Organisation nucléaire et régulation des activités transcriptionnelles - Parole de junior de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Martin Catherine - France - catherine.Martin-2@manchester.ac.uk
Les protéines sont essentielles au bon fonctionnement cellulaire et sont aujourd’hui des cibles d’intérêt thérapeutique. Cette formation aborde les différentes approches permettant aujourd’hui d’étudier la dynamique des protéines dans leur environnement cellulaire avec de nouvelles techniques d’analyse en temps réel :
- Translocation
- Interactions protéiques
- Modélisation de voies de signalisation cellulaires
- Changements de conformation
Présentation donnée à Forum Labo Paris 2017 par Mourad FERHAT, Ph.D (Promega France)
Titulaire d'un doctorat en physiologie de la nutrition, je vous invite ici a étudier le système nerveux sous l'aspect anatomique et fonctionel. Vous y apprendrez la structure d'un neurone, d'un nerf et les mécanismes de transmission de l'influx nerveux. merci
Titulaire d'un doctorat en physiologie de la nutrition, ancien chercheur et enseignant en BTS diététique, je vous invite ici à découvrir la cellule et les différentes structures qui la compose ainsi que les tissus en s'attardant sur le tissu osseux. Un autre cours est spécifiquement dédié aux muscles (lisses, squelettiques et cardiaque).
Docteur en physiologie de la nutrition, enseignant en BTS diététique, je vous invite ici à étudier les micro-organismes et leurs rôles dans les toxi-infections mais aussi les méthodes d'études.
Les enquêtes sanitaires effectuées auprès des populations habitant à proximité des installations nucléaires se suivent et se ressemblent : elles ne montrent, parmi ces populations riveraines, aucun excès de cancers ou de leucémies attribuables à la centrale nucléaire ou à l’usine située dans le voisinage. La dernière en date de ces études a été menée en 2013, à l’initiative des Commissions Locales d’Information du département de la Manche – qui compte sur son territoire l’usine de retraitement de La Hague, la centrale nucléaire de Flamanville, le centre de stockage de déchets radioactifs CSM et l’arsenal de Cherbourg spécialisé dans la construction et la maintenance des sous–marins nucléaires. L'étude a pour thème : « L’industrie nucléaire et le risque de cancers dans le département de la Manche ». Elle a été menée par le Registre régional des hémopathies malignes de Basse-Normandie en collaboration avec le Registre général des cancers de la Manche.
Cell division allows organisms to grow and reproduce. In eukaryotes, cell division involves mitosis, which consists of four phases - prophase, metaphase, anaphase, and telophase. During mitosis, duplicated chromosomes properly separate and are distributed into two daughter cells to ensure each cell has the full DNA complement. A loss of control of the cell cycle can lead to uncontrolled cell division and the formation of tumors.
Les protéines sont essentielles au bon fonctionnement cellulaire et sont aujourd’hui des cibles d’intérêt thérapeutique. Cette formation aborde les différentes approches permettant aujourd’hui d’étudier la dynamique des protéines dans leur environnement cellulaire avec de nouvelles techniques d’analyse en temps réel :
- Translocation
- Interactions protéiques
- Modélisation de voies de signalisation cellulaires
- Changements de conformation
Présentation donnée à Forum Labo Paris 2017 par Mourad FERHAT, Ph.D (Promega France)
Titulaire d'un doctorat en physiologie de la nutrition, je vous invite ici a étudier le système nerveux sous l'aspect anatomique et fonctionel. Vous y apprendrez la structure d'un neurone, d'un nerf et les mécanismes de transmission de l'influx nerveux. merci
Titulaire d'un doctorat en physiologie de la nutrition, ancien chercheur et enseignant en BTS diététique, je vous invite ici à découvrir la cellule et les différentes structures qui la compose ainsi que les tissus en s'attardant sur le tissu osseux. Un autre cours est spécifiquement dédié aux muscles (lisses, squelettiques et cardiaque).
Docteur en physiologie de la nutrition, enseignant en BTS diététique, je vous invite ici à étudier les micro-organismes et leurs rôles dans les toxi-infections mais aussi les méthodes d'études.
Les enquêtes sanitaires effectuées auprès des populations habitant à proximité des installations nucléaires se suivent et se ressemblent : elles ne montrent, parmi ces populations riveraines, aucun excès de cancers ou de leucémies attribuables à la centrale nucléaire ou à l’usine située dans le voisinage. La dernière en date de ces études a été menée en 2013, à l’initiative des Commissions Locales d’Information du département de la Manche – qui compte sur son territoire l’usine de retraitement de La Hague, la centrale nucléaire de Flamanville, le centre de stockage de déchets radioactifs CSM et l’arsenal de Cherbourg spécialisé dans la construction et la maintenance des sous–marins nucléaires. L'étude a pour thème : « L’industrie nucléaire et le risque de cancers dans le département de la Manche ». Elle a été menée par le Registre régional des hémopathies malignes de Basse-Normandie en collaboration avec le Registre général des cancers de la Manche.
Cell division allows organisms to grow and reproduce. In eukaryotes, cell division involves mitosis, which consists of four phases - prophase, metaphase, anaphase, and telophase. During mitosis, duplicated chromosomes properly separate and are distributed into two daughter cells to ensure each cell has the full DNA complement. A loss of control of the cell cycle can lead to uncontrolled cell division and the formation of tumors.
Données actuelles sur la physiopathologie du paludisme à Plasmodium falciparum - Conférence de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Louis PENALI - Institut Pasteur de Côte d'Ivoire - Ip@pasteur.ci
L'anophèle vecteur joue-t-il un rôle "filtre" sur les plasmodies? - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Maeder Muriel Nirina - Suisse - murielnirina@excite.com
Comment s'assurer que les antipaludiques recommandés sont efficaces? - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - TRAORE Oumar Bila - Assistant de recherche - Mali - traoreob@yahoo.fr
Méthode de diagnostic biologique du paludisme - Présentation de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - BY Youlet - Institut Pasteur du Cambodge 5, Bd MONIVONG, BP 983 - Phnom Penh - Royaume du Cambodge - Pharmacien - youlet@pasteur-kh.org
Antigènes parasitaires pour un vaccin bloquant la transmission de Plasmodium - Présentaiton de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - NYEMB Hermine Grace Aurelie - Médecin - Cameroun - nybhgra@yahoo.fr
Les preuves de l'action protectrice des anticorps dans le paludisme - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Grah Worro Elisabeth BEUGRE - Médecin/Chercheur - Institut Pasteur de Côte d'Ivoire - beugregrah@yahoo.fr
Quand et comment changer de politique de traitement aux antipaludiques ? - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Sali DJELE - Médecin - Délégation Provinciale de la Santé Publique - Cameroun - djelesali@yahoo.fr
Différence entre paludisme présumé et cas confirmés - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Peka MALLAYE - Entomologiste médical - Ministère de la santé publique - Tchad - peka_mallaye@yahoo.fr
Le paludisme dans le monde dans 20 ans. Scénario optimiste et scénario pessimiste - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Ousmane BA - Parasitologue/Chercheur - Institut Natinal de Recherches en Santé Publique - Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale - Mauritanie.ba4@caramail.com
Les stades chez le moustique - Présentation de la 1ère édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RADOERIMANANA, Adjoint technique au Service d'Appui à la Recherche, Min. Santé MADAGASCAR
Les structures tridimensionnelles des protéines: comprendre le vivant à l'échelle de l'atome et proposer de nouveaux médicaments par une approche informatique.
Par Alexandre G. de Brevern
Conférence du 9 mars 2011 à l'Institut français d'Oslo. www.france.no
Guide pour le suivi et l'évaluation des programmes - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Luciano TUSEO - World Health Organization / Roll Back Malaria - Office for Madagascar and Reunion - Antananarivo, Madagascar - maloms@iris.mg
Monitoring and Evaluation Toolkit - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Luciano TUSEO - World Health Organization / Roll Back Malaria - Office for Madagascar and Reunion - Antananarivo, Madagascar - maloms@iris.mg
Développement nouveaux médicaments - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Pascal MILLET - Université Victor Segalen Bordeaux2, France - pascal.millet@u-bordeaux2.fr
Diagnostic biologique du paludisme - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Didier MENARD et Vincent THONIER
Guide d’élaboration d’un plan de gestion des achats et des stocks (Global Funds) – (Version C) - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - René CAZETIEN - Sanofi Aventis, Gentilly, France - rene.cazetien@sanofi-aventis.com
Guide d’élaboration d’un plan de gestion des achats et des stocks (Global Fun...
Organisation nucléaire et régulation des activités transcriptionnelles
1. Organisation nucléaire et régulation
des activités transcriptionnelles
Catherine Martin
Université de Manchester
Atelier Paludisme – 7ème édition
Institut Pasteur de Madagascar 7 avril 2009
2. Organisation fonctionnelle du vivant:
compartimentation et activités cellulaires
-les compartiments du cytoplasmecytoplasme sont le siège
des synthsynthèèses de protses de protééinesines (enzymes, hormones,
signaux de transduction…) qui vont par la suite
conférer à la cellule sa spécialisation
-le noyaunoyau comprenant l’ADNADN, support de
l’information génétique, qui va commander le
démarrage des synthèses protéiques
D’après: http://biologienet.free.fr/celltissuoirg.gif
Source:
http://www.fundp.ac.be/sciences/enligne/transition/bi
ologie/images/celluleanimalejack.gif
Chaque cellule est constituée d’un
ensemble de compartiments (organitesorganites)
associés à des fonctions précises:
3. Organisation fonctionnelle du noyau: de l’ADN à la chromatine
Source: http://www.humans.be/images/chromatine2.jpg
Dans le noyau, l’ADN se présente suivant différents niveaux de compactionniveaux de compaction:
- longue molécule en double hélice
fibrefibre d’ADN
- qui va s’enrouler autour de nucléosomes
(« collier de perles »)
chromatinechromatine
- sur lesquels d’autres protéines (facteurs
chromatiniens) vont permettre un niveau de
compaction supérieur
domaines chromatiniensdomaines chromatiniens
4. Organisation fonctionnelle du noyau:
des compartiments pour assurer les activités nucléaires
Les compartiments chromatiniens ont une organisation spatialeorganisation spatiale précise :
-- EuchromatineEuchromatine
riche en gènes, active
-- HHééttéérochromatinerochromatine
pauvre en gènes, silencieuse
Enrichies en facteurs chromatiniens
particuliers, qui leur confèrent un degrés
de compaction +/- important
DynamiquesDynamiques
D’autres compartiments, riches en protéines, sont dédiés aux différents processus de
maturation des ARNs: speckles...
NuclNuclééolesoles: sites de transcription des gènes ribosomiques et d’assemblage des ribosomes.
Source: http://www.euchromatin.com/Lanctot01F1.jpe
5. Organisation fonctionnelle du noyau:
quels outils pour son exploration?
La microscopie optique etmicroscopie optique et éélectroniquelectronique avait déjà permis de visualiser
les deux types de chromatine et le nucléole.
Notamment la microscopie dite « confocaleconfocale » permet de travailler à une résolution de
l’ordre de 100nm sur des échantillons vivants.
Les avancées des dernières
décennies en microscopiemicroscopie àà
fluorescencefluorescence ont permis des analyses
de structure approfondie.
Engouement pour l’étude de
l’organisation du génome.
Source: http://imaginglinux2.omrf.ouhsc.edu/
6. Organisation fonctionnelle du noyau:
quels outils pour son exploration?
D’après Dundr et Misteli, 2001
Cellules FIXEES
Cellules VIVANTES
ImmunoImmuno-fluorescence:
Expression de protprotééine de fusion autoine de fusion auto--fluorescentefluorescente:
Source: www.ens-lyon.fr
7. Organisation fonctionnelle du noyau:
les chromocentres, des compartiments répresseurs
Paques and Grange, 2002
REPRESSION ACTIVATION
Positionnement de gènes « inactifs »
à proximité des chromocentres
compartiments rréépresseurspresseurs
Présence de grands blocs d’hétérochromatine
(correspondant aux centromères) appelés
chromocentreschromocentres
D’après Maison et Almouzni, 2004
8. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec la
mise en route des activités nucléaires dans l’embryon
Comment s’organisent les chromocentres dans un système où les activités
transcriptionnelles, d’abord silencieuses, se mettent progressivement en place?
9. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec la
mise en route des activités nucléaires dans l’embryon
Immunofluorescence pour détecter HP1 (Heterochromatin Protein 1) et des
protéines spécifiques des centromères sur des embryons fixés aux différents
stades de la période préimplantatoire.
10. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec la
mise en route des activités nucléaires dans l’embryon.
Corrélation entre la formation de chromocentresformation de chromocentres et le ddéémarrage de la transcriptionmarrage de la transcription
11. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec la mise en
route des activités nucléaires dans l’embryon: imagerie in vivo
1-cellule 2-cellules
S
blastocyste
F
Remise en culture2
Microinjection
d’un plasmide HP1-GFP
1
Suivi des embryons vivants
au microscope confocal
3
ordinateur
huile
milieu de
culture
0 30min 1h 1h30 2h 2h30
12. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec la mise en
route des activités nucléaires dans l’embryon: imagerie in vivo
Suivi des embryons vivants
au microscope confocal
3
Remise en culture2
1-cellule 2-cellules
S
blastocyste
F
Microinjection
d’un plasmide HP1-GFP
1
imagerie 3D
ordinateur
huile
milieu de
culture
13. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec la
mise en route des activités nucléaires dans l’embryon
L’organisation en chromocentres reflète ll’é’état transcriptionneltat transcriptionnel de la cellule.
Martin et al., 2006
14. From Roberts and Der, Oncogene, 2007
Raf-ERK-MEK MAPK cascade
Regulation of fundamental routes:
proliferation
apoptosis
differentiation
metabolism
cell migration...
Organisation fonctionnelle du génome en relation avec
l’activation des voies de signalisation MAP kinase
Cascade de signalisationCascade de signalisation permettant
le control de nombreux mécanismes
cellulaires ubiquitaires
Comment se comportent les
chromocentres quand cette voie est
suractivée?
noyau
cytoplasme
Milieu
extracellulaire
15. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec
l’activation des voies de signalisation MAP kinase
1- Diminution de la taille du noyau - Élargissement des blocs d’hétérochromatine
2- HP1, normalement exclusivement aux chromocentres (c-à-d aux centromères)
s’étend sur le reste du génome, surtout aux ttéélomlomèèresres
interphase
mitose
16. Organisation fonctionnelle du génome en relation avec
l’activation des voies de signalisation MAP kinase
Les marques d’hétérochromatine reflètent un éétat de difftat de difféérenciationrenciation.
L’activation de la voie de signalisation Raf prévient la cancérisation?
17. Organisation fonctionnelle et dynamique du génome:
mise en évidence d’un nucléosquelette
Un nucléosquelette formé de lamines nucllamines nuclééairesaires serait-il impliqué
dans la dynamique des compartiments?
Étude du rôle des lamines de type B1type B1 sur la dynamique des nuclnuclééolesoles
Source: http://www.euchromatin.com/Lanctot01F1.jpe
18. Organisation fonctionnelle et dynamique du génome:
mise en évidence d’un nucléosquelette
En bloquant l’expression
des lamines de type B1:
Nucléoles déstructurés
Ces effets peuvent être mimés en inhibant la transcriptioninhibant la transcription.
19. Organisation fonctionnelle et dynamique du génome:
mise en évidence d’un nucléosquelette
Double marquage LB1 – nucléole combiné à LB1-GFP
sur des nucléoles isolés biochimiquement (sur gradient densité de sucrose)
Présence d’une fraction de LB1 associée aux nucléoles
20. Organisation fonctionnelle et dynamique du génome:
mise en évidence d’un nucléosquelette
Martin et al., 2009
RRééseau de filamentsseau de filaments contenant LB1 permettant la dynamiquedynamique
et la plasticitplasticitéé des compartiments nucléaires
21. Organisation fonctionnelle du noyau:
quelles perspectives?
Définition de patrons dpatrons d’’organisation en chromatineorganisation en chromatine qui sont en relation avec
ll’é’état transcriptionneltat transcriptionnel de la cellule
(par extension en relation avec l’état de diffdifféérenciationrenciation de la cellule)
L’environnement chromatinien apparaît crucial pour l’expression ou
l’inactivation d’un gène
Les patrons de chromatine sont donc des paramètres qu’il faut maîtriser:
pour développer des outils moléculaires entrant dans le cadre des
ththéérapies grapies gééniquesniques
pour mettre au point des programmes de développement de cellulescellules
souchessouches
Compréhension des mécanismes moléculaires associés aux processus de
canccancéérisationrisation