SlideShare une entreprise Scribd logo
1  sur  21
Identification bactérienne à partir
 d’une culture de 18 à 24 heures

          Antibiogramme

                  TP 3 (DCEM1)
            Section de Microbiologie
       Département des Sciences de Base B
          Faculté de Médecine de Tunis
IDENTIFICATION

   CARACTÈRES:
       1- MORPHOLOGIQUES
       2- CULTURAUX
       3- BIOCHIMIQUES
Caractères culturaux
• Taille et aspect des colonies sur la gélose,
  pigmentation




• L’exigence nutritive des bactéries en culture
Caractères culturaux
    • Hémolyse sur GS

β                   α        γ
Caractères morphologiques
• Etat frais : forme & mobilité

• Coloration de Gram :
  – Forme des bactéries : bacille ou cocci
  – Gram + ou –
  – Mode regroupement (cocci ++)
Caractères biochimiques
• Type respiratoire




• Caractères biochimiques de base



 Catalase (+ Staphylococcus)        Oxydase (BGN)
BGN
           1er test d’identification = cytochrome oxydase

                  Positif                                        Négatif

          -BGN non fermentaires                              -Entérobactéries
            - Vibrio/ Aeromonas                               - Acinetobacter

                                         Type respiratoire

   AAF                  Aerobie strict                   AAF                     Aérobie strict

 Vibrio/Aeromonas        Pseudomonas                   Entérobactéries          Acinetobacter




Identification biochimique
complète : galerie classique ou
système Api
Cocci à Gram positif

                    Test catalase



                                    Négatif
   Positif
                                    Streptocoques
Staphylococcaceae                   Entérocoques
Cocci à Gram positif en amas
                      catalase +
Croissance milieu hypersalé sélectif avec ou sans virage
                   (Milieu Chapmann)

                          Staphylococcaceae

                                     Plusieurs tests

                                     Le plus important : Coagulase



                                      Négatif
    Positif = S. aureus               Staphylocoques à coagulase négative

                                      Galerie d’identification Api Staph
Cocci Gram positif catalase négative

                                                                   Exigent
         Non exigent                               Absence de croissance en milieux hostiles
Croissance en milieux hostiles :
   NaCl 6,5% , bile esculine                                  Hémolyse

                                                                             Béta
                                                         Alpha
         Enterococcus
                                                   Sensibilité à
                                                  l’optochine            Streptocoques groupables
                                                                         A, C, B, G, F …
    Galerie d’identification
         biochimique                S
                               S.pneumoniae           R  Autres
                                                  streptocoques non
                                                      groupables             Sérogroupage
                                                                             de Lancefield

                                              Galerie identification : Api
ETUDE DE LA SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

            ANTIBIOGRAMME
MÉTHODE DE DIFFUSION
                  = Antibiogramme
Conditions standardisées +++
• Milieu de culture (nature et épaisseur) : gélose Mueller Hinton (MH)
• Suspension bactérienne (inoculum)
• Disques d’antibiotiques : concentration d’antibiotique bien déterminée
• Choix des molécules par famille d’antibiotique +++
   Déduire les mécanismes de résistance

 Suivre les Normes proposés par les Comités d’experts

• Ensemencement par écouvillonnage
• Déposer les disques à la surface
• Incuber 18 à 24 h à 37°C
Antibiogramme
                        Culture pure de 24h




    Préparer inoculum
                            Ensemencer par stries serrées dans
                            trois sens en tournant la boîte de 1/3
                            de tour chaque fois
ANTIBIOGRAMME




3cm




         Diffusion de l’antibiotique
Résultat après 24 h à 37°C
ANTIBIOGRAMME
24h incubation 37°C




                      Lecture et interprétation des
                      diamètres d’inhibition: comparer
                      aux valeurs de référence (d et D)
                      S–I-R
Lecture brute : insuffisante
    Parfois ne permet pas d’évaluer correctement la
 sensibilité de certains antibiotiques vis-à-vis de certaines
                    espèces bactériennes




       Tests de dépistage et tests complémentaires


      Lecture interprétative de l’antibiogramme ++

But : rechercher une résistance insuffisamment exprimée
à l’antibiogramme
 Transformé un résultat S en I ou R
 Risque échec thérapeutique
Pneumocoque de sensibilité diminuée aux
             pénicillines : PSDP
                                      PSDP = Résistance croisée entre
                                      les β-lactamines à des degrés
                                      variés




Oxacilline< 26mm



                   Faire CMI β-lactamines
                   E-test +++
β-lactamase à spectre étendue : BLSE
• Essentiellement, les entérobactéries : Klebsiella et E. coli …
• Test double synergie ++
        Image en bouchon de champagne
        Souche R à toutes β-lactamines sauf les céphamycines et les
         carbapénèmes
S. aureus résistant à la méticilline : SARM




  Céfoxitine R
                     Résistance croisée à toutes les
                             β-lactamines
  Oxacilline R
SALLE DE TP
•   20 min :       Présentation du topo à la salle de Staff

•   10 min :       Démonstration aspect des colonies sur différents milieux de culture

•   20 min :       Préparation de l’étalement pour la coloration de Gram
                   Réalisation de la coloration de Gram
                   Lecture au microscope optique (objectif 100)

•   10 min :       Réalisation des tests biochimiques : catalase et oxydase en démonstration

•   10 min :       réalisation d’un antibiogramme : démonstration (10min)

•   20 min :        Démonstration de certains phénotypes de résistances acquises aux
    antibiotiques (20min)
                    PSDP
                    BLSE
                    SARM

Contenu connexe

Tendances

Le controle de qualite au laboratoire
Le controle de qualite au laboratoireLe controle de qualite au laboratoire
Le controle de qualite au laboratoire
S/Abdessemed
 
3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales
3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales
3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales
imlen gan
 
Les technique de protozoaires
Les technique de protozoairesLes technique de protozoaires
Les technique de protozoaires
abir
 

Tendances (20)

Le controle de qualite au laboratoire
Le controle de qualite au laboratoireLe controle de qualite au laboratoire
Le controle de qualite au laboratoire
 
Identification des bactéries "Galerie biohimique "API"
Identification  des bactéries "Galerie biohimique "API"Identification  des bactéries "Galerie biohimique "API"
Identification des bactéries "Galerie biohimique "API"
 
Diagnostic mycologique dr benlaribi imane halima
Diagnostic mycologique  dr benlaribi imane halimaDiagnostic mycologique  dr benlaribi imane halima
Diagnostic mycologique dr benlaribi imane halima
 
Les hemocultures en pratique
Les hemocultures en pratique Les hemocultures en pratique
Les hemocultures en pratique
 
Les endotoxines
Les endotoxinesLes endotoxines
Les endotoxines
 
Toxoplasmose
ToxoplasmoseToxoplasmose
Toxoplasmose
 
Coprologie parasitaire dr benlaribi imane halima
Coprologie parasitaire dr benlaribi imane halimaCoprologie parasitaire dr benlaribi imane halima
Coprologie parasitaire dr benlaribi imane halima
 
Biochimie clinique
Biochimie clinique Biochimie clinique
Biochimie clinique
 
Tout sur la bactériologie
Tout sur la bactériologieTout sur la bactériologie
Tout sur la bactériologie
 
Les streptocoques / Streptococcus / Enterococcus
Les streptocoques / Streptococcus / EnterococcusLes streptocoques / Streptococcus / Enterococcus
Les streptocoques / Streptococcus / Enterococcus
 
Le diagnostic biologique du paludisme par microscopie
Le diagnostic biologique du paludisme par microscopieLe diagnostic biologique du paludisme par microscopie
Le diagnostic biologique du paludisme par microscopie
 
Amibes
AmibesAmibes
Amibes
 
La partique au laboratoire de microbiologie
La partique au laboratoire de microbiologieLa partique au laboratoire de microbiologie
La partique au laboratoire de microbiologie
 
TITRAGE DES ANTICORPS ANTI-STREPTOLYSINE O (ASLO)
TITRAGE DES ANTICORPS ANTI-STREPTOLYSINE O (ASLO) TITRAGE DES ANTICORPS ANTI-STREPTOLYSINE O (ASLO)
TITRAGE DES ANTICORPS ANTI-STREPTOLYSINE O (ASLO)
 
La cellule de malassez
La cellule de malassezLa cellule de malassez
La cellule de malassez
 
Atlas de poche microbiologie
Atlas de poche   microbiologieAtlas de poche   microbiologie
Atlas de poche microbiologie
 
3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales
3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales
3cours les méthodes de diagnostic des pathologies virales
 
conduite a tenir devant un prélèvement de selles en parasitologie
conduite a tenir devant un prélèvement de selles en parasitologieconduite a tenir devant un prélèvement de selles en parasitologie
conduite a tenir devant un prélèvement de selles en parasitologie
 
Les technique de protozoaires
Les technique de protozoairesLes technique de protozoaires
Les technique de protozoaires
 
Techniques de concentration en parasitologie
Techniques de concentration en parasitologieTechniques de concentration en parasitologie
Techniques de concentration en parasitologie
 

En vedette

les moyens d'étude de la croissance microbienne
les moyens d'étude de la croissance microbienneles moyens d'étude de la croissance microbienne
les moyens d'étude de la croissance microbienne
Miraj Microbio
 
cti3-Ploy
cti3-Ploycti3-Ploy
cti3-Ploy
kumanai
 
Filtration
FiltrationFiltration
Filtration
ouffa
 
Biochemical Reaction - Prac. Microbiology
Biochemical Reaction - Prac. MicrobiologyBiochemical Reaction - Prac. Microbiology
Biochemical Reaction - Prac. Microbiology
CU Dentistry 2019
 

En vedette (20)

Rapport de microbiologie
Rapport de microbiologieRapport de microbiologie
Rapport de microbiologie
 
Poster 77 microbiologie
Poster 77 microbiologiePoster 77 microbiologie
Poster 77 microbiologie
 
Cours complet du Dr.Sc.Leunis
Cours complet du Dr.Sc.LeunisCours complet du Dr.Sc.Leunis
Cours complet du Dr.Sc.Leunis
 
Diapo somafaco 2003.
Diapo somafaco 2003.Diapo somafaco 2003.
Diapo somafaco 2003.
 
Api test.........بكتريا عملي
Api test.........بكتريا عملي Api test.........بكتريا عملي
Api test.........بكتريا عملي
 
Livre des cours+tp microbiologie
Livre des cours+tp microbiologieLivre des cours+tp microbiologie
Livre des cours+tp microbiologie
 
les moyens d'étude de la croissance microbienne
les moyens d'étude de la croissance microbienneles moyens d'étude de la croissance microbienne
les moyens d'étude de la croissance microbienne
 
Photothèque:parasitologie
Photothèque:parasitologiePhotothèque:parasitologie
Photothèque:parasitologie
 
Coloration de gram
Coloration de gramColoration de gram
Coloration de gram
 
1 100
1 1001 100
1 100
 
64946 128179-1-pb
64946 128179-1-pb64946 128179-1-pb
64946 128179-1-pb
 
La coloration de gram
La coloration de gramLa coloration de gram
La coloration de gram
 
cti3-Ploy
cti3-Ploycti3-Ploy
cti3-Ploy
 
Canalisation pour eau potable
Canalisation pour eau potableCanalisation pour eau potable
Canalisation pour eau potable
 
Henri Petit
Henri PetitHenri Petit
Henri Petit
 
Analytical Profile Index (API) & Automated Machines
Analytical Profile Index (API) & Automated MachinesAnalytical Profile Index (API) & Automated Machines
Analytical Profile Index (API) & Automated Machines
 
Filtration
FiltrationFiltration
Filtration
 
Api 20 e
Api 20 eApi 20 e
Api 20 e
 
Biochemical Reaction - Prac. Microbiology
Biochemical Reaction - Prac. MicrobiologyBiochemical Reaction - Prac. Microbiology
Biochemical Reaction - Prac. Microbiology
 
Slides examبكتريا عملي
Slides examبكتريا عملي Slides examبكتريا عملي
Slides examبكتريا عملي
 

Similaire à Topo3

Similaire à Topo3 (6)

dutai-grenoble-2021-22-resistances-des-gram-negatif-ycaspar.pdf
dutai-grenoble-2021-22-resistances-des-gram-negatif-ycaspar.pdfdutai-grenoble-2021-22-resistances-des-gram-negatif-ycaspar.pdf
dutai-grenoble-2021-22-resistances-des-gram-negatif-ycaspar.pdf
 
Biologie_moleculaire_CA.pdf
Biologie_moleculaire_CA.pdfBiologie_moleculaire_CA.pdf
Biologie_moleculaire_CA.pdf
 
Antibiothérapie IFSI 2018.pdf
Antibiothérapie IFSI 2018.pdfAntibiothérapie IFSI 2018.pdf
Antibiothérapie IFSI 2018.pdf
 
Cocci gram positif
Cocci   gram positifCocci   gram positif
Cocci gram positif
 
Bacteries anaerobies strictes
Bacteries anaerobies strictesBacteries anaerobies strictes
Bacteries anaerobies strictes
 
Français: Dr. Raymond J. Dattwyler
Français: Dr. Raymond J. DattwylerFrançais: Dr. Raymond J. Dattwyler
Français: Dr. Raymond J. Dattwyler
 

Topo3

  • 1. Identification bactérienne à partir d’une culture de 18 à 24 heures Antibiogramme TP 3 (DCEM1) Section de Microbiologie Département des Sciences de Base B Faculté de Médecine de Tunis
  • 2. IDENTIFICATION CARACTÈRES: 1- MORPHOLOGIQUES 2- CULTURAUX 3- BIOCHIMIQUES
  • 3. Caractères culturaux • Taille et aspect des colonies sur la gélose, pigmentation • L’exigence nutritive des bactéries en culture
  • 4. Caractères culturaux • Hémolyse sur GS β α γ
  • 5. Caractères morphologiques • Etat frais : forme & mobilité • Coloration de Gram : – Forme des bactéries : bacille ou cocci – Gram + ou – – Mode regroupement (cocci ++)
  • 6. Caractères biochimiques • Type respiratoire • Caractères biochimiques de base Catalase (+ Staphylococcus) Oxydase (BGN)
  • 7. BGN 1er test d’identification = cytochrome oxydase Positif Négatif -BGN non fermentaires -Entérobactéries - Vibrio/ Aeromonas - Acinetobacter Type respiratoire AAF Aerobie strict AAF Aérobie strict Vibrio/Aeromonas Pseudomonas Entérobactéries Acinetobacter Identification biochimique complète : galerie classique ou système Api
  • 8. Cocci à Gram positif Test catalase Négatif Positif Streptocoques Staphylococcaceae Entérocoques
  • 9. Cocci à Gram positif en amas catalase + Croissance milieu hypersalé sélectif avec ou sans virage (Milieu Chapmann) Staphylococcaceae Plusieurs tests Le plus important : Coagulase Négatif Positif = S. aureus Staphylocoques à coagulase négative Galerie d’identification Api Staph
  • 10. Cocci Gram positif catalase négative Exigent Non exigent Absence de croissance en milieux hostiles Croissance en milieux hostiles : NaCl 6,5% , bile esculine Hémolyse Béta Alpha Enterococcus Sensibilité à l’optochine Streptocoques groupables A, C, B, G, F … Galerie d’identification biochimique S S.pneumoniae R  Autres streptocoques non groupables Sérogroupage de Lancefield Galerie identification : Api
  • 11. ETUDE DE LA SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES ANTIBIOGRAMME
  • 12. MÉTHODE DE DIFFUSION = Antibiogramme Conditions standardisées +++ • Milieu de culture (nature et épaisseur) : gélose Mueller Hinton (MH) • Suspension bactérienne (inoculum) • Disques d’antibiotiques : concentration d’antibiotique bien déterminée • Choix des molécules par famille d’antibiotique +++  Déduire les mécanismes de résistance  Suivre les Normes proposés par les Comités d’experts • Ensemencement par écouvillonnage • Déposer les disques à la surface • Incuber 18 à 24 h à 37°C
  • 13. Antibiogramme Culture pure de 24h Préparer inoculum Ensemencer par stries serrées dans trois sens en tournant la boîte de 1/3 de tour chaque fois
  • 14. ANTIBIOGRAMME 3cm Diffusion de l’antibiotique
  • 15. Résultat après 24 h à 37°C
  • 16. ANTIBIOGRAMME 24h incubation 37°C Lecture et interprétation des diamètres d’inhibition: comparer aux valeurs de référence (d et D) S–I-R
  • 17. Lecture brute : insuffisante Parfois ne permet pas d’évaluer correctement la sensibilité de certains antibiotiques vis-à-vis de certaines espèces bactériennes Tests de dépistage et tests complémentaires Lecture interprétative de l’antibiogramme ++ But : rechercher une résistance insuffisamment exprimée à l’antibiogramme  Transformé un résultat S en I ou R  Risque échec thérapeutique
  • 18. Pneumocoque de sensibilité diminuée aux pénicillines : PSDP PSDP = Résistance croisée entre les β-lactamines à des degrés variés Oxacilline< 26mm Faire CMI β-lactamines E-test +++
  • 19. β-lactamase à spectre étendue : BLSE • Essentiellement, les entérobactéries : Klebsiella et E. coli … • Test double synergie ++  Image en bouchon de champagne  Souche R à toutes β-lactamines sauf les céphamycines et les carbapénèmes
  • 20. S. aureus résistant à la méticilline : SARM Céfoxitine R Résistance croisée à toutes les β-lactamines Oxacilline R
  • 21. SALLE DE TP • 20 min : Présentation du topo à la salle de Staff • 10 min : Démonstration aspect des colonies sur différents milieux de culture • 20 min : Préparation de l’étalement pour la coloration de Gram Réalisation de la coloration de Gram Lecture au microscope optique (objectif 100) • 10 min : Réalisation des tests biochimiques : catalase et oxydase en démonstration • 10 min : réalisation d’un antibiogramme : démonstration (10min) • 20 min : Démonstration de certains phénotypes de résistances acquises aux antibiotiques (20min) PSDP BLSE SARM