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M2 biologie gestion-sources et methodes pour la recherche documentaire_2018

  • 2. PLAN 1. Méthologie de recherche documentaire 2. Outils de recherche du WEB o Google/Google Scholar o Bases de données 3. Outils de recherche de Rennes 1 – Supernova – Revues en ligne 4. Organiser sa documentation personnelle 5. Autres ressources utiles Sources et méthode pour la recherche documentaire 2
  • 3. 1er niveau o 2e niveau ▷ 3e niveau • 4e niveau ⇢5e niveau Sources et méthode pour la recherche documentaire 3
  • 4. 1. Méthode de recherche d'articles scientifiques 2. Outils de recherche du WEB 3.Outils de recherche de Rennes 1 4. Organiser sa documentation personnelle 5. Pour aller plus loin Sources et méthode pour la recherche documentaire 4
  • 5. Méthode à suivre Sources et méthode pour la recherche documentaire 5 Choix des mots-clés Choix des sources d'information Fonction : Recherche avancée Navigation Rebond Analyse des résultats Analyse Sujet Analyse Sujet
  • 6. Trouver ses mots-clés Sources et méthode pour la recherche documentaire 6 3 outils terminologiques Termsciences http://www.termsciences.fr/ Grand dictionnaire terminologique http://www.granddictionnaire.com/ MESH http://mesh.inserm.fr/mesh/
  • 7. Délimiter son sujet Sources et méthode pour la recherche documentaire 7 Encyclopédie généraliste : Encyclopédies spécialisées : ENT > Ressources électroniques Sciences Santé
  • 8. Sources et méthode pour la recherche documentaire 8 Recherchez vos mots-clés et testez-les dans les encyclopédies... … et n'hésitez pas à poser des questions si nécessaire !
  • 9. 1. Méthode de recherche d'articles scientifiques 2. Outils de recherche du WEB 3. Outils de recherche de Rennes 1 4. Organiser sa documentation personnelle 5. Pour aller plus loin Sources et méthode pour la recherche documentaire 9
  • 10. Google Sources et méthode pour la recherche documentaire 10 - Trop de résultats : inexploitable - Tris proposés trop larges (images, livres...) - Recherche avancée utile mais insuffisante - Valeur scientifique des documents ?
  • 11. Sources et méthode pour la recherche documentaire 11 Recherche avancée Article payant Articles accessibles Article Open access Article payant Google Scholar
  • 12. Sources et méthode pour la recherche documentaire 12 Testez la pertinence de vos mots-clés dans Google Scholar... … et n'hésitez pas à poser des questions si nécessaire !
  • 13. Bouquets de revues multidisciplinaires 3 plates-formes d'éditeurs de revues scientifiques incontournables : Sources et méthode pour la recherche documentaire 13 Revues en texte intégral accessibles depuis les origines Revues en texte intégral accessibles depuis les origines Revues en texte intégral accessibles depuis 1997
  • 14. Bases de données spécialisées Sources et méthode pour la recherche documentaire 14 BBD bibliographique en santé (médecine et pharmacologie) Accès libre sur Internet Utiliser le lien via l'ENT pour l'accès au texte intégral BBD de chimie et de pharmacie Obligation de se créer un compte perso Interroge simultanément les bases de données de Chemical Abstracts Service (CAS) : CAPlus, Registry, CASReact et Medline
  • 15. Bases de données spécialisées Sources et méthode pour la recherche documentaire 15 Accès : ENT + de 3000 e-book français et A anglo-saxon Texte intégral an accès libre Texte intégral non téléchargeable Économie et gestion Fonctionnalités avancée avec un compte perso
  • 16. Site complémentaire utile ! Sources et méthode pour la recherche documentaire 16 Accès libre Fabricant et fournisseur de substances chimiques pour laboratoires Recherche simple et avancée de substances chimiques
  • 17. Sources et méthode pour la recherche documentaire 17 Faites vos propres recherches dans ces bases... … et n'hésitez pas à poser des questions si nécessaire !
  • 18. 1. Méthode de recherche d'articles scientifiques 2. Outils de recherche du WEB 3. Outils de recherche de Rennes 1 4. Organiser sa documentation personnelle 5. Pour aller plus loin Sources et méthode pour la recherche documentaire 18
  • 19. SUPERNOVA : moteur de recherche des ressources de Rennes 1 Sources et méthode pour la recherche documentaire 19 Accès ENT ou p. d'accueil BU Facettes de tri Tous types de documents
  • 20. Ressources électroniques de Rennes 1 Sources et méthode pour la recherche documentaire 20 Accès ENT Accès Site BU
  • 21. 1. Méthode de recherche d'articles scientifiques 2. Outils de recherche du WEB 3. Outils de recherche de Rennes 1 4. Organiser sa documentation personnelle 5. Pour aller plus loin Sources et méthode pour la recherche documentaire 21
  • 22. Outils de veille documentaire Sources et méthode pour la recherche documentaire 22 Les newsletters Les alertes Nouveaux outils collaboratifs : Twitter, Research gate Les flux RSS Agrégateur gratuits de flux (Netvibes, Feedly...)
  • 23. Possibilités de sauvegarde Exporter pour conserver toutes ses références et ses .pdf à partir : Sources et méthode pour la recherche documentaire 23 Vers : Clé USB Messagerie perso Disque dur Zotero D'une BDD D'un moteur de recherche D'une revue Espace perso ENT
  • 24. 1. Méthode de recherche d'articles scientifiques 2. Outils de recherche du WEB 3. Outils de recherche de Rennes 1 4. Organiser sa documentation personnelle 5. Pour aller plus loin Sources et méthode pour la recherche documentaire 24
  • 25. Autre ressource utile Sources et méthode pour la recherche documentaire 25 Actualiser mes références Faire une revue de presse thématique Recherche par mots-clés dans tous les titres Presse française et internationale Accès à l'intégralité de certains titres tels qu'imprimés
  • 26. Autre ressource utile Lire un livre en texte intégral Suggérer l'achat d'un livre par la BU et en bénéficier rapidement Pour bénéficier de toutes les fonctionnalités Créez-vous un compte !
  • 27. Aides à la recherche documentaire Sources et méthode pour la recherche documentaire 27 Les modes d'emploi des BDD de Rennes 1 FOCUS Page dédiée au M2 Biologie-Gestion
  • 28. Aides à la recherche documentaire (suite) Site de votre Master Biologie-Gestion : Site M2 Biologie-Gestion de Rennes 1 / Synthèse bibliogra Service de renseignements : - Sur place à la BU - A distance avec Sources et méthode pour la recherche documentaire 28 Accès depuis : L'ENT Le site de la BU Sur Ubib.fr
  • 29. Aides à la recherche documentaire (suite) Pour toute question sur cette séance ou pour prendre RDV : lenaick.denis@univ-rennes1.fr Sources et méthode pour la recherche documentaire 29

Notes de l'éditeur

  1. Information scientifique ? - L'auteur doit être quelqu'un de connu et reconnu en tant que scientifique - l'information doit être validée par un comité d'experts scientifiques avant la publication (commerciale ou open access) accessible :Sur des payanteplates-formes d'éditeurs (comme Elsevier, Wiley IOP, etc... Ou Sur des plates-formes d'éditeurs en Open-access : BioMedCentral Ou Sous forme papier (bibliothèque, librarie, etc...) Article scientifique ? - bien observer la structure de l'article : introduction, matériel et méthodes, résultats, discussions + bibliographie - DONC : pas un résumé, par un rapport ou un compte-rendu Article payant : La licence est le modèle de référence, traditionnel pour la diffusion des revues scientifiques. Modèle imposé par les éditeurs scientifiques connus comme Elsevier. Pose la question des coûts très importants, et de la garantie d'un accès pérenne aux abonnements pris. Ex : ScienceDirect : pls dizaines de milliers d'euros/an. 5-6% d’augmentation annuelle. A R1, les licences signées par le Président engagent tous les utilisateurs (personnels, étudiants) sur un certain nombre de règles à respecter (pas de téléchargements massifs, pas d’exploitation commerciale…Il est interdit, à la fois par la licence éditeur et par la charte informatique de l’université, de donner accès à une tierce personne sous son identifiant personnel) La plupart des ressources élec sont accessibles à distance via authentification Sésame. Règles : pas de téléchargements massifs, pas d’exploitation commerciale… Interdiction de donner accès à une tierce personne avec son ID personnel.  Article en Open access : Le modèle de l'accès libre, se développe depuis une décennie afin de contrecarrer le modèle payant dont les coûts sont difficiles à supporter par les institution. L'open access recouvre deux réalités distinctes : les revues en libre accès et les archives ouvertes (open archive). Exemples : DOAJ (directory of open access journals) ; HAL : http://hal.archives-ouvertes.fr ; BioMed Central qui est un éditeur de revues en ligne en libre-accès, peer-reviewed dans les les domaines des Sciences, Technologies et Médecine. Articles en libre accès en permanence immédiatement après leur publication. => Important et utile quand on est plus étudiant ou mb de l’université Autres sources d'information liées à Internet : forums, blogs (y compris de spécialistes)... La chaîne traditionnelle de l'édition scientifique (sélection et validation avant publication) n'opère plus de la même manière. Le chercheur doit effectuer un travail d'évaluation.
  2. Importance d'avoir une méthode d'analyse du sujet = partie indispensable d'une méthode de recherche documentaire Cette méthode est constamment à refaire en boucle au fur et à mesure l'affinage de la recherche On va ainsi du général au particulier Avantages : - éviter les hors-sujet - éviter les perte de temps - favoriser la pertinence des résultats - connaître ses ressources documentaires - mettre en place des automatismes de recherche
  3. Notion de « keyword » versus « recherche sur texte intégral » : Recherche par « keywords »  : « keywords » C'est + qu'un mot-clé. C'est un descripteur d'un concept qu'il caractérise ou d'un thésaurus. Permet la recherche dans les BDD, les catalogues de bib. Attention au BDD qui ont leur propre thésaurus ! Qui s'oppose à la : Recherche en texte intégral : recherche dans les mots du texte et non dans les « keywords » ou mots-clés qui le caractérisent. Ex : le terme « distilbène » n'est pas un keyword, il faut chercher avec le nom de la molécule. Nécessité de trouver vos mots-clés en anglais et en français : 1. Termsciences : Portail terminologique multidisciplinaire du CNRS 2. GDT : Base de données terminologiques français-anglais et anglais-français 3. Thesaurus MESH : vocabulaire « contrôlé » de la national Library of Medicine utilisé pour indexer les articles de MEDLINE / Pubmed => Montrer comment ajouter le plug-in de recherche dans Termsciences pour l'intégrer dans le navigateur Firefox http://www.termsciences.fr/spip.php?rubrique26 Page d'accueil : Services / interrogation à distance Exemple : « phytoestrogene » (Gr. 1) « cytochrome » (Gr. 2) - Faire voir l'arbre des concepts (autres mots-clés généraux et spécifiques...) + définition et traduction du mot-clé recherché Faire même recherche dans les 3 outils >complémentarité Idem pour le GDT
  4. Universalis : imprimée (BU) et en ligne (ENT) Version en ligne payante (R1) 30 000 articles validés par des experts (contrairement à Wikipédia). Permet d' « entrer » dans un sujet. Recherche par domaine disciplinaire si on a déjà quelques connaissances ou par recherche avancée. Dictionnaire. Exemple : « glyphosate » Voir le menu « classification » pour recherche thématique avec des articles complémentaires pour rebondir sur le sujet. Citation possible. Techniques de l’Ingénieur : source encyclopédique et factuelle actualisée sur l’ensemble des techniques analytiques et de leurs applications, en français Recherche avancée/par univers/moteur de recherche dans les ressources documentaires Exemples : Recherche simple dans ress. Doc. : «proteine biomateriaux » = 53 résultats Recherche avancée : « même recherche après le 01/01/2015» => 18 résultats Plusieurs types de documents : illustration (pb des droits de copyright), articles de la base documentaire validés par experts Existe aussi des articles R&D. Dictionnaire scientifique multilingue. EM-Premium : Intégralité de l'Encyclopédie Médica-Chirurgicale en ligne + 45 traités auxquels R1 est abonnés (pas aux revues) Exemple : parodontite AND bacterie* / depuis 2010 = 54 res. Possibilité d'exclure les anciennes versions d'articles = 52 résultats (baisse bcp les res. parfois) Possibilité de faire une recherche dans liste res. « fer » = 8 res.
  5. 1er réflexe de recherche : Google ! Exemple : targeted treatment epilepsy = 584 000 résultats ! Recherche non pertinente : - trop de résultats, donc trop de tri - quels documents pour quelle validité scientifique ? - validité des sources ?  n'existe aucun outils qui permette de chercher dans toutes les ressources pour trouver en un minimum de temps ce que vous cherchez
  6. Recherches sur : - des articles scientifiques - des thèses de type universitaire - des citations ou encore des livres scientifiques - des articles provenant des journaux de grands éditeurs de littérature scientifique Pas de sites commerciaux dans Google Scholar ! Recherche simple : targeted treatment epilepsy = 180 000 res. Utilisation de la recherche avancée : Exemple : targeted treatment epilepsy → Recherche avancée : mots dans titre de l'article = 6 résultats Idem avec : « targeted treatment » epilepsy = 2 res. Ne pas hésitez à utiliser le tri par date ! Décrypter la liste des résultats : Montrer l'outil bibliométrique : Exemple recherche auteur : DROULERS Olivier (prof. Marketing. M2 Bio-G.) Exemple recherche auteur : Arnaud Biraben = 72 résultats Gilles Bedoux = 14 résultats > s'est inscrit dans Google Scholar : on peut visualiser sa production
  7. 1 bouquet : regroupement de revues électroniques accessibles sur 1 même plate-forme. Langue d'interrogation = anglais (voir les outils terminologiques). Recherche dans l'ensemble de la plateforme. Structurer sa requête : exemple dans ScienceDirect (+ 2000 revues en texte intégral) Advanced search > onglet Journals: Exemple : bacteriophage* (TITLE-ABSTR-KEY) AND bacillus cereus (KEYWORDS) Pubdate > 2007 DocType Articles = 5 rés. Opérateur OU : targeted treatment epilepsy OU traitement* cible* epilepsie (TITLE-ABSTR-KEY)s) = 372 résultats Icône de couleur : open access, accès possible via R1, accès payant Affiner les résultats avec les facettes de gauche Review articles : vue d'ensemble substantielle sur un sujet avec bibliographie. Outils proposés pour les critères de recherche : Ex. : Être informé des nouveaux articles (après être enregistré) : - sauvegarder ses requêtes (accès par Recall search) - enregistrer sa requête comme une alerte (envoi sur le mail) - s'abonner à un flux RSS (séance 2) Le site propose des flux (ou fils) RSS, comprenant généralement, pour chaque information répertoriée, un titre, un résumé et le lien pointant directement sur l'information complète Outils proposés pour exploiter la liste de résultats : Ex. : Sauvegarder ses résultats (télécharger les pdf, exports -voir séance 2-) Important : recherche d'images (avec article ou son résumé correspondant, images en relation) Advanced search > onglet Images : bacteriophage* AND bacillus cereus Pubdate > 2007 = 46 résultats Wiley (+ de 1400 revues en texte intégral) : même recherche dans all fields. Utiliser aussi Browse by subject Springer (+ de 1200 revue en texte intégral) : idem
  8. Medline Base de données bibliographique gratuite. Recense une très grande partie de la documentation mondiale en médecine, dentaire, pharmacie etc. Fournit des citations aux articles repérés et PubMed, l'interface de recherche de Medline, affiche des liens vers le texte intégral d'un certain nombre d'articles trouvés. Attention ! Les liens sous forme de bouton rouge ne fonctionnent pas depuis l'extérieur de l'université. Toutefois, les revues électroniques pour lesquelles il apparaît sont accessibles depuis « Revues en ligne » dans Supernova ou le nom du bouquet de l'éditeur dans le dossier "Santé" Exemple : stem cells / metabilsm AND scetic shock = 4 res. Montrer les filtres SciFinder Base de données bibliographiques ET une base de données de substances (Explore substances) et de réactions interrogeable par structure.Attention : avant d’utiliser ce service vous devez vous enregistrer en utilisant obligatoirement votre adresse mail en @univ-rennes1.fr . Recherche simple et avancée. Exemple : « glyphosate » = 1 res. Le montrer et voir en-dessous les caractéristiques intéressantes pour rebondir. Copier-coller le titre et vérifier dans SUPERNOVA l'accès au texte intégral > pas d'accès pour cet exemple. Onglet « refine » pour affiner sa recherche avec d'autres mots-clés Base presque exhaustive en chimie + une très grande base de brevets Il existe aussi en libre-accès : - ChemSpider développée par la Royal Society of Chemistry PubChem développé par National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institute of health … (USA)
  9. Accès texte intégral Pas de recherche avancée  : Possibilité de filtrer les résultats Ex. : neuromarketing = 10 résultats Ex. rech. Par auteur : Droulers On peut juste lire en ligne : pas de téléchargement possible Possibilités de s'abonner à des flux RSS + autres bases de données en éco-gestion dans la liste des ressources électroniques dans l'ENT > Bibliothèque > ressources électroniques > droit économie gestion.
  10. Pour rechercher un produit chimique et/ou un matériel d'analyse utilisés pour les expériences
  11. Préférer au départ une recherche simple par mots-clés puis affiner par les facettes de gauche Accès direct au texte intégral quand Rennes 1 est abonné à la ressource Accès compte lecteur (de Novacat) Possibilité de se créer un compte Supernova : Exemple recherche d'articles : 1. A partir de mots-clés : Recherche simple par mots-clé : « fibromyalgia » = 99 0877 résultats ! * utiliser les facettes de gauche pour restreinte : Si restriction à R1 : on a 1 ouvrage de R1 qui parle de ce sujet (entre autres) Restriction par type de doc : 289 000 résultats Restriction par date : 2014 à 2015 = 5 869 résultats Recherche avancée : «NAdes » dans tout le titre AND « CO2 » dans tout le texte = 9 résultats (puis tri par date si besoin) ; «NAdes» dans tout le texte OR «Natural deep eutectuc solvents» dans tout le texte = 15 res. 2. A partir du titre d'une revue : Recherche avancée : «Comprehensive Psychiatry» dans champs SO Source AND «schizophrenia physical activity » dans champs TI Titre (de l'article) = 8 résultats 3. Revue en ligne Dans la facette de tri Revuie ou source, on voit c'est dans telle ou telle revue qu'il y a le + de res. Copier le titre de la revue dans Revue en ligne et y faire une recherche avec des mots-clés.
  12. 1. Les newsletters : document d'information envoyé de manière périodique par courrier électronique à une liste de diffusion 2. Les alertes : envoi sur messagerie d'une alerte sur un sujet, un périodique, une recherche 3. Flux Rss : De nombreux sites offrent désormais cette fonctionnalité : - La presse généraliste (Le Monde) ou économique (Les Échos)... - Des sites institutionnels (Science.gouv.fr) On peut choisir le flux généraliste ou spécialisé par domaine Exemple : intégrer un flux RSS de Science Direct dans sa barre personnelle de marque-pages en tant que marque-pages dynamique : - A partir de la page d'accueil d'une publication de Science Direct → « New article feed » → nommer le flux « continue » → cliquer sur le lien proposé → sélectionner Marque-pages dynamique « s'abonner maintenant » → Barre personnelle - A partir page de résultats de recherche « RSS Feed »→ même démarche que précédemment : - sélectionner les sources correspondant à vos centres d'intérêt ; - créer votre site personnel en le structurant selon vos besoins; - lire en étant déconnecté ou en temps réel des fils d'information ; - avoir une vision d'ensemble rapide des points d'actualité . Agrégateurs de flux RSS : par ex. Netvibes, Diigo, Feedly : permet d'organiser simplement sa veille d'informations sur un tableau de bord personnalisable, en ajoutant les sources d'informations de son choix parmi différentes thématiques. Les actualités sont présentées dans un format « magazine » avec les actualités les plus importantes en tête de page. Les flux RSS tendent à être remplacés par des outils plus collaboratifs, comme Twitter, Research gate
  13. Exporter vos références bibliographiques complètes : sauvegarder les résultats, utiliser l'envoi par mail des références, des articles...à partir des bases de données ou des revue en ligne. Attention : nécessité de vérifier et de modifier la structure de la références afin qu'elle soit conforme à ce qui vous est demandé pour la synthèse bibliographique. Utiliser les possibilités de sauvegarde et d'alertes proposées par les sites de bases de données Enregistrer vos informations dans tous les cas pour éviter les pertes de temps et d'information. Espace perso de l'ENT (après authentification) : onglet Mon bureau / Espace personnel où vous pouvez enregistre vos documents, vos recherches, des listes de références bibliographiques, créer des des dossiers, etc... Compte Supernova : offre notamment la possibilité sauvegarder des références dans votre dossier après avoir créer un compte Supernova (= un compte EBSCO) Mais uniquement les recherches, les résultats effectuées, les documents trouvés à partir de Supernova : - Enregistrer des préférences - Organiser des recherches via des dossiers - Partager vos dossiers avec d'autres personnes - Visualiser les dossiers d'autres personnes - Sauvegarder et récupérer vos historiques de recherche de Supernova - Créer des alertes e-mail et/ou des flux RSS - Accéder à distance à vos recherches sauvegardées  Vous serez également formés à l'outil gratuit Zotero pour vous aider à recueillir, d'organiser, de citer et partager vos sources de recherche.
  14. Europresse Utiliser la recherche avancée (flèche sous le champs de saisie de recherche) : Possibilité de filtrer par date, par type de contenu (presse spécialisée ou non), par zone géographique (presse mondiale, régionale, nationale). Ex. : Diabete (depuis 2 ans ; dans le titre ; presse spécialisée monde) Sauvegarde des articles Accès texte intégral au format PdF selon les revues Recherche directe de journaux au format PdF (onglet en haut)
  15. Site Master Biologie-gestion : - point sur la Synthèse bibliographique - accès à d'autres Synthèses bibliographiques réalisées à Rennes 1 entre 2010 et 2015 (versions longues ou courtes)