Détection des allèles polymorphiques ou
des allèles antigènes variants par PCR

        Jean Michel LEONG POCK TSY




           Atelier Paludisme session 2004
Allèles polymorphes

Il s’agit de gènes typiquement unique
mutations ponctuelles
existence des régions répétées qui diffèrent par leur séquence et leur
nombre de répétitions


gène MSP-1 (Merozoite Surface Protein 1)
    codent pour des protéines de surface des mérozoïtes
    impliquée dans l’invasion des hématies
    3 types d’allèles polymorphes : K1, MAD20, RO33
Allèles des antigènes variants
  Allèles responsable de la variation antigénique chez Pl. falciparum :
  famille des gènes var (environ 50 – 150 membres)

  La variation antigénique concerne :
      le changement d’épitopes immunodominants à la surface des
    hématies infestées due à l’expression des différentes protéines
    (PfEMP1)
      le choix des protéines est déterminés par le choix du gènes var
    exprimé.


  le switch d’expression d’un gène var à l’autre constitue le phénomène de
variation génétique pour PfEMP1 (Erythrocyte Membrane Protein 1)
  Gènes var codent
     protéines de surface des hématies parasitées
     permet l’adhésion au niveau des cellules endothéliales
     se lie avec les récepteurs endothéliaux (ICAM, CD36, CSA…)
Techniques de détection (1)
       Disposition des sondes




                                          MSP - 1




                                          PfEMP1

(A : Source : Hoffman HE. et al. Malaria Journal 2003)
(a : Smith JD. et al. Trends in Parasitology 2001)
Techniques de détection (2)
  Technique PCR : Amplification in vitro d’ADN




(http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/chap2/12.htm)
Techniques de détection (3)
   Electrophorèse : séparation des fragments




(Source : Nogueira PA. et al. Experimental Parasitology 2002)
Techniques de détection (4)
  Séquençage : analyses des
  séquences




(Source : Bischoff E , Thèse 2001)
Conclusion

Importance de la détection :
    Etablir la phylogénie des gènes
    Connaître la répartition et la limitation des différentes souches dans
    les antigènes polymorphes ou variants


Utiliser les informations pour le développement des vaccins antipaludiques
:
    contre les antigènes polymorphes ( 2 ou 3 allèles) : bloquer l’invasion
    contre des domaines conservés des antigènes variants : bloquer la
    cytoadhérence et le facteur principal de virulence
Références bibliographiques

http://ebischoff.free.fr
http://www.malariajournal.com/content/2/1/24
Kirsten F., Chen Q. 2003. var genes, PfEMP1 and human host. Mol.
Biochem. Parasitol. 134 : 3 – 9.
http://parasites.trends.com
http://www.malariajournal.com/content/2/1/7
www.academicpress.com
http://www.gnis-edagogie.org/pages/classbio/chap2/12.htm
Je vous remercie pour votre
     aimable attention

Détection des allèles polymorphiques ou allèles antigènes variants par PCR

  • 1.
    Détection des allèlespolymorphiques ou des allèles antigènes variants par PCR Jean Michel LEONG POCK TSY Atelier Paludisme session 2004
  • 2.
    Allèles polymorphes Il s’agitde gènes typiquement unique mutations ponctuelles existence des régions répétées qui diffèrent par leur séquence et leur nombre de répétitions gène MSP-1 (Merozoite Surface Protein 1) codent pour des protéines de surface des mérozoïtes impliquée dans l’invasion des hématies 3 types d’allèles polymorphes : K1, MAD20, RO33
  • 3.
    Allèles des antigènesvariants Allèles responsable de la variation antigénique chez Pl. falciparum : famille des gènes var (environ 50 – 150 membres) La variation antigénique concerne : le changement d’épitopes immunodominants à la surface des hématies infestées due à l’expression des différentes protéines (PfEMP1) le choix des protéines est déterminés par le choix du gènes var exprimé. le switch d’expression d’un gène var à l’autre constitue le phénomène de variation génétique pour PfEMP1 (Erythrocyte Membrane Protein 1) Gènes var codent protéines de surface des hématies parasitées permet l’adhésion au niveau des cellules endothéliales se lie avec les récepteurs endothéliaux (ICAM, CD36, CSA…)
  • 4.
    Techniques de détection(1) Disposition des sondes MSP - 1 PfEMP1 (A : Source : Hoffman HE. et al. Malaria Journal 2003) (a : Smith JD. et al. Trends in Parasitology 2001)
  • 5.
    Techniques de détection(2) Technique PCR : Amplification in vitro d’ADN (http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/chap2/12.htm)
  • 6.
    Techniques de détection(3) Electrophorèse : séparation des fragments (Source : Nogueira PA. et al. Experimental Parasitology 2002)
  • 7.
    Techniques de détection(4) Séquençage : analyses des séquences (Source : Bischoff E , Thèse 2001)
  • 8.
    Conclusion Importance de ladétection : Etablir la phylogénie des gènes Connaître la répartition et la limitation des différentes souches dans les antigènes polymorphes ou variants Utiliser les informations pour le développement des vaccins antipaludiques : contre les antigènes polymorphes ( 2 ou 3 allèles) : bloquer l’invasion contre des domaines conservés des antigènes variants : bloquer la cytoadhérence et le facteur principal de virulence
  • 9.
    Références bibliographiques http://ebischoff.free.fr http://www.malariajournal.com/content/2/1/24 Kirsten F.,Chen Q. 2003. var genes, PfEMP1 and human host. Mol. Biochem. Parasitol. 134 : 3 – 9. http://parasites.trends.com http://www.malariajournal.com/content/2/1/7 www.academicpress.com http://www.gnis-edagogie.org/pages/classbio/chap2/12.htm
  • 10.
    Je vous remerciepour votre aimable attention