MASTER 1 BMC
2012-2013
MAITRISE DE
L’INFORMATION
SCIENTIFIQUE
claire.sonnefraud@upmc.fr
Mise à jour août 2012

Contenu de la formation
1 cours en salle info : 3h
1 examen : 1h
Formation à distance : cours et annales
disponibles sur Jubil
Dates des examens:
Semaine du 17 décembre 2012.
Notes des examens : la note est sur 5 et est incluse dans
la note de participation.

Formation à distance
 Ce diaporama, des annales et un mémo sont
disponibles sur la page des Master sur Jubil :
http://www.jubil.upmc.fr/fr/guides_recherche/maste
r_sciences/master_biologie.html
 Pour compléter, il est conseillé de lire les
supports de cours spécialisés sur : Recherche
bibliographique en biologie ; Catalogue de la
BUPMC ; PubMed initiation ; Web of Science
http://www.jubil.upmc.fr/fr/guides_recherche/master_scienc
es/tutoriels.html

Plan du cours
1. Méthodes de la recherche bibliographique
Recherche d’articles ; accès aux ressources de la
BUPMC ; astuces de recherche
2. Web of Science
3. PubMed

Méthodes de la recherche
bibliographique

Méthodes de la recherche
bibliographique
 Jubil
 Guides de recherche : supports de cours
 Jubil ressources en ligne
 Recherche d’article
 Recherche d’article sur Jubil : liste A-Z
 Catalogue BUPMC. Sudoc.
 Trucs et astuces : traduction de mots-clés
 Trucs et astuces : équation de recherche

Jubil
www.jubil.upmc.fr
 Le site de la BUPMC permet de retrouver
les principales informations sur les
bibliothèques et d’accéder aux ressources
documentaires.

Présentation du site :

Informations sur les
bibliothèques
Pour connaître la localisation, les horaires,
conditions d’inscription et autres informations
pratiques sur le réseau des bibliothèques, il
suffit de naviguer sur leurs pages.
La rubrique « services » récapitule les aides
disponibles dans les sections :
- Prêt entre bibliothèques
- Prêt d’ordinateurs portables
- Accès Wifi
Etc.

Recherche d’informations : les
outils
Le nouveau site ne comporte pas de moteur
de recherche intégré pour l’instant :
- Catalogues = recherche sur les collections
de la BUPMC + liens vers d’autres
catalogues
- Ressources en ligne = listes des bases de
données et plateformes de revues auxquelles
est abonnée la BUPMC + liste A-Z des
revues @
- HAL-UPMC : lien vers le portail
institutionnel de l’archive ouverte UPMC.
- Jubilothèque : bibliothèque numérique de
la BUPMC

Guides de recherche
Des tutoriels permettent de
prendre en main rapidement les
différents outils documentaires
accessibles : catalogues, bases
de données, plateformes
d’éditeurs scientifiques… ou
encore d’apprendre à faire une
recherche documentaire
efficace ou à utiliser un logiciel
de gestion de références
bibliographiques (Zotero, etc.)

Jubil ressources en ligne
La page donne accès à la
liste A-Z des revues @
accessibles par les
abonnements UPMC.
Les autres rubriques
(revues, e-books, bases)
recensent les « bouquets »
ou bases de données :
Science Direct, Georef,
Web of Science, etc.

Rechercher des articles
Attention : seule la recherche par titre de revue est
possible sur le catalogue et la liste A-Z.
Lire un état de collection :
vol. 1, n. 3 (1965) – …
vol. 1, n. 3 (1965) – vol. 10, n. 5 (1975)
vol. 1, n. 3 (1965) – vol. 10, n. 5 (1975) ; vol. 12, n. 1
(1977) – …
La cote : identification du livre dans la bibliothèque,
son adresse.

Rechercher des articles sur Jubil
De plus en plus d’abonnements e-only
Des collections papier très riches
Vérifier la complémentarité des abonnements papier et
online : avec trois outils complémentaires
- La liste A-Z (support électronique, niveau revue)
- Le catalogue (support papier, niveau revue)
- Le résolveur de lien sur les bases de données
bibliographiques (support électronique, niveau article)

Liste A – Z : présentation
 Les titres signalés sur cette liste sont tous
accessibles aux membres de l’UPMC, soit sur
abonnement, soit en accès libre.
 En avril 2012, plus de 13 000 titres sont
signalés. Ce total est mis à jour régulièrement
en fonction des abonnements et
désabonnements.

Comment y accéder?
http://sfxeu06.hosted.exlibrisgroup.com/33UPMC/az
OU

Liste des revues
3 types de recherche:
 Recherche simple
 Recherche par discipline
 Recherche avancée

Recherche simple
 Taper un titre
et cliquer sur
OK
OU
 Feuilleter les
titres par ordre
alphabétique

Recherche par discipline
Affichage des titres en fonction de la discipline et
sous-discipline recherchée

Recherche avancée
Recherche d’un titre de revue via les champs Titre,
Issn, Discipline, Fournisseur.

Résultats
 Sur la page de résultat (liste de titres) : Deux
types d’affichage des titres sont possibles : Vue
tabulaire / Vue abrégée
 Le bouton permet d’accéder au texte intégral de la
revue, ainsi qu’à plusieurs services associés au titre
 Le bouton donne accès à des informations sur la
revue (titre, titre abrégé, Issn, état de collection,
discipline)

Exemples : Biologie

Catalogue BUPMC
http://catalogue-bibliotheques.upmc.fr

Contenu du catalogue
Le catalogue permet de chercher et de
localiser :
 tous les documents « physiquement »
présents dans les bibliothèques : livres,
revues, cartes, thèses, DVD, etc.
 les livres numériques (e-books)

Recherche simple
Recherche par :
- mots
- liste alphabétique
Recherche de
base : tous les
mots de la notice
Possibilité de
limiter sa
recherche sur le
titre, l’auteur, le
sujet, etc.

Recherche avancée
Possibilité de
croiser plusieurs
champs
Possibilités de limitation:
- Par bibliothèque
- Par langue
- Par type de support
- Par date

Recherche avancée
Possibilités de limitation:
- Par bibliothèque
- Par langue
- Par type de support
- Par date

Recherche avancée
Possibilités de limitation:
- Par bibliothèque
- Par langue
- Par type de support
- Par date

Liste de résultats
Rappel de la recherche
Livre
Ebook
Accès au texte intégral
Exporter ces résultats

Lire les résultats
Localisation de l’ouvrage:
bibliothèque et cote
Possibilité de rebondir en
relançant des recherches à
partir d’informations de la
notice trouvée

Affiner ses résultats

Recherche par cote
Permet de naviguer, de page de cote en page de cote

Détail d’une notice de livre
ISBN
Mots-clés
cliquables
Rebonds
Cote

Détail d’un livre dans une
collection
Titre collection
Mots-clés
cliquables
Rebonds

Détail d’un périodique
Titre
Volume
Editeur
Numéro
Date
Eléments à prendre
également en compte :
-Périodicité
-ISSN

Si le livre n’est pas dans les
catalogues de l’UPMC
• Consulter le
SUDOC(Système
Universitaire de
DOCumentation)
• Ouvrages de toutes
les bibliothèques
universitaires de
France (livres,
revues, thèses…)

Page d’accueil du SUDOC
37

Page de résultats SUDOC
Différentes icônes suivant le type de document

Détail d’un résultat SUDOC

SUDOC : où trouver le document
Les bibliothèques qui
possèdent
le livre peuvent
l’envoyer dans votre
bibliothèque

Le prêt entre bibliothèques (PEB)
• Intérêt du SUDOC : trouver un livre, un mémoire
ou une revue qui ne sont pas dans une
bibliothèque de l’UPMC
• Si l’ouvrage ou la revue ne sont pas dans une
bibliothèque proche, on peut se les procurer via
le PEB
• Payant : 6 € par ouvrage, 3 € par article (50
pages max.) pour des photocopies
• Quelques jours après, vous venez retirer
l’ouvrage ou les photocopies dans votre
bibliothèque

Trucs et astuces : Trouver
des traductions de mots-clés
http://www.granddictionnaire.com/
Grand dictionnaire terminologique
Dédié aux sciences et techniques
Bilingue : français/anglais
Définitions précises
Synonymes et expressions dérivées
Facile à utiliser
Gratuit

Trucs et astuces : Trouver
des traductions de mots-clés
 Le dictionnaire TermSciences du CNRS
http://www.termsciences.fr/
 Portail Terminologique de santé :
http://pts.chu-rouen.fr/ (traduction en français
des mots-clés MeSH)

Trucs et astuces : Equation
de recherche
Opérateurs booléens (ou logiques)
- pour construire une équation de recherche
- fonctionnent selon un ordre de priorité :
() : associe deux termes et un opérateur
SAME : recherche dans la même phrase
NOT : exclusion
AND : intersection
OR : union

Trucs et astuces : Equation
de recherche
Opérateurs booléens les plus courants
AND : intersection
OR : union
NOT : exclusion

Trucs et astuces : Equation
de recherche
 Troncature
? 1 caractère seulement
* 0 ou plusieurs caractères
$ 1 ou 0 caractères
Gene* >>> Genes, General, Generation
Dosto?evsk* >>> Dostoyevsky, Dostoievskii

Trucs et astuces : Equation
de recherche
Sur Internet :
* : troncature
« maladie d’Alzheimer » : recherche une
expression
+Alzheimer -maladie: exclure un mot
+Alzheimer +maladie : imposer un mot

Exercices méthodes de la
recherche bibliographique

Web of Science

Web of Science
 Présentation du WoS
 Recherche, tri par citations, affinage
 Résultats
 Liens SFX
 Analyser les résultats
 Recherche avancée

Présentation du Web of
Science (WoS)
 Base de données bibliographique
multidisciplinaire qui fait partie du Web of
Knowledge
 Outil payant (éditeur : Thomson Reuters)
accessible via un abonnement de l'Université
 Non exhaustif, fondé sur la sélection des revues
les plus importantes
 Mesure de l’importance des revues en fonction
du nombre de citations des articles

Accès depuis Jubil
Doctorat/Web of Science

Recherche simple
Attention à bien être
sur l’onglet « Web of
Science »
Sélection
possible de
15 champs
de
recherche
distincts

Tri par citations
Tri par défaut : date de publication. Possibilité
de trier par nombre de citations (Times cited)
Search
Topic : extracell* ATP
 + de 10 450 réf.

Affichage et affinage des
résultats (1)
* Ajout de mot-clef
Possibilité d’afficher le
*tri par catégorie résumé de l’article
du WOS
*tri par type de
document
*tri par sujet
(« Research Areas » + large
que « WoS Categories »)
*tri par affiliation
*etc.

Affiner les résultats (2)
Possibilité
d’inclure ou
Déroulement
des catégories
d’exclure les
du panneau critères
« Refine
Results »

Détail d’un résultat
Alerte à la
citation (nécessité
de créer un compte)
Références
citantes (cet article
est cité par…)
Références en
lien
Références citées
(cet article cite…)
Facteur d’impact

Liens SFX
Ce bouton donne accès au résolveur de lien :
ouvre une nouvelle fenêtre avec la disponibilité
de l’article
- en électronique (« Texte intégral »)
- sinon, en papier à la BUPMC ou ailleurs via le
Sudoc (« Localisations »)

Analyser les résultats
Analyze results : classer un ensemble de résultats par auteur, institution, sujet,
année de publication, titre de revue, type de document, langue
Create Citation report : visualiser les citations et leur distribution dans le
temps pour un ensemble de résultats (fonctionnalité inaccessible au-delà de
10 000 notices)

Analyze results
Paramètres
d’analyse
Inclure/exclure
un ensemble de
résultats
Exporter les
données dans
un fichier .txt

Create citation report
ATTENTION : le Citation Report concerne un ENSEMBLE de
résultats et non pas seule référence
Lien vers
articles citants
Moyenne de
citation par article Lien vers h-index
Retirer des articles du rapport et l’affiner par date
Détails pour chaque article
Doctorat/Web of Science
Export possible
du Citation
Report vers Excel

Champs
Recherche avancée indexés et
opérateurs
Icône
d’accès
aux index
• Advanced search : combiner des requêtes
• Search history :
- combiner des résultats de recherches
- sauvegarder un historique de recherche et créer
des alertes courriel/RSS sur des recherches en
conservant les critères d’affinage (nécessite la
création d’un compte)

Exercices Web of Science

PubMed

PubMed
 Présentation de PubMed
 PubMed Jubil
 MeSH
 Filtres additionnels
 Liens SFX
 Recherche avancée
 Combiner des recherches

Présentation de PubMed
 Outil d’accès à la base de données
bibliographique MEDLINE (Medical Literature
Analysis and Retrieval System Online)
 Exhaustif en sciences biomédicales
 Base publique gratuite, gérée et mise à jour par
la bibliothèque nationale de médecine des États-
Unis (NLM)

PubMed Jubil et SFX
Pour avoir les liens SFX, il faut se connecter via Jubil
Accès distant possible, quand on se connecte
depuis chez soi ou dans son labo !

Interroger PubMed : utiliser
MeSH
• Pour avoir des résultats pertinents, rechercher en
anglais
• Les articles sont indexés avec un système de
mots-clefs hiérarchisés : le MeSH
• MeSH pour Medical Subject Headings
• Intérêts du MeSH :
• gère les synonymes (Trisomy 21 = Down Syndrome =
Mongolism)
• permet de chercher sur le sujet seulement des articles
• permet de réaliser des recherches fines, en allant du
général au particulier

Qu’est-ce que le MeSH ?
● Plus de 26 000 termes, hiérarchisés entre
eux, répartis en 16 grandes catégories
● Mise à jour annuelle
Exemple d’un terme
● Traduction française par l’INSERM dans l’arborescence
du MeSH (on part du
général pour arriver
au plus précis)
Les catégories MeSH
69

Trouver les mots-clés MeSH en
anglais
Le Portail
terminologique de
santé propose la
traduction
française du
vocabulaire MeSH
http://pts.chu-
rouen.fr/

Trouver les mots-clés MeSH en
anglais
Mot clé validé en
anglais, à utiliser
sur PubMed.
Définition
pour vérifier
que c’est le
bon mot
Synonymes pris
en compte avec
ce mot-clé
Autres propositions de
mots-clés à partir du
terme recherché

Mesh : thème principal, sans
explosion, qualificatifs
 Trois fonctionnalités pour affiner les
recherches liées au MeSH :
 Recherche dans les termes qui se trouvent en
dessous dans l’arborescence (explosion)
 Qualificatifs pour rechercher sur un aspect
seulement du mot-clé
 Thème principal de l’article et non un thème
annexe

L’arborescence
Situation du mot
dans
l’arborescence
MeSH : un mot
peut être à
plusieurs endroits
de l’arborescence

Les qualificatifs
Qualificatifs
applicables au mot
pour affiner le
champ de la
recherche

La recherche par thème principal
Possibilité de
sélectionner les
ressources
principales

MeSH sur PubMed
Copier le mot clé anglais trouvé sur le PTS
Chercher dans le
thésaurus MeSH

Ce premier résultat correspond au terme
MeSH sur PubMed
cherché. On peut faire une recherche
générale sur ce terme en cochant la case,
puis en cliquant sur « Add to search
builder » puis « Search PubMed ». Pour
plus d’options, cliquer sur le mot clé.

En cliquant sur le mot clé,
on arrive sur sa notice
MeSH. On retrouve les
qualificatifs…
…le thème principal
et l’explosion…
…les synonymes…
…et la place dans
l’arborescence

Recherche MeSH sur PubMed
…puis ajouter à l’équation
de recherche en cliquant
sur « Add to search
builder » puis chercher
Cocher les options de recherche souhaitées… dans PubMed en cliquant
sur « Search PubMed »

Recherche MeSH sur PubMed
Rappel de
l’équation de
recherche

Filtres et filtres additionnels
Possibilité de filtrer les résultats. Attention : les
filtres restent actifs même si l’on change de
recherche, penser à les désactiver

Détail d’un résultat
Références de l’article
Liens
extérieurs, dont
résolveur de
lien
Liens pour
rebondir vers
d’autres
ressources du
NCBI
Abstract

Recherche avancée
Choix du champ de recherche
Possibilité
Choix du booléen d’ajouter ou
supprimer des
lignes

Combiner des recherches
Cliquer sur le numéro dans
l’historique de recherche pour
choisir un booléen et ajouter la
recherche au « Search Builder »
L’historique de recherche est disponible sur la page
de recherche avancée

Exercices PubMed

Auto-évaluation

Enquête
http://tinyurl.com/Enquete
Master

À bientôt à la bibliothèque !
claire.sonnefraud@upmc.fr