Méthodologies de la Recherche Médicale et Chirurgicale. DIU Nancy-Wuhan. Introduction à l'IST.

1. UE ISSM 7.309
Méthodologies de la recherche
médicale et chirurgicale
GC Faure 10/10/2019
Faculté de Médecine et CHU Brabois
Laboratoire d’Immunologie
Ancien Chargé de mission à la documentation UHP
Ancien responsable de la recherche clinique au CHU
Ex Maître-Toile du site de l’ASSIM
Curateur avec Scoop.it

2. Quelques questions avant de
commencer:
une feuille, votre nom, année, cycle
• Quels outils de recherche d’information
utilisez vous actuellement?
• Sur quel réseau social êtes-vous?
• Quelles « bases de données » connaissez
vous?
• Quels journaux lisez vous régulièrement ?
– Vulgarisation
– Scientifiques et Médicaux
• Qu’est ce qu’un curateur?
• Qu’est ce que SCI-HUB?

3. Filière Médicale Francophone
Nancy-Wuhan
 Depuis 2008
 Un nouveau diplôme
universitaire (DIU) associant
Nancy et Wuhan

4. Diplôme d’Université (DU/DIU)
 Méthodologies de la recherche
médicale et chirurgicale
 Intégré dans le cursus de Master UE 7.309
 Objectifs:
 Acquérir ou conforter les connaissances de base
des méthodologies utiles à la pratique de la
recherche médicale

5. DU: Thèmes abordés
Eléments de base
 Information scientifique et Techniques de
communication
Bases de données, publications, projets de
recherche, recherche clinique
 Méthodes en biologie moléculaire, génomique,
protéomique
ADN, ARN, gènes, protéines…
 Méthodes en biologie cellulaire, d’organes et
d’organisme
Isolement, imagerie, cellulaire, de tissus, modèles
animaux

6. DU: Illustration par le biais de
projets en cours à Nancy
 Eléments applicatifs
 Applications en recherche médicale
Hémato-oncologie, Nutrition,
Pathologies du vieillissement
(cardiovasculaire, articulaire)
Pathologies inflammatoires aigues et
chroniques
 Applications en recherche chirurgicale
Chirurgie robotique, coeliochirurgie,
microchirurgie
Greffes et transplantations
 Applications dans les biothérapies
Thérapies cellulaire et génique
Thérapies moléculaires innovantes

7. Programme 2020 (1)
 Jeudi 10 octobre : Salle ED 11
 14h - 18h : Introduction à l'enseignement et IST en
recherche médicale et chirurgicale (G. Faure)
 Jeudi 17 octobre : Salle ED 11
 14h - 16h : Méthodes d'étude des réflexes et
sensations respiratoires (S Demoulin)
 16h - 18h : Méthodes de la recherche
pharmacologique (E Pape)
 Jeudi 24 octobre : Salle ED 09 puis ED16
 14h - 16h : Génomique et transcriptomique
fonctionnelle (C. Nemos)
 16h - 18h : Désordres génomiques chez l'homme: de
la maladie monogénique au syndrome (C. Nemos)

8. Programme 2020 (2)
 Jeudi 7 novembre : Salle ED 16
 14h - 16h : Cytomique (M. De Carvalho)
 16h - 18h : Techniques d'études des modifications
épigénétiques (F. Namour)
 Jeudi 14 novembre : Salle ED 14
 14h - 16h : Recherche chirurgicale (N Tran)
 16h - 18h : Recherche clinique (P Rossignol)
 Jeudi 21 novembre : Salle ED 16
 14h - 16h : Recherche en imagerie (Chen
Bailiang)
 16h -18h : Méthodes en Recherche chirurgicale (P
Gallet)

9. Examen 5 décembre salle?
 4 questions ouvertes et courtes 4x4
points
 Active learning 4 points
 Curation d’un sujet médical et/ou
biologique
 Scoop.it gratuit
 https://www.scoop.it/pricing
 1 sujet, 50 posts maximum

10. Chercher et trouver
 Des exemples, des méthodes
 Quelles recherches
 Recherche Médicale
 Recherche Chirurgicale
 Recherche Clinique
 Recherche Biologique
 Recherche Imagerie

11. Où fait-on de la recherche?
 Universités, Facultés, UFRs
 EPST (Inserm, CNRS, INRA, Inria…)
 EA (AERES)
 CHUs
 CIC, CEC, CIT, CICancer, CIB
 CRB, Thèques…
 Cancéropôles
 Industrie
 Laboratoires Pharmaceutiques
 Laboratoires Biotechnologies, Imagerie

12. Qui soutient la recherche?
 Les états
 Les organismes publics
 Les Ministères (Recherche, Enseignement
supérieur, Industrie, Innovation)
 Les Régions
 L’Europe
 Les organismes privés
 Industrie
 Associations charitables
 Ligue, ARC, x Associations, Charities

13. Que fait-on en recherche médicale
et chirurgicale?
 Faire des expériences?
 Faire des manipulations?
 Travailler dans un laboratoire?
 Travailler avec des animaux?
 Travailler avec des patients?
 Travailler dans un service hospitalier?
 Recueillir des données et faire des
statistiques?
 Lire et écrire

14. Recent Evolutions and Concerns
INFOBESITY
• Too much information is killing information...
• and Knowledge
– Surinformation, Pollution informationnelle,
– Harcèlement textuel
• Networking
– From individuals and communities of interest
– To (social) networks

15. Research skills
 Autodidacte!
 “Research Tools” can be defined as
vehicles that broadly facilitate
research and related activities….
enable researchers to collect,
organize, analyze, visualize and
publicized research outputs….
 https://figshare.com/articles/Research_Skills_Session_1
_Introduction/9931163/1

16. Scholarly communication 2019

17. Information Literacies
 https://www.sciencemag.org/careers/2016/11/how-keep-
scientific-literature?r3f_986=https://t.co/GwBA573G7x

18. Researcher development framework UK2018
information literacy

19. Lire… et écrire
 Accéder à l’information
 Papier ou numérique
 Centres de documentation, bibliothèques,
 En ligne, via internet
 Sélectionner l’information
 Stocker l’information
 Utiliser l’information

20. Forbes
http://www.forbes.com/sites/chrisperry/2011/10/27/do-
organizations-need-a-chief-content-officer/Trop d'information....
 YouTube users upload two days of video every
minute. They receive up to 3 billion views per day.
 Twitter users generate over 2 million daily tweets.
2,200 new tweets every second.
 The average Facebook user creates 90 pieces of
content each month. More than 30 billion pieces
are shared monthly, an average over 7 billion a
week.
 Google takes in over 8.5 billion monthly search
queries to find relevance in it all.

21. Information scientifique et
technique:
Matière première
du médecin, du scientifique, du malade,
du consommateur
Produit fini
du médecin, du scientifique, du
chercheur
Produit à haute valeur ajoutée
Produit à valeur stratégique

22. L'IST: une espèce vivante
ou des populations cellulaires
 ..démographie galopante
 Ou prolifération
 ..inégalités géographiques et socio-
culturelles
 Ou hétérogénéité, sélection
 ..Histoire et oubli
 Ou Mémoire (immunitaire-
neurologique) et apoptose, mort

23. Pourquoi un immunologiste
intéressé par l'IST
 SCICOM « CD-ROM ».SCICOM 2
 Mission Ministère Recherche
 Mission à la Doc UHP
 Contacts Liège, UGR, Lausanne...
 Publications, Livres...
 UEMS, EACCME: e-learning
 Site ASSIM, Blogs, Linkedin,
Scoop-it

24. Selon vos besoins, variables
selon votre développement
• Recherche fondamentale et clinique
• Etudes de Médecine, Préparation à
l'internat
– UMVF
• FMC (CME), DPC (CPD)
• E-Learning
• Concept de portfolio

25. Un peu d ’histoire
 L ’information scientifique
et technique
 un phénomène récent, un siècle environ
 du « savant fou »... aux équipes
pléthoriques
 de la monographie,
 à la publication avec plusieurs centaines
d ’auteurs
 Quel futur au 3ème millénaire?

26. Histoire: depuis 350 ans
• Depuis...le XVIIème siècle
 Philosophical transactions (Royal
Society)
 Le journal des scavans 1665
• XVIIIème: Encyclopédie France
• XIXème: Allemagne
• XXème: USA
• XXIème: ???

27. Circulation de l’information
scientifique
 Analogue au circuit de l’eau dans la
nature
 les récepteurs reçoivent l’information
sous forme variée, pluie, neige, grêle...
 les émetteurs produisent de
l’information…
 celle-ci s’accumule dans des réservoirs,
mer, lacs, neiges éternelles, glaciers
 les conservateurs stockent l ’information

28. Le Circuit de l'eau

29. En images
MASSE d'information en croissance exponentielle
INTERNATIONALISATION évidente
l’anglais est devenu la langue vernaculaire
Influence de la NUMERISATION
Evolution des OUTILS
d’accès à l’INFORMATION
et des SUPPORTS

30. Masse information toujours
croissante
• PLoS ONE Publishes 10,000th Manuscript!
Posted on April 2nd, 2010 by Allison Van Gemert depuis December 2006
PubMed Central, a full-text archive of journals freely available to all -
PubMedCentral currently holds over 1.7 million articles
PubMed, a freely available index of biomedical abstracts published by the National Center for
Biotechnology Information has a collection of more than 19 million citations.
Scopus, a subscription-only database of journals covers a wider range of literature than PubMed and
currently claims to have indexed over 40 million records.

31. Combien d'articles
scientifiques? 50 Millions
 One paper for every base-pair in human chromsome Y
 One paper per tweet at twitter on an average day in 2010
 One paper for each year that modern mammals have been roaming the earth (at least
according to wikipedia)
 One paper per resident of England
 One paper per minute is based on 679,858 papers per year in 2009 / 365 days / 24
hours / 60 minutes = 1.29 papers per minute.
 CrossRef — 41,913,980 DOIs registered to date the majority journal articles, but some
book items. So 50m isn’t a bad guesstimate. Would make a good infographic. (Still only
one paper per 10 people on Facebook…)

32. Livres and Books
 GoogleBooks:http://booksearch.blog
spot.com/
Books of the World, stand up!
and be counted
All 129 864 880
Thursday, August 05, 2010 at 8:26 AM
The current number is around 210 million.
Is that a final number of books in the world? Not quite. We still have to exclude non-books such as
microforms (8 million), audio recordings (4.5 million), videos (2 million), maps (another 2 million), t-shirts
with ISBNs (about one thousand), turkey probes (1, added to a library catalog as an April Fools joke), and
other items for which we receive catalog entries.

33. Mais...
• Croissance un log tous les 50 ans, on
parlait de 40 000 en 1995
• Les journaux en support papier sont
en train de disparaître …
• Remplacés par

34. surf

36. LES DOCUMENTS PRIMAIRES
L'INFORMATION SECONDAIRE
LA LITTERATURE GRISE

37. La littérature scientifique
• Littérature en noir et blanc: les
documents primaires
• Littérature en couleur: journaux et
magazines
• Littérature grise
• Littérature multicolore: les
catalogues commerciaux

38. LES DOCUMENTS PRIMAIRES
JOURNAUX (25 000) ET ARTICLES
•ARTICLES ORIGINAUX
ANATOMIE D'UN ARTICLE
SCIENTIFIQUE
•LETTRES
•REVUES GENERALES
Journaux de REVUES
LIVRES ou Book series
DIDACTIQUES...TEXTBOOKS

39. Quelles fonctions
pour une revue scientifique?
 La dissémination de l’information
 Le contrôle de qualité de la recherche
 la constitution d’archives
« canoniques »
 la reconnaissance portée aux auteurs

40. La forme JOURNAL
est apparue la plus adéquate
 Regroupement d’articles dans un
ensemble diffusé en bloc aux abonnés
 Parution à dates données, régulières
 Traitement des articles, qualité
typographie, langage
 non modification après publication
 garantie de retrouver un
article/référence

41. Apprendre à lire, à écrire
 Ce qu’on ne nous a jamais appris à la
Fac!
 Apprendre à trouver
 connaître les bases de données
 apprendre à interroger ces bases
 Lire, sélectionner...
 sur les bases de données:
 TITRE, auteurs, mots-clés, résumé…
 Classer et retrouver...

42. Anatomie macroscopique d’un
article scientifique:
Titre «self-explaining»
Auteurs (Noms, prénoms, titres...), Adresses
Résumé (structuration)
 Mots Clés (indexation) Abréviations (etc!)
 Introduction (rationale)
 Matériel et méthodes (reproductibilité)
 Résultats (statistiques)
 Figures et tableaux (légendes, PAO, visibilité)
 Discussion (des résultats aux hypothèses)
Références (normes à respecter)
 Remerciements (collaborations, financements)

43. De systèmes ésotériques... au
langage naturel
 Mots-clés, keywords...
 MESH

44. Références
 Respecter le format
 Vancouver
 Des fiches bristol...
 À l'utilisation de logiciels spécialisés
(>25)
 EndNote, reference manager
 Les DOI (Digital Object Identifier)

45. Un exemple d ’article
 Format pdf, exemple

46. Apprendre à lire, à écrire
Lire un article:Désordre de Lecture
remerciements!,
fin de l’introduction, ou début de la discussion,
méthodes,
références,
légendes des figures et tableaux,
introduction ou discussion,
résultats
Ecrire:..... au maximum 4 pages double
interligne à l ’heure

47. LA PRODUCTION D'INFORMATION
Physiologie d'un article scientifique
Conception
Développement
Naissance
Vie
et Mort
Le concept d'EVALUATION

48. Développement et physiologie
d’un article scientifique
Conception
Fécondation in vitro ou sexualité de groupe
Embryologie
beaucoup plus long que chez les éléphants
les avortements sont fréquents, et
l’accouchement difficile
 beaucoup de partenaires, quelques bonnes fées et
des accoucheurs
Vie et mort d’un article
beaucoup d’appelés, peu d’élus

49. Embryologie
Bibliothèques et paillasses
lecture, expérimentation, observation
consignation dans un cahier
Lab Notebook
https://www.sciencemag.org/careers/2019
/09/how-keep-lab-notebook
Ordinateur, postes et publishers
rédactions et écritures
un manuscrit, soumission, éditeur, Peer
Review, referees, refus ou!
révisions, manuscrit, éditeur, referees,
accepté!
imprimeur, bon à tirer, publication,
diffusion, bibliothèques

50. Peer Review
 Peer review is a process used in the selection
of manuscripts for journal publication and
proposals for grant funding. It is tightly linked
to the allocation of scarce resources so that
those resources can be deployed to maximally
foster innovation and scientific progress.
 Nevertheless, peer review is not a process
without flaws and limitations.
 Researchers have identified issues related to its
fairness and transparency, including
conservatism and risk-taking, gender and other
bias, as well as predictability, reliability, and
validity issues

51. Physiologie: Vie, Mort et à
quoi ça sert
Lieu de naissance
Vie personnelle d’un article
Etre lu par des chercheurs, médecins,
journalistes, étudiants
Etre compris
Etre évalué, être CITE
Rester inconnu, être oublié, ressusciter

52. Physiologie: Vie, Mort et à
quoi ça sert
Vie sociale des articles
Etre utile à ses auteurs (DEA, Thèse,
Titres et travaux... position)
Etre utile à son environnement (équipe,
unité, université, ville, hôpital)
ETRE EVALUE

53. Le Concept d’évaluation
 Distribution des fréquences de
citation des articles scientifiques
 1 citation: 56%
 2-4: 24%
 50-99: 1% cumulé: 99.56%
 1000: 1300 / 32 728 729=0.00004
 Facteur d’impact…
 durée de citation...

54. William Bruce Cameron
 Not everything that can be counted
counts
 And not everything that counts can
be counted!
 William Bruce Cameron (born February 2, 1960) is an
American author, columnist, and humorist. Cameron is most famous
for his novel A Dog's Purpose,[1] which spent 19 weeks on the New
York Times bestseller list.

55. 2018
 Out of some 45.5M articles and
proceedings papers published and
indexed in Web of Science since
1970, only .01% have been cited
2000 times or more.

56. Impact factor(s)
• Impact Factor (Eugene Garfield)
 Haematologica
 Citation frequency?
 Immediacy index
 Cited half-life
Indicateurs d'impact
 Indice H
Indicateurs de production

57. L ’information grise
Les Thèses
Les Brevets et Normes
Sites spécifiques « Espacenet »
Les Rapports publics
Les Rapports privés
Internet? Trop d’information tue
l’information

58. La littérature multicolore
 Les catalogues des fabricants
 ex: SIGMA, R&D
 Les revues «interface»
 Les sites internet spécialisés

59. L'information SECONDAIRE
ou TERTIAIRE
ou PLUS
Journaux Médicaux
quotidiens
hebdomadaires
MAGAZINES d'actualités
Journaux non médicaux
quotidiens
hebdomadaires
mensuels
autres
AUDIO-VISUEL: RADIO, TELEVISION
INTERNET: sites spécialisés

60. Wikipedia?
• Nature Medicine 2007;13: 231-233

61. LES ACCES A L'INFORMATION
ABONNEMENTS
BIBLIOTHEQUES
PHOTOCOPIES
TIRES A PART
SOMMAIRES de Revues
Index de Sommaires
REVUES de Sommaires
... + Résumés (Summaries)

62. Bases de données:
Medline, PuBMeD
(Pascal)
Current Contents... Web of Science
Scopus
Google Scholar
https://osf.io/preprints/socarxiv/42nkm/

63. PubMed/NLM

64. Les opportunités de l ’électronique
indexation en texte intégral
outils de recherche intelligents
inclusion de données actives
liens hypertextes vers d’autres ressources
open peer comments…living seminar
multimédia
utilisation du réseau

65. Numérisation: intérêt pratique
http://www.scd.uhp-nancy.fr/
• A Nancy et
ailleurs...
– des étagères
et du PEB aux
périodiques
en texte
intégral…
– marcher
– feuilleter
– «cliquer»

66. Les Revues électroniques
Qu’est ce qui a changé?
 l’accès au réseau, dans les universités, dans les
Hôpitaux
 l’accès aux bases de données PUBMED (références, et
résumés)
 l’accès aux éditeurs et aux instructions aux auteurs
Qu’est ce qui va changer?
 le réseau
 les accès au document primaire ? et son format?
 les BU /SCD
 A qui sont ces articles ? QUI PAYE?
Qu’est ce qui ne change pas?
les end-users !
les nécessités:
de lire d’avoir des résultats, d’écrire...
d’un peer-review

67. Classer...
et retrouver
• Des boîtes de photocopies et des fiches
en carton
 Academia de Lincei
• Aux logiciels de bibliographie et à
votre PC
• ZOTERO: Zotero est un logiciel de gestion de références gratuit, libre
et open source qui s'inscrit dans la philosophie du Web 2.0. Il permet de
gérer des données bibliographiques et des documents de recherche.

68. Mais...
• Feuilleter: to leaf through books
㼀 1. Young twigs, leaves, and shoots that are fit for animals to eat.
• To browse
[Probably from obsolete French broust, young shoot, from Old French brost,
a. To inspect something leisurely and casually: browsed through the map collection for items of interest.
b. To read something superficially by selecting passages at random: browsed through the report during
lunch.
2. To look for information on the Internet.
3. To feed on leaves, young shoots, and other vegetation; graze.
a. To nibble; crop.
b. To graze on.
• Marcher vers la BU?

69. Bases de données
 Crossref
 Dimensions
 Google Scholar,
 Microsoft Academic,
 Scopus
 Web of Science
 https://www.ilovefreesoftware.com/2
4/featured/free-search-engines-for-
academic-research.html

70. Les Réseaux Sociaux
spécialisés
 Pas vraiment Facebook, ni QQ
 Mais
 Linkedin
 Academia.edu
 Biomed experts
 Research Gate
 Le Top 20 des réseaux sociaux scientifiques
 http://www.knowtex.com/blog/le-top-20-des-reseaux-
sociaux-scientifiques/

71. Les ressources OPEN Access
• Concept Open Access
• Bases de données et Moteurs de
recherche
 Google Scholar
 Thèses.fr
 Gold, green

72. Repositories
 Liège
 California
 HAL/CNRS

73. Retour sur les coûts
 A qui sont les articles ?
 QUI VA PAYER?
 OPEN ou FREE

74. Predatory journals, meetings…
 Editors
 Open access
 Up to 8000 journals?
 https://beallslist.weebly.com/

75. SCI-HUB… LIBGEN
 En 2019, 8 ans de recul
 76 millions articles
 400 000 users

76. Education
e-learning... to MOOC
 From Portfolio...
 To Massive Open Online Course
As we always says at Scoop.it, curation is expression, action and passion. It is also a soft revolution for the
classroom. Early, teachers saw us as a potential education tool.

77. Son et Image
• Podcasts: NEJM, Nature, Science
Hstalks (payants)
http://hstalks.com/main/search_bar.php?s=
immunology&l=252&k=TALK
• Videos: NIH
– You can practice your english/american easily
• YOUTUBE et
– Examen neurologique

78. Aimez vous les vidéos?
Utilisez vous les podcast?
 UMVF: canal U
 http://www.canal-
u.tv/themes/sciences_de_la_sante_e
t_du_sport
 Au NIH, cela dépasse l’internat
 NIH videocasting and podcasting
 http://videocast.nih.gov/

79. Les moteurs de recherche
 Google, Yahoo, Bing…
 Wikipedia?
 Nature Medicine 2007;13: 231-233
 Unpaywall
 Dimensions
 Kopernio

80. What do you
do when you
search
something on
Google
• Physiology

81. Other resources (en anglais)
 emedicine by WebMD
 http://emedicine.medscape.com/
 Sur PubMed
 OMIM
 Books
 PubMedCentral (Free archives)
 Cochrane? 25 y EBP
 McMaster

82. Suivre l'actualitéBut when there are 200 000 000 tweets per day or more activity on the web in 60 seconds than you could produce in a whole life, how
to be sure your online strategy is still efficient
 Once upon a time...
 Current Contents
 Flux RSS?
 Scoop.it
 Pearltrees
 Q Medicus

83. Social media
 Or networks

84. Impact
 generating

85. Scholarly communication 2019

86. Connectivism
 …is this an informal learning theory or is it a
combination of learning theories based on our digital
age? The simple fact is that information, unlike in the
past, is now available to anyone who has an internet
connection.

87. Unesco
 MIL Global Week

88. Veille
et sérendipité
 Individuelle ou collaborative
 Fake news!: vaccinations,
 https://www.media-paris-saclay.fr/il-
etait-une-fois-la-serendipite/

89. Méthodes de travail!
Active-learning
 À L’Ecole
 Programmes… Examen
 En Recherche
 Cahier de laboratoire
 Electronic-lab-book
 A l’Université et tout au long de la vie
 Logbook,
 Portfolio
 E-portfolio
 Learning while working

90. Workplace-Based Assessment
Assessing a trainee’s progress
 Assessing competences in laboratory
procedures and clinical skills
 Assessing trainee’s skills in clinical
examination
 Case-based discussions
An hindrance: duration (5years)
and diversity of training
How to help trainees in acquiring
skills and competences?

91. Portfolio: old and new words,
evolving concepts in training
 From « Titres et
travaux » to
portfolio
 Logbook..
 Book
 Portfolio
 a tool for training
and legitimation

92. E-portfolio: the future
 Usage of internet
and web 2.0
 Access anywhere
anytime
 UK: Wales
 Europe:Elfel
project

93. To learn…
curate
 Active learning
 with scoop.it

94. Content Curation supports
Learning and Training through Reading
Riga January 2018
GC Faure MD, PhD
Immunology
Université Lorraine, Nancy
F Arnal
CPGE Lycée C Fauriel
St Etienne

95. Overview
Context = Infobesity
From Knowledge Management to
Information Literacy
Trainees and PhD students : Europe, OCDE,
UNESCO (MIL)
Curation: Tools, Scoop.it
Geography
Immunology and related topics
Benefits and Challenges
« From STEM to STREAM »

96. Information Literacy (IL)
in higher education:
• Society 2020 requires
– Multi-skilled learners
– Able to think critically
– Pose and solve problems
– Become independent and life long learners
 Postgraduate and PhD students
• OCDE and UNESCO: (MIL) Media and
Information Literacy
Recognize needs of information!!
Localize information!
Select information
Organize information

97. Recent Evolutions and Concerns
INFOBESITY
• Too much information is killing information...
• and Knowledge
– Surinformation, Pollution informationnelle,
– Harcèlement textuel
• Networking
– From individuals and communities of interest
– To (social) networks

98. CURATION for knowledge
management
What is curation?
– A recent concept
– Many tools
• Scoop.it Vs other tools
• Experiences with Scoop.it in immunology
• Other experiences for
– Other fields of Research,
– Science mediation
– Information literacy

99. Curation is... gold panning,
DJ playing, Hunting-gathering,
Scouting
• Selection
– Agregation, distillation,
• Commenting
• Editorialisation
– Elevation, mashup
• Diffusion
– Sharing

100. Curation tools (>50)
• Google news
• Pearltrees, Paper.li, Pinterest, TumblR, Storify,
Sharezy, Flipboard...
• Scoop.it
– A french and californian start-up
– Various plans (Individual, Education, Business)
– Growing

101. Geography
Literary Preparatory classes: (Hypo-Khâgne St
Etienne) #50 + 40 students >5years
• Teacher activity: curation with Scoop.it,
paper.li of topic of the year exams China,
Brasil…
• Students activity: curation with Scoop.it,
Pearltrees, Pinterest; sharing with Twitter,
Facebook
Evaluation on learning,
Openings for language learning

102. Immunology Topics
By Teachers
• Basic Science, Biotechnologies, BioTherapies
– Immunology (>6K scoops, >75K visitors, >106K
views)
– From Flow Cytometry to Cytomics (>4K scoops, >21K
views)
– Immunology and Biotherapies (>6K scoops, >17K
views)
– Mucosal Immunity (>3,3K scoops, >10K views)
• Immuno-Pathology
– Autoimmunity, (>2,8K scoops, >8,5K views)
– Allergy and clinical immunology

103. Topics covered using Scoop.it
• By researchers and students
– M. de Carvalho Nancy Immune monitoring
– R.Creusot, Columbia NY USA Diabetes
– By students
– PhD students XW China ENT,
– Master students from Nancy-Wuhan Training program :
Methodologies of medical clinical and surgical research
– 10 chinese + 20 french students
– Topics related to medicine and biology
– Bonus points based on activity (searching, posting,
commenting and tagging)
– To be included into competences referential

104. Finding information
Focused or serendipitous
Building and enrichment of content hubs
• Traditional searching (Pubmed, Google scholar)
• Crawling of internet with Scoop.it , personalized +++
•Sources: Published Journals,
•Websites, Blogs, Press releases
•Social networks (Twitter, Linkedin, Facebook..) Research social
networks (Researchgate..)
• Curating when browsing (Use of applet)
• Reposting of scoops (from followed topics)
• Creation of scoops + publishing (Slideshare)

105. Curating information is
reading and writing
Title
Illustration
Body
Comments
Tags

106. Sharing
and retrieving
OPEN and actualized webmagazine
Tagged, commented, discussed
Attractive (pictures)
Rediffused on other networks (Twitter,
Linkedin (25) Facebook, Google+
Via e-mails, newsletters
Content Hubs
Are Searchable for retrieving

107. You and
 … curation

108. Opportunities in training
New ways of learning: Flipped or
blended or hybrid
Help students master information
techniques: learning by reading
and writing
Stimulating curiosity in a field and
adjacent areas

109. Benefits for students and
trainees end-users
(1)Building personal content hubs for their
master and PhD training projects
(2) Becoming information literate and able to
surf the information wave
(3) Becoming information literate for future life-
long learning in universities, research
centers or industry

110. Benefits for teachers and
researchers end-users
(1)Keeping abreast of scientific (and
societal) information for individual
continuous education and e-learning
(2) Building leadership in a dedicated
field
(3)Joining a network of specialists and
communities of interest
(4)Open serendipitous research fields

111. Challenges
The human factor of curation is the added value compared to
algorithms: selection, editorialism
Human dependency of curation
A « day to day » duty for scientists and
researchers like « walking the dog »
Permanence of tools
Individualism of some researchers
Reluctance to share

112. From STEM to STR(eading)EAM
Context = Infobesity
From Knowledge Management to Information
Literacy
Trainees and PhD students : Europe, OCDE,
UNESCO (MIL)
Curation: What is it? Tools, Scoop.it
Geography
Immunology and related topics
Benefits and Challenges
READING as a core competency

113. Disclaimer
once upon a time…
Europe SCICOM meetings
Paris MRES Comité stratégique IST
UHP Nancy 1 Chargé de mission DOC
AUF: ASSIM: maître toile
(http://www.assim.refer.org)
http://www.scoop.it/u/gilbertcfaure
No conflict of interest to declare

114. L’UMVF:
 Fédération Inter-
Universitaire pour
l’Université Médicale
Virtuelle Francophone
 GIP FIU-UMVF
 MEN, MESR, MEFI
 JO 13 Aout 2003
 33 Universités
 http://www.umvf.prd.fr/in
fo/qui/presentation.html

115. L’UMVF: ses missions
 mettre en œuvre les technologies de l’information et de la
communication pour l'enseignement (TICE) de la médecine
en formations initiale et continue.
 Centre de ressources interactif dans le domaine de la santé
 Centre d’information et de prévention pour le public
 Diffusion et de promotion de la science médicale française dans le
monde.
 produire des ressources documentaires venant en
complément des cours.
 Etudiants de 2e cycle préparant les Epreuves Classantes Nationales
(ECN)… une banque de données
 Plus d'une trentaine de campus numériques disciplinaires
 soutenue par
 la Conférence des Présidents d’Université
 la Conférence Nationale des Doyens des Facultés de Médecine.

116. Les Campus Numériques
http://www.umvf.prd.fr/ressources/campus.php
 Plus de 45 en fait,
 Toutes disciplines
du premier cycle
 Histologie-
embryologie
 Microbiologie
 Statistiques
 à l’ECN
 Néphrologie
 Neurologie
 Rhumatologie…

117. ASSIM: RAISIL Réseau d’accès à l’information
scientifique en ligne
http://www.assim.refer.org
 Les questions du
module 8 Immunologie
 De 112 à 127
 Une structure en
briques de
connaissance
 Des cas cliniques
 Des réponses
 Pas de QCMs

118. Doc’UMVF
 Nouvelle Page ECN 2010
 345 items
 Plus de 2000 documents
pédagogiques
 CISMEF Rouen
 S Darmoni
 JP Thirion

119. Autres ressources d’intérêt en
langue française
 CNCI
 http://www.cnci.univ-paris5.fr/welcome.html
 Concours Médecins étrangers
 Annales QCM 2005-2007: 3x120
 http://www.cnci.univ-
paris5.fr/medecine/Annales_ETR.html
 Les pages ECN de l’HAS +++
 http://www.has-
sante.fr/portail/jcms/c_646948/examen-classant-
national-ecn-mot-du-president-sommaire-mode-d-
emploi
 Mise à jour mensuelle
 ORPHANET++