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DE L’ADN A LA PROTEINE
BA Ousmane
Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale
Institut Nationale de Recherches en Santé publique
Atelier paludisme 2006
EVALUATION
par les FACILITATEURS
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Anonyme, visite le 07 Mars 2006
http://ludwig-sun1.unil.ch/~vjongene/molbio/chapt_1.htm
Berthier A.L. (1997). A la découverte du gène.Agro Performances, Hors série oct. 97, 8-9.
http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/biblio.htm
Francoise Baunaure, Gordon Langsley. Trafic protéique dans le globule rouge infecté par
Plasmodium
Synthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9
http://disc.vjf.inserm.fr/basismedsci/2005/ms_5_2005/BAUNAURE_p523_529.pdf
K. G. Le Roch, J. R. Johnson, L. Florens, Y. Zhou, A. Santrosyan, M. Grainger, S. F. Yan, K.
C. Williamson, A. A. Holder, D. J. Carucci, J. R. Yates III, and E. A. Winzeler
Global analysis of transcript and protein levels across the Plasmodium falciparum life cycleGenome
Res., November 1, 2004; 14(11): 2308 – 2318
http://www.ajtmh.org/cgi/content/abstract/67/3/233
L. H. Freitas-Junior, E. Bottius, L. A. Pirrit, K. W. Deitsch, C. Scheidig, F. Guinet, U.
Nehrbass, T. E. Wellems and A. Scherf. Frequent ectopic recombination of virulence factor
genes in telomeric chromosome clusters of P. falciparum. Nature. vol. 407, october 2000, pp.
1018-1022.
http://www.cnrs.fr/Cnrspresse/n390/html/n390a09.htm
Bibliographie (2)
MCINTOSH MT, SRIVASTAVA R & VAIDYA AB- Divergent evolutionary
constraints on mitochondrial and nuclear genomes ofmalaria parasites. Mol Biochem Parasitol, 1998,
95 , 69-80.
http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf
P. Collet, V.Derozier, G. Dray, F. Trousset, P. Poncelet, M. Crampes. Tendances dans les
expressions de
gènes : Application à l’analyse du transcriptome de Plasmodium Falciparum. Actes du Congrès EGC
2005, Paris,
janvier 2005. Editions Cepaduès. ISBN : 2-85428-683-9.
http://pbil.univ-lyon1.fr/events/jobim2005/proceedings/P60Collet.pdf
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Approche génétique de l’étudedu cycle sporogonique de Plasmodium.
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P. falciparum in Southeast Asia and Africa. Cell, 1997.91, 593-603.
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WATERS AP, THOMAS AW, VANDIJK MR & JANSE CJ
Transfectionof malaria parasites. Methods, 1997, 13, 134-147.
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De l'ADN à la protéine

  • 1. DE L’ADN A LA PROTEINE BA Ousmane Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale Institut Nationale de Recherches en Santé publique Atelier paludisme 2006 EVALUATION par les FACILITATEURS
  • 2. Plan Introduction Génome du Plasmodium falciparum Transcription Protéines Conclusion
  • 4. Génome du Plasmodium falciparum Trois types de génomes: nucléaire, mitochondrial, apicoplaste Taille: 25 méga base 14 chromosomes(séquençage terminé en octobre 2002) 5279 gènes identifiés, 60% de fonction inconnue Composition en A-T: 80%(90% dans les introns), différence P. vivax(67%) Polymorphisme élevé
  • 6. Transcription (2) Transcriptome: ensemble des ARNm issu de l’expression d’une partie du génome d’une cellule Intérêt: identifier gènes actifs, mécanisme de régulation d’expression des gènes, définir les réseaux d’expression des gènes Environ 40% des gènes du Plasmodium falciparum sont transcrits
  • 7. Transcription (3) P. falciparum: transcription en fonction de la demande Suivant les trois phases du cycle chez l’Homme: protéines intervenants dans les stades : trophozoïtes, hypnozoïtes (sauf Pf), gamétocytes Actif aussi chez le moustique: production des sporozoïtes
  • 9. Protéines (2) PfEMP1( Erythrocyte Membrane Protein 1 ) Exprimée/parasite et transporté à la surface des globules rouges grâce au réseau tubulovésiculaire (Synthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9) Quasi-totalité de l’adhésion Production sans cesse de nouveau variants Rôle: agglutination, variation antigénique, immunorégulation.
  • 10. Protéine (3) Variation Tropisme (répartition récepteur endothéliaux non homogène) CS (Circum Sporozoïtes) Adhésion des sporozoïtes aux hépatocytes Développement du parasite dans le moustique Formation des sporozoïtes dans les oocystes
  • 11. Conclusion (1) Application thérapeutique: CQrésistance Etude du polymorphisme de séquences répétées associées aux mutations:origine de la chloroquino-résistance PfCRT, sur chx7, proximité de PfCG2, mutations ponctuelles retrouvées dans échecs thérapeutiques de la chloroquine . PfMDR1, gène, sur chx5, mutations ponctuelles sont liées à la chloroquino-résistance
  • 12. Conclusion (2) Moitié des protéines du P. falciparum ont une fonction inconnue Et sont spécifiques du parasite Donc ces protéines peuvent représenter des cibles thérapeutiques originales
  • 13. Bibliographie (1) Anonyme, visite le 07 Mars 2006 http://ludwig-sun1.unil.ch/~vjongene/molbio/chapt_1.htm Berthier A.L. (1997). A la découverte du gène.Agro Performances, Hors série oct. 97, 8-9. http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/biblio.htm Francoise Baunaure, Gordon Langsley. Trafic protéique dans le globule rouge infecté par Plasmodium Synthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9 http://disc.vjf.inserm.fr/basismedsci/2005/ms_5_2005/BAUNAURE_p523_529.pdf K. G. Le Roch, J. R. Johnson, L. Florens, Y. Zhou, A. Santrosyan, M. Grainger, S. F. Yan, K. C. Williamson, A. A. Holder, D. J. Carucci, J. R. Yates III, and E. A. Winzeler Global analysis of transcript and protein levels across the Plasmodium falciparum life cycleGenome Res., November 1, 2004; 14(11): 2308 – 2318 http://www.ajtmh.org/cgi/content/abstract/67/3/233 L. H. Freitas-Junior, E. Bottius, L. A. Pirrit, K. W. Deitsch, C. Scheidig, F. Guinet, U. Nehrbass, T. E. Wellems and A. Scherf. Frequent ectopic recombination of virulence factor genes in telomeric chromosome clusters of P. falciparum. Nature. vol. 407, october 2000, pp. 1018-1022. http://www.cnrs.fr/Cnrspresse/n390/html/n390a09.htm
  • 14. Bibliographie (2) MCINTOSH MT, SRIVASTAVA R & VAIDYA AB- Divergent evolutionary constraints on mitochondrial and nuclear genomes ofmalaria parasites. Mol Biochem Parasitol, 1998, 95 , 69-80. http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf P. Collet, V.Derozier, G. Dray, F. Trousset, P. Poncelet, M. Crampes. Tendances dans les expressions de gènes : Application à l’analyse du transcriptome de Plasmodium Falciparum. Actes du Congrès EGC 2005, Paris, janvier 2005. Editions Cepaduès. ISBN : 2-85428-683-9. http://pbil.univ-lyon1.fr/events/jobim2005/proceedings/P60Collet.pdf R. Ménard Approche génétique de l’étudedu cycle sporogonique de Plasmodium. Manuscrit n°1963/PLS12. Journée IP en hommage à Paul-Louis SIMOND. http://www.pathexo.fr/pdf/1999n5b/Menard.pdf SU XZ, KIRKMAN LA, FUJIOKA H & WELLEMS TE - Complex polymorphism’s in a 330-kDa protein are linked to chloroquineresistant P. falciparum in Southeast Asia and Africa. Cell, 1997.91, 593-603. http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf WATERS AP, THOMAS AW, VANDIJK MR & JANSE CJ Transfectionof malaria parasites. Methods, 1997, 13, 134-147. http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf
  • 15. DE L’ADN A LA PROTEINE BA Ousmane Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale Institut Nationale de Recherches en Santé publique Atelier paludisme 2006