formulaire de recherche avancée. Accès via l’arborescence Accès à la fiche du descripteur : - terme retenu - termes rejetés - termes génériques - termes spécifiques - termes associés
  • 17. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 17 La recherche avancée La Banque de données en santé publique (BDSP) Pour lancer une recherche à l’aide du thesaurus, utiliser le formulaire de recherche avancée. Saisir le premier terme recherché dans le champ «Mots-clés». Le système fait des propositions au fur et à mesure de la saisie et affiche en face de chaque mot- clé proposé le nombre de documents indexés avec celui-ci. Sélectionner le mot-clé à l’aide de la souris et valider à l’aide d’un clic gauche ou si vous souhaitez sélectionner la pre- mière proposition, utiliser la touche En- trée directement. Pour associer un deuxième mot-clé, saisir un séparateur : , ; / ou un opérateur booléen : ET, OU, SAUF. Sélectionner le deuxième mot-clé et lancer la recherche.
  • 18. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 18 La Banque de données en santé publique (BDSP) L’affichage et l’exploitation des résultats A l’aide du menu déroulant, possibilité de modifier l’affichage des résultats (auteur, date de publication, revue…) Afficher les filtres Les filtres permettent de limiter la recherche à une tranche chronologique (utile pour isoler les documents récents) et à une langue (anglais/français) Lien pour exporter la référence dans un logiciel de gestion de références bibliographiques, ici Zotero a été paramétré (voir page 21) Les autres options d’export s’affichent dans la colonne de droite. Il est possible de se créer un compte (gratuit) pour constituer un panier et sauvegarder les résultats.
  • 19. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 19 La Banque de données en santé publique (BDSP) L’affichage et l’exploitation des résultats Détails d’une notice : Résumé Liens permettant de relancer la recherche Descripteurs : mots-clés du thesaurus de la BDSP et de la base Pascal Centre documentaire producteur de la notice
  • 20. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 20 La Banque de données en santé publique (BDSP) L’affichage et l’exploitation des résultats Le service de la BDSP ne détient aucun document. Pour accéder au texte intégral de la référence trouvée, plusieurs possibilités : -Accéder au texte intégral lorsque ce- lui-ci est disponible en ligne. - Identifier et solliciter le centre documentaire qui a produit la notice : accès via le lien, à ses coor- données et aux conditions d’accès aux documents. - Localiser le document dans une bi- bliothèque (SUDOC) - Commander une copie auprès d’un service de fourniture de documents comme celui de la BIU Santé ou le portail Refdoc (INIST- CNRS).
  • 21. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 21 La Banque de données en santé publique (BDSP) Choix des préférences d’affichage La page de gestion de préférences est accessible en haut à droite de l’interface. Cette page permet notamment de : Définir un filtre par défaut Définir un logiciel de gestion de références bibliographiques par défaut Modifier les paramètres d’affichage Cocher la case "Utiliser ces options lors de mes prochaines visites" et valider par "Enregistrer mes préférences".
  • 22. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 22 Exercice : interroger la BDSP Dans la BDSP, en utilisant le formulaire de recherche avancée et en vous servant du thesaurus de la BDSP, faites une recherche sur la prise en charge de la maladie d’Alzheimer par les médecins généralistes. Limitez la recherche aux articles et aux thèses/mémoires disponibles en texte intégral, parus depuis 2010. Quel est le producteur de la notice de la première référence trouvée ? La Banque de données en santé publique (BDSP)
  • 23. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 23 Domaines : hôpital, soins, santé publique, sciences humaines et sociales, management hospitalier, formation continue…. Producteurs : association de 4 centres de documentation (par ailleurs membres du réseau BDSP) :  Centre de documentation de l’AP-HP  Centre de documentation de l’IFSI Pitié Salpêtrière  Centre de documentation de l’IFSI Bichat  Centre de documentation de l’IFSI Henri Mondor Type de données : près de 100 000 références d’articles, ouvrages, rapports, mémoires, films… Un certain nombre de docu- ments sont accessibles en ligne. Langue : français Langue d’interrogation : français Couverture chronologique : depuis la fin des années 1970 Couverture géographique : France Mise à jour : quotidienne Interrogation :  Langage naturel  Thesaurus de la BDSP Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.aphp.fr/ressourcesdocumentaires/base-documentaire-delfodoc/ Avantages :  Gratuit  Complémentaire de la BDSP (comprend des revues non dépouillées dans la BDSP) Delfodoc Présentation
  • 24. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 24 La base s’ouvre par défaut sur l’interface de recherche simple. L’opérateur ET est par défaut. La recherche simple Delfodoc Il est possible de limiter la recherche à une tranche chronologique pour isoler les documents récents. Cliquer sur pour lancer la recherche. La recherche avancée Limitation aux documents disponibles en ligne La recherche avancée permet notamment d’inter- roger la base à l’aide du thesaurus de la BDSP. L’icône permet de consulter le thesaurus : celui-ci s’affiche alors dans la colonne de droite. Il est cependant préférable de connaître au préalable ses mots-clés ou de consulter le thesaurus à partir du site de la BDSP : http://asp.bdsp.ehesp.fr/Thesaurus/ Limitation par type de documents
  • 25. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 25 CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones Présentation Domaines : médecine et santé Producteur : CHU de Rouen Type de données : annuaire de sites Web et de documents en ligne, validés selon des critères de qualité, principalement destinés aux professionnels de santé et indexés en MeSH Langue : français Couverture chronologique : à partir de 1990 Couverture géographique : aire francophone : France (70% des ressources), Canada (Québec), Suisse, Belgique, Afrique... Mise à jour : hebdomadaire Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.chu-rouen.fr/cismef ou http://www.cismef.org. Interrogation :  Langage naturel  MeSH français via HeTOP (Portail Terminologique de Santé) Avantages :  Français  Qualité et validité de l’information  Point unique pour trouver des documents produits par différentes institutions (Ministère de la santé, HAS…). Le CISMEF est notamment un outil adéquat pour trouver des recommandations de bonne pratique, des conférences de consensus, des rapports, du matériel d’enseignement…  Ressource utile pour trouver des informations à destination des patients
  • 26. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 26 CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones La recherche en langage libre L’outil Doc’CISMEF est un moteur de recherche qui permet d’interroger l’ensemble des ressources du portail. Le système accepte les opérateurs booléens (ET implicite), la troncature (*) et les guillemets. Possibilité de limiter par type de document
  • 27. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 27 CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones L’affichage des résultats Historique de recherche (au cours d’une session) Relancer la recherche dans d’autres moteurs et bases de données : PubMed, Google... Filtres permettant d’affiner la recherche : - par source : OMS, HAS, Ministère de la Santé… - par type de document : recommanda- tion de santé publique, article de revue, rapport, thèse ou mémoire, document produit par une association profession- nelle de santé… - par mots-clés ayant servi à décrire les ressources - par niveau d’études (PACES, 1er cycle…) - par pays : France, Canada, etc. - par année de publication. Les résultats sont affichés par ordre antéchronologique Suggestion de descripteurs MeSH pour relancer la recherche Descripteurs MeSH en rapport avec la recherche saisie en langage libre
  • 28. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 28 CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones L’affichage des résultats Lien cliquable vers le document Afficher la notice complète Attention, le CISMEF n’est pas compatible avec Zotero. Afficher les mots-clés MeSH ayant servi à l’indexation de la ressource Type de document Afficher l’URL de la ressource Date de la ressource Détails d’une référence :
  • 29. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 29 CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones La recherche en MeSH à l’aide du Portail Terminologique de Santé (HeTOP) L’ensemble des ressources du CISMeF sont indexées en MeSH français. Il est possible d’interroger la base à l’aide du MeSH en passant par le Portail Terminologique de Santé. 2. Cliquer sur l’onglet "PubMed / Doc’CISMeF" 4. La recherche a bien porté sur les ressources indexées avec le mot-clé MeSH "vaccins antigrippaux/administration et posologie" 3. Cocher éventuellement un qualificatif et lancer la recherche en cliquant sur "Doc’CISMeF" en bas de la page 1. Lancer la recherche dans le Portail Terminologique de Santé et afficher la notice du mot-clé MeSH correspondant :
  • 30. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 30 Dans le CISMeF, rechercher en langage libre des documents sur la prévention de la bronchopneumopathie chronique obstructive. A l’aide des filtres, isoler les ressources produites par le Centre Cochrane français. Combien de résultats trouvez- vous ? Effectuer ensuite une recherche en MeSH sur le même sujet à l’aide du Portail terminologique de Santé. Combien de résultats Exercice : trouver des documents dans le CISMeF CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
  • 31. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 31 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé Présentation Domaines : médecine et santé Producteur : CHU de Rouen LiSSa est un projet supporté par l'ANR avec 5 partenaires : Équipe CISMeF (CHU de Rouen) ; Équipe d'Accueil 2694 "Santé Publique : épidémiologie et qualité des soins" (Lille) ; Elsevier Masson ; Alicante (qui développe SIGAPS/SIGREC) ; SenseGates (société qui produit le dictionnaire Sensagent). Le site actuel est un prototype, dont certaines fonctionnalités (recherche avancée, envoi des références par mail, interface pour tablettes et smartphones...) sont pour le moment annoncées et en cours de développement, projet définitif prévu pour mars 2018. Type de données : plus de 865 000 références d’articles de périodiques (en février 2017), issues de 640 revues :  Comprend le contenu francophone de PubMed  Comprend des articles de revues non incluses dans PubMed  Comprend les traités de l’EMC Plus de 35 000 liens vers des articles gratuits sont référencés dans LiSSa. La liste complète des revues est disponible à l’adresse suivante : http://www.lissa.fr/rep/revues Langue : français Couverture géographique : aire francophone : France, Canada (Québec), Suisse, Belgique... Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.lissa.fr ou via la page d’accueil du CISMeF (http://www.cismef.org) Interrogation :  Langage naturel et MeSH Avantages :  Français  Ressources francophones non incluses dans PubMed : si l’on considère uniquement les années postérieures à 2000, la moitié du contenu de LiSSa est inédite
  • 32. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 32 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé La recherche en langage libre Saisir les termes en saisie libre dans la barre de recherche. Le moteur de recherche sémantique suggère le descripteur MeSH correspondant ou approchant, on le sélectionne avec la souris ou pas. Par exemple ici : vaccins antigrippaux, est le concept qui a été identifié avec la notion de vac- cin contre la grippe. L’opérateur booléen ET est implicite, les autres opérateurs sont acceptés ainsi que la troncature (*), à droite, à gauche et au milieu du mot.
  • 33. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 33 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé La recherche avancée La recherche avancée propose un formulaire de recherche, composé de 5 lignes. «Ajouter une ligne» permet de rajouter jus- qu’à 5 autres lignes. 3 possibilités de saisie sont offertes, en fonction de l’index sélectionné : - Commencer à saisir (permet la saisie semi- automatique avec suggestion du descripteur MeSH) -Saisie libre -Choisir dans la liste L’opérateur booléen ET est proposé par défaut, entre chaque ligne. Pour lier deux mots clé par l’opérateur OU, il est nécessaire de cliquer sur le + en bout de ligne. 12 index de recherche sont suggérés. Un filtre est possible sur la période
  • 34. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 34 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé L’affichage des résultats Les résultats sont classés par pertinence, un tri par année est possible Indique si l’article est acces- sible gratuitement ou non A gauche, la rubrique "Affiner" permet d’appliquer des filtres à la recherche effectuée : type de document, statut du texte (accès au texte intégral gratuit ou sur abonnement), année de publication, titre de revue, indexation. Seules les 4 premières entrées sont affichées. Cliquer sur "Voir plus" pour afficher toutes les entrées.
  • 35. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 35 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé L’affichage des résultats En cliquant ici, on peut vérifier la requête effectuée ou rebondir sur le concept identifié dans HeTop. Les résultats peuvent être envoyés vers Votre sélection et retrouvés ensuite dans le bandeau de gauche dans la ru- brique «Votre sélection». Envoyer Citations (ris) permet d’intégrer plusieurs réfé- rences à la fois dans un logiciel de gestion bibliographique, de type Zotero (voir pages 38 et 39).
  • 36. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 36 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé L’affichage des résultats En cliquant ici, on peut vérifier la requête effectuée ou rebondir sur le concept identifié dans HeTop. En cliquant sur le titre dans la liste des résultats, on obtient - la description du document - le Résumé - les Mots-clés attribués par les auteurs - l’Indexation proposée par LiSSa Un clic sur le + donne accès aux termes retenus pour l’indexation
  • 37. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 37 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé La recherche experte Des codes peuvent être utilisés pour une utilisation experte du moteur de recherche. Ce mode de recherche suppose :  d’avoir identifié au préalable - les abréviations utilisées par LiSSa - éventuellement les mots-clés MeSH à utiliser, ainsi que les éventuels qualificatifs, en utilisant par exemple le portail ter- minologique HeTOP  de maîtriser la syntaxe propre aux outils du CISMeF La requête ci-dessus vaccination.mc et 2014.an sauf grippe.ti correspond à : (vaccination (descripteur MeSH) sauf grippe (dans le titre) et paru en 2014) Liste des abréviations des champs utilisés dans Doc’CISMeF et LiSSa (extrait) Exemple de syntaxe: (douleur.mc ou morphine.mc) et (cancérologie.mt sauf adulte.tc) sera compris comme (douleur (mot clé) ou morphine (mot clé)) et (cancérologie (métaterme) sauf adulte (tous champs)) Pondération : pour restreindre un sujet à ses aspect majeurs : douleur.mc[majeur] Explosion : par défaut dans CISMeF, il est toutefois possible de ne pas l’utiliser : douleur.mc [nonexpl] ou douleur.mc[majeur][nonexpl] Qualificatifs : La syntaxe doit être : douleur/diagnostic.mc. Il est possible d’utiliser les abrévia- tions des qualificatifs : di.qu (explosion par défaut) ou di.qu[nonexpl]. Un qualificatif peut-être recherché seul, on dit alors qu’il est « flottant » : diagnostic.qu. Il est alors recherché quel que soit sa place parmi les mots clés. Troncature (trois possibilités : droite, gauche, les deux) : rééduc*.ti, *rééducation.ti, ou encore *réédu*.ti [attention !contrairement à PubMed, la troncature dans CISMeF, avec explosion par défaut, est permise avec les mots clés et les qualificatifs : (*tumeur*.mc et *thérap*.qu)].
  • 38. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 38 La recherche par mots-clés MeSH LiSSa : Littérature Scientifique en Santé Il est possible d’effectuer une recherche en mots-clés MeSH à partir du Constructeur de Requêtes Bibliographiques Médicales (CRBM). Cet outil est disponible en bas de la page d’accueil du CiSMeF.
  • 39. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 39 L’exploitation des résultats LiSSa : Littérature Scientifique en Santé Il est possible de récupérer les références obtenues dans LiSSa dans un logiciel de gestion de références bibliographiques, et notamment dans Zotero. Cocher les références que l’on souhaite sauvegarder puis, dans le menu déroulant "Envoyer vers", sélection- ner le format "Citations (ris)". Une fenêtre s’ouvre : cliquer sur OK
  • 40. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 40 L’exploitation des résultats Lorsqu’on affiche une notice, il est possible de récupérer directement celle-ci dans Zotero ou d’utiliser le menu déroulant "Envoyer vers" L’accès au texte intégral, lorsque celui-ci est disponible, se fait à partir des liens disponibles en bas de la notice : Recherche par DOI (Digital Object Identifier) ou identifiant d’objet numérique. Il permet d’identifier une ressource électronique (article en ligne) de façon pérenne. Recherche via le site de la revue (résolveur de lien). L’accès aux ressources payantes nécessite de travailler sur un poste de la bibliothèque ou de s’authentifier. Cliquer sur "Autres liens" pour :  lancer la recherche dans Google Scholar  accéder au site de la revue  localiser la revue dans une bibliothèque, en France (SUDOC) ou dans le monde (WorldCat) LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
  • 41. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 41 L’exploitation des résultats Si le texte intégral n’est pas accessible, LiSSa propose de Chercher l’article. Lorsque la référence est issue de PubMed, le lien vers la no- tice est aussi proposé. LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
  • 42. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 42 LiSSa : Littérature Scientifique en Santé Exercice : interroger la base LiSSa Dans LiSSa recherchez des revues de la littérature sur l’éducation thérapeutique des patients insuffisants cardiaques.
  • 43. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 43 Kinédoc Domaines : masso-kinésithérapie et physiothérapie Producteur : réseau de partenaires institutionnels et professionnels francophones. Type de données : références d'articles, d’ouvrages, de travaux de recherche (mémoires et thèses), de manifestations scientifiques et de textes officiels. Un certain nombre de documents sont accessibles en ligne. Langue : français Langue d’interrogation : français Couverture chronologique : inconnue Couverture géographique : aire francophone Interrogation : langage naturel Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.kinedoc.org/ Avantages :  Principale ressource du domaine  Français  Gratuit  Recensement de la littérature grise (nombreux mémoires d’élèves kinésithérapeutes) Présentation
  • 44. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 44 Kinédoc La recherche avancée Préférer la recherche avancée à la recherche simple. Saisir les termes de recherche. L’opérateur par défaut est ET. Il est possible d’utiliser les autres opérateurs disponibles : pour cela, saisir OU ou SAUF en majuscules. Le système accepte la troncature (*). Il est possible de limiter la recherche : - au titre, au sous-titre, au résumé et aux mots-clés ayant servi à indexer la ressource - aux documents disponibles en ligne - à un type de document (utile pour isoler les mémoires) - à une thématique : prévention, rééducation... - à un auteur et à un pays Cliquer sur "Lancer la recherche" ou valider par Entrée.
  • 45. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 45 Kinédoc L’affichage des résultats Par défaut, les résultats sont classés par pertinence. L’icône permet de télécharger un document disponible en ligne. L’icône indique un lien vers le site de l’éditeur dans le cas d’un article de revue. Attention, il ne s‘agit pas d’un résolveur de liens. La base n’est pas compatible avec Zotero.
  • 46. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 46 Kinédoc Exercice : interroger la base Kinédoc Dans Kinédoc, recherchez des références d’articles sur la prévention de l’ostéoporose. Limitez la recherche aux articles comprenant le terme "ostéoporose" dans le titre et le sous-titre. Combien de références trouvez-vous ? Combien d’articles sont disponibles en texte intégral ?
  • 47. Bases de données thématiques en médecine Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 47 http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/fr/ Sont autorisées la diffusion et la réutilisation de ce support sous réserve d’en citer les auteurs et uniquement à des fins non commerciales.