Projet génome de Plasmodium: Approches utilisées et résultats attendus - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - KARENZO Jeanne et LABOUDI Majda
Petit exercice de vulgarisation sur les tenants et aboutissants du séquençage de l'ADN, de ses applications et de l'écosystème entrepreneurial qui l'entoure.
Entomologie moléculaire et étude de la structuration génétique des populations d'anophèles - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Hadiza Soumaila AMADOU - Entomologiste - Ministère de la Santé / PNLP - Niamey, Niger - soumailahadiza@yahoo.fr
Détection des allèles polymorphiques ou allèles antigènes variants par PCR - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - OULD BRAHIM Hamoud, INSTITUT PASTEUR de DAKAR - Unité d’épidémiologie, BP :220, Dakar - SENEGAL - Etudiant en Thèse - hamoudey@yahoo.com
ADN et génotypage - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Célestin RAZAFINJATO - Médecin - INSPC - Antananarivo, Madagascar - razafinjatocelestin@yahoo.fr
Prévalence des infections à Plasmodium : apport des nouvelles méthodes de détection du parasite - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - ANDRIANARANJAKA Voahangy Hanitriniaina - Madagascar - fararanontsoa@gmail.com
L'Institut national du cancer, la Fondation Arc et la Ligue contre le cancer ont organisé le séminaire de préparation à l'appel à projet "Programme d'Actions Intégrées de Recherche (PAIR) sur les cancers de l'enfant" qui s'est tenu le 13 avril 2016 à Paris.
Séquence complète du génome de Plasmodium falciparum: intérêts pour les chercheurs - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Abdou Razack SAFIOU - Médecin - Ministère de la Santé / PNLP - Libreville, Gabon - safiouabdourazack@yahoo.fr
Petit exercice de vulgarisation sur les tenants et aboutissants du séquençage de l'ADN, de ses applications et de l'écosystème entrepreneurial qui l'entoure.
Entomologie moléculaire et étude de la structuration génétique des populations d'anophèles - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Hadiza Soumaila AMADOU - Entomologiste - Ministère de la Santé / PNLP - Niamey, Niger - soumailahadiza@yahoo.fr
Détection des allèles polymorphiques ou allèles antigènes variants par PCR - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - OULD BRAHIM Hamoud, INSTITUT PASTEUR de DAKAR - Unité d’épidémiologie, BP :220, Dakar - SENEGAL - Etudiant en Thèse - hamoudey@yahoo.com
ADN et génotypage - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Célestin RAZAFINJATO - Médecin - INSPC - Antananarivo, Madagascar - razafinjatocelestin@yahoo.fr
Prévalence des infections à Plasmodium : apport des nouvelles méthodes de détection du parasite - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - ANDRIANARANJAKA Voahangy Hanitriniaina - Madagascar - fararanontsoa@gmail.com
L'Institut national du cancer, la Fondation Arc et la Ligue contre le cancer ont organisé le séminaire de préparation à l'appel à projet "Programme d'Actions Intégrées de Recherche (PAIR) sur les cancers de l'enfant" qui s'est tenu le 13 avril 2016 à Paris.
Séquence complète du génome de Plasmodium falciparum: intérêts pour les chercheurs - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Abdou Razack SAFIOU - Médecin - Ministère de la Santé / PNLP - Libreville, Gabon - safiouabdourazack@yahoo.fr
Le séquençage haut débit: NGS, une révolution de la biologie moléculaire au s...Pasteur_Tunis
Présentation de MALLEK Ramdane
rmallek@lab-cerba.com
Biologie Moléculaire et génomique, Laboratoire Cerba, Saint-Ouen l'Aumône, France
Institut Pasteur de Tunis 6 Avril 2019
Résistance de Plasmodium vivax à la chloroquine - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Grah Worro Elisabeth BEUGRE - Médecin/Chercheur - Institut Pasteur de Côte d'Ivoire - beugregrah@yahoo.fr
phage for detection of viable Salmonella typhimuriumLiliane Majed
Development of an engineered bioluminescent reporter phage for the sensitive detection of viable Salmonella typhimurium
Because foodborne illnesses continuously threaten public health, rapid
and sensitive detection of pathogens in food has become an important issue. As an
alternative to time-consuming and laborious conventional detection methods, a
technique using recombinant reporter phages has been developed. Here, we developed
an advanced bioluminescent reporter phage SPC32H-CDABE by inserting a bacterial
luxCDABE operon into the Salmonella temperate phage SPC32H genome. Whole
SPC32H genome sequencing enabled the selection of nonessential genes, which can
be replaced with approximately 6-kb luxCDABE operon, which provides both
luciferase (LuxAB) and its substrate, fatty aldehyde, as generated by fatty acid
reductase (LuxCDE). Thus, the SPC32H-CDABE detection assay is simpler and more
efficient compared to the luxAB-based assay because the substrate addition step is
excluded. At least 20 CFU/mL of pure S. Typhimurium culture was detectable using
SPC32H-CDABE within 2 h, and the signals increased proportionally to the number
of cells contaminated in lettuce, sliced pork, and milk. These results thereby demonstrate that this phage successfully detects live
Salmonella without appreciable interference from food components. Furthermore, the presented data suggest that SPC32HCDABE
represents a promising easy-to-use diagnostic tool for the detection of Salmonella contamination in food.
Seongmi Kim,# Minsik Kim,# and Sangryeol Ryu*
Department of Food and Animal Biotechnology, Department of Agricultural Biotechnology, Research Institute for Agriculture and
Life Sciences, and Center for Food and Bioconvergence, Seoul National University, Seoul 151-921, South Korea
pubmed link :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24806327
french traduction and power point presentation by Liliane M. Lebanese university - Section 1 - Hadath
Biology department
Applications dans l'évaluation de l'impact des interventions dans lutte contre le paludisme - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - IDRISSA Sabit et STEENKESTE Nicolas
Rendement parasitaire chez l'anophèle - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RAKOTOARIVELO Rivonirina Andry - Médecin - Madagascar - randry-tiana@caramail.com
Entomologie moléculaire et étude de la structuration génétique des anophèles - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RANDRIANASOLO Laurence - INSTITUT PASTEUR de MADAGASCAR BP 1274 Antananarivo, Madagascar - laurandrianas@yahoo.fr
TECHNIQUES DE BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE
EXTRACTION D'AN
TECHNIQUE PCR
SEQUENCAGE D'AN
GENOTYPAGE
APPORT DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE MEDICALE
Polymorphisme des gènes hrpII et pldh chez Plasmodium - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Ravaoarisoa Elisabeth et Tabue Ngomdjum Raymond
Antibiotics: classification and spectrum of actionBashar Mudallal
This document provides an overview of different classes of antibiotics, including cell wall inhibitors, protein synthesis inhibitors, topoisomerase inhibitors, anti-metabolites, and anti-mycobacterials. It describes common antibiotics within each class, what types of bacteria they cover, and examples of specific antibiotics. It also briefly discusses empiric antimicrobial therapy and treatment for C. difficile infections.
Le séquençage haut débit: NGS, une révolution de la biologie moléculaire au s...Pasteur_Tunis
Présentation de MALLEK Ramdane
rmallek@lab-cerba.com
Biologie Moléculaire et génomique, Laboratoire Cerba, Saint-Ouen l'Aumône, France
Institut Pasteur de Tunis 6 Avril 2019
Résistance de Plasmodium vivax à la chloroquine - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Grah Worro Elisabeth BEUGRE - Médecin/Chercheur - Institut Pasteur de Côte d'Ivoire - beugregrah@yahoo.fr
phage for detection of viable Salmonella typhimuriumLiliane Majed
Development of an engineered bioluminescent reporter phage for the sensitive detection of viable Salmonella typhimurium
Because foodborne illnesses continuously threaten public health, rapid
and sensitive detection of pathogens in food has become an important issue. As an
alternative to time-consuming and laborious conventional detection methods, a
technique using recombinant reporter phages has been developed. Here, we developed
an advanced bioluminescent reporter phage SPC32H-CDABE by inserting a bacterial
luxCDABE operon into the Salmonella temperate phage SPC32H genome. Whole
SPC32H genome sequencing enabled the selection of nonessential genes, which can
be replaced with approximately 6-kb luxCDABE operon, which provides both
luciferase (LuxAB) and its substrate, fatty aldehyde, as generated by fatty acid
reductase (LuxCDE). Thus, the SPC32H-CDABE detection assay is simpler and more
efficient compared to the luxAB-based assay because the substrate addition step is
excluded. At least 20 CFU/mL of pure S. Typhimurium culture was detectable using
SPC32H-CDABE within 2 h, and the signals increased proportionally to the number
of cells contaminated in lettuce, sliced pork, and milk. These results thereby demonstrate that this phage successfully detects live
Salmonella without appreciable interference from food components. Furthermore, the presented data suggest that SPC32HCDABE
represents a promising easy-to-use diagnostic tool for the detection of Salmonella contamination in food.
Seongmi Kim,# Minsik Kim,# and Sangryeol Ryu*
Department of Food and Animal Biotechnology, Department of Agricultural Biotechnology, Research Institute for Agriculture and
Life Sciences, and Center for Food and Bioconvergence, Seoul National University, Seoul 151-921, South Korea
pubmed link :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24806327
french traduction and power point presentation by Liliane M. Lebanese university - Section 1 - Hadath
Biology department
Applications dans l'évaluation de l'impact des interventions dans lutte contre le paludisme - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - IDRISSA Sabit et STEENKESTE Nicolas
Rendement parasitaire chez l'anophèle - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RAKOTOARIVELO Rivonirina Andry - Médecin - Madagascar - randry-tiana@caramail.com
Entomologie moléculaire et étude de la structuration génétique des anophèles - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RANDRIANASOLO Laurence - INSTITUT PASTEUR de MADAGASCAR BP 1274 Antananarivo, Madagascar - laurandrianas@yahoo.fr
TECHNIQUES DE BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE
EXTRACTION D'AN
TECHNIQUE PCR
SEQUENCAGE D'AN
GENOTYPAGE
APPORT DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE MEDICALE
Polymorphisme des gènes hrpII et pldh chez Plasmodium - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Ravaoarisoa Elisabeth et Tabue Ngomdjum Raymond
Antibiotics: classification and spectrum of actionBashar Mudallal
This document provides an overview of different classes of antibiotics, including cell wall inhibitors, protein synthesis inhibitors, topoisomerase inhibitors, anti-metabolites, and anti-mycobacterials. It describes common antibiotics within each class, what types of bacteria they cover, and examples of specific antibiotics. It also briefly discusses empiric antimicrobial therapy and treatment for C. difficile infections.
Avant-projet de loi visant à instituer de nouvelles libertés et de nouvelles ...Gouvernement
Le document que vous pouvez consulter ici est un avant-projet de loi. Il est actuellement soumis pour avis au Conseil d’État et à plusieurs instances consultatives composées, en particulier, des organisations syndicales de salariés et des organisations professionnelles d’employeurs. C’est la version adoptée en Conseil des ministres, le 9 mars prochain à l’issue de cette phase préparatoire, qui sera ensuite examinée par le Parlement.
Les anophèles du Niger, Recherche et appui au programme national de lutte. Conférence de la 8ème édition du Cours international « Atelier Paludisme » - DUCHEMIN Jean Bernard
Méthode de diagnostic biologique du paludisme - Conférence du 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - BY Youlet - Institut Pasteur du Cambodge 5, Bd MONIVONG, BP 983, Phnom Penh - Royaume du Cambodge - Pharmacien - youlet@pasteur-kh.org
Où sont les malades du paludisme et comment les prendre en charge ? - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Aboubacar ACHIRAFI - Infirmier/Chargé de Programmes - DASS de Mayotte - abou.achiraf@laposte.net
Moustiquaires imprégnées d'insecticide : Pour qui ? Pour où ? Comment ? - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Valérie ANDRIANTSOANIRINA - Etudiant/Chercheur - Institut Pasteur de Madagascar - landyvalerie@yahoo.fr
Quel serait l'impact des ACT sur la transmission de Plasmodium? - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - TRAORE Oumar Bila - Assistant de recherche - Mali - traoreob@yahoo.fr
Les mécanismes immuno-physiopathologiques de l'anémie sévère - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Peka MALLAYE - Entomologiste médical - Ministère de la santé publique - Tchad - peka_mallaye@yahoo.fr
Génétique humaine et infection palustre - Présentation de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RANDRIAMANANTENA Arthur Dieudonné - INSTITUT PASTEUR DE MADAGASCAR - Médecin diplômé d'Etat - Généraliste - randriaman@yahoo.fr
Médicaments antipaludiques : outil majeur pour l’élimination du paludisme à Madagascar - Conférence de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Milijaona RANDRIANARIVELO JOSIA - Institut Pasteur de Madagascar - milijaon@pasteur.mg
Réflexion sur les traitements préventifs intermittents pour la lutte contre le paludisme - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Kabore Youssouf - Burkina Faso - kabyssef.cnrfp@fasonet.bf
Gamétocytes et résistances aux antipaludiques, comment aborder cette question? - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - AÏSSAN Codjovi Julien - Benin - codjo3aj2000@yahoo.fr
1. The document discusses a meeting between two parties to negotiate an agreement on sharing natural resources from a disputed territory.
2. Both sides presented their positions and concerns regarding access, usage rights, environmental protections, and economic benefits from the resources.
3. No final deal was reached but further discussions were planned to continue working towards a mutually agreeable solution.
Quelles sont les principales recommandations du Roll Back Malaria pour le contrôle du paludisme? - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - HAMIDOU LAZOUMAR Ramatoulaye - Stagiaire de recherche - Niger - lramatoulaye@yahoo.fr
De l'antigène à l'anticorps - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Serge Brice ASSI - Médecin/Chercheur - Institut Pierre Richet - Institut National de Santé Publique - Côte d'Ivoire - assisergi@yahoo.fr
Le cycle de Plasmodium falciparum: aspects genetiques et antigéniques - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Hadiza Soumaila AMADOU - Entomologiste - Ministère de la Santé / PNLP - Niamey, Niger - soumailahadiza@yahoo.fr
Paludisme: est-ce uniquement une maladie affectant l'homme? - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RAKOTONDRAZAFY Simon - Médecin Entomologiste - Madagascar - simonhpa2@yahoo.fr
SP Tests antipaludogrammes - Conférence de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Marie Ange RASON et Milijaona RANDRIANARIVELO JOSIA
Etude de la réponse immunitaire in vitro contre Plasmodium: exemples et leçons - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Vololoniala Aimée RAVAOARINOSY - Médecin - Ministère de la Santé et du Planning Familial - Service de Lutte Contre le Paludisme - Madagascar - ravaoaim@yahoo.fr
Les méthodes de diagnostic biologique du paludisme - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Marie Clémence RAKOTOARIVONY - Médecin - Service de Lutte contre le Paludisme /MINSANPF - Antananarivo, Madagascar - kamansy2@yahoo,fr
Gamétocytes de Plasmodium infectant l’homme - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - MOYA ALVAREZ Violeta - Espagne - vmoyaalvarez@gmail.com
Dégager les faits marquants de la bio-écologie des anophèles pour la transmission des Plasmodium - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - TCHIEKOI N'cho Bertin - Côte d'Ivoire - tchiekoi@yahoo.fr
Cycle biologique de Plasmodium: processus d'invasion du mérozoïte - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - HAMIDOU LAZOUMAR Ramatoulaye - Stagiaire de recherche - Niger - lramatoulaye@yahoo.fr
Résistance de Plasmodium falciparum à la chloroquine - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Amina YSSOUF - Biologiste/Entomologiste - Ministère de la Santé des Comores, Union des Comores - yssoufamina@yahoo.fr
Cycle biologique de Plasmodium: du gamétocyte au zygote - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - MANDOKO NKOLI Alain Serge - Médecin - République Democratique du Congo - drpmandoko@yahoo.fr
Cycle de developpement du Plasmodium: devenir des sporozoïtes - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Gaye Abdoulaye - Sénégal - ablayeg@yahoo.fr
Les facteurs favorables au passage de l'accès simple vers l'accès grave, et les facteurs de protection - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Excellent Shapoul RANDRIANARY - Médecin - Direction Régionale de la Santé et du Planning Familial - Vatovavy Fitovinany, Madagascar
L'intérêt des modèles animaux dans l'étude du paludisme - Présentation de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - VARELA Marie Louise - Institut Pasteur de Dakar - Etudiante en 2ème année de thèse de Parasitologie - Marie_varela@hotmail.com
Cycle biologique de Plasmodium: de l'oocyste au stade hépatique - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - YARO Jean Baptiste Bibié - Médecin - Burkina Faso - baptist.cnrfp@fasonet.bf
Intérêts des modèles animaux en paludologie - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - LAMINOU MAMAN Ibrahim - CERMES - BP 10887, NIAMEY, Niger - Etudiant en Thèse - lamine@cermes.ne
Les indices paludométriques - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Soloarivelo Tantely RAVOKATRA - Médecin - CHU Befelatanana - Antananarivo, Madagascar - tantelyrav@freenet.mg
Le passage du plasmodium du moustique à l'homme et de l'homme au moustique - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - ANDRIANANTOANDRO Vololomboahangy - MINISTERE de la SANTE et du PLANNING FAMILIAL de MADAGASCAR - Responsable Paludisme, DPS Tamatave - andriboahangy@yahoo.fr
Le passage du plasmodium du moustique à l'homme et de l'homme au moustique - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - ANDRIANANTOANDRO Vololomboahangy - MINISTERE de la SANTE et du PLANNING FAMILIAL de MADAGASCAR - Responsable Paludisme, DPS Tamatave - andriboahangy@yahoo.fr
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Guide pour le suivi et l'évaluation des programmes - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Luciano TUSEO - World Health Organization / Roll Back Malaria - Office for Madagascar and Reunion - Antananarivo, Madagascar - maloms@iris.mg
Monitoring and Evaluation Toolkit - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Luciano TUSEO - World Health Organization / Roll Back Malaria - Office for Madagascar and Reunion - Antananarivo, Madagascar - maloms@iris.mg
Développement nouveaux médicaments - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Pascal MILLET - Université Victor Segalen Bordeaux2, France - pascal.millet@u-bordeaux2.fr
Diagnostic biologique du paludisme - Séances Pratiques de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Didier MENARD et Vincent THONIER
Projet génome de Plasmodium: Approches utilisées et résultats attendus
1. Ministère de la Santé, du Planning
Familial et de la Protection Sociale
Madagascar
Projet GProjet Géénome denome de PlasmodiumPlasmodium ::
Approches utilisApproches utiliséées et res et réésultats attendussultats attendus
Présentée
Par
Melle LABOUDI Majda Dr KARENZO Jeanne
EVALUATION
par les FACILITATEURS
2. 2
PlanPlan
II-- IntroductionIntroduction
IIII-- Pourquoi les projets gPourquoi les projets géénomenome PlasmodiumPlasmodium??
IIIIII-- IntIntéérêt des projets grêt des projets géénome dunome du PlasmodiumPlasmodium
IVIV-- Projets de gProjets de géénomenome PlasmodiumPlasmodium connusconnus
VV-- PlasmoPlasmo DBDB
VIVI-- Approches utilisApproches utiliséés dans le projet gs dans le projet géénomenome PlasmodiumPlasmodium
VIIVII-- RRéésultats attendussultats attendus
VIIIVIII-- Pourquoi le sPourquoi le sééquenquenççage du gage du géénomenome PlasmodiumPlasmodium desdes
animaux?animaux?
ConclusionConclusion
PerspectivesPerspectives
3. 3
IntroductionIntroduction
140140 àà 150 esp150 espèècesces plasmodialesplasmodiales connues infectant desconnues infectant des
vertvertéébrbrééss
P.P. malariaemalariaeP. ovaleP. ovaleP.P. vivaxvivaxP.P. falciparumfalciparum,,
ll’’homme ethomme et
aux grandsaux grands
singessinges
spspéécifiques de lcifiques de l’’hommehomme
4. 4
Pourquoi les projets gPourquoi les projets géénomenome
Plasmodium?Plasmodium?
L’échec de toutes les tentatives de vaccin.
L’apparition de résistances aux Antipaludiques
Le faible nombre de nouvelles cibles thérapeutiques,
lié au fait que le génome de P. falciparum n’est pas très
bien connu
5. 5
IntIntéérêt des projets grêt des projets géénome dunome du
PlasmodiumPlasmodium
Recherche des nouvelles méthode de diagnostic du Plasmodium
Identification des gIdentification des gèènes rnes réésistantssistants
-- Permet de comprendre le mPermet de comprendre le méécanismecanisme
- Recherche de nouveaux médicaments
- Développement de nouveaux outils performants de suivi
évaluation des activités de lutte contre le paludisme
Permet le dPermet le dééveloppement des nouvelles stratveloppement des nouvelles stratéégiesgies Recherche
vaccinale
Avoir une base de données sur le génome de Plasmodium accessible
par le web
Comprendre la biologie du parasiteComprendre la biologie du parasite
6. 6
Red: indicates species for which sequencing
is requested
( John Adams et al, 2007 )
Blod : species already sequenced,
Phylogenetic tree of Plasmodium
**: Denotes species that infect humans
8. 8
Projets génome plasmodium réalisés par
Wellcome Trust Sanger Institute
(http://www.sanger.ac.uk,Wellcome trust Sanger institut (2007) projet de génome de
P. falciparum)
9. 9
SangerSangerTIGRTIGRSangerSangerSangerSangerTIGRTIGRTIGR, USA,TIGR, USA,
SangerSanger
InstitutInstitut
PubPubPubPubEnEn prprééppPubPubInIn prepprepPubPubSituationSituation
4X4X5X5X8X8X2x2x10X10XSSééquencequence
complcomplèètete
Final dataFinal data
14.970*14.970*5,8785,878NKNKNKNKNKNK5.4035.403## GGèènesnes
24,324,322,822,8~~ 3535NKNK~~ 454519,419,4(G+C) %(G+C) %
14141414nknkNKNK14141414## ChromosomeChromosome
16,916,923?123?1~~ 2525NKNK~~ 272723,323,3Taille( Mo)Taille( Mo)
RodentRodentRodentRodentMonkeyMonkeyChimpChimpHumanHumanHumanHumanHôteHôte
NK: non connu; En prép: en préparation; TIGR: The Institute for Genomic Research;
* Une surestimation en raison du caractère partiel des données du génome
Caractéristiques du génome de Plasmodium
P.P.
falciparumfalciparum
P.P.
vivaxvivax
P.P.
relictumrelictum
P.P.
knowlesiknowlesi
P.P.
yoeliiyoelii
P.P.
ChabaudiChabaudi
10. 10
Global distribution of P. falciparum
parasites that have been sequenced
( John Adams et al, 2007 )
11. 11
Approches utilisApproches utiliséés danss dans
le Projets de gle Projets de géénomenome PlasmodiumPlasmodium
Un consortium aUn consortium a ééttéé formforméé en 1996 pour sen 1996 pour sééquencer lequencer le
ggéénomenome
le travail est rle travail est rééparti entre trois groupes :parti entre trois groupes :
-- LeLe Wellcome Trust Sanger Institute --
-- L'universitL'universitéé dede StanfordStanford..
-- L'institut pour la recherche gL'institut pour la recherche géénomique/ Centre navalnomique/ Centre naval
de recherches mde recherches méédicalesdicales
(http://www.sanger.ac.uk,Wellcome Trust Sanger Institute, 2007)
12. 12
LeLe PlasmoDBPlasmoDB
Augmenter l'utilisation des vastes quantités de données émergeant des
projets génome par la communauté mondiale de recherches sur le paludisme
But:
(www.plasmoDB.org)
Base de donnBase de donnéées officielle de ses officielle de sééquence de gquence de géénomenome P.P. falciparumfalciparum,,
RRéésultat dsultat d’’un consortium dun consortium d’’Institutions de recherchesInstitutions de recherches
ActuellementActuellement
Banque dBanque d’’information sur 5 espinformation sur 5 espèèces parasitairesces parasitaires
donne des outils pour la comparaison croisdonne des outils pour la comparaison croiséée entre les espe entre les espèècesces
13. 13
DonnDonnéées disponible danses disponible dans
lele plasmoDBplasmoDB
Contient des donnContient des donnéées finie et non finie sures finie et non finie sur
la sla sééquence du gquence du géénome de 5 espnome de 5 espèèces duces du
PlasmodiumPlasmodium :: P.P. falciparumfalciparum
P.P. vivaxvivax..
P.P. yoeliiyoelii
P.P. chabaudichabaudi
P.P. bergheiberghei
14. 14
Pourquoi le sPourquoi le sééquenquenççage du gage du géénome denome de
PlasmodiumPlasmodium des animaux ?des animaux ?
Permettra de connaPermettra de connaîître le comportement des parasites detre le comportement des parasites de
PlasmodiumPlasmodium avec leurs hôtes et les vecteursavec leurs hôtes et les vecteurs
Facilitera lesFacilitera les éétudes biologiques, biochimiques et cellulairestudes biologiques, biochimiques et cellulaires
ddéétailltailléées dues du PlasmodiumPlasmodium
15. 15
Pourquoi faire le sPourquoi faire le sééquenquenççage du gage du géénomenome
dede PlasmodiumPlasmodium des animaux ?des animaux ?
Modèle d’étude des aspects biologiques du
parasite
P. berghei
Modèle dans la recherche des vaccins agissant
au niveau du stade pré-erythrocytaire
P. yoelii:
Réponse immunologiques et la virulence dans
le paludisme
P. chabaudi
P. vivax : les études sur l’efficacité des
médicaments
P. cynomolgi
UsageEspèces
plasmodiales
( John Adams et al, 2007 )
16. 16
RRéésultats attendussultats attendus
La découverte d’un nouveau traitement
anti-paludique
L’importante utilisation des données génome permettra de
développer un vaccin efficace contre le paludisme
Progresser dans l'inventaire des cibles possibles
pour des traitements antipaludiques
17. 17
ConclusionConclusion
La comparaison des génomes entre les espèces de Plasmodium pourrait
alors fournir une indication plus claire sur la position phylogénétique du
Plasmodium et constituer un repère génétique
La détermination du génome de Plasmodium et l'analyse moléculaire des
populations de parasites devrait augmenter le potentiel pour la découverte
Le temps et les fonds nécessaires pour générer les Ressources
génomique et postgénomques du Plasmodium sont importants
Investissement est indispensable pour progresser
dans la recherche
18. 18
Perspectives (1)Perspectives (1)
ccomprendre comment et pourquoi les espomprendre comment et pourquoi les espèècesces
plasmodialesplasmodiales entraentraîînent la maladie et survivent dansnent la maladie et survivent dans
leurs hôtes et vecteurs:leurs hôtes et vecteurs:
--les interactions hôteles interactions hôte –– parasiteparasite
-- vecteurvecteur -- parasiteparasite
-- vecteurvecteur -- hôtehôte
EEtudiertudier ll’’expression des gexpression des gèènes et les caractnes et les caractèèresres
structurels des protstructurels des protééinesines
ccomprendre les gomprendre les gèènes clefs qui sont impliqunes clefs qui sont impliquéés dans las dans la
vie du parasites du paludisme humain aux diffvie du parasites du paludisme humain aux difféérentesrentes
éétapes qui se produisent chez le hôte et le vecteurtapes qui se produisent chez le hôte et le vecteur
19. 19
Perspectives (2)Perspectives (2)
DDéévelopper des systvelopper des systèèmes modmes modèèles animaux et desles animaux et des
éétudes humaines de population qui aideronttudes humaines de population qui aideront àà rréépondrepondre
aux questions scientifiques concernant leaux questions scientifiques concernant le Plasmodium.Plasmodium.
DDéévelopper des nouveaux mvelopper des nouveaux méédicaments,dicaments,
des vaccins?des vaccins?
EEtablirtablir uneune ccomparaison des gomparaison des géénomes des diffnomes des difféérentesrentes
espespèèces deces de PlasmodiumPlasmodium
20. 20
RRééfféérence bibliographiquerence bibliographique
Carlton J, 2003: The Plasmodium vivax genome sequencing project, Review,
TRENDS in Parasitology, Vol.19 N°5, P: 227 -231,http://parasites.trends.com
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