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Etude expérimentale de la
résistance au parasitisme et
des compromis fonctionnels
chez des brebis allaitantes
issues de sélection divergente
Frédéric DOUHARD
INRAE
Webinaire UMT STAR – 1ier décembre 2023
Les lignées : un outil pour l’étude de la
génétique de la résistance
• Un outil multifonction :
• « Visionnage accéléré » de la sélection populationnelle (pression de sélection +++, milieu mieux contrôlé)
• Effets de la sélection sur les autres caractères
• Étude des mécanismes sous-jacents (expression, immunité)
• Coévolution des parasites
• Interactions Génétique (Hôte) × Environnement (Élevage) × Parasites (Souche)
• Etc.
• Plusieurs lignées résistantes de petits ruminants à travers le monde :
• Ovins
Australie (CSIRO) : Merinos / Haemonchus contortus
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Nlle Zélande (AgResearch) : Romney / divers nématodes
Uruguay (INIA) : Corriedale / divers nématodes
• Caprins
France (INRAE) : Créole / Haemonchus contortus
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En France, des lignées ovines divergentes
« en miroir » de la sélection dans les populations
 phénotypage de 240 animaux en 2013 (Génération 0)
 Sélection divergente sur index
Index OPG = ½ (OPG1 + OPG2)
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Carole MORENO
h² OPG1 (ES) = 0,28 (0,07)
h² OPG2 = 0,20 (0,06)
rG OPG1|OPG2 = 0,67 (0,17)
Écart R/S ≃ 1,7 σG
Traitement Traitement
La sélection est-elle efficace, quelque soit le
stade physiologique?
Infestations artificielles (H. contortus, souche ENVT)
Croissance
Sélection sur index
?
La sélection est-elle efficace, quelque soit le
stade physiologique?
 Les agneaux résistants sélectionnés deviennent des adultes résistants
Adulte
Péripartum 1 Péripartum 2
Début gestation
Croissance
r = 0,55***
r = 0,65***
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r = corrélations phénotypiques
entres OPG à différents stades
Mars 2018
N = 91 G2
(50% R + 50%S)
N = 48 N = 81 N = 55
Infestations artificielles (H. contortus, souche ENVT) Février 2020
Douhard et al. 2022. Evol. App.
La sélection est-elle efficace, quelque soit le
stade physiologique?
 Une résistance « mise entre parenthèses » autour de la mise-bas
Adulte
Péripartum 1 Péripartum 2
Début gestation
Croissance
Relâchement
immunitaire
OPG
N = 48 N = 81 N = 55
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N = 91 G2
(50% R + 50%S)
Infestations artificielles (H. contortus, souche ENVT)
La sélection conduit-elle à des compromis
avec le poids et l’état corporel des brebis ?
OPG
ΔHT
défavorable
favorable
Péripartum 1 Péripartum 2
défavorable
favorable
 Peu d’effet en général (hormis peut-être une croissance ralentie)
Un compromis
seulement à la
1iere mise-bas
Douhard et al. 2022. Evol. App.
Corrélations
interindividuelles
La sélection conduit-elle à des compromis
avec le poids et l’état corporel des agnelles ?
 Des agnelles résistantes moins grasses
GRAS
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corporel de
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dorsale (mm)
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La sélection conduit-elle à des compromis
avec l’efficacité alimentaire des agnelles ?
 Pas de lien apparent entre résistance et efficacité
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Infestées Non-infestées Infestées Non-infestées
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Les agneaux résistants sélectionnés deviennent des adultes résistants,
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(mais ne veut pas dire qu’il n’y a pas un besoin nutritionnel pour résister)
Perspectives
• « Visionnage accéléré » de la sélection populationnelle
• Effets de la sélection sur les autres caractères
• Etude des mécanismes sous-jacents (expression, immunité)
• Co-évolution des parasites
• Interactions Génétique (Hôte) × Environnement (Élevage) × Parasites (Souche)
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  • 1. Etude expérimentale de la résistance au parasitisme et des compromis fonctionnels chez des brebis allaitantes issues de sélection divergente Frédéric DOUHARD INRAE Webinaire UMT STAR – 1ier décembre 2023
  • 2. Les lignées : un outil pour l’étude de la génétique de la résistance • Un outil multifonction : • « Visionnage accéléré » de la sélection populationnelle (pression de sélection +++, milieu mieux contrôlé) • Effets de la sélection sur les autres caractères • Étude des mécanismes sous-jacents (expression, immunité) • Coévolution des parasites • Interactions Génétique (Hôte) × Environnement (Élevage) × Parasites (Souche) • Etc. • Plusieurs lignées résistantes de petits ruminants à travers le monde : • Ovins Australie (CSIRO) : Merinos / Haemonchus contortus Australie (CSIRO) : Merinos / Trichostronglylus colubriformis Nlle Zélande (AgResearch) : Romney / divers nématodes Uruguay (INIA) : Corriedale / divers nématodes • Caprins France (INRAE) : Créole / Haemonchus contortus Ecosse (Moredun) : Cachemire / divers nématodes
  • 3. En France, des lignées ovines divergentes « en miroir » de la sélection dans les populations  phénotypage de 240 animaux en 2013 (Génération 0)  Sélection divergente sur index Index OPG = ½ (OPG1 + OPG2)  Génération 4 en 2021 Carole MORENO h² OPG1 (ES) = 0,28 (0,07) h² OPG2 = 0,20 (0,06) rG OPG1|OPG2 = 0,67 (0,17) Écart R/S ≃ 1,7 σG Traitement Traitement
  • 4. La sélection est-elle efficace, quelque soit le stade physiologique? Infestations artificielles (H. contortus, souche ENVT) Croissance Sélection sur index ?
  • 5. La sélection est-elle efficace, quelque soit le stade physiologique?  Les agneaux résistants sélectionnés deviennent des adultes résistants Adulte Péripartum 1 Péripartum 2 Début gestation Croissance r = 0,55*** r = 0,65*** r = 0,52** r = corrélations phénotypiques entres OPG à différents stades Mars 2018 N = 91 G2 (50% R + 50%S) N = 48 N = 81 N = 55 Infestations artificielles (H. contortus, souche ENVT) Février 2020 Douhard et al. 2022. Evol. App.
  • 6. La sélection est-elle efficace, quelque soit le stade physiologique?  Une résistance « mise entre parenthèses » autour de la mise-bas Adulte Péripartum 1 Péripartum 2 Début gestation Croissance Relâchement immunitaire OPG N = 48 N = 81 N = 55 Mars 2018 N = 91 G2 (50% R + 50%S) Infestations artificielles (H. contortus, souche ENVT)
  • 7. La sélection conduit-elle à des compromis avec le poids et l’état corporel des brebis ? OPG ΔHT défavorable favorable Péripartum 1 Péripartum 2 défavorable favorable  Peu d’effet en général (hormis peut-être une croissance ralentie) Un compromis seulement à la 1iere mise-bas Douhard et al. 2022. Evol. App. Corrélations interindividuelles
  • 8. La sélection conduit-elle à des compromis avec le poids et l’état corporel des agnelles ?  Des agnelles résistantes moins grasses GRAS Épaisseur dorsale (mm) Volume corporel de gras (dm3) Infestées Non-infestées Épaisseur dorsale (mm) Douhard et al. in prep. Infestation 2 traitement
  • 9. La sélection conduit-elle à des compromis avec l’efficacité alimentaire des agnelles ?  Pas de lien apparent entre résistance et efficacité Consommation résiduelle de concentrés (g/jour) inefficace efficace Infestées Non-infestées Infestées Non-infestées Douhard et al. WCGALP 2022 OPG Infestation 1 traitement Infestation 2 traitement
  • 10. Principaux résultats Les agneaux résistants sélectionnés deviennent des adultes résistants, sauf autour de la mise-bas Peu d’effet sur les caractères de production chez les brebis (hormis peut-être une croissance ralentie) Peu d’effet non plus chez les agnelles, sauf sur le niveau de gras A priori pas de lien entre résistance et efficacité alimentaire (mais ne veut pas dire qu’il n’y a pas un besoin nutritionnel pour résister)
  • 11. Perspectives • « Visionnage accéléré » de la sélection populationnelle • Effets de la sélection sur les autres caractères • Etude des mécanismes sous-jacents (expression, immunité) • Co-évolution des parasites • Interactions Génétique (Hôte) × Environnement (Élevage) × Parasites (Souche) • Etc. Utilisation du levier génétique dans des stratégies de gestion intégrées ? (projet PHENOPASTO, réseau du MP SANBA « PARASITEAMS) Multi-résistance aux anthelminthiques ? Contournement de la résistance de l’hôte ? Changement climatique ? Variabilité des ressources ?
  • 12. MERCI POUR VOTRE ATTENTION