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UE ISSM 7.309/DIU
Méthodologies de la recherche
médicale et chirurgicale
Gilbert C Faure 26/10/2023
Faculté de Médecine et CHU Brabois
Laboratoire d’Immunologie
Professeur Emérite
Ancien Chargé de mission à la documentation UHP
Ancien responsable de la recherche clinique au CHU
Ex Maître-Toile du site de l’ASSIM
Curateur avec Scoop.it
CREM (Centre de recherche sur les médiations)/UL
Quelques questions avant de
commencer:
une feuille, votre nom, année, cycle
• Quels outils de recherche d’information
utilisez vous actuellement?
• Sur quels réseau(x) social(aux) êtes-vous?
• Quelles « bases de données » médicales
connaissez vous?
• Quels journaux lisez vous régulièrement ?
– Vulgarisation
– Scientifiques et Médicaux
– Sur quels supports
• Qu’est ce qu’un curateur?
• Qu’est ce que SCI-HUB?
APPRENTISSAGES et enseignement
Pedagogie et/ou Andragogie
 Apprentissages en ligne: E-learning Or (Online)
 I (Informal)- Incremental- inquiry-
 A (Active-)
 B (Blended)- H (Hybrid)
 C (Collaborative) or (Continuous)
 D/LD (Distance) (deliberate)
 S (self/directed)- Heutagogy Social
 M (Micro or Bite-sized) Mobile- Multimodal -
 P (PeRsonal)
 w (Workplace)-
 Project Based - L
 L-L (Life long)
Filière Médicale Francophone
Nancy-Wuhan
 Depuis 2008
 Un nouveau diplôme
universitaire (DIU)
associant Nancy et Wuhan
 https://www.scoop.it/topic/
wuhan
Diplôme d’Université (DU/DIU)
 Méthodologies de la
recherche(clinique) médicale et
chirurgicale
 Intégré dans le cursus de Master UE 7.309
 Objectifs:
 Acquérir ou conforter les connaissances de base
des méthodologies utiles à la pratique de la
recherche médicale
DU: Thèmes abordés
Eléments de base
 Information scientifique et Techniques de
communication
Bases de données, publications, projets de
recherche, recherche clinique
 Méthodes en biologie moléculaire, génomique,
protéomique
ADN, ARN, gènes, protéines…
 Méthodes en biologie cellulaire, d’organes et
d’organisme
Isolement, imagerie, cellulaire, de tissus, modèles
animaux
DU: Illustration par le biais de
projets en cours à Nancy
 Eléments applicatifs
 Applications en recherche médicale
Hémato-oncologie, Nutrition,
Pathologies du vieillissement
(cardiovasculaire, articulaire)
Pathologies inflammatoires aigues et
chroniques
 Applications en recherche chirurgicale
Chirurgie robotique, coeliochirurgie,
microchirurgie
Greffes et transplantations
 Applications dans les biothérapies
Thérapies cellulaire et génique
Thérapies moléculaires innovantes
Programme… voir ENT/ARCHE
Examen janvier salle?
 3 questions ouvertes et courtes 3x5
points
 Active learning 5 points
 Curation d’un sujet médical et/ou
biologique
 Scoop.it « gratuit »
 https://www.scoop.it/pricing
 1 sujet, (50 posts max… illimité)
Curating information is
reading and writing
Title
Illustration
Body
Comments
Tags
Apprendre
Chercher et trouver
 Des exemples, des méthodes
 Quelles recherches
 Recherche Médicale
 Recherche Chirurgicale
 Recherche Biologique
 Recherche Imagerie
 Recherche fondamentale
 Recherche clinique
Où fait-on de la recherche?
 Universités, Facultés, UFRs
 EPST (Inserm, CNRS, INRA, Inria…)
 EA (AERES/ARS)
 CHUs
 CIC, CEC, CIT, CICancer, CIB
 CRB, Thèques…
 Cancéropôles
 Industrie
 Laboratoires Pharmaceutiques
 Start Up, Spin Off
 Laboratoires Biotechnologies, Imagerie
Qui soutient la recherche?
 Les états
 Les organismes publics
 Les Ministères (Recherche, Enseignement
supérieur, Industrie, Innovation)
 Les Régions
 L’Europe
 Les organismes privés
 Industrie
 Associations charitables
 Ligue, ARC, x Associations, Charities
Que fait-on en recherche (clinique)
médicale et chirurgicale?
 Faire des expériences?
 Faire des manipulations?
 Travailler dans un laboratoire?
 Travailler avec des animaux?
 Travailler avec des patients?
 Travailler dans un service hospitalier?
 Recueillir des données et faire des
statistiques?
 Lire et écrire
Once upon a time…
 Academic (reading) and writing
 Numerous presentations and
publications
 ECIL,
 BOBCATSS
 WRAB
 NASCE, Nancy 2023
Recent Evolutions and Concerns
INFOBESITY
• Too much information is killing information...
• and Knowledge
– Surinformation, Pollution informationnelle,
– Harcèlement textuel
• Networking
– From individuals and communities of interest
– To (social) networks
Research skills
 Autodidacte!
 “Research Tools” can be defined as
vehicles that broadly facilitate
research and related activities….
enable researchers to collect,
organize, analyze, visualize and
publicized research outputs….
 https://figshare.com/articles/Research_Skills_Session_1
_Introduction/9931163/1
Scholarly communication 2019
 "Literacy is the ability to communicate in all
forms for all purposes. If we are literate, we
have the reading, writing and oracy skills and
knowledge needed for success in life.​
 Numérique, digitale, santé…
MIL Week 2022/3
Information Literacies
 https://www.sciencemag.org/careers/2016/11/how-keep-
scientific-literature?r3f_986=https://t.co/GwBA573G7x
Researcher development framework UK2018
information literacy
Lire… et écrire
 Accéder à l’information
 Papier ou numérique
 Centres de documentation, bibliothèques,
 En ligne, via internet
 Sélectionner l’information
 Stocker l’information
 Retrouver l’information
 Utiliser l’information
Forbes
http://www.forbes.com/sites/chrisperry/2011/10/27/do-
organizations-need-a-chief-content-officer/Trop d'information....
 YouTube users upload two days of
video every minute. They receive
up to 3 billion views per day.
 Twitter users generate over 2
million daily tweets. 2,200 new
tweets every second.
 The average Facebook user
creates 90 pieces of content each
month. More than 30 billion pieces
are shared monthly, an average
over 7 billion a week.
 Google takes in over 8.5 billion
monthly search queries to find
relevance in it all.
Information scientifique et
technique:
Matière première
du médecin, du scientifique, du malade,
du consommateur
Produit fini
du médecin, du scientifique, du
chercheur
Produit à haute valeur ajoutée
Produit à valeur stratégique
L'IST: une espèce vivante
ou des populations cellulaires
 ..démographie galopante
 Ou prolifération
 ..inégalités géographiques et socio-
culturelles
 Ou hétérogénéité, sélection
 ..Histoire et oubli
 Ou Mémoire (immunitaire-
neurologique) et apoptose, mort
Pourquoi un immunologiste
intéressé par l'IST
 SCICOM « CD-ROM ».SCICOM 2
 Mission Ministère Recherche
 Mission à la Documentation UHP
 Contacts Liège, UGR, Lausanne...
 Publications, Livres...
 UEMS, EACCME: e-learning
 Site ASSIM, Blogs, Linkedin,Twitter
 Scoop-it..
Selon vos besoins, variables
selon votre développement
• Recherche fondamentale et clinique
• Etudes de Médecine, Préparation à
l'internat
– UMVF
• FMC (CME), DPC (CPD)
• E-Learning
• Concept de portfolio
Un peu d ’histoire
 L ’information scientifique
et technique
 un phénomène récent, un siècle environ
 du « savant fou »... aux équipes
pléthoriques
 de la monographie,
 à la publication avec plusieurs centaines
d ’auteurs
 Quel futur au 3ème millénaire?
Histoire: depuis 350 ans
• Depuis...le XVIIème siècle
 Philosophical transactions (Royal
Society)
 Le journal des scavans 1665
• XVIIIème: Encyclopédie France
• XIXème: Allemagne
• XXème: USA
• XXIème: ???
Circulation de l’information
scientifique
 Analogue au circuit de l’eau dans la
nature
 les récepteurs reçoivent l’information
sous forme variée, pluie, neige, grêle...
 les émetteurs produisent de
l’information…
 celle-ci s’accumule dans des réservoirs,
mer, lacs, neiges éternelles, glaciers
 les conservateurs stockent l ’information
Le Circuit de l'eau
En images
MASSE d'information en croissance exponentielle
INTERNATIONALISATION évidente
l’anglais est devenu la langue vernaculaire
Influence de la NUMERISATION
Evolution des OUTILS
d’accès à l’INFORMATION
et des SUPPORTS
Masse information toujours
croissante!
Posted on April 2nd, 2010 by Allison Van Gemert depuis December 2006
PubMed Central, a full-text archive of journals freely available to all -
PubMedCentral currently holds over 1.7 million articles
PubMed, a freely available index of biomedical abstracts published by the National Center for
Biotechnology Information has a collection of more than 19 million citations.
Scopus, a subscription-only database of journals covers a wider range of literature than PubMed and
currently claims to have indexed over 40 million records.
Evolution récente: De 800 000 par an en 2000 à 1 800 000
en 2015
One paper per minute is based on 679,858 papers per year in
2009 / = 1.29 papers per minute.
Maintenant Chaque minute 3,4
2022
Livres and Books
 GoogleBooks:http://booksearch.blog
spot.com/
Books of the World, stand up!
and be counted
All 129 864 880
Thursday, August 05, 2010 at 8:26 AM
The current number is around 210 million.
Is that a final number of books in the world? Not quite. We still have to exclude non-books such as
microforms (8 million), audio recordings (4.5 million), videos (2 million), maps (another 2 million), t-shirts
with ISBNs (about one thousand), turkey probes (1, added to a library catalog as an April Fools joke), and
other items for which we receive catalog entries.
Mais...
• Croissance un log tous les 50 ans, on
parlait de 40 000 en 1995
• Les journaux en support papier sont
en train de disparaître …
• Remplacés par
surf
LES DOCUMENTS PRIMAIRES
L'INFORMATION SECONDAIRE
LA LITTERATURE GRISE
La littérature scientifique
• Littérature en noir et blanc: les
documents primaires
• Littérature en couleur: journaux et
magazines
• Littérature grise
• Littérature multicolore: les
catalogues commerciaux
LES DOCUMENTS PRIMAIRES
JOURNAUX (25 000) ET ARTICLES
•ARTICLES ORIGINAUX
ANATOMIE D'UN ARTICLE
SCIENTIFIQUE
•LETTRES
•REVUES GENERALES
Journaux de REVUES
LIVRES ou Book series
DIDACTIQUES...TEXTBOOKS
Quelles fonctions
pour une revue scientifique?
 La dissémination de l’information
 Le contrôle de qualité de la recherche
 la constitution d’archives
« canoniques »
 la reconnaissance portée aux auteurs
La forme JOURNAL
était apparue la plus adéquate
 Regroupement d’articles dans un
ensemble diffusé en bloc aux abonnés
 Parution à dates données, régulières
 Traitement des articles, qualité
typographie, langage
 non modification après publication
 garantie de retrouver un
article/référence
Apprendre à lire, à écrire
 Ce qu’on ne nous a jamais appris à la
Fac!
 Apprendre à trouver
 connaître les bases de données
 apprendre à interroger ces bases
 Lire, sélectionner...
 sur les bases de données:
 TITRE, auteurs, mots-clés, résumé…
 Classer et retrouver...
Anatomie macroscopique d’un
article scientifique:
Titre «self-explaining»
Auteurs (Noms, prénoms, titres...), Adresses
Résumé (structuration)
 Mots Clés (indexation) Abréviations (etc!)
 Introduction (rationale)
 Matériel et méthodes (reproductibilité)
 Résultats (statistiques)
 Figures et tableaux (légendes, PAO, visibilité)
 Discussion (des résultats aux hypothèses)
Références (normes à respecter)
 Remerciements (collaborations, financements)
De systèmes ésotériques... au
langage naturel
 Mots-clés, keywords...
 MESH
Références
 Respecter le format
 Vancouver
 Des fiches bristol...
 À l'utilisation de logiciels spécialisés
(>25)
 EndNote, reference manager
 Les DOI (Digital Object Identifier)
Maintenant
 plutôt
Apprendre à lire, à écrire
Lire un article:Désordre de Lecture
remerciements!,
fin de l’introduction, ou début de la discussion,
méthodes,
références,
légendes des figures et tableaux,
introduction ou discussion,
résultats
Ecrire:..... au maximum 4 pages double
interligne à l ’heure
LA PRODUCTION D'INFORMATION
Physiologie d'un article scientifique
Conception
Développement
Naissance
Vie
et Mort
Le concept d'EVALUATION
Développement et physiologie
d’un article scientifique
Conception
Fécondation in vitro ou sexualité de groupe
Embryologie
beaucoup plus long que chez les éléphants
les avortements sont fréquents, et
l’accouchement difficile
 beaucoup de partenaires, quelques bonnes fées et
des accoucheurs
Vie et mort d’un article
beaucoup d’appelés, peu d’élus
Embryologie
Bibliothèques et paillasses
lecture, expérimentation, observation
consignation dans un cahier
Lab Notebook
https://www.sciencemag.org/careers/2019
/09/how-keep-lab-notebook
Ordinateur, postes et publishers
rédactions et écritures
un manuscrit, soumission, éditeur, Peer
Review, referees, refus ou!
révisions, manuscrit, éditeur, referees,
accepté!
imprimeur, bon à tirer, publication,
diffusion, bibliothèques
Peer Review
 Peer review is a process used in the selection
of manuscripts for journal publication and
proposals for grant funding. It is tightly linked
to the allocation of scarce resources so that
those resources can be deployed to maximally
foster innovation and scientific progress.
 Nevertheless, peer review is not a process
without flaws and limitations.
 Researchers have identified issues related to its
fairness and transparency, including
conservatism and risk-taking, gender and other
bias, as well as predictability, reliability, and
validity issues
Physiologie: Vie, Mort et à
quoi ça sert
Lieu de naissance
Vie personnelle d’un article
Etre lu par des chercheurs, médecins,
journalistes, étudiants
Etre compris
Etre évalué, être CITE
Rester inconnu, être oublié, ressusciter
Physiologie: Vie, Mort et à
quoi ça sert
Vie sociale des articles
Etre utile à ses auteurs (DEA, Thèse,
Titres et travaux... position)
Etre utile à son environnement (équipe,
unité, université, ville, hôpital)
ETRE EVALUE?
Le Concept d’évaluation
 Distribution des fréquences de
citation des articles scientifiques
 1 citation: 56%
 2-4: 24%
 50-99: 1% cumulé: 99.56%
 1000: 1300 / 32 728 729=0.00004
 Facteur d’impact…
 durée de citation...
William Bruce Cameron
 Not everything that can be counted
counts
 And not everything that counts can
be counted!
 William Bruce Cameron (born February 2, 1960) is an
American author, columnist, and humorist. Cameron is most famous
for his novel A Dog's Purpose,[1] which spent 19 weeks on the New
York Times bestseller list.
2018
 Out of some 45.5M articles and
proceedings papers published and
indexed in Web of Science since
1970, only .01% have been cited
2000 times or more.
Impact factor(s)
SCI!!!
• Impact Factor (Eugene Garfield)
 Citation frequency?
 Immediacy index
 Cited half-life
Indicateurs d'impact
 H index
Indicateurs de production
L ’information grise
Les Thèses
Les Brevets et Normes
Sites spécifiques « Espacenet »
Les Rapports publics
Les Rapports privés
Internet? Trop d’information tue
l’information
La littérature multicolore
 Les catalogues des fabricants
 ex: SIGMA, R&D
 Les revues «interface»
 Les sites internet spécialisés
L'information SECONDAIRE
ou TERTIAIRE
ou PLUS
Journaux Médicaux
quotidiens
hebdomadaires
MAGAZINES d'actualités
Journaux non médicaux
quotidiens
hebdomadaires
mensuels
autres
AUDIO-VISUEL: RADIO, TELEVISION
INTERNET: sites spécialisés
Wikipedia?
• Nature Medicine 2007;13: 231-233
LES ACCES A L'INFORMATION
ABONNEMENTS
BIBLIOTHEQUES
PHOTOCOPIES
TIRES A PART
SOMMAIRES de Revues
Index de Sommaires
REVUES de Sommaires
... + Résumés (Summaries)
Bases de données:
Medline, PuBMeD
(Pascal)
Current Contents... Web of Science
Scopus
Google Scholar
https://osf.io/preprints/socarxiv/42nkm/
PubMed/NLM
Les opportunités de l ’électronique
indexation en texte intégral
outils de recherche intelligents
inclusion de données actives
liens hypertextes vers d’autres ressources
open peer comments…living seminar
multimédia
utilisation du réseau
Numérisation: intérêt pratique
http://www.scd.uhp-nancy.fr/
• A Nancy et
ailleurs...
– des étagères
et du PEB aux
périodiques
en texte
intégral…
– marcher
– feuilleter
– «cliquer»
Les Revues électroniques
Qu’est ce qui a changé?
 l’accès au réseau, dans les universités, dans les
Hôpitaux
 l’accès aux bases de données PUBMED (références, et
résumés)
 l’accès aux éditeurs et aux instructions aux auteurs
Qu’est ce qui va changer?
 le réseau
 les accès au document primaire ? et son format?
 les BU /SCD
 A qui sont ces articles ? QUI PAYE?
Qu’est ce qui ne change pas?
les end-users !
les nécessités:
de lire d’avoir des résultats, d’écrire...
d’un peer-review
Classer...
et retrouver
• Des boîtes de photocopies et des fiches
en carton
 Academia de Lincei
• Aux logiciels de bibliographie et à
votre PC
• ZOTERO: Zotero est un logiciel de gestion de références gratuit, libre
et open source qui s'inscrit dans la philosophie du Web 2.0. Il permet de
gérer des données bibliographiques et des documents de recherche.
Browsing
Feuilleter…. Google images!
• Feuilleter: to leaf through books
㼀 1. Young twigs, leaves, and shoots that are fit for animals to eat.
• To browse
[Probably from obsolete French broust, young shoot, from Old French brost,
a. To inspect something leisurely and casually: browsed through the map collection for items of interest.
b. To read something superficially by selecting passages at random: browsed through the report during
lunch.
2. To look for information on the Internet.
3. To feed on leaves, young shoots, and other vegetation; graze.
a. To nibble; crop.
b. To graze on.
• Marcher vers la BU?
Bases de données
 Crossref
 Dimensions
 Google Scholar,
 Microsoft Academic,
 Scopus
 Web of Science
 https://www.ilovefreesoftware.com/2
4/featured/free-search-engines-for-
academic-research.html
Les Réseaux Sociaux
spécialisés
 Pas vraiment Facebook, ni QQ
 Mais
 Linkedin
 Academia.edu
 Biomed experts
 Research Gate
 Le Top 20 des réseaux sociaux scientifiques
 http://www.knowtex.com/blog/le-top-20-des-reseaux-sociaux-
scientifiques/
Les ressources OPEN Access
• Concept Open Access
• Bases de données et Moteurs de
recherche
 Google Scholar
 Thèses.fr
 Gold, green
 Diamond
OPEN SOURCE
 OPEN Access
 Green,
 Gold,
 DIAMOND
 PREPRINTS
 ArXiv
 Production MedRXiv, chiffres, qualité
Repositories
 Liège
 California
 HAL/CNRS
Retour sur les coûts
 A qui sont les articles ?
 QUI VA PAYER?
 OPEN ou FREE
Predatory journals, meetings…
 Editors
 Open access
 Up to 8000 journals?
 https://beallslist.weebly.com/
SCI-HUB… LIBGEN
 En 2019, 8 ans de recul
 76 millions articles
 400 000 users
Mauvais comportements des
auteurs
 Triche (CHEATING)
 Plagiat
 Fraude scientifique/retraction watch
 CASH REWARDS En ChinE
 Hyperprolifiques (2/3 en Biologie/santé)
 >3 articles par semaine
Education
e-learning... to MOOC
 From Portfolio...
 To Massive Open Online Course
As we always says at Scoop.it, curation is expression, action and passion. It is also a soft revolution for the
classroom. Early, teachers saw us as a potential education tool.
Son et Image
• Podcasts: NEJM, Nature, Science
Hstalks (payants)
http://hstalks.com/main/search_bar.php?s=
immunology&l=252&k=TALK
• Videos: NIH
– You can practice your english/american easily
• YOUTUBE et
– Examen neurologique
Aimez vous les vidéos?
Utilisez vous les podcast?
 UMVF: canal U
 http://www.canal-
u.tv/themes/sciences_de_la_sante_e
t_du_sport
 Au NIH, cela dépasse l’internat
 NIH videocasting and podcasting
 http://videocast.nih.gov/
Les moteurs de recherche
 Google, Yahoo, Bing…
 Wikipedia?
 Nature Medicine 2007;13: 231-233
 Unpaywall
 Dimensions
 Kopernio
What do you
do when you
search
something on
Google
• Physiology
Other resources (en anglais)
 emedicine by WebMD
 http://emedicine.medscape.com/
 Sur PubMed
 OMIM
 Books
 PubMedCentral (Free archives)
 Cochrane? 25 y EBP
 McMaster
Suivre l'actualité
But when there are 200 000 000 tweets per day or more activity on the web in 60 seconds than you could produce in a whole life, how
to be sure your online strategy is still efficient
 Once upon a time...
 Current Contents
 Flux RSS?
 Scoop.it
 Pearltrees
 Q Medicus
Social media
 Or networks
Generating Impact
 But de la recherche?
Scholarly communication 2019
Connectivism
 …is this an informal learning theory or is it a
combination of learning theories based on our digital
age? The simple fact is that information, unlike in the
past, is now available to anyone who has an internet
connection.
Veille
et sérendipité
 Individuelle ou collaborative
 https://www.media-paris-saclay.fr/il-
etait-une-fois-la-serendipite/
Méthodes de travail!
Active-learning
 À L’Ecole
 Programmes… Examen
 En Recherche
 Cahier de laboratoire
 Electronic-lab-book
 A l’Université et tout au long de la vie
 Logbook,
 Portfolio
 E-portfolio
 Learning while working
Workplace-Based Assessment
Assessing a trainee’s progress
 Assessing competences in laboratory
procedures and clinical skills
 Assessing trainee’s skills in clinical
examination
 Case-based discussions
An hindrance: duration (5years)
and diversity of training
How to help trainees in acquiring
skills and competences?
Portfolio: old and new words,
evolving concepts in training
 From « Titres et
travaux » to
portfolio
 Logbook..
 Book
 Portfolio
 a tool for training
and legitimation
E-portfolio: the future
 Usage of internet
and web 2.0
 Access anywhere
anytime
 UK: Wales
 Europe:Elfel
project
Portfolio
A simple digital platform
where your work, skills, ideas & achievements can shine.
is:
• A place to assemble, collect & share work using a wide range
of embedded multimedia.
• A place to keep & add to your work for life.
• A place to create, develop, identify & evaluate ideas, research,
learning, and projects.
Your interactive bulb CV/Resume allows you to show actual evidence
of your strengths, achievements, and passions versus simply just
writing about them.
To learn…
curate
 Active learning
 with scoop.it
Where are you?
 Learner/trainee
SCOOP.IT
 MA PAGE
 Principale

FUTURS? depuis 2023…
 AI: Unlocking Academic Excellence: How
AI-Powered E-Research Tools Are
Transforming Research…
Content Curation supports
Learning and Training through Reading
Riga January 2018
GC Faure MD, PhD
Immunology
Université Lorraine, Nancy
F Arnal
CPGE Lycée C Fauriel
St Etienne
Overview
Context = Infobesity
From Knowledge Management to
Information Literacy
Trainees and PhD students : Europe, OCDE,
UNESCO (MIL)
Curation: Tools, Scoop.it
Geography
Immunology and related topics
Benefits and Challenges
« From STEM to STREAM »
Information Literacy (IL)
in higher education:
• Society 2020 requires
– Multi-skilled learners
– Able to think critically
– Pose and solve problems
– Become independent and life long learners
 Postgraduate and PhD students
• OCDE and UNESCO: (MIL) Media and
Information Literacy
Recognize needs of information!!
Localize information!
Select information
Organize information
Recent Evolutions and Concerns
INFOBESITY
• Too much information is killing information...
• and Knowledge
– Surinformation, Pollution informationnelle,
– Harcèlement textuel
• Networking
– From individuals and communities of interest
– To (social) networks
CURATION for knowledge
management
What is curation?
– A recent concept
– Many tools
• Scoop.it Vs other tools
• Experiences with Scoop.it in immunology
• Other experiences for
– Other fields of Research,
– Science mediation
– Information literacy
Curation is... gold panning,
DJ playing, Hunting-gathering,
Scouting
• Selection
– Agregation, distillation,
• Commenting
• Editorialisation
– Elevation, mashup
• Diffusion
– Sharing
Curation tools (>50)
• Google news
• Pearltrees, Paper.li, Pinterest, TumblR,
Storify, Sharezy, Flipboard...
• Scoop.it
– A french and californian start-up
– Various plans (Individual, Education, Business)
– Growing
Geography
Literary Preparatory classes: (Hypo-Khâgne St
Etienne) #50 + 40 students >5years
• Teacher activity: curation with Scoop.it,
paper.li of topic of the year exams China,
Brasil…
• Students activity: curation with Scoop.it,
Pearltrees, Pinterest; sharing with Twitter,
Facebook
Evaluation on learning,
Openings for language learning
Immunology Topics
By Teachers
• Basic Science, Biotechnologies, BioTherapies
– Immunology (>6K scoops, >75K visitors, >106K
views)
– From Flow Cytometry to Cytomics (>4K scoops, >21K
views)
– Immunology and Biotherapies (>6K scoops, >17K
views)
– Mucosal Immunity (>3,3K scoops, >10K views)
• Immuno-Pathology
– Autoimmunity, (>2,8K scoops, >8,5K views)
– Allergy and clinical immunology
Topics covered using Scoop.it
• By researchers and students
– M. de Carvalho Nancy Immune monitoring
– R.Creusot, Columbia NY USA Diabetes
– By students
– PhD students XW China ENT,
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Methodologies of medical clinical and surgical research
– 10 chinese + 20 french students
– Topics related to medicine and biology
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 … curation
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Challenges
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researchers like « walking the dog »
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Context = Infobesity
From Knowledge Management to Information
Literacy
Trainees and PhD students : Europe, OCDE,
UNESCO (MIL)
Curation: What is it? Tools, Scoop.it
Geography
Immunology and related topics
Benefits and Challenges
READING as a core competency
Disclaimer
once upon a time…
Europe SCICOM meetings
Paris MRES Comité stratégique IST
UHP Nancy 1 Chargé de mission DOC
AUF: ASSIM: maître toile
(http://www.assim.refer.org)
http://www.scoop.it/u/gilbertcfaure
No conflict of interest to declare
L’UMVF:
 Fédération Inter-
Universitaire pour
l’Université Médicale
Virtuelle Francophone
 GIP FIU-UMVF
 MEN, MESR, MEFI
 JO 13 Aout 2003
 33 Universités
 http://www.umvf.prd.fr/in
fo/qui/presentation.html
L’UMVF: ses missions
 mettre en œuvre les technologies de l’information et de la
communication pour l'enseignement (TICE) de la médecine
en formations initiale et continue.
 Centre de ressources interactif dans le domaine de la santé
 Centre d’information et de prévention pour le public
 Diffusion et de promotion de la science médicale française dans le
monde.
 produire des ressources documentaires venant en
complément des cours.
 Etudiants de 2e cycle préparant les Epreuves Classantes Nationales
(ECN)… une banque de données
 Plus d'une trentaine de campus numériques disciplinaires
 soutenue par
 la Conférence des Présidents d’Université
 la Conférence Nationale des Doyens des Facultés de Médecine.
Les Campus Numériques
http://www.umvf.prd.fr/ressources/campus.php
 Plus de 45 en fait,
 Toutes disciplines
du premier cycle
 Histologie-
embryologie
 Microbiologie
 Statistiques
 à l’ECN
 Néphrologie
 Neurologie
 Rhumatologie…
ASSIM: RAISIL Réseau d’accès à l’information
scientifique en ligne
http://www.assim.refer.org
 Les questions du
module 8 Immunologie
 De 112 à 127
 Une structure en
briques de
connaissance
 Des cas cliniques
 Des réponses
 Pas de QCMs
Doc’UMVF
 Nouvelle Page ECN 2010
 345 items
 Plus de 2000 documents
pédagogiques
 CISMEF Rouen
 S Darmoni
 JP Thirion
Autres ressources d’intérêt en
langue française
 CNCI
 http://www.cnci.univ-paris5.fr/welcome.html
 Concours Médecins étrangers
 Annales QCM 2005-2007: 3x120
 http://www.cnci.univ-
paris5.fr/medecine/Annales_ETR.html
 Les pages ECN de l’HAS +++
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sante.fr/portail/jcms/c_646948/examen-classant-
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 Mise à jour mensuelle
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  • 1. UE ISSM 7.309/DIU Méthodologies de la recherche médicale et chirurgicale Gilbert C Faure 26/10/2023 Faculté de Médecine et CHU Brabois Laboratoire d’Immunologie Professeur Emérite Ancien Chargé de mission à la documentation UHP Ancien responsable de la recherche clinique au CHU Ex Maître-Toile du site de l’ASSIM Curateur avec Scoop.it CREM (Centre de recherche sur les médiations)/UL
  • 2. Quelques questions avant de commencer: une feuille, votre nom, année, cycle • Quels outils de recherche d’information utilisez vous actuellement? • Sur quels réseau(x) social(aux) êtes-vous? • Quelles « bases de données » médicales connaissez vous? • Quels journaux lisez vous régulièrement ? – Vulgarisation – Scientifiques et Médicaux – Sur quels supports • Qu’est ce qu’un curateur? • Qu’est ce que SCI-HUB?
  • 3. APPRENTISSAGES et enseignement Pedagogie et/ou Andragogie  Apprentissages en ligne: E-learning Or (Online)  I (Informal)- Incremental- inquiry-  A (Active-)  B (Blended)- H (Hybrid)  C (Collaborative) or (Continuous)  D/LD (Distance) (deliberate)  S (self/directed)- Heutagogy Social  M (Micro or Bite-sized) Mobile- Multimodal -  P (PeRsonal)  w (Workplace)-  Project Based - L  L-L (Life long)
  • 4. Filière Médicale Francophone Nancy-Wuhan  Depuis 2008  Un nouveau diplôme universitaire (DIU) associant Nancy et Wuhan  https://www.scoop.it/topic/ wuhan
  • 5. Diplôme d’Université (DU/DIU)  Méthodologies de la recherche(clinique) médicale et chirurgicale  Intégré dans le cursus de Master UE 7.309  Objectifs:  Acquérir ou conforter les connaissances de base des méthodologies utiles à la pratique de la recherche médicale
  • 6. DU: Thèmes abordés Eléments de base  Information scientifique et Techniques de communication Bases de données, publications, projets de recherche, recherche clinique  Méthodes en biologie moléculaire, génomique, protéomique ADN, ARN, gènes, protéines…  Méthodes en biologie cellulaire, d’organes et d’organisme Isolement, imagerie, cellulaire, de tissus, modèles animaux
  • 7. DU: Illustration par le biais de projets en cours à Nancy  Eléments applicatifs  Applications en recherche médicale Hémato-oncologie, Nutrition, Pathologies du vieillissement (cardiovasculaire, articulaire) Pathologies inflammatoires aigues et chroniques  Applications en recherche chirurgicale Chirurgie robotique, coeliochirurgie, microchirurgie Greffes et transplantations  Applications dans les biothérapies Thérapies cellulaire et génique Thérapies moléculaires innovantes
  • 8. Programme… voir ENT/ARCHE Examen janvier salle?  3 questions ouvertes et courtes 3x5 points  Active learning 5 points  Curation d’un sujet médical et/ou biologique  Scoop.it « gratuit »  https://www.scoop.it/pricing  1 sujet, (50 posts max… illimité)
  • 9. Curating information is reading and writing Title Illustration Body Comments Tags
  • 10. Apprendre Chercher et trouver  Des exemples, des méthodes  Quelles recherches  Recherche Médicale  Recherche Chirurgicale  Recherche Biologique  Recherche Imagerie  Recherche fondamentale  Recherche clinique
  • 11. Où fait-on de la recherche?  Universités, Facultés, UFRs  EPST (Inserm, CNRS, INRA, Inria…)  EA (AERES/ARS)  CHUs  CIC, CEC, CIT, CICancer, CIB  CRB, Thèques…  Cancéropôles  Industrie  Laboratoires Pharmaceutiques  Start Up, Spin Off  Laboratoires Biotechnologies, Imagerie
  • 12. Qui soutient la recherche?  Les états  Les organismes publics  Les Ministères (Recherche, Enseignement supérieur, Industrie, Innovation)  Les Régions  L’Europe  Les organismes privés  Industrie  Associations charitables  Ligue, ARC, x Associations, Charities
  • 13. Que fait-on en recherche (clinique) médicale et chirurgicale?  Faire des expériences?  Faire des manipulations?  Travailler dans un laboratoire?  Travailler avec des animaux?  Travailler avec des patients?  Travailler dans un service hospitalier?  Recueillir des données et faire des statistiques?  Lire et écrire
  • 14. Once upon a time…  Academic (reading) and writing  Numerous presentations and publications  ECIL,  BOBCATSS  WRAB  NASCE, Nancy 2023
  • 15. Recent Evolutions and Concerns INFOBESITY • Too much information is killing information... • and Knowledge – Surinformation, Pollution informationnelle, – Harcèlement textuel • Networking – From individuals and communities of interest – To (social) networks
  • 16. Research skills  Autodidacte!  “Research Tools” can be defined as vehicles that broadly facilitate research and related activities…. enable researchers to collect, organize, analyze, visualize and publicized research outputs….  https://figshare.com/articles/Research_Skills_Session_1 _Introduction/9931163/1
  • 18.  "Literacy is the ability to communicate in all forms for all purposes. If we are literate, we have the reading, writing and oracy skills and knowledge needed for success in life.​  Numérique, digitale, santé… MIL Week 2022/3
  • 20. Researcher development framework UK2018 information literacy
  • 21. Lire… et écrire  Accéder à l’information  Papier ou numérique  Centres de documentation, bibliothèques,  En ligne, via internet  Sélectionner l’information  Stocker l’information  Retrouver l’information  Utiliser l’information
  • 22. Forbes http://www.forbes.com/sites/chrisperry/2011/10/27/do- organizations-need-a-chief-content-officer/Trop d'information....  YouTube users upload two days of video every minute. They receive up to 3 billion views per day.  Twitter users generate over 2 million daily tweets. 2,200 new tweets every second.  The average Facebook user creates 90 pieces of content each month. More than 30 billion pieces are shared monthly, an average over 7 billion a week.  Google takes in over 8.5 billion monthly search queries to find relevance in it all.
  • 23. Information scientifique et technique: Matière première du médecin, du scientifique, du malade, du consommateur Produit fini du médecin, du scientifique, du chercheur Produit à haute valeur ajoutée Produit à valeur stratégique
  • 24. L'IST: une espèce vivante ou des populations cellulaires  ..démographie galopante  Ou prolifération  ..inégalités géographiques et socio- culturelles  Ou hétérogénéité, sélection  ..Histoire et oubli  Ou Mémoire (immunitaire- neurologique) et apoptose, mort
  • 25. Pourquoi un immunologiste intéressé par l'IST  SCICOM « CD-ROM ».SCICOM 2  Mission Ministère Recherche  Mission à la Documentation UHP  Contacts Liège, UGR, Lausanne...  Publications, Livres...  UEMS, EACCME: e-learning  Site ASSIM, Blogs, Linkedin,Twitter  Scoop-it..
  • 26. Selon vos besoins, variables selon votre développement • Recherche fondamentale et clinique • Etudes de Médecine, Préparation à l'internat – UMVF • FMC (CME), DPC (CPD) • E-Learning • Concept de portfolio
  • 27. Un peu d ’histoire  L ’information scientifique et technique  un phénomène récent, un siècle environ  du « savant fou »... aux équipes pléthoriques  de la monographie,  à la publication avec plusieurs centaines d ’auteurs  Quel futur au 3ème millénaire?
  • 28. Histoire: depuis 350 ans • Depuis...le XVIIème siècle  Philosophical transactions (Royal Society)  Le journal des scavans 1665 • XVIIIème: Encyclopédie France • XIXème: Allemagne • XXème: USA • XXIème: ???
  • 29. Circulation de l’information scientifique  Analogue au circuit de l’eau dans la nature  les récepteurs reçoivent l’information sous forme variée, pluie, neige, grêle...  les émetteurs produisent de l’information…  celle-ci s’accumule dans des réservoirs, mer, lacs, neiges éternelles, glaciers  les conservateurs stockent l ’information
  • 30. Le Circuit de l'eau
  • 31. En images MASSE d'information en croissance exponentielle INTERNATIONALISATION évidente l’anglais est devenu la langue vernaculaire Influence de la NUMERISATION Evolution des OUTILS d’accès à l’INFORMATION et des SUPPORTS
  • 32. Masse information toujours croissante! Posted on April 2nd, 2010 by Allison Van Gemert depuis December 2006 PubMed Central, a full-text archive of journals freely available to all - PubMedCentral currently holds over 1.7 million articles PubMed, a freely available index of biomedical abstracts published by the National Center for Biotechnology Information has a collection of more than 19 million citations. Scopus, a subscription-only database of journals covers a wider range of literature than PubMed and currently claims to have indexed over 40 million records. Evolution récente: De 800 000 par an en 2000 à 1 800 000 en 2015 One paper per minute is based on 679,858 papers per year in 2009 / = 1.29 papers per minute. Maintenant Chaque minute 3,4 2022
  • 33. Livres and Books  GoogleBooks:http://booksearch.blog spot.com/ Books of the World, stand up! and be counted All 129 864 880 Thursday, August 05, 2010 at 8:26 AM The current number is around 210 million. Is that a final number of books in the world? Not quite. We still have to exclude non-books such as microforms (8 million), audio recordings (4.5 million), videos (2 million), maps (another 2 million), t-shirts with ISBNs (about one thousand), turkey probes (1, added to a library catalog as an April Fools joke), and other items for which we receive catalog entries.
  • 34. Mais... • Croissance un log tous les 50 ans, on parlait de 40 000 en 1995 • Les journaux en support papier sont en train de disparaître … • Remplacés par
  • 35. surf
  • 36.
  • 37. LES DOCUMENTS PRIMAIRES L'INFORMATION SECONDAIRE LA LITTERATURE GRISE
  • 38. La littérature scientifique • Littérature en noir et blanc: les documents primaires • Littérature en couleur: journaux et magazines • Littérature grise • Littérature multicolore: les catalogues commerciaux
  • 39. LES DOCUMENTS PRIMAIRES JOURNAUX (25 000) ET ARTICLES •ARTICLES ORIGINAUX ANATOMIE D'UN ARTICLE SCIENTIFIQUE •LETTRES •REVUES GENERALES Journaux de REVUES LIVRES ou Book series DIDACTIQUES...TEXTBOOKS
  • 40. Quelles fonctions pour une revue scientifique?  La dissémination de l’information  Le contrôle de qualité de la recherche  la constitution d’archives « canoniques »  la reconnaissance portée aux auteurs
  • 41. La forme JOURNAL était apparue la plus adéquate  Regroupement d’articles dans un ensemble diffusé en bloc aux abonnés  Parution à dates données, régulières  Traitement des articles, qualité typographie, langage  non modification après publication  garantie de retrouver un article/référence
  • 42. Apprendre à lire, à écrire  Ce qu’on ne nous a jamais appris à la Fac!  Apprendre à trouver  connaître les bases de données  apprendre à interroger ces bases  Lire, sélectionner...  sur les bases de données:  TITRE, auteurs, mots-clés, résumé…  Classer et retrouver...
  • 43. Anatomie macroscopique d’un article scientifique: Titre «self-explaining» Auteurs (Noms, prénoms, titres...), Adresses Résumé (structuration)  Mots Clés (indexation) Abréviations (etc!)  Introduction (rationale)  Matériel et méthodes (reproductibilité)  Résultats (statistiques)  Figures et tableaux (légendes, PAO, visibilité)  Discussion (des résultats aux hypothèses) Références (normes à respecter)  Remerciements (collaborations, financements)
  • 44. De systèmes ésotériques... au langage naturel  Mots-clés, keywords...  MESH
  • 45. Références  Respecter le format  Vancouver  Des fiches bristol...  À l'utilisation de logiciels spécialisés (>25)  EndNote, reference manager  Les DOI (Digital Object Identifier)
  • 47. Apprendre à lire, à écrire Lire un article:Désordre de Lecture remerciements!, fin de l’introduction, ou début de la discussion, méthodes, références, légendes des figures et tableaux, introduction ou discussion, résultats Ecrire:..... au maximum 4 pages double interligne à l ’heure
  • 48. LA PRODUCTION D'INFORMATION Physiologie d'un article scientifique Conception Développement Naissance Vie et Mort Le concept d'EVALUATION
  • 49. Développement et physiologie d’un article scientifique Conception Fécondation in vitro ou sexualité de groupe Embryologie beaucoup plus long que chez les éléphants les avortements sont fréquents, et l’accouchement difficile  beaucoup de partenaires, quelques bonnes fées et des accoucheurs Vie et mort d’un article beaucoup d’appelés, peu d’élus
  • 50. Embryologie Bibliothèques et paillasses lecture, expérimentation, observation consignation dans un cahier Lab Notebook https://www.sciencemag.org/careers/2019 /09/how-keep-lab-notebook Ordinateur, postes et publishers rédactions et écritures un manuscrit, soumission, éditeur, Peer Review, referees, refus ou! révisions, manuscrit, éditeur, referees, accepté! imprimeur, bon à tirer, publication, diffusion, bibliothèques
  • 51. Peer Review  Peer review is a process used in the selection of manuscripts for journal publication and proposals for grant funding. It is tightly linked to the allocation of scarce resources so that those resources can be deployed to maximally foster innovation and scientific progress.  Nevertheless, peer review is not a process without flaws and limitations.  Researchers have identified issues related to its fairness and transparency, including conservatism and risk-taking, gender and other bias, as well as predictability, reliability, and validity issues
  • 52. Physiologie: Vie, Mort et à quoi ça sert Lieu de naissance Vie personnelle d’un article Etre lu par des chercheurs, médecins, journalistes, étudiants Etre compris Etre évalué, être CITE Rester inconnu, être oublié, ressusciter
  • 53. Physiologie: Vie, Mort et à quoi ça sert Vie sociale des articles Etre utile à ses auteurs (DEA, Thèse, Titres et travaux... position) Etre utile à son environnement (équipe, unité, université, ville, hôpital) ETRE EVALUE?
  • 54. Le Concept d’évaluation  Distribution des fréquences de citation des articles scientifiques  1 citation: 56%  2-4: 24%  50-99: 1% cumulé: 99.56%  1000: 1300 / 32 728 729=0.00004  Facteur d’impact…  durée de citation...
  • 55. William Bruce Cameron  Not everything that can be counted counts  And not everything that counts can be counted!  William Bruce Cameron (born February 2, 1960) is an American author, columnist, and humorist. Cameron is most famous for his novel A Dog's Purpose,[1] which spent 19 weeks on the New York Times bestseller list.
  • 56. 2018  Out of some 45.5M articles and proceedings papers published and indexed in Web of Science since 1970, only .01% have been cited 2000 times or more.
  • 57. Impact factor(s) SCI!!! • Impact Factor (Eugene Garfield)  Citation frequency?  Immediacy index  Cited half-life Indicateurs d'impact  H index Indicateurs de production
  • 58. L ’information grise Les Thèses Les Brevets et Normes Sites spécifiques « Espacenet » Les Rapports publics Les Rapports privés Internet? Trop d’information tue l’information
  • 59. La littérature multicolore  Les catalogues des fabricants  ex: SIGMA, R&D  Les revues «interface»  Les sites internet spécialisés
  • 60. L'information SECONDAIRE ou TERTIAIRE ou PLUS Journaux Médicaux quotidiens hebdomadaires MAGAZINES d'actualités Journaux non médicaux quotidiens hebdomadaires mensuels autres AUDIO-VISUEL: RADIO, TELEVISION INTERNET: sites spécialisés
  • 61. Wikipedia? • Nature Medicine 2007;13: 231-233
  • 62. LES ACCES A L'INFORMATION ABONNEMENTS BIBLIOTHEQUES PHOTOCOPIES TIRES A PART SOMMAIRES de Revues Index de Sommaires REVUES de Sommaires ... + Résumés (Summaries)
  • 63. Bases de données: Medline, PuBMeD (Pascal) Current Contents... Web of Science Scopus Google Scholar https://osf.io/preprints/socarxiv/42nkm/
  • 65. Les opportunités de l ’électronique indexation en texte intégral outils de recherche intelligents inclusion de données actives liens hypertextes vers d’autres ressources open peer comments…living seminar multimédia utilisation du réseau
  • 66. Numérisation: intérêt pratique http://www.scd.uhp-nancy.fr/ • A Nancy et ailleurs... – des étagères et du PEB aux périodiques en texte intégral… – marcher – feuilleter – «cliquer»
  • 67. Les Revues électroniques Qu’est ce qui a changé?  l’accès au réseau, dans les universités, dans les Hôpitaux  l’accès aux bases de données PUBMED (références, et résumés)  l’accès aux éditeurs et aux instructions aux auteurs Qu’est ce qui va changer?  le réseau  les accès au document primaire ? et son format?  les BU /SCD  A qui sont ces articles ? QUI PAYE? Qu’est ce qui ne change pas? les end-users ! les nécessités: de lire d’avoir des résultats, d’écrire... d’un peer-review
  • 68. Classer... et retrouver • Des boîtes de photocopies et des fiches en carton  Academia de Lincei • Aux logiciels de bibliographie et à votre PC • ZOTERO: Zotero est un logiciel de gestion de références gratuit, libre et open source qui s'inscrit dans la philosophie du Web 2.0. Il permet de gérer des données bibliographiques et des documents de recherche.
  • 69. Browsing Feuilleter…. Google images! • Feuilleter: to leaf through books 㼀 1. Young twigs, leaves, and shoots that are fit for animals to eat. • To browse [Probably from obsolete French broust, young shoot, from Old French brost, a. To inspect something leisurely and casually: browsed through the map collection for items of interest. b. To read something superficially by selecting passages at random: browsed through the report during lunch. 2. To look for information on the Internet. 3. To feed on leaves, young shoots, and other vegetation; graze. a. To nibble; crop. b. To graze on. • Marcher vers la BU?
  • 70. Bases de données  Crossref  Dimensions  Google Scholar,  Microsoft Academic,  Scopus  Web of Science  https://www.ilovefreesoftware.com/2 4/featured/free-search-engines-for- academic-research.html
  • 71. Les Réseaux Sociaux spécialisés  Pas vraiment Facebook, ni QQ  Mais  Linkedin  Academia.edu  Biomed experts  Research Gate  Le Top 20 des réseaux sociaux scientifiques  http://www.knowtex.com/blog/le-top-20-des-reseaux-sociaux- scientifiques/
  • 72. Les ressources OPEN Access • Concept Open Access • Bases de données et Moteurs de recherche  Google Scholar  Thèses.fr  Gold, green  Diamond
  • 73. OPEN SOURCE  OPEN Access  Green,  Gold,  DIAMOND  PREPRINTS  ArXiv  Production MedRXiv, chiffres, qualité
  • 75. Retour sur les coûts  A qui sont les articles ?  QUI VA PAYER?  OPEN ou FREE
  • 76. Predatory journals, meetings…  Editors  Open access  Up to 8000 journals?  https://beallslist.weebly.com/
  • 77. SCI-HUB… LIBGEN  En 2019, 8 ans de recul  76 millions articles  400 000 users
  • 78. Mauvais comportements des auteurs  Triche (CHEATING)  Plagiat  Fraude scientifique/retraction watch  CASH REWARDS En ChinE  Hyperprolifiques (2/3 en Biologie/santé)  >3 articles par semaine
  • 79. Education e-learning... to MOOC  From Portfolio...  To Massive Open Online Course As we always says at Scoop.it, curation is expression, action and passion. It is also a soft revolution for the classroom. Early, teachers saw us as a potential education tool.
  • 80. Son et Image • Podcasts: NEJM, Nature, Science Hstalks (payants) http://hstalks.com/main/search_bar.php?s= immunology&l=252&k=TALK • Videos: NIH – You can practice your english/american easily • YOUTUBE et – Examen neurologique
  • 81. Aimez vous les vidéos? Utilisez vous les podcast?  UMVF: canal U  http://www.canal- u.tv/themes/sciences_de_la_sante_e t_du_sport  Au NIH, cela dépasse l’internat  NIH videocasting and podcasting  http://videocast.nih.gov/
  • 82. Les moteurs de recherche  Google, Yahoo, Bing…  Wikipedia?  Nature Medicine 2007;13: 231-233  Unpaywall  Dimensions  Kopernio
  • 83. What do you do when you search something on Google • Physiology
  • 84. Other resources (en anglais)  emedicine by WebMD  http://emedicine.medscape.com/  Sur PubMed  OMIM  Books  PubMedCentral (Free archives)  Cochrane? 25 y EBP  McMaster
  • 85. Suivre l'actualité But when there are 200 000 000 tweets per day or more activity on the web in 60 seconds than you could produce in a whole life, how to be sure your online strategy is still efficient  Once upon a time...  Current Contents  Flux RSS?  Scoop.it  Pearltrees  Q Medicus
  • 87. Generating Impact  But de la recherche?
  • 89. Connectivism  …is this an informal learning theory or is it a combination of learning theories based on our digital age? The simple fact is that information, unlike in the past, is now available to anyone who has an internet connection.
  • 90. Veille et sérendipité  Individuelle ou collaborative  https://www.media-paris-saclay.fr/il- etait-une-fois-la-serendipite/
  • 91. Méthodes de travail! Active-learning  À L’Ecole  Programmes… Examen  En Recherche  Cahier de laboratoire  Electronic-lab-book  A l’Université et tout au long de la vie  Logbook,  Portfolio  E-portfolio  Learning while working
  • 92. Workplace-Based Assessment Assessing a trainee’s progress  Assessing competences in laboratory procedures and clinical skills  Assessing trainee’s skills in clinical examination  Case-based discussions An hindrance: duration (5years) and diversity of training How to help trainees in acquiring skills and competences?
  • 93.
  • 94. Portfolio: old and new words, evolving concepts in training  From « Titres et travaux » to portfolio  Logbook..  Book  Portfolio  a tool for training and legitimation
  • 95. E-portfolio: the future  Usage of internet and web 2.0  Access anywhere anytime  UK: Wales  Europe:Elfel project
  • 96. Portfolio A simple digital platform where your work, skills, ideas & achievements can shine. is: • A place to assemble, collect & share work using a wide range of embedded multimedia. • A place to keep & add to your work for life. • A place to create, develop, identify & evaluate ideas, research, learning, and projects. Your interactive bulb CV/Resume allows you to show actual evidence of your strengths, achievements, and passions versus simply just writing about them.
  • 97. To learn… curate  Active learning  with scoop.it
  • 98. Where are you?  Learner/trainee
  • 99. SCOOP.IT  MA PAGE  Principale 
  • 100. FUTURS? depuis 2023…  AI: Unlocking Academic Excellence: How AI-Powered E-Research Tools Are Transforming Research…
  • 101.
  • 102. Content Curation supports Learning and Training through Reading Riga January 2018 GC Faure MD, PhD Immunology Université Lorraine, Nancy F Arnal CPGE Lycée C Fauriel St Etienne
  • 103. Overview Context = Infobesity From Knowledge Management to Information Literacy Trainees and PhD students : Europe, OCDE, UNESCO (MIL) Curation: Tools, Scoop.it Geography Immunology and related topics Benefits and Challenges « From STEM to STREAM »
  • 104. Information Literacy (IL) in higher education: • Society 2020 requires – Multi-skilled learners – Able to think critically – Pose and solve problems – Become independent and life long learners  Postgraduate and PhD students • OCDE and UNESCO: (MIL) Media and Information Literacy Recognize needs of information!! Localize information! Select information Organize information
  • 105. Recent Evolutions and Concerns INFOBESITY • Too much information is killing information... • and Knowledge – Surinformation, Pollution informationnelle, – Harcèlement textuel • Networking – From individuals and communities of interest – To (social) networks
  • 106. CURATION for knowledge management What is curation? – A recent concept – Many tools • Scoop.it Vs other tools • Experiences with Scoop.it in immunology • Other experiences for – Other fields of Research, – Science mediation – Information literacy
  • 107. Curation is... gold panning, DJ playing, Hunting-gathering, Scouting • Selection – Agregation, distillation, • Commenting • Editorialisation – Elevation, mashup • Diffusion – Sharing
  • 108. Curation tools (>50) • Google news • Pearltrees, Paper.li, Pinterest, TumblR, Storify, Sharezy, Flipboard... • Scoop.it – A french and californian start-up – Various plans (Individual, Education, Business) – Growing
  • 109. Geography Literary Preparatory classes: (Hypo-Khâgne St Etienne) #50 + 40 students >5years • Teacher activity: curation with Scoop.it, paper.li of topic of the year exams China, Brasil… • Students activity: curation with Scoop.it, Pearltrees, Pinterest; sharing with Twitter, Facebook Evaluation on learning, Openings for language learning
  • 110. Immunology Topics By Teachers • Basic Science, Biotechnologies, BioTherapies – Immunology (>6K scoops, >75K visitors, >106K views) – From Flow Cytometry to Cytomics (>4K scoops, >21K views) – Immunology and Biotherapies (>6K scoops, >17K views) – Mucosal Immunity (>3,3K scoops, >10K views) • Immuno-Pathology – Autoimmunity, (>2,8K scoops, >8,5K views) – Allergy and clinical immunology
  • 111. Topics covered using Scoop.it • By researchers and students – M. de Carvalho Nancy Immune monitoring – R.Creusot, Columbia NY USA Diabetes – By students – PhD students XW China ENT, – Master students from Nancy-Wuhan Training program : Methodologies of medical clinical and surgical research – 10 chinese + 20 french students – Topics related to medicine and biology – Bonus points based on activity (searching, posting, commenting and tagging) – To be included into competences referential
  • 112. Finding information Focused or serendipitous Building and enrichment of content hubs • Traditional searching (Pubmed, Google scholar) • Crawling of internet with Scoop.it , personalized +++ •Sources: Published Journals, •Websites, Blogs, Press releases •Social networks (Twitter, Linkedin, Facebook..) Research social networks (Researchgate..) • Curating when browsing (Use of applet) • Reposting of scoops (from followed topics) • Creation of scoops + publishing (Slideshare)
  • 113. Curating information is reading and writing Title Illustration Body Comments Tags
  • 114. Sharing and retrieving OPEN and actualized webmagazine Tagged, commented, discussed Attractive (pictures) Rediffused on other networks (Twitter, Linkedin (25) Facebook, Google+ Via e-mails, newsletters Content Hubs Are Searchable for retrieving
  • 115. You and  … curation
  • 116. Opportunities in training New ways of learning: Flipped or blended or hybrid Help students master information techniques: learning by reading and writing Stimulating curiosity in a field and adjacent areas
  • 117. Benefits for students and trainees end-users (1)Building personal content hubs for their master and PhD training projects (2) Becoming information literate and able to surf the information wave (3) Becoming information literate for future life- long learning in universities, research centers or industry
  • 118. Benefits for teachers and researchers end-users (1)Keeping abreast of scientific (and societal) information for individual continuous education and e-learning (2) Building leadership in a dedicated field (3)Joining a network of specialists and communities of interest (4)Open serendipitous research fields
  • 119. Challenges The human factor of curation is the added value compared to algorithms: selection, editorialism Human dependency of curation A « day to day » duty for scientists and researchers like « walking the dog » Permanence of tools Individualism of some researchers Reluctance to share
  • 120. From STEM to STR(eading)EAM Context = Infobesity From Knowledge Management to Information Literacy Trainees and PhD students : Europe, OCDE, UNESCO (MIL) Curation: What is it? Tools, Scoop.it Geography Immunology and related topics Benefits and Challenges READING as a core competency
  • 121. Disclaimer once upon a time… Europe SCICOM meetings Paris MRES Comité stratégique IST UHP Nancy 1 Chargé de mission DOC AUF: ASSIM: maître toile (http://www.assim.refer.org) http://www.scoop.it/u/gilbertcfaure No conflict of interest to declare
  • 122.
  • 123. L’UMVF:  Fédération Inter- Universitaire pour l’Université Médicale Virtuelle Francophone  GIP FIU-UMVF  MEN, MESR, MEFI  JO 13 Aout 2003  33 Universités  http://www.umvf.prd.fr/in fo/qui/presentation.html
  • 124. L’UMVF: ses missions  mettre en œuvre les technologies de l’information et de la communication pour l'enseignement (TICE) de la médecine en formations initiale et continue.  Centre de ressources interactif dans le domaine de la santé  Centre d’information et de prévention pour le public  Diffusion et de promotion de la science médicale française dans le monde.  produire des ressources documentaires venant en complément des cours.  Etudiants de 2e cycle préparant les Epreuves Classantes Nationales (ECN)… une banque de données  Plus d'une trentaine de campus numériques disciplinaires  soutenue par  la Conférence des Présidents d’Université  la Conférence Nationale des Doyens des Facultés de Médecine.
  • 125. Les Campus Numériques http://www.umvf.prd.fr/ressources/campus.php  Plus de 45 en fait,  Toutes disciplines du premier cycle  Histologie- embryologie  Microbiologie  Statistiques  à l’ECN  Néphrologie  Neurologie  Rhumatologie…
  • 126. ASSIM: RAISIL Réseau d’accès à l’information scientifique en ligne http://www.assim.refer.org  Les questions du module 8 Immunologie  De 112 à 127  Une structure en briques de connaissance  Des cas cliniques  Des réponses  Pas de QCMs
  • 127. Doc’UMVF  Nouvelle Page ECN 2010  345 items  Plus de 2000 documents pédagogiques  CISMEF Rouen  S Darmoni  JP Thirion
  • 128. Autres ressources d’intérêt en langue française  CNCI  http://www.cnci.univ-paris5.fr/welcome.html  Concours Médecins étrangers  Annales QCM 2005-2007: 3x120  http://www.cnci.univ- paris5.fr/medecine/Annales_ETR.html  Les pages ECN de l’HAS +++  http://www.has- sante.fr/portail/jcms/c_646948/examen-classant- national-ecn-mot-du-president-sommaire-mode-d- emploi  Mise à jour mensuelle  ORPHANET++