3. Stickase
Substrat
Etat de Transition Produit
X Si l’enzyme se lie au substrat
Aucune reaction ne se produit
L’enzyme ne reconner pas seulement le substrat,
Mais induire la formation de la transition d’état.
SV 3 (2010)
4. Nature de la Catalyse Enzymatique
● L’enzyme fournit une surface catalityque
● Cette surface stabilise l’état de transition
● Etat de transition transformé en produit
B
A
A B Surface Catalytique
5. L’enzyme stabilise l’état de transition
Energie changer
ST
Energie éxigée (non catalyse)
Energie diminué
EST
S
ES
EP P
Direction de Reaction
T = Etat de Transition quelle est la différence?
6. Le site Actif est une poche profonde
Pourquoi l’energie necessaire pour atteindre
l’état de transition est plus faible dans le site actif ?
Magique poche
+ (1) Stabilize la transition
(2) Expulse H2O
CoE (1) (2)
(3) Groupes Réactifs
(4) - (4) Coenzyme
(3)
7. Site Actif de l’Enzyme est plus profond que la
liaison de Ac a Ag
La liaison de Ac a Ag est Le site actif de l’enzyme reconnait
Complementaire.Aucune le substrat, induire l’état de transition
Reaction n’est produite.
X
8. Le Site Actif évite l’influence de l’eau
+
-
Prevention de l’influence de H2O soutient la formation de liaison ionique stable
9. Cinetique Enzimatique
Activité enzymatique
Etudiant A
Score
Etudiant B
Etudiant C
0 1 2 3 4 0 1 2 3 4
Chapitres d’Examens [Substrat]
Augmentation de la concentration de S,
Changement de l’activité enzymatique
SV 3 (2010)
11. Invertase (IT)
Sucre
Sucre non-reducteur Energie reduite
Reducteur
IT
Saccharose Glucose + Fructose
HOCH2 HOCH2 HOCH2 HOCH2
HOCH2 HOCH2 6 6 1
O O O
O 5 5
4 1 2
1 2
3 OH
2 OH 4
OH HO 3 b b
H 2O CHO 1 H2C-OH
HOCH2 H-C-OH 2 C=O
HOCH2 HOCH2
O O HO-C-H 3 HO-C-H
H-C-OH 4 H-C-OH
O H-C-OH 5 H-C-OH
H2-C-OH 6 H2-C-OH
12. (temps fixe)
S
E
P
+
↓
8
8
Substrat (mmole)
7
6
6
5
4
4
3
2
2
1
0
0
80
60
40
20
0
Produit
Augmentation de la [Substrat]
13. Essentiel de la cinetique enzymatique
Theorie de l’état stationnaire
E+ S E S E +P
Dans l’état d’équilibre,la production et la
consommation de l’état de transtion contenue dans
le meme niveau.
14. Constante ES a l’état stable
S
P
Concentration
ES
E
Temps Réaction
15. Example d’Enzyme (Invertase)
1) Utilisation Enzyme → E
2) Ajouter S a differents [ ] → S
3) Mesure de Produit en Temps fixe (P/t)
4) (x, y) courbe hyperbolique , estimation → Vmax
5) y = 1/2 Vmax → Km
Vmax
1
vo vo
1/2
-1
Km 1
Vmax
Double reciproque1/S Km Graph directe S
16. Cinetique Enzymatique
Graph Direct Significance
kcat /Km Vmax [S] Ordre zero
vo=
Km + [S] 1 er ordre
kcat
E3
Turn over E2
number E1
k3 [Et] Vmax & Km
Competitive
Unité Vitesse Affinitée avec Double reciproque
1 mole Maximum le substrat
Inhibition
min
Non-competitive
Activitée spécifique
unité Activité
mg
Uncompetitive
SV 3 (2010)
17. Les Paramètres de la Cinétique Enzymatique
v0 = Vmax × K = k3 [Et] × K
Obtention Vmax et Km Vmax [S]
vo =
Km + [S]
Concentration de E
Proportionelle a la
Ordre zero
E3
E2
1er ordre E1
[S] = faible→ élevée [S] = concentration fixée
18. Km: Affinité avec le Substrat
Vmax [S] Vmax
vo = If vo =
Km + [S] 2
Quand utilisant differents substrats Vmax Vmax [S]
Vmax =
S2 2 Km + [S]
S1 S3
1/2
Km + [S] = 2 [S]
S1 S2 S3
Km = [S]
Km Affinités changes
19. Km: Example Hexokinase
Glucose + ATP → Glc-6-P + ADP
nombre
Glucose Allose Mannose Substrat
1 CHO CHO CHO
2 H-C-OH H-C-OH HO-C-H
3 HO-C-H H-C-OH HO-C-H
4 H-C-OH H-C-OH H-C-OH
5 H-C-OH H-C-OH H-C-OH
6 H2-C-OH H2-C-OH H2-C-OH
Km = 8 8,000 5 M
20. Turn Over Number, kcat
k1 k3
E+S ES (v ) E + P
k2 o
Substrat en excé, k3 = kcat, turn over number (t.o.n)
Quand [substrat] est faible (IV) Deuxième ordre
Vmax [S] k3 [E][S] k3
vo = = = [E][S]
Km + [S] Km + [S] Km
Commence par eq M-M. Omettre le [substrat] specificité Substrat
21. Turn Over Numbers of Enzymes
Enzymes Substrat kcat (s-1)
Catalase H2O2 40,000,000
Anhydrase Carbonique HCO3- 400,000
Acetylcholinesterase Acetylcholine 140,000
-Lactamase Benzylpenicilline 2,000
Fumarase Fumarate 800
proteine RecA (ATPase) ATP 0.4
Le nombre de produit transformé de substrtat
par une molecule d’enzyme en une seconde
22.
23. Inhibition Enzymatique (Mechanisme)
I Competitive I Non-competitive I Incompetitive
Substrate E
Dessin Guide
S S E I
S
E S I I
I
Competition S I
Inhibiteur Sur le site actif Site Different
E + S ← ES → E + P
→ E + S ← ES → E + P
→ E + S ← ES → E + P
→
Equation et Description
+ + + +
I I I I
↑
↓ ↓↑ ↓↑ ↓↑
EI EI + S →EIS EIS
[I] se lie seulement a [E] [I] se lie a [E] libre ou au [I] se lie seulement au complexe
libre,et se compite avec[S]; complexe [ES] [ES], augmentation [S] favorise
Augmentation [S] surmente ; augmentation [S] ne peut L’inhibition par[I].
L’Inhibition par[I].
surmenter l’inhibition [I].
SV 3 (2010)
24. Inhibition Enzymatique (Graphiques)
I Competitive I Non-competitive I Incompetitive
Vmax Vmax Vmax
vo vo
Vmax’ Vmax’
graphiques
I I I
Km Km’ [S], mM Km = Km’ [S], mM Km’ Km [S], mM
Vmax inchangé Vmax diminué
Km augmenté Km inchangé Vmax & Km diminué
Double Réciproque
1/vo I 1/vo I 1/vo
I
Deux lignes
Intersecter paralleles
a l’axe Y 1/ Vmax Intersecter 1/ Vmax 1/ Vmax
a l’axe X
1/Km 1/[S] 1/Km 1/[S] 1/Km 1/[S]
SV 3 (2010)
25. Le Drogue Sulfamide est inhibiteur competitive
Domagk (1939)
Acide Para-aminobenzoique (PABA)
Les bacteris besoins de PABA
H2N- -COOH Pour la biosynthèse de l’acide
Folique
acide acide
Precurseur Folique Tetrahydro-
folique
Les Sulfamides ont une
H2N- -SONH2 Structure similaire avec
PABA, inhibent la
croissance Bacterienne.
Sulfanilamide
(anti-inflammation)
27. I E Sont Utilisés De manière Considérable
● drogue Sulfamide (anti-inflammatoire)
inhibiteur competitive
● inhibiteur Protease Maladie d’Alzheimer
● protease HIV est crucial au cycle de HIV
HIV protease (homodimer): s unité 1 s unité 2
↑inhibiteur pour traiter AIDS As As Symétrie
p p
→ aspartyl-protease Humain : domaine 1 domaine 2 asymétrie
(monodimer) As As
p p