Master chimie 2014

RECHERCHE
BIBLIOGRAPHIQUE
EN MASTER CHIMIE
BU St-Jérôme
Septembre 2014

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Septembre 2014
2
Plan du cours
• Rechercher l’information
• Evaluer l’information
• Présenter l’information
Recherche bibliographique en Master Chimie
>Plan du cours
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Septembre 2014
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Rechercher l’information
• Définir son sujet
 Objectif 1 :
Déterminer le contexte général de sa recherche et la situer dans son
champ disciplinaire, chronologique…
 Objectif 2 :
Trouver les « mots clés » les plus pertinents.
Pour les mots-clés en anglais : Termsciences portail terminologique
scientifique multilingue développé par l’Inist
(http://www.termsciences.fr/)
 Objectif 3 :
Savoir adapter ses mots clés aux différents outils documentaires (moteurs
de recherche, catalogues, bases de données bibliographiques)
>Rechercher l’information
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• Classement des mots-clés du + général au + spécialisé :
Atome de fluor = fluorine atom
Réactifs de fluoration = fluorination reagents
Réaction de fluoration nucléophile =
nucleophilic fluorination

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• Les différents outils d’une recherche bibliographique :
Septembre 2014
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Je veux : J’utilise :
Préciser des notions,
vocabulaire…
Dictionnaires, encyclopédies,
bases de données factuelles.
M’approprier le sujet,
Faire la synthèse des
connaissances…
Encyclopédies spécialisées,
handbooks.
Creuser une
problématique,
Vérifier des hypothèses…
Articles originaux, thèses, actes
de congrès.

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Septembre 2014
6
Quelques outils généralistes en sciences
Le Grand dictionnaire terminologique : dictionnaire de définitions (Accès libre)
TermSciences : dictionnaire de traduction en 3 langues (Accès libre)
Les Techniques de l’Ingénieur : encyclopédie en langue française spécialisée en
sciences et techniques, base documentaire « Sciences fondamentales » (Accès
réservé AMU)
Quelques outils généralistes en chimie
CRC Handbook of chemistry and physics
Chemspider, base de données sur les substances chimiques hébergée par RSC
(Accès libre)
La base CAS Registry de SciFinder (Accès réservé AMU)
Des outils spécialisés en chimie
Matières dangereuses : Fiches toxicologiques de l’INRS (Accès libre); Toxnet
(Accès libre)
Atlas de spectres : Spectral data of organic compounds (Accès libre)
Réactions : Organic chemistry portal (Accès libre) ; CASReact de SciFinder
(Accès réservé AMU) ; Reaxys (Accès réservé AMU)

Pour vous aider dans vos recherches, vous pouvez vous reporter :
-Aux cours des BU AMU sur la recherche documentaire, disponibles sur la plateforme pédagogique
d’AMU, Ametice (accessible via l’ENT > Pédagogie > Ametice> Tous les cours > catégorie
Bibliothèques)
-Aux guides des BU AMU en chimie (+ guides sur les bases Reaxys et Scifinder)
http://bu.univ-amu.libguides.com/
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• Sélectionner les outils pour chercher l’information
- Grandes familles d’outils :
les catalogues
les bases de données
les plates-formes de revues
outils complémentaires : brevets et archives ouvertes
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Rechercher l’information dans les catalogues
Le catalogue Koha commun aux 72 bibliothèques d’Aix-Marseille (il recense
1,4 millions de documents) est accessible via le site web de la BU :
http://bu.univ-amu.fr/
ou sur l’adresse : http://catalogue.univ-aix-marseille.fr/
>Rechercher l’information dans les catalogues
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Accès possible aussi via l’ENT : onglet « BU » > « Compte lecteur »
+ accès à son compte lecteur (pour voir ses documents en prêt,
dates de retour, retards ; prolonger un prêt soi-même ; voir
l’historique de ses recherches; créer des listes; réserver un
document).
- faire des suggestions d’achat.
• .
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11
• Recherche avancée sur Koha:
Elle permet de croiser des arguments de recherche dans tous les index de la
recherche simple (par les opérateurs booléens OU, ET et NON)
Filtres :
- par année de publication, langue du texte, type de publication (livres,
périodiques, ressources électroniques, thèses), localisation (limiter sa recherche à
une bibliothèque ou à un groupe de bibliothèques par domaine : ex. sciences)
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Septembre 2014

12
Accès aux ressources imprimées
• Liste des résultats d’une recherche
Pour trouver physiquement votre document, il faut lire les données d’« exemplaires », qui
vous indiqueront:
- Le type de prêt
- La localisation
- La cote
- La disponibilité
- Particularité pour les périodiques : onglet « Etat de collection », indiquant l’étendue de
l’abonnement
Attention ! Un catalogue ne fournit que des titres de périodiques et non des articles.
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Le classement par cote, qui répartit les connaissances en
catégories, permet de localiser le document dans la BU.
La cote est établie en fonction du sujet abordé.
540 Chimie
541 Chimie Théorique-Chimie quantique
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1414
• Sudoc, catalogue commun de toutes les bibliothèques universitaires
françaises (10 millions de notices)
Il permet de :
- Trouver un document sur un sujet donné
- Localiser ce document dans une bibliothèque universitaire
- Obtenir le prêt du document ou sa reproduction
http://www.sudoc.abes.fr/
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14

151515
Accès aux ressources en ligne
• Accès aux ressources en ligne via le site web de la BU. Si vous êtes hors
campus, pensez à saisir vos identifiants pour avoir accès à nos ressources
accessibles via un abonnement.
• Ou accès aux ressources en ligne via l’ENT (onglet BU> site web BU >
Documentation> Liste des ressources électroniques)
• Contactez le service de questions-réponses en ligne Azimut si vous
constatez des problèmes d’accès.
15
> Rechercher l’information en ligne
Septembre 2014

16
Accès aux ressources en ligne
• Accès à des dizaines de milliers de revues et livres en plein texte à partir de
Bento, répertoire des ressources en ligne (Recherche par Articles &
Revues). Possibilité de recherche par articles dans Google Scholar, par titre
de revues, ou par sujet.
• Onglet Ressources électroniques : accès aux bases de données par leurs
noms ou par la discipline (ex. chimie)
Septembre 2014
Les titres signalés sur cette liste sont
tous accessibles aux membres de
l’AMU, soit sur abonnement, soit en
accès libre.
Cette liste est mise à jour en fonction
des abonnements.

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Les règles de base de l’accès aux ressources en ligne
Les usages communément admis sont la consultation,
l'impression, l'envoi par mél, l'enregistrement sur support fixe
(disque dur) ou mobile (clé USB) d'une partie raisonnable des
contenus proposés.
Les usages généralement interdits sont la diffusion des
contenus à des tiers (non membres de l'université), gratuite
ou commerciale, la reproduction ou mise à disposition sur un
site web ou autre sans demande d'autorisation préalable, la
copie ou le téléchargement massif de contenus, etc...
> Rechercher l’information en ligne

1818
Rechercher l’information dans les bases de données
• Définition :
Les bases de données sont produites par des éditeurs spécialisés et sont
généralement payantes. Elles rassemblent des données structurées, interrogeables
par leur contenu et peuvent être :
• Factuelles : Elles proposent une réponse directe à une question, comme
les bases de données de résultats d’expériences.
• Bibliographiques : elles permettent de retrouver des références de
documents, majoritairement des articles de périodiques, mais aussi des
séries, des actes de congrès.
Elles contiennent essentiellement du texte, fournissent des notices
bibliographiques (fiches signalétiques propres à un document), et les
informations qu’elle proposent sont structurées, exhaustives dans un
domaine.
Les références contiennent le titre de l’article, son auteur, la source (la
revue dont est issu l’article) des mots-clés et un résumé.
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>Rechercher l’information dans les bases de données
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1919
• Scifinder Web/Chemical Abstract Service (CAS)
Le (CAS) indexe la littérature chimique depuis 1907.
Champs couverts par Scifinder Scholar/ Chemical Abstracts :
 Chimie inorganique et organique, chimie physique, ingénierie et chimie
appliquée, génie chimique, biochimie qui représente à elle seule 34% des
notices bibliographiques.
 Références bibliographiques : 62% d’articles de journéux, le reste étant
composé de brevets et communications aux congrès.
Libguide BU AMU Scifinder : http://bu.univ-amu.libguides.com/content.php?pid=584968&sid=4820874
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20
• Accès Scifinder Web/ Chemical Abstracts :
L’accès est possible sur la version web en s’enregistrant à partir du portail de la bibliothèque :
- Créer un compte utilisateur personnel en s’enregistrant sur un ordinateur de la BU (avec une
adresse e-mail valide se terminant par etu.univ-amu.fr).
- Le nom d’utilisateur doit comprendre entre 5 et 15 caractères dont au moins une lettre,
et le mot de passe entre 7 et 15 caractères, dont des chiffres, lettres et caractères non
alphanumériques (@,#,%,&).
- Attendre de recevoir le mail de confirmation à votre adresse e-mail indiquée lors de
l’enregistrement.
- Cliquer sur le lien contenu dans le mail pour activer son enregistrement (délai max de 48
heures).
- Se connecter avec les identifiants créés (nom d’utilisateur et mot de passe).
La session s’interrompt après 15 mn d’inactivité.
Comme il y a un identifiant de session dès l'accès à https://scifinder.cas.org/ et qu'il faut
entrer ensuite un login/mot de passe, il faut plutôt passer par l'adresse suivante pour la
connexion en accès distant :
https://scifinder.cas.org.lama.univ-amu.fr
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21
• Les sous-bases contenues dans Scifinder / Chemical Abstracts :
 CAplus (base bibliographique) : >37 M références bibliographiques depuis le début des années
1800 ; >10 000 revues dépouillées; Brevets issus de 61 offices de brevets; Articles cités depuis
1997(322 M de citations à ce jour); Mise à jour quotidienne.
 CAS Registry (base des substances) : >76 M petites molécules; >63 M séquences (nomenclatures,
propriétés expérimentales et calculées); Substances signalées dans la littérature depuis 1957; mise à
jour quotidienne.
 CASReact (base des réactions) : 56 M réactions extraites de la littérature depuis 1840, conditions de
réaction depuis 2003, mise à jour hebdomadaire.
 Chemcat : >68 M composés disponibles commercialement; >1119 fournisseurs; Mise à jour à chaque
publication ou révision de catalogue, mise à jour à chaque publication de catalogue.
 ChemList: informations réglementaires issues de plus de 100 inventaires mondiaux.
 Marpat : Plus de 975 000 formules génériques de Markush depuis 1961; 380 000 brevets.
 Medline : 22 Millions références bibliographiques biomédicales depuis 1946; 3900 revues biomédicales;
mise à jour 4 fois par semaine
CAPADOC, représentant du CAS en France : http://www.capadoc.com/scifinder.html
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Septembre 2014
22
• Explore
- Ouverture par défaut de la base
bibliographique Caplus et de la
recherche par sujets.
- Accès aux bases factuelles
Casregistry (substances)
Casreact (réactions)

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• Recherche bibliographique : Explore references
Septembre 2014
• Recherche par phrases de mots-
clés, synonymes et abréviations en
utilisant des prépositions et des
conjonctions.
• Recherche automatique de
l’orthographe anglaise ou
américaine, des singuliers et des
pluriels.
• Troncature automatique
• Recherche avancée :
par année de publication, type de
document, nom d’auteur, de
compagnie ou d’organisation.

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Septembre 2014
24
• Sur la page intermédiaire d’affichage des résultats, les notices
sont regroupées par lot, par nombre de concepts décroissant.
« as entered » = adjacence
stricte des termes
« closely associated with
one another » = termes
dans le même champ de la
référence
Termes présents dans la référence mais dans des champs différents

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Septembre 2014
25
• Traitement des résultats
Get
substances/reactions
Liste des
substances/réactions
décrites dans les
références cochées
Get related
Lien vers les
références
citées ou
citantes
Get full text
Le lien vers le plein texte
fonctionne si l’université a
payé les droits d’accès du
document.
Tous les articles ne sont
pas accessibles en ligne:
consultez les catalogues
Sudoc et Koha pour
localiser les périodiques
imprimés.
Tools
Suppression
de doublons
avec Medline,
combinaison
de résultats
de recherche,
ajout de tag
Send to Sciplanner
Espace de travail
interactif identifiant
les options de
synthèse

26
Septembre 2014
26
• Affiner la recherche :
- Analyze : création d’histogrammes sur ≠
critères (auteur…)
- Refine : affiner sa requête en ajoutant des
critères
- Categorize : analyse détaillée par l’index CAS

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Septembre 2014
27
• Save : la fonction de sauvegarde
On peut sauvegarder un lot de références avec « Save », ou pour sauvegarder des
lots de substances et de réactions.
Lors de la connexion suivante, cliquez sur « Saved searches » > « Answer sets » pour
réactiver le lot de références.
Des ensembles de résultats (réaction+ substance) peuvent être combinés.

2828
La section du plan de classement
de la version papier Chemical
Abstract
Identification de la notice
biblio dans CAplus
Identification du
document dont est
issu l’article
• Détail d’une référence
Références de l’article
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Septembre 2014
29
On peut exporter les références
sélectionnées au format RIS vers son
logiciel de gestion de références
bibliographiques
• L’export de références

30
Septembre 2014
30
• La fonction Veille
La fonction de veille Keep me
posted permet de sauvegarder
une équation de recherche sur
le serveur de CAS.
Les mises à jour s’effectuent
une fois par semaine et les
nouveaux résultats s’affichent à
la connexion dans Keep me
posted Results.
Par défaut la sauvegarde est
mise en place pendant un an.

31
Septembre 2014
31
Les modes de
recherche :
Chemical Structure
(par dessin de
structure)
Markush (par
structure Markush)
Molecular Formula
(par formule brute)
Property (propriétés
expérimentales)
Substance Identifier
(register number, nom
commun)
Advanced Search : possibilité
d’affiner la recherche
L’option Studies permet de limiter la
sélection des substances à celles pour
lesquelles existent des notices
bibliographiques portant sur l’analyse,
la préparation etc…
• Recherche par substances : base Cas registry

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Septembre 2014
32
32
• Recherche par Chemical structure : on peut dessiner ou importer le dessin
d’une substance.

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33
• Recherche par identifiant de substance, Substance identifier : on peut
rentrer jusqu’à 25 substances différentes (une par ligne).
33

34
Septembre 2014
34
• La page d’affichage des résultats
Le clic sur le Registry Number
permet d’afficher le détail des
propriétés des substances
Liens vers :
- les références bibliographiques
- les réactions
- Les catalogues commerciaux
- La réglementation en vigueur
(nom de la substance et
référencement dans les registres
nationaux
Liens hypertexte indiquent la disponibilité de spectres (Spectra) et de
propriétés expérimentales (Experimental Properties) sur la fiche détaillée
de la substance.

35
Septembre 2014
35
• Accès à la base CAS react : Explore reactions
Recherche de réactions par dessin de molécules chimiques, « Reaction structure ».
35
Advanced Search : possibilité d’affiner la recherche

36
Septembre 2014
36
• Explore Reactions : on peut chercher toutes les réactions où la structure
sélectionnée apparaît comme produit ou réactif, ou dessiner une réaction
complète.
36
La flèche
symbolise les
étapes : ce qui
se présente à
gauche de la
flèche prend la
fonction de
réactif (reactant)

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Septembre 2014
37
• Affichage des résultats
37
-Références
bibliographiques
- Possibilité
de tri par
rendement,
année de
publication
etc…

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Septembre 2014
38
• Reaxys
Reaxys est une base de donnée en chimie spécialisée en chimie organique,
organométallique et inorganique.
La plateforme Reaxys permet l’interrogation simultanée de 3 bases couvrant plus de
200 périodiques :
- CrossFire Beilstein (11 M de composés organiques, 23 M réactions, 2 M
références)
- CrossFire Gmelin ( 2,6 M composés minéraux et organométalliques, 2 M
réactions, 1,3 M références)
- Crossfire Patent Chemistry Database (5 M composés organiques,
organométalliques, minéraux, 4 M de réactions, issus de 460000 brevets en chimie
organique et en sciences de la vie)
Depuis 2012, la base PubChem, issue du National Center for Biotechnology
Information, a été intégrée à Reaxys, et donne des informations sur les activités
biologiques des molécules.
Depuis 2013 la base eMolecules a été intégrée donnant accès aux catalogues
commerciaux de 150 fournisseurs.
Guide d’utilisation :
http://cdn.elsevier.com/assets/pdf_file/0004/128182/Reaxys_QUG_March2013.pdf

« Ask Reaxys» : interrogation en langage libre, permet d’identifier les concepts et le
type de recherche demandé (par Structures&Réactions, Identifiants&Formules, références
bibliographiques, données).
Possibilité de recherche par données de réaction (réactifs, produits…), données physiques
(point d’ébullition…), spectres, activité biologique des molécules, « natural products »
(isolation de substances à partir de produits naturels).
39
>Rechercher l’information dans les bases de données Septembre 2014

4040
• Recherche de réactions
Permet de faire la recherche de réactions du composé. Vous pouvez soit
dessiner la structure, ou saisir le nom du composé pour générer la
structure (Create Structure template from name) en spécifiant les alliages,
le rôle des substances etc avec « Add to query »….

4141
• Affichage des résultats d’une recherche de réactions :
Limiter les résultats par filtres réactionnels ou bibliographiques (Type de
documents, date de publication etc…)

4242
Open Analysis View : analyse par histogramme des résultats (par
rendement, réactifs…)

4343
• Recherche par substance
Recherche de substance et ses propriétés soit en dessinant la structure
(Add to query > Structure), soit en utilisant son identifiant (Identification).

44
• Affichage des résultats d’une recherche par substance
Interrogation simultanée dans PubChem et eMolecules
Propriétés expérimentales
Informations sur
les fournisseurs
Interrogation pubChem et eMolecules
Information sur
catalogues
commerciaux des
fournisseurs
Zoom sur la
structure en
vision 3D

4545
• Synthesize = Informations sur la synthèse.
Transfert automatique vers un plan de synthèse (Autoplan), accessible aussi
via l’onglet « Synthesis Plans »

4646
• Recherche par références dans l’onglet Literature, par
auteur/mots-clés :
Vous pouvez utiliser les opérateurs booléens AND et NOT, ainsi que les
troncatures * (pour remplacer plusieurs caractères) ou ? (un seul
caractère). Pensez aux différentes façons d’écrire un nom d’auteur.

4747
• Recherche par auteur/mots-clés : création d’alertes (en créant un
compte utilisateur via l’onglet Register ) et export de références
vers des logiciels de gestion de références (Output).

• Recherche par index ou Reaxys tree : ce type de recherche par
classification permet de cibler d’emblée les éléments pour sa recherche.

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Septembre 2014
49
• Comparaison Scifinder / Reaxys : les deux bases sont
complémentaires !
SCIFINDER REAXYS
Points +
- Mise à jour quotidienne
- Plus performant pour
recherche par auteurs, mots-
clefs que Reaxys
- Couverture plus large que
Reaxys (littérature récente,
brevets)
- Editeur de structure intégré
(donc mises à jour du plugin
JAVA non nécessaire)
- Outil plus performant pour la
recherche d'équations
chimiques
- Base de données factuelles
majeure en chimie organique,
minérale et organométallique
- Pas besoin de se créer un
compte utilisateur pour la 1ère
utilisation.
Points -
- Moins performant pour la
recherche d’équations chimiques
- Mise à jour moins fréquente
(2x / semaine pour les brevets
et 1x / mois pour les autres
sources
COUPERIN- Réseau de négociation et d’expertise des ressources documentaires électroniques :
Groupe de veille thématique-Reaxys: http://www.couperin.org/dossier-de-veille-thematiques/bilans-dactivites-couperin/144-bilans-dactivites-couperin/785-reaxys
Groupe de veille thématique-SciFinder: http://www.couperin.org/dossier-de-veille-thematiques/bilans-dactivites-couperin/144-bilans-dactivites-couperin/820-
scifinder

50
Notre abonnement au Web of Science comprend Medline + Current
Contents Connect + Web of Science Core collection
- Web of Science Core Collection, une base bibliographique de plus
de 12 000 revues en sciences, sciences sociales, lettres et sciences
humaines (Science et Social Science citation index), depuis 1975.
Elle permet également d'interroger :
- Conference Proceedings Citation Index couvrant près de 150 000
conférences (depuis 2000).
- Index Chemicus, base de données en chimie (depuis 1993)
- Mise à jour : hebdomadaire
Compléments : Journal Citation Report et Researcher ID
Tutoriel en ligne : http://www.youtube.com/watch?v=D9hPIvp4j0M
Tutoriel en ligne : Critères de sélection des revues :
http://thomsonreuters.com/content/science/pdf/ssr/journal_selection_essay-french.pdf
Web of Science

51
Web of Science
• Recherche générale
Sélectionnez AND,
OR, NOT pour
modifier la relation
entre les pavés de
recherche
Modifiez les
paramètres de
recherche :
l’étendue du
fichier,
sélection des
index
Sélection du critère de
recherche :
topic, author,
publication name,
funding agency…

52
Web of Science
• Troncature
* = Zéro ou plusieurs caractères
Ex : gene* (gene, genetics,
generation)
Ex : *oxide (peroxide, sulfoxide,
zinc oxide)
$ = Zéro ou un seul caractère
Ex : lap$roscopic (laproscopic,
laparoscopic)
? = Un caractère
Ex : en?oblast (entoblast,
endoblast)
• Opérateurs de proximité
Recherche par phrase exacte (« »)
Ex : « stem cell »
SAME = L’opérateur SAME permet
de retrouver des termes dans une
même phrase, dans n’importe quel
ordre
Ex : forest SAME fire, dans le
champ « topic »
NEAR/x = permet de retrouver des
termes rapprochés. Le nombre de
mots qui les séparent peut être
précisé. Par défaut la requête
s’effectue sur un écart maximum de
15 mots entre les termes recherchés.
Ex : Salmon NEAR virus =
Salmon NEAR/15 virus

53
Web of Science
• Gestion des résultats : tri par défaut par date de publication.
Alerte sur la recherche (seulement pour une recherche dans Web
of Science Core Collection), sauvegarde et export des résultats
(impression, courriel, marked list, export vers des logiciels de gestion
bibliographique).
Accès au plein
texte pour les
revues auxquelles
la BU est abonnée
Visualiser les citations
et leur distribution
dans le temps pour un
ensemble de résultats
(fonctionnalité
inaccessible au-delà de
10 000 notices)

54
Web of Science
• Gestion des résultats:
Affinage des résultats par
- ajout d’un mot-clé,
- catégorie WOS,
- type de document,
- sujet (+large que catégorie WOS),
-Organisme d’affiliation
-Revues en open access…

55
Web of Science
• Détail d’un résultat :
View Journal Information : données du Journal Citation Reports,
ISSN…
Related Records, liste des références en lien avec cet article ;
Citation Map : cartographie du réseau de citations de l’article

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Septembre 2014
56
Rechercher l’information dans les plateformes
de revues
• Définition
L’ensemble des revues d’un éditeur est présentée dans la même interface.
Intérêt :
- Cibler ses recherches sur un éditeur, parfois spécialisé dans la discipline
- Avoir accès au texte intégral si la bibliothèque est abonnée
- Ne pas manquer les revues confidentielles d’un éditeur
Ces plateformes peuvent être spécialisées (ACS, RSC) ou pluridisciplinaires
(ScienceDirect, Wiley, Springer).
>Rechercher l’information dans les plates-formes de revues

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Septembre 2014
57
Rechercher l’information dans les plateformes de revues
• L’American Chemical Society (ACS)
Fondée en 1876, son format bibliographique fait référence pour les
publications de chimie

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Septembre 2014
58
• Publications A-Z et recherche simple :
Liste des revues, livres de l’ACS.
Classement par ordre alphabétique ou par CAS section
Critères de la recherche
simple :
-Opérateurs booléens
« AND » & « OR »
-1 expression exacte se
recherche entre
guillemets: « »
-Le signe de troncature est
le *
-Subject search = CAS
section

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Septembre 2014
59
• Recherche par CAS section

60
Septembre 2014
60

61
• Royal Society of Chemistry (RSC)
La Royal society of chemistry, est une société savante qui a succédé à la Chemical
Society of London (créée en 1841), dont le but est l’avancement des sciences
chimiques, notamment par le biais de publications de journaux scientifiques.
La bibliothèque est abonnée à 23 de ces titres.
• Accès aux archives de 76 titres de revues RSC, depuis les origines jusqu’à 2010,
dans le cadre du projet ISTEX.
RSC a développé une base de données gratuite Chemspider (29 M structures)
>Rechercher l’information dans les plates-formes de revues Septembre 2014

62
• Recherche par titre de journaux ou par sujet

63
• Recherche avancée
- Opérateurs booléens:
AND (ou « + »)
OR, NOT (ou « - »)
- Date de publication :
à partir de 1841

64

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Septembre 2014
65
• Wiley Online library
Cet éditeur donne accès à plus de 1000 revues multidisciplinaires.
Parmi elles :
- Angewandte Chemie international edition
- Chemistry : a European journal
- Journal of Polymer Science
- Advanced materials
• Recherche par publication ou par sujet

Science Direct
ScienceDirect : répertoire de périodiques, séries et
encyclopédies scientifiques multidisciplinaires de l’éditeur
Elsevier (2500 revues et 20000 ebooks). Les archives de +
de 2200 titres de revues scientifiques publiées par Elsevier
depuis les origines (1823) jusqu'en 2001, sont disponibles
dans le cadre du projet ISTEX.
La bibliothèque n’est pas abonnée à l’intégralité du
catalogue de cet éditeur : les 12 millions d’articles de SD ne
sont pas tous en texte intégral.
Mise à jour quotidienne
Tutoriel en ligne :
http://help.sciencedirect.com/Content/tutorials/sd_menu.html
66

Springer Link
Plateforme de revues électroniques de l’éditeur Springer.

Ebrary
Plateforme pluridisciplinaire d’ebooks. Possibilité de télécharger:
- au format pdf 36 pages max.
- ou l’intégralité du document mais pour 14 jours.
68

Annuaire d’entreprises
Kompass : annuaire d’entreprises françaises et européennes.
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Septembre 2014
70
Outils complémentaires : les bases de données de
brevets
• Espacenet
L’Office européen des brevets a développé la base Esp@cenet qui recense 70
millions de brevets, de 1836 à nos jours.
Espacenet donne accès à la base française de l’INPI et à 3 bases
internationales :
- la base EP (European Patents) recense les demandes de brevets EP publiées
par l'Office européen des brevets au cours des 24 derniers mois.
- la base de l’OMPI (WIPO) rassemble les demandes déposées au niveau
mondial selon la procédure PCT.
- la base Worldwide recense les données sur des brevets provenant de 85
pays.
Il y a plusieurs accès possibles à cette base de brevets :
http://worldwide.espacenet.com : accès à la base mondiale.
http://fr.espacenet.com/:accès à l'antenne française, via l'INPI.
Philippe Eyraud, « La base de données des brevets : Esp@cenet », Ecole Centrale de Lyon, 2010 :
http://bibli.ec-lyon.fr/sites/bibli.ec-lyon.fr/files/supports/2010-utiliser-espacenet.pdf
Guide d’utilisation Espacenet en français :
http://documents.epo.org/projects/babylon/eponet.nsf/0/4e8744eb66e8f944c12577d600598eef/$FILE/e
spacenet_brochure_fr.pdf

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Outils complémentaires : les archives ouvertes
• HAL- Hyper Articles en Ligne
L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, créée en 2006, sous la
responsabilité du CNRS, est destinée au dépôt et à la diffusion d'articles
scientifiques de niveau recherche, publiés ou non.
Elle regroupe plusieurs sous-bases comme TEL pour les thèses ou CEL
pour les cours.
Il s’agit d’une démarche volontaire permettant une réappropriation
gratuite par les chercheurs de l’information qu’ils produisent eux-mêmes.
AMU a un dépôt dans HAL : http://hal.archives-ouvertes.fr/UNIV-AMU/fr/
A noter, DUMAS est une archive ouverte de travaux d'étudiants de niveaux
bac+4 et bac+5 .
>Rechercher l’information dans les archives ouvertes

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Septembre 2014
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Evaluer l’information
• Sites identifiés
Institutions, industrie, associations, etc.
Identification de l’organisation, nature et statut, objet, public visé, date de
création, notoriété.
Exemple : site de l’INRS http://www.inrs.fr/accueil
• Outils spécialisés
Annuaires, signets (d’une bibliothèque, d’un laboratoire) : sources sélectionnées et
déjà évaluées.
Exemple : sélection de lien sur le site du labo ISM2 http://www.ism2.univ-
cezanne.fr/pages-bleues/liens_pro.htm ou Netvibes d’un chercheur :
http://www.netvibes.com/gaellechou#Accueil
• Moteurs de recherche spécialisés
Google Scholar, etc.
>Evaluer l’information

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• Évaluation
- Evaluation de la source, de l’auteur :
Fiabilité de l’organisation, degré de compétence dans le domaine, notoriété de
l’auteur (réseau de références).
ResearcherID permet d’identifier un réseau d’auteurs travaillant sur une même
thématique.
www.researcherid.com/
- Évaluation du contenu :
Degré de fiabilité de l’information, niveau de précision, degré de nouveauté,
pertinence.
- Évaluation de la structuration du site ou du document :
Logique de l’organisation, facilité de navigation, outil de recherche dans le site.
- Évaluation de l’accessibilité et des aspects techniques :
Rapidité de chargement du site et des pages, référencement du site dans les outils
de recherche.
Support de cours Master Chimie UPMC- Paris VI
http://australe.upmc.fr/access/content/group/BUPMC_02/pdf_cours/master_chimie.pdf

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Evaluer la qualité des sources
• Livres : tenir compte de la réputation de la maison d'édition et
de celle de l’auteur (publications antérieures, institution de
rattachement…).
• Articles de périodiques : pour un travail de niveau universitaire
mieux vaut consulter un article paru dans un périodique spécialisé
que celui publié dans une revue de vulgarisation.
• Site web : l'adresse des documents (URL) peut servir de point de
repère, en laissant entrevoir la nature de leur contenu.
On y trouve en général le nom, le type d'organisation qui «héberge»
les pages trouvées et le code du pays où se trouve l'adresse (ex. :
insee.fr).
Vérifier les liens externes qui sont offerts sur la page d'accueil et s’ils
renvoient vers des renseignements biographiques.
>Evaluer l’information Septembre 2014

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Septembre 2014
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• Google Scholar
Créé en 2004, c’est un moteur de recherche spécialisé dans la littérature de
recherche universitaire : il indexe des articles issus de périodiques, des
thèses, des livres, des articles en pré-publication, des rapports.
Ces documents proviennent d'éditeurs scientifiques, de sociétés savantes. Le
classement des résultats est basé sur le nombre de citations. Préférer l’interface
en anglais, qui permet de restreindre la recherche par sujet et d’obtenir
davantage de résultats.
- Intérêt : simple d’utilisation, utile pour retrouver une référence bibliographique
manquante, GS permet ainsi de retrouver des documents du web invisible
indisponibles sur les moteurs de recherche généralistes.
- Limites : la couverture réelle de GS n’est pas connue précisément, il ne
convient pas pour un véritable travail de recherche approfondi.
Les algorithmes utilisés pour le calcul du classement sont confidentiels. On ne
peut pas utiliser la troncature dans sa recherche. Peu de possibilités de tri.
Julien Sicot, guide d’utilisation Google Scholar, 2007 : http://fr.slideshare.net/jsicot/google-scholar-guide-
dutilisation
Béatrice Foenix-Riou, Quelles alternatives à Google Scholar dans le domaine scientifique, 24/10/2013 :
http://fr.slideshare.net/bfoenix/quelles-alternatives-google-dans-le-domaine-scientifique?qid=7a574652-
3ad2-4c5a-8076-51d88f75c236&v=qf1&b=&from_search=11

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Présenter l’information
• Citation des sources et plagiat
Lorsque vous citez vos sources, vous prouvez votre capacité à rechercher des
informations pertinentes.
Absence de citations de sources = plagiat
PLAGIER (verb. transitif) : « Emprunter à un ouvrage original, et (…) à son
auteur, des éléments, des fragments dont on s'attribue abusivement la paternité en
les reproduisant, avec plus ou moins de fidélité, dans une œuvre que l'on présente
comme personnelle. Synon. copier, piller, pirater (fam.).»
Trésor de la Langue Française Informatisé, consulté le 22/05/2012 http://atilf.atilf.fr/
Il est rendu très facile par le développement du Web, mais beaucoup d’outils sont
disponibles pour le détecter (logiciel de détection de plagiat Compilatio)
Sources utiles :
Cours de Rémi Bachelet pour Centrale Lille : http://plagiat.ec-lille.fr/Amphi_Plagiat.html
Bibliothèques de l’Université de Montréal : http://www.bibliotheques.uqam.ca/plagiat
>Présenter l’information

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• Exemples de situations de plagiat :
- Copier intégralement un passage d’un livre ou d’une revue sans le mettre
entre guillemets et sans mentionner la source
- Insérer dans son texte des graphiques, des données provenant de sources
externes sans en indiquer la provenance
- Traduire un texte sans en mentionner la source
• Sanctions prévue contre le plagiat : suspension temporaire ou
définitive
« Pour avoir intégralement copié le « projet personnel » d’une camarade
de l’année précédente, M.B. s’est ainsi fait exclure, en 2003 de son
université pour six mois. (…)
Une étudiante n’ayant écrit que trois pages de son mémoire de maîtrise a,
quant à elle, été condamnée à un an d’exclusion de son université, en juin
2004 »
Luc Bronner, De plus en plus créative, la fraude aux examens est durement punie,
02 mars 2005, Le Monde
Charte anti-plagiat AMU 2012 : http://sciences.univ-amu.fr/sites/sciences.univ-
amu.fr/files/charte_ant-plagiat_amu.pdf

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• Citation dans le texte
Les références peuvent être citées dans le texte par numéro :
On utilise l'exposant, ou le caractère normal entouré de parenthèses ou de
crochets :
...en 1924 Heiss et Weistock² démontrent que…
...en 1924 Heiss et Weistock [2] démontrent que …
Ces références dans le texte sont détaillées dans la bibliographie.

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• Quelques principes de base pour la rédaction de la bibliographie
- La bibliographie donne toutes les informations permettant de retrouver le
document.
- Quand on décrit une partie d’un document (un article dans une revue, un chapitre
dans un livre), on décrit d’abord la partie, ensuite le document dans son ensemble.
- On peut choisir de suivre une norme de présentation (par exemple la norme
prescrite par l’éditeur American Chemical society, disponible sur
http://pubs.acs.org/userimages/ContentEditor/1246030496632/chapter14.pdf), mais
quelque soit le choix de présentation, le plus important est de la suivre tout au
long de son travail.
- Les logiciels de gestions de références bibliographiques permettent d’éditer une
bibliographie sur Word ou Open Office en utilisant les normes prescrites par les
différents éditeurs.
Exemple : Zotero
http://www.zotero.org/ ;
Libguide BU AMU Zotero : http://bu.univ-amu.libguides.com/content.php?pid=588396

80
• Référence d’un livre
Lehn, J.-M. Supramolecular Chemistry Concepts and
Perspectives; VCH: Weinheim, 1995; pp 139-160.
Auteur
Titre
Editeur
Lieu d’édition Date de publication
>Présenter l’information Septembre 2014

81
• Référence d’un chapitre d’ouvrage
Rizzo, A.; Coriani, S. Birefringences : A Challenge for Both
Theory and Experiment. In Advances in quantum
chemistry; Sabin, J.R., Brändas E.; Elsevier : Amsterdam,
2005; Vol. 50, 142-184
Auteur du chap.
Titre du chapitre
Titre de l’ouvrageEditeurs scientifiques de l’ouvrage
Editeur commercial de l’ouvrage

82
• Référence d’un article
First, E.L.; Gounaris, C.E.; Floudas C.A. J. Chem. Inf.
Model, 2012, 52, 84-92
Abréviations des revues utilisées par le CASSI, Chemical abstracts service
source index : http://cassi.cas.org/
Auteurs de l’article
Titre abrégé de la revue
Date
Fascicule
Pages

83
• Référence d’un article consulté en ligne
Bahr, S. S.; Ramana M. M. V. Novel Domino Reactions
for Diterpene Synthesis. J. Org. Chem. [en ligne]
2004, 69, 8935–8937. Disponible sur :
<http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jo049616n>
(consulté le 24/05/2012).
Adresse URL

84
• Référence d’un site web
Royal Society Of Chemistry. RSC Conferences. [en
ligne]. Disponible sur
<http://www.rsc.org/ConferencesAndEvents/RSCCo
nferences/> (consulté le 24/05/2012)
Auteur ou Organisme Titre de la page d’accueil
Adresse URL

Avantages du choix du logiciel Zotero
- Plug-in Firefox, gratuit, open source et extensible, installation facile
- Utilisation individuelle et/ou collective (poste et/ou serveur), 300 Mo
d’espace de stockage
- Logiciel libre
- Fort dynamisme de développement (mises à jour automatiques très
fréquentes)
- Intégration à d'autres logiciels (traitement de texte, sites, etc.)
- Stocke des références sur le disque dur et / ou en ligne
Synchronisation
- Stocke et gère des références, les documents qu’elles décrivent, des
captures de pages Web et des annotations de pages Web, et
des liens vers des pages Web.
- Développement pérenne assuré par des institutions reconnues
(Centre for History and New Media ; George Mason University) et
financé par des partenaires importants (United States Institute of
Museum and Library Services, les fondations Andrew W. Mellon et
Alfred P. Sloan).

Installer Zotero
Utiliser une version à jour de Firefox
Dernière version Zotero : 4.0.
http://www.zotero.org/download/
Si nécessaire, autoriser l’installation
du programme

Présentation générale de l’interface locale

Barre d’outils : ajouter, importer, modifier une référence
Ajouter un élément :
• nouveau
• à partir d’une page web
• À partir de son identifiant (ISBN, DOI, PMID)
• depuis la page d’un site compatible (Koha, Sudoc, Google
Scholar…):
Attacher un fichier à une référence
Importer des données par fichier

Collecter des références en ligne à partir de sites
compatibles
Si l’icône Zotero apparaît dans la barre d’URL, cela indique que
le site est compatible (liste des sites compatibles:
http://www.zotero.org/translators/)
Ex: catalogue Koha (BU Aix-Marseille)

Collecter des références en ligne sur des sites non
compatibles
Ex : Reaxys, importer le fichier de références téléchargé avec l’icône
« Actions »

Collecter des références à partir d’une page Web
On peut ajouter un lien vers une page Web et une capture de page
Web avec l’icône« Créer un nouveau document à partir de la page
courante » :

Collecter des références: récupérer les
métadonnées d’un PDF
On peut rajouter des PDF à la bibliothèque Zotero en les
faisant glisser depuis leur emplacement d’origine, vers la
collection de la bibliothèque souhaitée.

Gestion des références : organiser sa bibliothèque en
collections
« Ma bibliothèque »
Les collections: créer une nouvelle collection
Classer / déplacer
Une référence peut être classée dans plusieurs dossiers, mais
elle existe en un seul exemplaire dans la bibliothèque

Gestion des références : affichage et tri
Définir dans la barre d’outils les critères de tri des références :

Gestion des références : rechercher des références
dans sa base
Zotero a un moteur de recherche interne capable de rechercher des
références à l’intérieur de "Ma bibliothèque" ou d’un dossier en
particulier.

Gestion des références : supprimer des références
Clic droit sur la référence à supprimer:
Les références supprimées sont conservées dans la poubelle.

Citation rapide
Insérer rapidement une citation et créer une bibliographie par glisser-
déplacer (ou insérer seulement la référence en appuyant sur Shift)
Paramétrer le style bibliographique, etc. dans « Préférences », puis
« Exportation »

Interaction avec un traitement de texte
Plug-in Word/Open Office:
http://www.zotero.org/support/word_processor_plugin_installation
Dans Word 2007 les icônes Zotero apparaissent dans l’onglet
« Compléments »
Insérer et modifier des références
Insérer et modifier une bibliographie
Choisir le style bibliographique et la place des notes (bas de page et/ou fin
du document, en fonction des styles)
Style à définir dans les Préférences de Zotero :
Liste complète des styles bibliographiques disponibles, comme ACS par
exemple, sur le site : http://www.zotero.org/styles
(7121 styles disponibles le 16/09/14)

Installer un style bibliographique
A partir du site : http://www.zotero.org/styles
 Cliquer sur le titre du journal sélectionné > Cliquez sur
« Installer»

Insertion de référence: lors de la 1ère insertion dans un
document, il faut choisir son style.
Choix de la référence et prévisualisation:

Générer une bibliographie à partir de tous les éléments
référencés (NB : si le style l’autorise)
Éditer une citation insérée dans le document
Éditer une bibliographie insérée dans le document (ajouter
une référence non citée dans le texte par ex.)
Refresh : mise à jour des citations et de la bibliographie pour
répercuter les modifications faites dans la bibliothèque
Modifie le choix de la norme bibliographique.

Synchronisation avec l’espace serveur Zotero
La synchronisation permet :
- la copie des données d’une instance locale de Zotero vers un
serveur distant
- une utilisation nomade (sur plusieurs ordinateurs)
- le partage de ses références avec des groupes privés ou publics
Création d’un compte sur le site Web Zotero :

103
N’hésitez pas à poser des questions aux
bibliothécaires : ils sont à votre service toute
l’année, et peuvent vous former à l’utilisation et
la gestion des différentes ressources.
Vous pouvez nous retrouver en ligne sur le site
de la bibliothèque http://bu.univ-amu.fr/
Ou sur la page Facebook des BU sciences :
https://fr-fr.facebook.com/busciencesamu
Mon contact : caroline.peron@univ-amu.fr

Master chimie 2014

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