Face à la paratuberculose bovine, la vaccination peut apparaître comme un outil complémentaire de lutte. Qu'en est-il en pratique de son efficacité ? Des résultats préliminaires sont présentés

1. Fabien Corbiere, Gilles Foucras (UMR INRA-ENVT 1225 IHAP)
Emma Dubaux, Laurent Foures (GDS 55)
Paratuberculose : résultats
préliminaires des effets de la
vaccination en élevage bovin laitier
UMT PSR, 15 décembre 2020

2. Paratuberculose et vaccination
• Paratuberculose
• Maladie enzootique contagieuse des ruminants due à Mycobacterium avium
ssp. paratuberculosis (Map), à l'origine de pertes économiques importantes
• Maitrise et prévention difficiles
• Longue période d’incubation, faibles performances des tests diagnostiques ante-
mortem
• Plans de maitrise basés sur « test and cull », longs, contraignants et souvent peu
efficaces
• Possibilité de vaccination en France
• Gudair® (petits ruminants) ATU depuis 2009
• Silirum® (bovins) AMM depuis fin 2014
2

3. Paratuberculose et vaccination
• Bastida et Juste, 2011
• Nombreux vaccins, atténués ou inactivés
• Vaccination très majoritairement < 1 mois d’âge
3

4. Effets de la vaccination Silirum®
4
• Peu d’études publiées avec Silirum®
• Vaccin inactivé, souche 316F, une seule injection
• Infections expérimentales (Sweeney 2009, Munoz, 2005)
• Faibles effectifs (12-14 bovins), vaccination 14 j – 2 mois
•  (52%, 84%) de l’identification de MAP dans les tissus / fèces
• Comparaison intra-élevage (Alonso-Hearn, 2012)
• 1 troupeau : bovins vaccinés (50) vs non vaccinés (38)
•  fréquence de l’excrétion fécale, sévérité des lésions
•  période productive et période pré-clinique (4,7 contre 3,7 ans)
•  poids carcasse à la réforme
• Comparaison avant après vaccination (Juste, 2009)
•  (68%) de la fréquence de l’excrétion fécale
•  de la production laitière
•  de la vie productive

5. Paratuberculose Meuse : les questions
5
• Effet de la vaccination
• sur l’excrétion fécale
• sur la réponse sérologique
• Effet de l’âge à la vaccination
• sur l’excrétion fécale
• sur la réponse sérologique

6. Pourquoi dans la Meuse ?
• Département de la Meuse
• 204 000 bovins adultes
• 1400 troupeaux
• Plan de lutte contre la Paratuberculose
• Troupeaux en plan de surveillance : 172
• Troupeaux en plan de maitrise : 15
• Troupeaux en plan de maitrise + vaccination : 17
• Troupeaux en garantie : 15
• Cadre de la vaccination :
• Convention tripartite (Eleveur, GDS, DDCSPP)
• Suivi du plan de maitrise
6
05.09.2019
• 3652 bovins vaccinés depuis 2015
• 2920 encore vivants
• Age moyen à la vaccination : 122 jours (92 j in 2019)

7. Paratuberculose Meuse : protocole mis en place
• Elevages, animaux et prélèvements
• 7 élevages infectés volontaires, en plan vaccination
• ayant des vaches vaccinées (1er génération) et non vaccinées (dernière génération) en 2e
lactation
• Prélèvements
• Fèces, sang, lait
• Prélèvements en mai 2018, octobre 2018, avril 2019, décembre 2019
• Conservation à -20°C
• Analyses de laboratoire (UMR 1225 IHAP)
• Fèces
• 10 g de fèces, concentration par Adiafilter®
• Extraction par billes magnétiques (NucléoMag 96 ®) sur KingFisher® 96
• qPCR Adiavet® ParaTB realTime
• Amplification par LightCycler® 480
• Reprise des échantillons à résultat mal défini (n=168)
• Sérum
• Sérologie ELISA Kit IDScreen ® paratuberculosis screening
• Analyse en duplicatas
7

8. Paratuberculose Meuse : protocole mis en place
• Quantification de Map dans les fèces
• Gamme de dilution souche MAP K10 quantifiée par cDrop
• 108 à 100 copies gène IS900
• Triplicatas
• Amplification par qPCR Adiavet RealTime
8
y = -1.837ln(x) + 40.336
R² = 0.9889
0
5
10
15
20
25
30
35
40
1.00E+00 1.00E+01 1.00E+02 1.00E+03 1.00E+04 1.00E+05 1.00E+06 1.00E+07 1.00E+08
CT
copies IS900 par puits PCR
CT_LC
Log. (CT_LC)
Relation entre Ct et [Map] / gramme de fèces

9. Résultats : animaux prélevés
• Animaux prélevés par statut vaccinal
9
Vacciné
Prélevé
1 seule fois
Prélevé
2 fois
Prélevé
3 fois
Total
Non
84
30.6%
166
60.6%
24
8.7%
274
Oui
259
66.6%
112
28.8%
18
4.6%
389
Total 343 278 42 663

10. Résultats : animaux prélevés
• Age des bovins lors des prélèvements (en mois)
10
Bovins vaccinés plus jeunes (~ 7 à 10 mois) que les bovins non vaccinés

11. Résultats : animaux prélevés
• Age à la vaccination
11
267 bovins (68.6%) vaccinés avant 6 mois
107 bovins (27.5%) vaccinés entre 6 et 12 mois

12. Résultats : statut sérologique selon le statut vaccinal
• 274 bovins non vaccinés
• 19 (6.9 %) au moins un résultat positif et 4 (1.5 %) au moins un résultat douteux
• 188 bovins testés au moins 2 fois
• 174 (92.5%) sont négatifs à toutes les dates
• Aucun n’est positif à deux reprises
• 9 (4.8%) négatifs  positifs
• 2 (1.0 %) négatifs  douteux
• 389 bovins vaccinés
• 95 (24.4%) au moins un résultat positif et 13 (3.3%) au moins un résultat douteux
• 130 bovins testés au moins 2 fois
• 69 (53.1%) sont séronégatifs à toutes les dates
• 18 (13.9%) sont séropositifs toutes les dates
• 13 (10.0%) négatifs  positifs
• 18 (13.9%) positifs  négatifs
12

13. Résultats : qPCR sur fèces
• 1020 échantillons de fèces analysés par qPCR
• 259 positifs (25.4%)
13

14. Résultats : qPCR sur fèces
• Quantification Map
14
Valeur Ct =< 25 ]25-30] ]30-33.5] ]33.5-42.0] >42.1
Charge bactérienne
(équivalent bactéries / g de fèces)
> 10 000
1000
à
10 000
100
à
1000
1
à
100
< 1
Classe POS 4+ POS 3+ POS 2+ POS 1+ Négatif
Nombre d’échantillons 7 13 14 225 761
Nombre de bovins 6 11 12 137 497

15. Résultats : statut excréteur (qPCR fèces)
• 663 bovins au total
• 206 (31.01%) ont eu au moins 1 résultat positif en qPCR
• bovins non vaccinés : 77 / 274 (28.1 %)
• bovins vaccinés : 129 / 389 (33.2 %)
• 316 bovins testés aux moins 2 fois
• 196 (62.0 %) négatifs à tous les points
• 33 (10.5 %) positifs à tous les points
• 87 (27.5 %) positifs à au moins un point
15
 Statut excréteur peu stable

16. Résultats : effet de la vaccination sur le statut excréteur
• Modèles logistiques à effets aléatoires vache et élevage
• Prise en compte
• Age et statut sérologique au moment du prélèvement
• Interaction vaccination * statut sérologique
• Résultats
• Pas d’effet de l’âge
• Effet élevage très fort
• Pas ou peu d’effet de la vaccination
16

17. Résultats : effet de la vaccination sur le niveau
d’excrétion
• Niveau d’excrétion par statut vaccinal
17
p<10-7

18. Résultats : effet de la vaccination sur le niveau
d’excrétion
• Modèles linéaires à effets aléatoires vache et élevage
• Interaction vaccination * statut sérologique lors du prélèvement
18

19. Résultats : effet de l’âge à la vaccination
• Fort effet de l’âge à la vaccination sur le statut sérologique à la
première analyse
19
Pas d’effet du statut qPCR ni de l’âge lors du prélèvement

20. Résultats : effet de l’âge à la vaccination
• Pas d’effet de l’âge à la vaccination sur le statut excréteur à la
première analyse
20
Pas d’effet du statut sérologique ni de l’âge lors du prélèvement
Résultats identiques si prise en compte de l’ensemble des prélèvements (n=345)

21. Résultats : effet de l’âge à la vaccination
• Pas d’effet de l’âge à la vaccination sur le niveau d’excrétion
21
Pas d’effet du statut sérologique ni de l’âge lors du prélèvement
p=0.18

22. Bilan et discussion
• Vaccination Silirum® : effet global
• Peu (pas) d’effet sur la probabilité d’excréter
• Peu (pas) d’effet sur le niveau d’excrétion
• Effet variable entre élevages
• Age à la vaccination
• Effet fort sur le statut sérologique : origine ????
• Pas d’effet sur la probabilité d’excrétion
• Pas d’effet sur niveau d’excrétion
• Manque de puissance statistique ?
• Sentiment unanime des éleveurs
• Réduction (disparition) des cas cliniques
• Amélioration de la longévité / productivité
22
(Ovins - Reddacliff, Vet microbiol 2006,
Gudair)
2-3 mois
1-3 mois
1-2 mois

23. Bilan et discussion
• Limites du protocole d’étude
• Bovins vaccinés : une majorité prélevée uniquement une fois
• Une dernière série de prélèvements prévue début 2021
• Faible prévalence globale des forts excréteurs
• 17/663 bovins (2.6%) avec charge estimée > 1000 eq MAP/g fèces
• Grande majorité d’échantillons avec charge faible <100 eq MAP/g fèces
• Signification biologique ?
• Limite la mise en évidence d’un effet positif de la vaccination ?
• Vaches L2
• Trop jeunes ?
• Problématique de la longévité des vaches en élevages laitiers
• Plan de maitrise de la paratuberculose : pas uniquement la vaccination !
• Effet des autres mesures de maitrise : réduction de la prévalence ?
• Réforme des vaches non vaccinées plus précoce ?
23

24. Perspectives
• Dernière série de prélèvements début 2021
• Compléter les statuts des vaches prélevées 1 seule fois
• Analyse des échantillons de lait
• Analyses des données de production
• Analyse survie des vaches
• Performances d’abattage
• Production laitière
• Performances de reproduction
24

25. Remerciements
ENVT/ IHAP
• Kevin Baldet
• Jérémy Duret
• Estelle Gonzalez
• Christian Tasca
• Julie Cournet
• Gilles Foucras
25
GDS 55
• Emma Dubaux
• Laurent Foures
• Eleveurs

26. Merci pour votre attention !!
Des questions ?
fabien.corbiere@envt.fr
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