De nos jours le diabète représente un grand problème de santé publique. Il s’agit d’une maladie métabolique complexe due à des causes multifactorielles mettant en œuvre des facteurs génétiques et environnementaux, Le diabète est caractérisé par une hyperglycémie chronique qui à long terme entraine des complications organiques dégénératives graves, Une hyperglycémie chronique: un défaut de la sécrétion de l’insuline, ou de son action sur ses cellules cibles, ou bien de la combinaison de ces deux anomalies, Ce problème est encore plus grave quand on voit sa prévalence qui croit de façon alarmante, Sa prévalence à l’échelle nationale et internationale est en croissance alarmante laissant penser à une pandémie mondiale. le syndrome métabolique : Ce syndrome entraine des complications graves , il augmente le risque des cardiopathies et du diabète type 2. Il provoque des maladies rénales et hépatiques, le syndrome des ovaires polykistiques, ainsi que des maladies neurodégénératives tel que l’Alzheimer et même le cancer.
Science Ensemble : La boutique des Sciences de l'Institut Pasteur de Tunis
Fête de la Science : Les maladies métaboliques chroniques en Tunisie: une épidémie ?
1. Recherche et formation
Les maladies métaboliques chroniques en
Tunisie: une épidémie?
Institut de nutrition de
Tunis
Dr Rym KEFI
Maître assistante universitaire (PhD, HDR)
Laboratoire de Génomique Biomédicale et Oncogénétique
Institut Pasteur de Tunis
Mr Hamza DALLALI
Etudiant en thèse
3. Recherche et formation
Transition épidémiologique
Contexte actuel
Des maladies infectieuses
Des maladies non transmissibles
(diabète, hypertension artérielle, dyslipidémie,
maladies cardiovasculaires et cancers)
4. Recherche et formation
Une hyperglycémie chronique:
un défaut de la sécrétion de l’insuline
ou de son action sur ses cellules cibles
ou bien de la combinaison de ces deux anomalies
5. Recherche et formation
Diabète
Diabète MODY
Diabète gestationnel
Diabète
mitochondrial
2-5%
Diabète de type
2
90-95%
Diabète de
type 1
5-10%
Les types du diabète
6. Recherche et formation
Selon les critères de l’OMS et l’IDF:
Glycémie à jeun ≥ 1,26 g/l (7 mmol/l)
Glycémie post-prandiale ≥ 2 g/l (11,1 mmol/l)).
10. Recherche et formation
Dans le monde, plus de 5,1 millions de décès par an sont dus au
diabète!
soit 14 000 morts par jour
1 mort toutes les 7 secondes !
Fédération internationale de diabète, 2015
14. Recherche et formation
• Composante
environnementale
• Composante génétique
Incidence nettement plus élevée chez
les individus ayant des antécédents
familiaux
14
Maladie multifactorielle
Syndrome métabolique
16. Recherche et formation
16
Continent Pays
Prévalence totale
(%)
Auteurs (Année)
Afrique du Nord
Tunisie 30.0 (Belfki et al., 2013)
Algérie 5.8
(Thanopoulou et al.,
2006)
Maroc 12,8 (van Vliet et al., 2009)
Amérique
Venezuela 26.6 (Florez et al., 2005)
Mexique 26.6
(Aguilar-Salinas et al.,
2004)
Etats unis 23.7 (Ford et al., 2002)
Asie
Iran 23.7 (Sharifi et al., 2009)
Turquie 32.8 (Onat et al., 2002)
Inde 18.3 (Deepa et al., 2007)
Inde 31.6 (Gupta et al., 2004)
Singapour 13.2 (Heng et al., 2006)
Japon 13 (Ishizaka et al., 2005)
Chine 7.3 (Lao et al., 2012)
Europe
Croatie 34 (Kolcic et al., 2006)
Espagne 26.5 (Lorenzo et al., 2003)
Pays bas 25.5 (Dekker et al., 2005)
Grèce 24.5 (Athyros et al., 2005)
Portugal 27.5 (Fiuza et al., 2008)
Italie 22.2 (Miccoli et al., 2005)
Prévalence
17. Recherche et formation
New Partnership for Africa’s Development (NEPAD)
North Africa Biosciences Network (NABNet)
http://www.nrc.sci.eg/nepad/default.html
TUNISIA
MAURITANIA
ALGERIA
MOROCCO
“lnvestigation multidisciplinaire des facteurs génétiques
à risque pour le diabète de type II et ses complications
en Afrique du Nord »
Collaboration régionale
2008-2011
18. Recherche et formation
Identification: MEDIGENE – FP7-279171-1
Titre: « les facteurs génétiques et environnementaux du
syndrome métabolique et ses complications chez les
populations méditerranéennes»
Durée: 4 ans et demi (Janvier 2012-2015; prolongation
Juillet 2016)
18
21. Recherche et formation
Approche: étude d’association
Le variant génétique est-il plus fréquent chez les sujets malades
que chez les témoins?
22. Recherche et formation
Les variants du gène KCNJ11 (ATP-sensitive potassium) et
IGF2BP2 (Insulin Like Growth Factor 2 mRNA Binding Protein 2)
augmente le risque de DT2 en Tunisie et en Mauritanie
Facteur de 2 à 3,6 le risque de DT2
Résultats (DT2)
Le variant rs7756992 du gène CDKAL1 (CDK5 Regulatory Subunit
Associated Protein 1 Like) possède un rôle protecteur contre la
néphropathie diabétique (OR = 0.44, 95% CI = 0.27–0.73, P = 0.001)
24. Recherche et formation
24
L’haplotype GCA (rs1421085 A>G -rs 8057044 T>C -
rs9939609 T>A ) du gène FTO, est associé avec un risque élevé
de développer un Smet (OR = 3,81; 95% CI = 0,987-9,86; p = 0,
015)
L’haplotype GCA est associé à des valeurs élevées de GAJ, PAS,
TG.
Différence entre les hommes et les femmes
Association des variants du gène FTO (Fat mass and obesity
associated) avec Smet.
Le genotype TA du rs9939609 augmente d’un facteur de 1,5
(OR = 1,54; 95% CI =1,11 – 2,14; p = 0.009)
Résultats (Smet)
27. Recherche et formation
MODY: c’est quoi?
• Une forme atypique de diabète survenant dés l’enfance ou
l’adolescence
Diabète de type adulte chez le jeune= Maturity Onset Diabetes
of the Young.
• Une forme monogénique du diabète de type 2.
• Une prévalence estimée à 2% des cas diabétiques type 2.
La prévalence exacte de MODY est
sous-estimée
Présence de signes cliniques communs à ceux
des deux types majeurs du diabète
28. Recherche et formation
MODY: Hétérogénéité clinique et
génétiqueType Gène atteint Fréquence
relative
Age au diagnostic Traitement Complications
du diabète
MODY 1 HNF4A 5% Jeunes adultes Régime, sulfonylurées,
insuline
Fréquents
MODY 2 GCK 20-50% Enfants Régime, activité physique Rares
MODY 3 HNF1A 20-50% Enfants Régime, sulfonylurées,
insuline
Fréquents
MODY 4 PDX1 <1% Nouveaux nés,
enfants
Antidiabétiques oraux,
insuline
?
MODY 5 HNF1B 5% Jeunes adultes Antidiabétiques oraux,
insuline
Rénales
MODY 6 NEUROD1 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 7 KLF11 très rare Jeunes adultes ? DT2
MODY 8 CEL très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 9 PAX4 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 10 INS très rare Jeunes adultes Antidiabétiques oraux,
insuline
?
MODY 11 BLK très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 12 ABCC8 très rare Jeunes adultes , sulfonylurées ?
MODY 13 KCNJ11 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 14 APPL1 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY X ? ? ? ? ?
29. Recherche et formation
Existence d'une hyperglycémie
permanente
< 25 ans
Forte hérédité familiale
Mode autosomique dominant
Une indépendance à l’insuline, au
moins durant les premières années de
la maladie.
Pas d'acidocétose
Absence d'autoanticorps
pancréatiques
Le diagnostic du Diabète MODY
31. Recherche et formation
12 jeunes tunisiens
atteints du diabète
familial non auto-
immun
La recherche des
mutations dans 6
gènes de MODY
Identification de la
mutation causale chez
uniquement un patient
au niveau du gène
HNF4A
32. Recherche et formation
Projet:
Etude épidémiologique et génétique des formes
atypiques du diabète en Tunisie : le MODY
Coordinateur principal: Dr Rym KEFI
Une étude pluridisciplinaire impliquant plusieurs partenaires:
L’institut de nutrition de Tunis
Le laboratoire de biochimie à l’IPT
Le laboratoire d’immunologie clinique à l’IPT
Collaborateurs étrangers pour l’application du NGS à des
patients tunisiens cliniquement suspectés MODY.
Implication de référents en statistique et en bioinformatique.
33. Recherche et formation
Objectif du projet
Améliorer le diagnostic du diabète de type MODY en Tunisie
Le diagnostic clinique Le diagnostic moléculaire.
Mise en place d’un calculateur prédictif
34. Recherche et formation
collecte des
données
cliniques,
généalogique
s
Investigati
on
moléculair
e par
séquençag
e à Haut
Débit
Intégration
et analyse
des
données
Identificati
on des
mutations
causales
et
validation
du
calculateu
r prédictif
Déterminatio
n
de la sous
classe de
MODY
Patient
Prescription
du traitement
adéquat
35. Recherche et formation
Identification de biomarqueurs pour le diabète de
type 2 à travers des investigations pluridisciplinaires
Nouveau projet
Etude génétique
Etude du stress oxydant
Etude de la flore intestinale
Janvier 2018
Coordinatrice : Dr Rym KEFI
De nos jours le diabète représente un grand problème de santé publique. Il s’agit d’une maladie métabolique complexe due à des causes multifactorielles mettant en œuvre des facteurs génétiques et environnementaux
Le diabète est caractérisé par une hyperglycémie chronique qui à long terme entraine des complications organiques dégénératives graves
Ce prb est encore plus grave quand on voit sa prévalence qui croit de facon alarmante, Sa prévalence à l’échelle nationale et internationale est en croissance alarmante laissant penser à une pandémie mondiale
Ces complications graves vont conduire à l’invalidité et au décès
Metabolic syndrome (MetS) is a complex diseases characterised by multiple metabolic abnormalities including central obesity, hypertension, dyslipidemia and insulin resistance. Mets leads to CV disorders and T2D
Sposition à ce syndrome La prédcomposante environnementale se manifestant par une alimentation non saine riche en sucre et en graisse accompagnée d’un manque d’activité physique. une composante génétique justifiée par une incidence nettement plus élevée de ce syndrome chez les individus ayant des antécédents familiaux.
Ce syndrome émergent entraine des complications graves , il augmente le risque des cardiopathies et du diabète type 2. Il provoque des maladies rénales et hépatiques , le syndrome des ovaires polykistiques , ainsii que des maladies neurodegeneratives tel que l’alzeihmer et même le cancer.
Selon certaines études épidémiologiques, la prévalence actuelle du Smet dans le monde se situerait autour de 20 à 30% de la population adulte. Le Smet est considéré de nos jours comme un problème majeur de santé publique
T2D is a multifactorial disease depending on complex interactions between environmental and genetic factors. Recent advances in defining the genetic basis of T2D have been achieved thanks to huge international consortia using post genomic high throughput genotyping platforms. Unfortunately, this type of investigation is still not possible in North Africa, not only because of the lack of the adequate infrastructure but also because of the high fragmentation of the research activity. This project is the establishment of a multidisciplinary and multi institutional approach in North Africa (especially Tunisia, Morocco, Algeria and Mauritania) in order to Identify the genetic basis of type II diabetes and its complications in North African Population.
International cooperation is a unique opportunity to develop local competencies and build capacities in new disciplines in particular genomics and bioinformatics.
SNP rs7756992 et rs4402960 localisés respectivement au niveau des gènes CDKAL1 et IGF2BP2 st la probabilité d'obtenir la même valeur (ou une valeur encore plus extrême) du test si l'hypothèse nulle était vraie.
Le variant rs4402960 du, augmente le rique de DT2
(OR = 1.86, 95% CI = 1.34–2.58, P < 10−4)
L’association du polymorphisme rs9939609 avec des valeurs de glycémie à jeun plus élevé
Existence d’au moins 14 sous-classes.
Plusieurs cas diabétiques ne sont pas encore classés
Chaque sous classe est définie en se basant sur le gène causal impliqué dans la maladie.
est évoqué devant Existence d'une hyperglycémie permanente
chez une personne de moins de 25 ans ayant une forte hérédité familiale.
Hyperglycémie souvent asymptomatique de découverte fortuite
En 2011, Shields et al ont établi un calculateur prédictif, déterminant la probabilité pour qu’un patient diabétique soit de type MODY. Ce calculateur, basé sur un modèle de régression logistique, utilise des paramètres cliniques tels que l’âge au diagnostic, le sexe, le traitement actuel (insuline ou antidiabétiques oraux ), le BMI, l’HBA1c (Shields et al 2011). Ce modèle améliore la sensibilité du diagnostic du diabète de type MODY qui peut dépasser les 90%. Cependant ce calculateur de probabilité a été conçu sur la base d’une population caucasienne de moins de 35 ans, son rendement pourra être donc variable en fonction de l’origine ethnique.