Détection des allèles polymorphiques ou allèles antigènes variants par PCR - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - OULD BRAHIM Hamoud, INSTITUT PASTEUR de DAKAR - Unité d’épidémiologie, BP :220, Dakar - SENEGAL - Etudiant en Thèse - hamoudey@yahoo.com

1. Détection des allèles polymorphiques ou
des allèles antigènes variants par PCR
Jean Michel LEONG POCK TSY
Atelier Paludisme session 2004

2. Allèles polymorphes
Il s’agit de gènes typiquement unique
mutations ponctuelles
existence des régions répétées qui diffèrent par leur séquence et leur
nombre de répétitions
gène MSP-1 (Merozoite Surface Protein 1)
codent pour des protéines de surface des mérozoïtes
impliquée dans l’invasion des hématies
3 types d’allèles polymorphes : K1, MAD20, RO33

3. Allèles des antigènes variants
Allèles responsable de la variation antigénique chez Pl. falciparum :
famille des gènes var (environ 50 – 150 membres)
La variation antigénique concerne :
le changement d’épitopes immunodominants à la surface des
hématies infestées due à l’expression des différentes protéines
(PfEMP1)
le choix des protéines est déterminés par le choix du gènes var
exprimé.
le switch d’expression d’un gène var à l’autre constitue le phénomène de
variation génétique pour PfEMP1 (Erythrocyte Membrane Protein 1)
Gènes var codent
protéines de surface des hématies parasitées
permet l’adhésion au niveau des cellules endothéliales
se lie avec les récepteurs endothéliaux (ICAM, CD36, CSA…)

4. Techniques de détection (1)
Disposition des sondes
MSP - 1
PfEMP1
(A : Source : Hoffman HE. et al. Malaria Journal 2003)
(a : Smith JD. et al. Trends in Parasitology 2001)

5. Techniques de détection (2)
Technique PCR : Amplification in vitro d’ADN
(http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/chap2/12.htm)

6. Techniques de détection (3)
Electrophorèse : séparation des fragments
(Source : Nogueira PA. et al. Experimental Parasitology 2002)

7. Techniques de détection (4)
Séquençage : analyses des
séquences
(Source : Bischoff E , Thèse 2001)

8. Conclusion
Importance de la détection :
Etablir la phylogénie des gènes
Connaître la répartition et la limitation des différentes souches dans
les antigènes polymorphes ou variants
Utiliser les informations pour le développement des vaccins antipaludiques
:
contre les antigènes polymorphes ( 2 ou 3 allèles) : bloquer l’invasion
contre des domaines conservés des antigènes variants : bloquer la
cytoadhérence et le facteur principal de virulence

9. Références bibliographiques
http://ebischoff.free.fr
http://www.malariajournal.com/content/2/1/24
Kirsten F., Chen Q. 2003. var genes, PfEMP1 and human host. Mol.
Biochem. Parasitol. 134 : 3 – 9.
http://parasites.trends.com
http://www.malariajournal.com/content/2/1/7
www.academicpress.com
http://www.gnis-edagogie.org/pages/classbio/chap2/12.htm

10. Je vous remercie pour votre
aimable attention