Une réflexion partagée dans le cadre de la semaine du Libre Accès au Sénégal, octobre 2015

1. L’Open Source dans la dynamique
de l’Open Access
&
de l’Open Science
Antonin Benoît Diouf
Conservateur des bibliothèques, IDEP
OPEN ACCESS WEEK 2015-SENEGAL : journée du libre accès à l’UCAD
Dakar, Mercredi 21 octobre 2015

2. Plan
• Définitions et concepts
– Open Source
– Open Access
– Open Science
• Open Source & Open Access
• Open Source et Open Science
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3. Open Source
• Notion de code source : qui est la version d’un programme qui est lisible
et intelligible pour l’homme. C’est le code source qui est écrit par
l’informaticien, le programmeur, et qui pourra être relu et modifié par
d’autres. Les programmes peuvent ensuite être compilés, ce qui produit le
code objet, ou binaire, ou encore exécutable, qui lui n’est pas
compréhensible par l’homme, seul l’ordinateur le comprend (c’est ce code
exécutable qui est vendu quand il s’agit d’un logiciel propriétaire).
• Un logiciel libre, ou logiciel open source, est un programme dont le code
source est distribué et peut être utilisé, copié, étudié, modifié et
redistribué sans restriction.
 Attention : lorsque le code source est disponible, il n’est pas toujours
autorisé de le modifier. Ce sont les termes de la licence, concédée par
l’auteur ou le détenteur des droits, qui précisent s’il est permis ou non de
modifier le code, de le réutiliser, de le redistribuer, et sous quelles
conditions.
 Licences : 2 grandes familles GNU/GPL et BSD (respectivement : GNU
General Public License et Berkeley Software Distribution)
3
Source : Comprendre l’Open Source et les logiciels libres : histoire, philosophie, licences, support, marchés, modèles économiques, modèles de
développement / Smile. Open source solutions, 2012

4. Open Source
• Logiciel libre est la juste traduction française de free software,
l’appellation lancée par Richard Stallman et défendue par la Free
Software Foundation, la FSF dont il est le père en 1985.
• Open source est l’appellation de l’Open Source Initiative, qui édicte sur le
site http://opensource.org les conditions que doit satisfaire une licence
pour se dire open source.
• Le logiciel libre est défini par quatre libertés fondamentales : exécuter le
programme, l’étudier, l’adapter, le redistribuer. Il faut souligner que le libre
accès au code source est simplement rendu nécessaire par ces libertés
fondamentales, et non une fin en soi.
• Le logiciel open source se définit par les 10 articles de l’open source
definition. (Diapo suivante)
• Les deux appellations sont presque équivalentes, mais correspondent à
des écoles de pensées différentes. Aucune n’acceptant d’être englobée
par l’autre, les américains utilisent parfois le terme de FOSS pour « Free
and Open Source Software », ou encore FLOSS pour « Free/Libre and Open
Source Software (retenu par l’UE officiellement)».
• Pour nous ce sera tout simplement OPEN SOURCE 
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5. Open source definition
• La définition établie par Open Source Initiative comporte
dix points, dont les trois premiers sont les principaux :
 Libre redistribution : la licence ne doit pas interdire à qui
que ce soit de vendre ou donner le programme.
 Code source : la licence doit permettre la distribution sous
forme de code source, et si le code source n’accompagne
pas le programme il doit être disponible de manière facile
et pratiquement gratuite.
 Travaux dérivés : la licence doit permettre des
modifications et des travaux dérivés, et doit permettre que
ces travaux soient distribués sous les mêmes termes de
licence.
• Liste complète : http://opensource.org/definition
5

6. De l’importance du code source
• En Sciences, le patrimoine est entièrement dans le savoir, en informatique, il y a deux
patrimoines : la connaissance d’une part, le code source d’autre part. La connaissance
progresse lentement et il y a peu de savoirs fondamentaux pour bâtir de nouveaux logiciels
qui étaient inconnus il y a 15 ans. Si l’informatique progresse, c’est plus par le patrimoine de
code source que par la connaissance, c’est-à-dire que l’on peut s’appuyer aujourd’hui sur un
immense socle de code source.
• Dans les premiers temps, les informaticiens devaient tout créer, pratiquement pour chaque
programme. Puis, les systèmes d’exploitation (DOS, Windows, etc.) ont amené un premier
niveau de socle, qui est devenu plus sophistiqué au fil des années, et les langages de haut
niveau ont amené des bibliothèques de plus en plus riches.
• Sur ce socle élémentaire, ont été ajoutés différents socles de développement, des
frameworks, qui constituent une seconde couche. Il y a aussi une quantité de composants de
haut niveau, qui peuvent être assemblés pour construire des applications nouvelles. Au total,
90% du code déroulé dans ces applications sera issu, soit du système d’exploitation, soit des
frameworks, soit des composants. Et les informaticiens actuels ne développent réellement
que les 10% de valeur ajoutée spécifique.
 C’est un constat important : l’informatique progresse essentiellement parce que le socle de
code qui constitue notre patrimoine s’agrandit.
 En savoir plus sur les logiciels libres : https://aful.org/ressources/logiciel-libre
6

7. Open Access
• Le libre accès consiste à fournir à tous un accès libre à des informations scientifiques (articles
scientifiques et données de la recherche) revues par des pairs.
• Il prévoit que le détenteur des droits accorde, dans le monde entier, un droit irrévocable
d’accès permettant de copier, d’utiliser, de diffuser, de transmettre et de produire des
travaux dérivés sous toute forme et pour toute activité licite en mentionnant dûment l’auteur
initial.
• Le libre accès utilise les technologies de l’information et de la communication (TIC) pour
accroître et améliorer la diffusion des travaux de recherche.
• Le concept conjugue liberté (gratuité et liberté d’expression), flexibilité (choix des options de
licence et des modèles économiques) et équité (envers le créateur/l’auteur et la société).
• La hausse du prix des abonnements aux revues a été un élément majeur dans l’essor du
mouvement du libre accès.
• L’apparition de la numérisation et d’Internet ont démultiplié les possibilités de rendre
l’information disponible à tous, partout, à tout moment et dans n’importe quel format.
• Pour que cela soit possible, la société civile a adopté plusieurs déclarations, souvent
désignées par le sigle « 3B » : l’Initiative de Budapest pour le libre accès (2002), la
Déclaration de Bethesda pour l’édition en libre accès (juin 2003) et la Déclaration de Berlin
sur le libre accès à la connaissance en sciences exactes, sciences de la vie, sciences humaines
(octobre 2003).
7Source : « Libre accès à l’information et à la recherche scientifiques » : brochure / Unesco

8. 8Source : « Libre accès à l’information et à la recherche scientifiques » : brochure / Unesco

9. Accès libre vs Modèle classique de diffusion
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10. Open Science
• Science ouverte à tous, décloisonnée, vulgarisée, en un mot casser
l’ésotérisme de la Science (telle qu’elle a été conçue par des générations
de scientifiques).
• La science est faite pour tout le monde toute découverte scientifique
profite à l’humanité qui applique les résultats de la Science mais on ne lui
explique pas la substance de toute découverte scientifique, les processus,
les procédés, contenus dans les publications ou exposés dans des
conférences qui ne concernent que des « initiés » de la discipline
• Une initiation scientifique cloisonnée qui rend difficile l’interdisciplinarité
et qu’il faut casser
 Le partage et l'échange de données entre chercheurs étaient censés
révolutionner la science. Mais, pour le moment, la mise en commun des
découvertes reste très théorique
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11. Open Science
• La science ouverte est une nouvelle façon de construire et de diffuser le savoir scientifique.
• Orientée vers l'idéal du libre partage des connaissances, du travail collaboratif, de la justice
cognitive, du rapprochement entre la science et la société, bref de la science comme «
patrimoine commun de l’humanité», elle regroupe des pratiques variées et parfois
hétérogènes qui vont du libre accès aux publications scientifiques (par le biais des revues ou
des dépôts institutionnels) à la recherche-action participative et à la démocratie scientifique,
en passant par la création des lieux alternatifs de recherche (tels les laboratoires vivants, les
laboratoires ouverts et les boutiques de sciences), l'ouverture et le partage des données de
recherche et bibliographiques, l'écriture scientifique collaborative, le recours au web 2.0 et
aux réseaux sociaux pour valoriser les recherches, l'intérêt pour les savoirs locaux, les
sciences citoyennes et participatives, la critique des pratiques conventionnelles d'évaluation
par les pairs et la priorité accordée aux logiciels libres et aux licences ouvertes
• C'est une science qui s'ouvre aux savoirs non scientifiques (traditionnels indigènes, locaux,
politiques, quotidiens, hétérodoxes etc.) au lieu de les mépriser ou de les ignorer.
• C'est une science qui s'ouvre à la contribution des non-scientifiques à la recherche, que ce
soit dans la collecte des données de première main ou la définition du projet de recherche.
C'est une science qui donne universellement accès à ses textes et à ses données de
recherche, dans tous les pays du monde et sans barrière financière, et qui favorise leur
réutilisation au service du bien commun (F. Piron).
11

12. Open Source / Open Access
• Cette relation est surtout caractérisée par la
mise à disposition de contenus numériques
sous la forme d’archives ouvertes et dépôts
institutionnels, de bibliothèques numériques
classiques, de revues et publications en accès
libre et via des logiciels libres
• C’est aussi sous forme de Plateformes de
partage de contenus
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13. Archives ouvertes/Dépôts institutionnels
13

14. Bibliothèques numériques
14

15. Edition de revues scientifiques
15

16. Plateforme collective de partage de contenus
16

17. Outil multifonctions
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18. Plusieurs plages de convergence
• Recherche collaborative (une des briques de la
Science ouverte) & Intelligence collective
• Gestion des références bibliographiques
• Logiciels systèmes
• Enseignement
Open Source / Open Science
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19. Collaboration scientifique
La gestion des projets scientifiques dans le Cloud (collaboration scientifique simplifié)
L'OSF est un service Open-source du Centre pour la science ouverte. Avec comme leitmotiv
l’alignement des pratiques scientifiques avec des valeurs scientifiques en améliorant la
transparence, l'intégrité et la reproductibilité de la recherche
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20. Collaboration scientifique
OpenStack est un ensemble de logiciels open source permettant
de déployer des infrastructures de cloud computing (informatique
en nuage), ce qui ouvre la porte à des possibilités de collaboration
scientifique intra-universitaire ou interuniversitaire.
20

21. Intelligence collective
Le projet Open Source Paludisme tente une approche différente pour guérir le
paludisme. Guidé par les principes de l'open source, tout est ouvert et tout le
monde peut contribuer.
21

22. Références bibliographiques et Citations
22

23. Logiciels système
Fedora Scientific cible ceux qui utilisent Linux pour leur calcul scientifique. Ces
utilisateurs incluent les étudiants et les chercheurs dont le travail implique des expériences
numériques, la préparation de leurs résultats, la rédaction de rapports de recherche et leur
présentation. Fedora scientifique vise à être utile dans toutes les phases du pipeline de
recherche.
C’est une distribution Linux spécialement conçue pour permettre la Science ouverte 23

24. Logiciels système
Ecosystème de logiciels Open source en langage Python pour les
mathématiques, sciences fondamentales et sciences de l’ingénieur
24

25. Enseignement
OSP fournit plusieurs applications générales pour l'enseignement de la
physique, les activités des étudiants et la délivrance des programmes. 25

26. Conclusion
Sous forme de
plaidoyer
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27. TEXTE
MERCI DE
VOTRE
ATTENTION
BINAIRE
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AntoninBenoîtDIOUF