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Gérer ses références bibliographiques
avec Zotero
Master 2 Biologie Gestion – septembre 2015
SCD de l'Université de Rennes 1
PLAN
Les logiciels de gestion bibliographique : introduction
1.Démarrer avec Zotero : installation, importation
2.Gérer ses références : manipuler, organiser
3.Sauvegarder sa bibliothèque : créer un compte
4.Produire une bibliographie dans un traitement de texte
5.Partager ses références : création de groupes
2
Les outils de gestion bibliographique
Utilité des logiciels de gestion des références bibliographiques
• Pouvoir importer automatiquement des références résultant
de recherches documentaires (bases de données ou pages web)
• Pouvoir exploiter facilement de gros corpus de références
• Pouvoir récupérer des références lors de l’écriture d’un texte et
pour établir sa bibliographie
• Pouvoir formater automatiquement des références selon les
normes d’écriture et conventions en vigueur
• Faire une saisie unique des données
1. Qu’est-ce que Zotero ?
Simple d’utilisation
2 versions disponibles :
• Une extension du navigateur
Firefox (plugin)
OU
• Une application indépendante
du navigateur (standalone)
=> utilisation possible avec Firefox,
Chrome ou Safari
NB : on peut travailler avec les 2 en
fonction de son environnement,
mais sur des ordinateurs distincts
Open source
• Logiciel libre et gratuit
• Lancé en 2006 par le Centre for
History and New Media de
l’Université George Mason
(USA)
http://www.zotero.org
URFIST - SCD U.Rennes 1
5
Que peut-on faire avec Zotero ?
… Etc.
Bibliographie
1__________2__
________3_____
_____4________
__5__________
Article avec
citations et
bibliographie
Pages web
Base Zotero de
références et pdf
biblio en ligne,
groupes
1.1 Installer Zotero
Choix de la version
Si vous utilisez Firefox comme navigateur :
• Extension de Firefox
1- Télécharger Zotero 4.0 à partir de la page
http://www.zotero.org
2- Après l’installation de Zotero : redémarrer Firefox
=> Icône Zotero en haut à droite de l’écran
OU
Si vous utilisez un autre navigateur :
• Zotero Standalone 
1- Choisir la version en fonction de votre environnement
Windows, Mac, Linux
2- Installer le connecteur correspondant au navigateur de votre
choix (Firefox, Chrome ou Safari)
1.1 Installer Zotero
1.2 Importer et créer des références
1. Import automatique direct
2. Récupération des
références à partir d’un
identifiant (ISBN, DOI, PMID)
3. Création d’une référence à
partir d’une page web
(signet)
4. Récupération des
références d’un document
pdf
5. Création manuelle d’une
référence
8
1.2 Importer les références
Récupération
automatique
des données
par lot
Google Scholar
1.2 Importer les références
Sélectionner
les documents
1.2 Importer les références
Vérifier qu’elles
soient complètes
Récupérer les références
dans Zotero
Joindre le pdf si disponible
1.2 Importez des références
Sites Zotero compatibles :
• ScienceDirect, SpringerLink, Wiley online Library, Google Scholar
et Books, PubMed, Amazon, ACS, Cairn, Europress, Sudoc,
Supernova...
• Voir la liste non exhaustive à : http://www.zotero.org/translators
• Repère = l’icône à droite du Z
1.2 Importer des références
13
Le cas de Elevier ScienceDirect
Selon les possibilités :
soit récupérer un
ensemble de références
soit récupérer référence
par référence
soit récupérer un
ensemble de références par le
bouton export citations sur la
page de résultats (dans le cas
où les 2 premières solutions
ne marchent pas)
14
1.2 Importer des références
Vérifier si le PDF
est présent sous la
référence
Vérifier si le PDF
est présent sous la
référence
1.2 Importer des références
Autres possibilités d’import :
• Récupération par l’ISBN pour un livre, ou le DOI
pour un article
• Création d’une référence à partir d’une page web
• Récupération des métadonnées d’un fichier pdf
• Création manuelle de la référence (en dernier
recours)
16
1.2 Importer des références à partir d’un identifiant
1- Copier le DOI
Ne pas oublier de
récupérer le pdf
s’il existe
1.2 Importer des références à partir de la page web
• Références de pages web
– Import automatique
ou
– Création d’un élément à
partir de la page courante
Capture d’écran
Lien vers la page courante
Compléter les références
après vérification
1.2 Importer des références d’un pdf
La première fois :
Installer les outils pdftotext et pdfinfo
dans les Préférences
1.2 Importer des références d’un pdf
1-Glisser déposer le fichier pdf
dans Zotero
2- Clic droit sur le
fichier importé
3- Récupérer les
métadonnées
1.2 Importer des références manuellement
Si l’import automatique ne marche pas :
• Pas d’icône dans la barre d’adresse
• En cas d’échec de l’enregistrement
Cliquer sur nouveau document
Sélectionner le type de
document à ajouter
Remplir les champs
manuellement
21
2. Gérer ses références : classer, organiser
• Gestion de la base personnelle
– Modification de références
– Recherche dans la base
– Classement des références
– Ajout de notes de lecture
– Ajout de tags (marqueurs)
– Lien de deux notices
2. Gérer ses références
• Interface de travail : 3 parties distinctes
• La barre d’outils
Une référence
Liste des
références
Bibliothèque
et ses
collections
2. Gérer ses références
• La barre d’outils
- Créer une collection
- Créer un groupe
- Actions : importer, exporter
gérer les préférences
- Nouveau document : créer manuellement
une référence et faire le lien vers le texte
intégral
- Ajouter un document par son
identifiant
- Ajouter une note
- Joindre un lien vers un fichier
- Recherche avancée
- Recherche dans la base
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afficher en ligne
- Synchroniser les données
avec le serveur Zotero
2. Gérer ses références
• Modifier une référence
Ajouter des données
supplémentaires
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en cliquant dessus
2. Gérer ses références
• Enrichir ses références : mots-clés, notes
Saisir la note dans
l’éditeur de texte
Cliquer sur l’onglet Note
Marqueur, Connexe
Ajouter le marqueur
La fonction Connexe permet
de faire le lien avec
une autre référence
26
2. Gérer ses références
Fonction Localiser
Afficher
Afficher / Localiser le document selon son statut : PDF,
capture, lien vers la page en ligne …
26
Fonction Localiser
2. Gérer ses références
• Classer, organiser sa bibliothèque
Ma bibliothèque
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les références
Classer :
Créer une collection
et sous collection
(barre d’outils)
Glisser-déposer les
références
Renommer ou
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2. Gérer ses références
• Fusionner les doublons
Sélectionner les doublons Fusionner les doublonsAfficher les doublons
29
2. Gérer ses références : classer, organiser
Recherche dans la bibliothèque de références
Fenêtre de
recherche
avancée,
accessible par
la barre d’outils
Possibilité
d’enregistrer la
recherche
30
2. Gérer ses références : classer, organiser
Accéder à ses références par les marqueurs / tags
Zone des marqueurs
dans la colonne de
gauche de Zotero
Possibilité de filtrer
les références en
sélectionnant des
mots clés
3. Sauvegarder sa bibliothèque
Synchroniser l’ensemble de ses données avec le serveur Zotero
Cela permet de :
• Copier votre bibliothèque sur le serveur distant
→ Accès à My library gratuit jusqu’à 300 Mo
• Permet la sauvegarde de vos données
→ il est souhaitable aussi de sauvegarder sur un 3e support (clé usb)
• Consulter votre bibliothèque de n’importe quel ordinateur
→ après avoir installé Zotero et entré vos identifiants
3. Sauvegarder sa bibliothèque
1. Créer un compte sur le serveur Zotero
2. Compléter les paramètres
de synchronisation
Aller dans Actions / Préférences
Onglet Synchronisation
3. Activer la synchronisation
4. Produire une bibliographie
• Création d’une bibliographie
– À partir d’une collection donnée
– Formatage dans un style donné
• Passerelle avec les traitements de texte
– Word (Microsoft) et Writer (OpenOffice ou
LibreOffice)
– Insertion de citations pendant la rédaction
sans avoir à réécrire les références
4- Produire une bibliographie
• Formater la bibliographie
– Utilisation des styles fournis par Zotero
Enregistrer au
Format RTF, HTML
Ou Copier dans
le presse-papier
4- Produire une bibliographie
• Choisir un style : le gestionnaire de styles
Aller dans Préférences / Citer / Styles
12 styles par défaut
Pour chercher d’autres styles
Cliquer sur
Obtenir des styles supplémentaires
Janvier 2012 URFIST - SCD U.Rennes 1URFIST - SCD U.Rennes 1
4. Produire une bibliographie
36
Utiliser le répertoire de styles de Zotero
4- Produire une bibliographie et citer
• Utiliser Zotero dans un traitement de texte
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Les plugins sont « pré-intégrés »
Aller dans Préférences / Citer
Onglet Traitement de texte
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4- Produire une bibliographie et citer
• Utiliser Zotero dans un traitement de texte
Version Firefox
Plug-in spécifique à installer
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Choisir le plugin en fonction
du traitement de texte
4- Citer avec Zotero
• Barre d’outils Zotero dans Word ou Writer
Insérer une
référence Créer la bibliographie
Éditer et modifier une référence
Éditer et modifier la bibliographie
Modifier les préférences
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Supprimer le lien entre Zotero et le document
4- Citer avec Zotero
1- Placer le curseur dans le
texte où vous voulez insérer
une citation
2- Cliquer sur l’icône
d’insertion
3- Définir les préférences
(styles) et le type de citation
(bas de page etc.)
4- Taper un mot contenu dans
la référence que vous
voulez insérer
5- Envoi
6- A la fin de votre article, il
suffit de cliquer sur
« Insérer bibliographie »
pour que les références
complètes s’affichent
5- Partager ses références
• Outil collaboratif : Créer un groupe
• Réalisation de bibliographies collectives
Paramétrage du groupe
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Définition du groupe
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- Statut
- Disciplines concernées
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Gestion des membres
- propriétaire, éditeur
Ressources
• Tutoriel Form@doct
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  • 1. Gérer ses références bibliographiques avec Zotero Master 2 Biologie Gestion – septembre 2015 SCD de l'Université de Rennes 1
  • 2. PLAN Les logiciels de gestion bibliographique : introduction 1.Démarrer avec Zotero : installation, importation 2.Gérer ses références : manipuler, organiser 3.Sauvegarder sa bibliothèque : créer un compte 4.Produire une bibliographie dans un traitement de texte 5.Partager ses références : création de groupes 2
  • 3. Les outils de gestion bibliographique Utilité des logiciels de gestion des références bibliographiques • Pouvoir importer automatiquement des références résultant de recherches documentaires (bases de données ou pages web) • Pouvoir exploiter facilement de gros corpus de références • Pouvoir récupérer des références lors de l’écriture d’un texte et pour établir sa bibliographie • Pouvoir formater automatiquement des références selon les normes d’écriture et conventions en vigueur • Faire une saisie unique des données
  • 4. 1. Qu’est-ce que Zotero ? Simple d’utilisation 2 versions disponibles : • Une extension du navigateur Firefox (plugin) OU • Une application indépendante du navigateur (standalone) => utilisation possible avec Firefox, Chrome ou Safari NB : on peut travailler avec les 2 en fonction de son environnement, mais sur des ordinateurs distincts Open source • Logiciel libre et gratuit • Lancé en 2006 par le Centre for History and New Media de l’Université George Mason (USA) http://www.zotero.org
  • 5. URFIST - SCD U.Rennes 1 5 Que peut-on faire avec Zotero ? … Etc. Bibliographie 1__________2__ ________3_____ _____4________ __5__________ Article avec citations et bibliographie Pages web Base Zotero de références et pdf biblio en ligne, groupes
  • 6. 1.1 Installer Zotero Choix de la version Si vous utilisez Firefox comme navigateur : • Extension de Firefox 1- Télécharger Zotero 4.0 à partir de la page http://www.zotero.org 2- Après l’installation de Zotero : redémarrer Firefox => Icône Zotero en haut à droite de l’écran OU Si vous utilisez un autre navigateur : • Zotero Standalone  1- Choisir la version en fonction de votre environnement Windows, Mac, Linux 2- Installer le connecteur correspondant au navigateur de votre choix (Firefox, Chrome ou Safari)
  • 8. 1.2 Importer et créer des références 1. Import automatique direct 2. Récupération des références à partir d’un identifiant (ISBN, DOI, PMID) 3. Création d’une référence à partir d’une page web (signet) 4. Récupération des références d’un document pdf 5. Création manuelle d’une référence 8
  • 9. 1.2 Importer les références Récupération automatique des données par lot Google Scholar
  • 10. 1.2 Importer les références Sélectionner les documents
  • 11. 1.2 Importer les références Vérifier qu’elles soient complètes Récupérer les références dans Zotero Joindre le pdf si disponible
  • 12. 1.2 Importez des références Sites Zotero compatibles : • ScienceDirect, SpringerLink, Wiley online Library, Google Scholar et Books, PubMed, Amazon, ACS, Cairn, Europress, Sudoc, Supernova... • Voir la liste non exhaustive à : http://www.zotero.org/translators • Repère = l’icône à droite du Z
  • 13. 1.2 Importer des références 13 Le cas de Elevier ScienceDirect Selon les possibilités : soit récupérer un ensemble de références soit récupérer référence par référence soit récupérer un ensemble de références par le bouton export citations sur la page de résultats (dans le cas où les 2 premières solutions ne marchent pas)
  • 14. 14 1.2 Importer des références Vérifier si le PDF est présent sous la référence Vérifier si le PDF est présent sous la référence
  • 15. 1.2 Importer des références Autres possibilités d’import : • Récupération par l’ISBN pour un livre, ou le DOI pour un article • Création d’une référence à partir d’une page web • Récupération des métadonnées d’un fichier pdf • Création manuelle de la référence (en dernier recours)
  • 16. 16 1.2 Importer des références à partir d’un identifiant 1- Copier le DOI Ne pas oublier de récupérer le pdf s’il existe
  • 17. 1.2 Importer des références à partir de la page web • Références de pages web – Import automatique ou – Création d’un élément à partir de la page courante Capture d’écran Lien vers la page courante Compléter les références après vérification
  • 18. 1.2 Importer des références d’un pdf La première fois : Installer les outils pdftotext et pdfinfo dans les Préférences
  • 19. 1.2 Importer des références d’un pdf 1-Glisser déposer le fichier pdf dans Zotero 2- Clic droit sur le fichier importé 3- Récupérer les métadonnées
  • 20. 1.2 Importer des références manuellement Si l’import automatique ne marche pas : • Pas d’icône dans la barre d’adresse • En cas d’échec de l’enregistrement Cliquer sur nouveau document Sélectionner le type de document à ajouter Remplir les champs manuellement
  • 21. 21 2. Gérer ses références : classer, organiser • Gestion de la base personnelle – Modification de références – Recherche dans la base – Classement des références – Ajout de notes de lecture – Ajout de tags (marqueurs) – Lien de deux notices
  • 22. 2. Gérer ses références • Interface de travail : 3 parties distinctes • La barre d’outils Une référence Liste des références Bibliothèque et ses collections
  • 23. 2. Gérer ses références • La barre d’outils - Créer une collection - Créer un groupe - Actions : importer, exporter gérer les préférences - Nouveau document : créer manuellement une référence et faire le lien vers le texte intégral - Ajouter un document par son identifiant - Ajouter une note - Joindre un lien vers un fichier - Recherche avancée - Recherche dans la base Localiser le fichier, afficher en ligne - Synchroniser les données avec le serveur Zotero
  • 24. 2. Gérer ses références • Modifier une référence Ajouter des données supplémentaires Modifier un champ en cliquant dessus
  • 25. 2. Gérer ses références • Enrichir ses références : mots-clés, notes Saisir la note dans l’éditeur de texte Cliquer sur l’onglet Note Marqueur, Connexe Ajouter le marqueur La fonction Connexe permet de faire le lien avec une autre référence
  • 26. 26 2. Gérer ses références Fonction Localiser Afficher Afficher / Localiser le document selon son statut : PDF, capture, lien vers la page en ligne … 26 Fonction Localiser
  • 27. 2. Gérer ses références • Classer, organiser sa bibliothèque Ma bibliothèque Contient toutes les références Classer : Créer une collection et sous collection (barre d’outils) Glisser-déposer les références Renommer ou Supprimer (clic droit)
  • 28. 2. Gérer ses références • Fusionner les doublons Sélectionner les doublons Fusionner les doublonsAfficher les doublons
  • 29. 29 2. Gérer ses références : classer, organiser Recherche dans la bibliothèque de références Fenêtre de recherche avancée, accessible par la barre d’outils Possibilité d’enregistrer la recherche
  • 30. 30 2. Gérer ses références : classer, organiser Accéder à ses références par les marqueurs / tags Zone des marqueurs dans la colonne de gauche de Zotero Possibilité de filtrer les références en sélectionnant des mots clés
  • 31. 3. Sauvegarder sa bibliothèque Synchroniser l’ensemble de ses données avec le serveur Zotero Cela permet de : • Copier votre bibliothèque sur le serveur distant → Accès à My library gratuit jusqu’à 300 Mo • Permet la sauvegarde de vos données → il est souhaitable aussi de sauvegarder sur un 3e support (clé usb) • Consulter votre bibliothèque de n’importe quel ordinateur → après avoir installé Zotero et entré vos identifiants
  • 32. 3. Sauvegarder sa bibliothèque 1. Créer un compte sur le serveur Zotero 2. Compléter les paramètres de synchronisation Aller dans Actions / Préférences Onglet Synchronisation 3. Activer la synchronisation
  • 33. 4. Produire une bibliographie • Création d’une bibliographie – À partir d’une collection donnée – Formatage dans un style donné • Passerelle avec les traitements de texte – Word (Microsoft) et Writer (OpenOffice ou LibreOffice) – Insertion de citations pendant la rédaction sans avoir à réécrire les références
  • 34. 4- Produire une bibliographie • Formater la bibliographie – Utilisation des styles fournis par Zotero Enregistrer au Format RTF, HTML Ou Copier dans le presse-papier
  • 35. 4- Produire une bibliographie • Choisir un style : le gestionnaire de styles Aller dans Préférences / Citer / Styles 12 styles par défaut Pour chercher d’autres styles Cliquer sur Obtenir des styles supplémentaires
  • 36. Janvier 2012 URFIST - SCD U.Rennes 1URFIST - SCD U.Rennes 1 4. Produire une bibliographie 36 Utiliser le répertoire de styles de Zotero
  • 37. 4- Produire une bibliographie et citer • Utiliser Zotero dans un traitement de texte Version Standalone Les plugins sont « pré-intégrés » Aller dans Préférences / Citer Onglet Traitement de texte pour terminer l’installation
  • 38. 4- Produire une bibliographie et citer • Utiliser Zotero dans un traitement de texte Version Firefox Plug-in spécifique à installer À partir du site Zotero Choisir le plugin en fonction du traitement de texte
  • 39. 4- Citer avec Zotero • Barre d’outils Zotero dans Word ou Writer Insérer une référence Créer la bibliographie Éditer et modifier une référence Éditer et modifier la bibliographie Modifier les préférences du document Rafraîchir l’affichage Supprimer le lien entre Zotero et le document
  • 40. 4- Citer avec Zotero 1- Placer le curseur dans le texte où vous voulez insérer une citation 2- Cliquer sur l’icône d’insertion 3- Définir les préférences (styles) et le type de citation (bas de page etc.) 4- Taper un mot contenu dans la référence que vous voulez insérer 5- Envoi 6- A la fin de votre article, il suffit de cliquer sur « Insérer bibliographie » pour que les références complètes s’affichent
  • 41. 5- Partager ses références • Outil collaboratif : Créer un groupe • Réalisation de bibliographies collectives Paramétrage du groupe - Public ou privé Définition du groupe - Nom et description - Statut - Disciplines concernées - etc. Gestion des membres - propriétaire, éditeur
  • 42. Ressources • Tutoriel Form@doct http://guides-formadoct.ueb.eu/zotero • Blog francophone http://zotero.hypotheses.org/ • Contact marc.lemarchand@univ-rennes1.fr