Le monde de la recherche a pour partie découvert l’APA (Accès aux ressources génétiques et Partage juste et équitable des Avantages découlant de leur utilisation) avec les obligations réglementaires issues de la mise en œuvre du Protocole de Nagoya par les pays l’ayant ratifié.
A l’origine, ce mécanisme s’inscrit dans un objectif de conservation de la biodiversité.
Au-delà des aspects réglementaires, l’APA interroge les pratiques de la recherche, en particulier à l’IRD, y compris celles de la science ouverte. Les connaissances traditionnelles associées aux ressources génétiques ne sont pas la seule information sensible, comme l’illustrent les négociations en cours sur l’inclusion des données de séquençage génétique dans le périmètre de l’APA.
Jean-Louis Pham est généticien dans l’UMR Diversité, Adaptation et Développement des plantes (DIADE, Montpellier) et Référent scientifique Nagoya pour l’IRD.
Etude de faisabilité du projet de création d’une unité de production, de pr...Philippe AKPAKI
Dans le cadre de la finalisation de ma formation en Gestion de Projets et Management de la Qualité, j'ai rédigé et soutenu un mémoire projet dont je partage avec vous l'étude de faisabilité.
Il s'agit du business plan du projet. Le document présente l'analyse de l’offre, de la demande et de l’environnement ainsi que la Stratégie Commerciale (Part du marché, prévision des ventes, stratégies mix marketing). La partie suivi-évaluation y est décrite sans oublier les indicateurs financiers et de rentabilité.
L’étude technique de dépollution vise à régulariser la situation des unités existantes vis-à-vis de la réglementation en vigueur. Elle concerne les projets existants qui sont :
– soit en infraction par rapport à la réglementation environnementale en vigueur suite à un contrôle des autorités compétentes (ANPE) ou suite à une plainte du voisinage ou à un accident sur le site, …
– soit qui sont existants avant l’apparition du décret 2005-1991 et doivent donc s’y conformer.
Ce cours s'intéresse à une partie du traitement documentaire : l'indexation. Il s'est adressé à des étudiants en CAPES Documentation. Les résumés ne sont pas abordés dans ce cours.
Etude de faisabilité du projet de création d’une unité de production, de pr...Philippe AKPAKI
Dans le cadre de la finalisation de ma formation en Gestion de Projets et Management de la Qualité, j'ai rédigé et soutenu un mémoire projet dont je partage avec vous l'étude de faisabilité.
Il s'agit du business plan du projet. Le document présente l'analyse de l’offre, de la demande et de l’environnement ainsi que la Stratégie Commerciale (Part du marché, prévision des ventes, stratégies mix marketing). La partie suivi-évaluation y est décrite sans oublier les indicateurs financiers et de rentabilité.
L’étude technique de dépollution vise à régulariser la situation des unités existantes vis-à-vis de la réglementation en vigueur. Elle concerne les projets existants qui sont :
– soit en infraction par rapport à la réglementation environnementale en vigueur suite à un contrôle des autorités compétentes (ANPE) ou suite à une plainte du voisinage ou à un accident sur le site, …
– soit qui sont existants avant l’apparition du décret 2005-1991 et doivent donc s’y conformer.
Ce cours s'intéresse à une partie du traitement documentaire : l'indexation. Il s'est adressé à des étudiants en CAPES Documentation. Les résumés ne sont pas abordés dans ce cours.
La présentation « Financement International du Climat » par Aïssatou Diagne, Centre de Suivi Ecologique, prononcée au Deuxième Forum francophone sur le processus de Plans Nationaux d'Adaptation (PNA), à Dakar, au Sénégal, du 30 juillet au 02 août 2019.
La protection de l'environnement devient de plus en plus une préoccupation collective.
La question des déchets est quotidienne et touche chaque être humain tant sur le plan professionnel que familial.
En qualité de consommateur, producteur, usager du ramassage des ordures et trieur de déchets recyclables, citoyen ou contribuable, chacun peut et doit être acteur d'une meilleure gestion des déchets, donc comment se fait la gestion et tri des déchets et quel est son utilité ?
Présentation d'une "Planification de la gestion des déchets solides urbaines et solutions d’amélioration" à l'occasion de la rencontre "Jeudi des Déchets" du 13 avril 2017
Le diagnostic biologique du paludisme par microscopie - Conférence du 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - MENARD Didier - Madagascar - dmenard@pasteur.mg
On est dans la période des réinscription au cycle doctorale, de ce fait je partage avec les doctorants un exemple de la structure du rapport d'état d'avancement pour une réinscription réussites ...
La présentation « Financement International du Climat » par Aïssatou Diagne, Centre de Suivi Ecologique, prononcée au Deuxième Forum francophone sur le processus de Plans Nationaux d'Adaptation (PNA), à Dakar, au Sénégal, du 30 juillet au 02 août 2019.
La protection de l'environnement devient de plus en plus une préoccupation collective.
La question des déchets est quotidienne et touche chaque être humain tant sur le plan professionnel que familial.
En qualité de consommateur, producteur, usager du ramassage des ordures et trieur de déchets recyclables, citoyen ou contribuable, chacun peut et doit être acteur d'une meilleure gestion des déchets, donc comment se fait la gestion et tri des déchets et quel est son utilité ?
Présentation d'une "Planification de la gestion des déchets solides urbaines et solutions d’amélioration" à l'occasion de la rencontre "Jeudi des Déchets" du 13 avril 2017
Le diagnostic biologique du paludisme par microscopie - Conférence du 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - MENARD Didier - Madagascar - dmenard@pasteur.mg
On est dans la période des réinscription au cycle doctorale, de ce fait je partage avec les doctorants un exemple de la structure du rapport d'état d'avancement pour une réinscription réussites ...
La recherche en biologie et en médecine et les développements technologiques ont permis des avancées spectaculaires dans le domaine de la santé. Ces avancées mettent toutefois en jeu des questions éthiques qui touchent à l'individu et à la protection de ses droits et de sa dignité (génétique, procréation médicalement assistée, diagnostic prénatal, recherche sur les cellules souches, etc.). La brochure sur La bioéthique au Conseil de l'Europe traite des activités du Conseil de l'Europe en bioéthique.
Plus - www.coe.int/bioethics
Communiqués de presse, poster, liste des publications. Cellule d'ingénierie des connaissances et d'assistance à la publication scientifique (CICAP). Unité mixte de recherche 1347 Agroécologie, INRA, Dijon, France.
Cela n’a échappé à personne, la bio a le vent en poupe : l'Agence Bio parle même de "croissance exponentielle" des achats de produits alimentaires issus de l'agriculture biologique.
C’est dans ce contexte que L’agence Protéines vous présente depuis plusieurs mois son décryptage sur le sujet.
Transformations agroécologiques pour des systèmes alimentaires durablesAgropolis International
Dossier Thematique Agropolis . La Commission française pour la recherche agricole internationale (CRAI) et Agropolis International, au nom du CIRAD, d'INRAE et de l'IRD et en partenariat avec CGIAR, ont réalisé ce nouveau numéro de la série Les dossiers d'Agropolis international, avec le soutien des ministères français des Affaires étrangères et de l'Agriculture. Le choix du thème de l'agroécologie est l'une des priorités du plan d'action France-CGIAR signé le 4 février 2021.
L'usage raisonné des produits phytosanitairesmairie2000
Un grand nombre de collectivités utilisent des produits phytosanitaires pour valoriser et entretenir la voirie et les espaces verts dont ils ont la responsabilité. Si l’usage de ces produits permet d’obtenir un résultat efficace, il est indéniable qu’ils présentent des risques sanitaires et environnementaux.
Soucieuses d’accompagner leurs adhérents dans ces pratiques et de favoriser le partage d’expériences, l’AMF et l’ATTF ont élaboré ce guide pratique, qui retrace, du diagnostic à l’application, les étapes clés d’un usage raisonné des produits phytosanitaires. Cet ouvrage, non exhaustif, nous l’avons souhaité pédagogique et accessible, afin de sensibiliser toute personne intervenant sur nos territoires, qu’elle soit professionnelle ou non.
Le GBIF (Système Mondial d'Information sur la Biodiversité) est un programme international, fondé à l’initiative de l’OCDE en 2001, dont le but est l'accès libre et ouvert aux données de biodiversité.
A ce jour, plus d'un milliard de données sont disponibles et téléchargeables librement via le portail GBIF.
Outre le portail et ses outils, les activités du point nodal français et ses actions au Sud ont été présentées jeudi 18/05/2019 à Montpellier dans le cadre des Jeud'IST de l'IRD par Eric Chenin.
Eric Chenin (IRD) est impliqué dans le GBIF depuis 2003 : créateur du point nodal France en 2006, responsable du GBIF France jusqu'en 2013, chef de la délégation française au Conseil d'Administration.
Similaire à APA et Protocole de nagoya et leur impact sur la recherche et sa valorisation -JL Pham-jeud-ist-ird_20191205 (20)
Pour les universités et instituts du Sud, les bouleversements de l'IST ouvrent des perspectives nouvelles : la littérature scientifique devient plus accessible et la production scientifique de l’organisme peut être diffusée plus facilement, grâce aux mouvements du Libre Accès et de la Science Ouverte, et aux développement de technologies de l’information basées sur des logiciels libres.
Marc Goovaerts met en application ce nouveau paradigme dans différents projets de coopération Nord-Sud-Sud, en portant une attention particulière à l’interopérabilité, aux métadonnées et aux identifiants uniques.
Marc Goovaerts, bibliothécaire à l’Université de Hasselt (Belgique), coordonne depuis 20 ans divers projets de coopération financés par le programme IODE de l’UNESCO (https://www.iode.org/) et VLIR-UOS (https://www.vliruos.be/en) avec des bibliothèques et instituts du Sud. Deux récents projets de coopération avec 5 universités cubaines serviront d’exemple.
Un plan de gestion de données (PGD ou DMP pour Data Management Plan) est un document qui spécifie quelles données sont collectées ou générées, et comment elles seront gérées, partagées et préservées pendant et après un projet. Le support de ce webinaire donne les clés pour pouvoir amorcer la rédaction d’un PGD en toute sérénité en présentant les enjeux et objectifs d’un PGD, son contenu et un outil d’aide à la rédaction : DMP OPIDOR.
Claire SOWINSKI est responsable du service formation-DoRANum de l’Inist-CNRS (Institut de l’Information Scientifique et Technique).
Présentaion des outils et services documentaires offerts par le Service IST de la Délégation Régionale Occitanie de l'IRD (Montpellier), en présentiel et à distance : sites web, adresses mails, publications et ressources sur abonnement, assistance, recommandations et formations,...
Cette présentation définit rapidement le Plan de gestion de données dans le cadre du Module Doctoral Cap sur les Données Environnement 2020 réalisé pour l'Université de Montpellier par la Commission Information Scientifique et Technique Agropolis.
Cette introduction au Module Doctoral Cap sur les Données Environnement 2020 réalisé pour l'Université de Montpellier par la Commission Information Scientifique et Technique Agropolis définit rapidement ce qui fait partie des données de la recherche publique et le cadre juridique qui leur est appliqué.
Perfectionnement sur le logiciel de gestion de bibliographie Zotero, version 5. Avec travaux pratiques indiqués sur fonds jaune pour mieux s’approprier le logiciel.
Initiation au logiciel de gestion de bibliographie Zotero, version 5. Avec travaux pratiques indiqués sur fonds jaune pour mieux s’approprier le logiciel.
Entreposer des données : pourquoi, domment. Introduction généraleà la présentation de DataSuds, l'entrepôt de données de l'IRD, par Luc Decker, administrateur des données à l'IRD
This document discusses authorship practices in scientific publishing. It describes how authorship is typically determined by contributions to writing, experimental work, analysis, and other aspects of a study. It also discusses debates around collective authorship and ensuring proper attribution for collaborative work. Guidelines from organizations like ICMJE aim to promote transparency and accountability in determining authorship. New technologies may help better track individual contributions through standardized role definitions and digital attribution methods.
La Science Ouverte est à l’ordre du jour, en France et en Europe.
Après les publications, les données de la recherche sont sous le feu des projecteurs.
Ce gisement de connaissances, trop peu connu et exploité, est même souvent voué à l’oubli et à la destruction, faute de signalisation et de sauvegarde pérenne.
L’IRD, plus encore que les autres organismes de recherche, se doit de proposer une politique, des méthodologies et des outils de préservation et de partage des données recueillies dans, par et pour les pays du Sud par l’ensemble de ses équipes de recherche.
Lors de cette conférence, Pascal Aventurier, responsable du Service Information Scientifique et Technique (IST), et Jean-Christophe Desconnets, Directeur de la Mission Infrastructure et Données Numériques (MIDN), présenteront le projet d’entrepôt de données de l’IRD qui ouvrira mi 2019.
Les scientifiques font face à des défis de plus en plus complexes : changement climatique, santé, migrations. Ceci est d’autant plus vrai si l’on s’intéresse aux zones intertropicales qui sont des régions à forts enjeux (croissance démographique, sécurité alimentaire, pression accrue sur les ressources). Ces défis nécessitent l'interdisciplinarité, l’ouverture et la mutualisation des données et des compétences. Dans ce contexte, les méthodes de la recherche évoluent pour s’adapter ou tirer en profit en proposant des environnements de recherche capables de lier des données provenant de différentes sources, de nouvelles approches exploitant les données massives. Dans ce contexte et tant qu’acteur de recherche dans les pays du sud, l’IRD a démarré un projet d’entrepôt de données ouvertes. L’objectif de ce projet est d’assurer un partage ouvert, pérenne des jeux de données d’intérêt récoltées dans les zones intertropicales par l’IRD et ses partenaires. Plus précisément, les objectifs à court terme de cet entrepôt sont de mieux pérenniser et valoriser le patrimoine informationnel de l’IRD et de ses partenaires. Il s'agit également de fournir un service de d’identification, de dépôts et de découverte des données pour les scientifiques afin qu’ils puissent en maîtriser la diffusion et le partage selon les principes FAIR. A plus long terme, l’entrepôt de données vise à assurer la découverte des ressources numériques produites par l’IRD (données, support multimédia, publications) et déposées dans d’autres dépôts, bases de données, pôles de données. Il s’agit de fournir une vision la plus exhaustive possible du patrimoine de données.
Support de cours sur le logiciel de gestion et de mise en forme de références bibliographiques et de documents EndNote, et de son outil en ligne de partage, EndNote Online.
"Open data repository for scientific data sharing with the southern countries" was the subject of the talk given by Jean-Chsritophe Desconnets, head of the IRD's Infrastructure and Digital Data Mission (MIDN), in Gabarone (Botswana) on 2018, november 8th during the International Data Week. It presents the IRD's data repository project that will open in 2019. This project is co-managed by MIDN, IT and IST Services.
La bibliométrie, à travers l’exploitation statistique des données issues des publications scientifiques, élabore des indicateurs qui constituent des points de repères pour situer la production scientifique au niveau national et international. Chaque indicateurs produit un éclairage différent et seule la convergence de plusieurs d’entre eux permet d’atteindre une vision globale et réaliste de l’impact de la recherche.
Cette conférence d'Isabelle Henry était programmée le 8/11/2018 dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie, mais n'a pas pu se tenir pour des raisons indépendantes de notre volonté.
Isabelle Henry est Directrice de la mission Evaluation et Programmation de la recherche de l’IRD depuis décembre 2015. Après 20 ans de recherche à l'Inserm comme généticienne moléculaire, elle a été responsable de sa politique de site puis a dirigé son département de l'évaluation et du suivi des programmes pendant 8 ans.
Les pratiques discutables en recherche scientifique, observées depuis les années 60, semblent en augmentation. Des chercheurs honnêtes peuvent dériver vers des comportements douteux pour répondre aux pressions…
La culture POP (Publish Or Perish) doit laisser place à une culture TOP (Transparency Openess Promotion), pour promouvoir une conduite responsable de la recherche...
Cette conférence d'Hervé Maisonneuve s'est déroulée le 11/10/2018 dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie.
Hervé Maisonneuve, médecin de santé publique, a été président de l’European Association of Science Editors. Il anime le conseil scientifique de l’Institut International de Recherche et d’Action sur la Fraude et le Plagiat Académiques (Genève). Il est rédacteur de www.redactionmedicale.fr
Présentation au Pôle Science de l’IRD , le 13 septembre 2018 du projet d'entrepôt de données ouvertes de l'IRD, du contexte de l'Open Science en France et en Europe et des avantages à disposer d'un entrepôt de données pour l'IRD et ses partenaires.
Ce fichier d'accompagnement de TP sur DMP OPIDOR a été réalisé par Annabelle Filâtre et Hanka Hensens pour la journée d'études Open Science Open Data du 28 mars 2017organisée à Agropolis. Il a été mis à jour pour le JeudISST IRD du 20/09/2018.
Un PGD, qu'est-ce que c'est ? Pour quoi faire ? Comment ?
Un PGD sert surtout à se poser les bonnes questions et à adopter des méthodes rigoureuses de gestion pour documenter, stocker, responsabiliser, archiver, informer, et finalement partager les données scientifiques.
Le PGD est de plus en plus souvent recommandé ou même exigé par les financeurs, les éditeurs, les organismes scientifiques.
L’exposé présente les grands principes et principales étapes d’un PGD et les aides à la rédaction.
Cette intervention d'Hanka Hensens a eu lieu le 20 septembre 2018, dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie.
Hanka Hensens, responsable du Centre de Documentation IRD Occitanie, a animé depuis 2017 plusieurs ateliers sur les Plans de Gestion de Données en direction des scientifiques d’Agropolis. Elle forme étudiants et chercheurs depuis près de 20 ans à la recherche et à la gestion de l’information scientifique.
Plus de IST IRD - Service IST de l'Institut de Recherche pour le Développement (20)
14. d’après L’APA pas à pas (FRB, 2017)
Accès aux ressources génétiques et Partage juste et
équitable des Avantages découlant de leur
utilisation
(en anglais : Access and Benefit-Sharing – ABS)
PIC: Prior Informed Consent
MAT: Mutually Agreed Terms
18. Benefit‐sharing
Examples of Monetary Benefit‐Sharing
Access fee per sample collected
Licence fees in case of commercialization
Research funding
Joint ownership of relevant intellectual property rights
…
Examples of Non‐monetary Benefit‐Sharing
Sharing of research and development results
Contribution in education and training
Access to scientific information relevant to biodiversity
conservation
Access to collections and databases
… 18
20. 20
PIC: Prior Informed Consent
Permit from the
national competent
authority
Prior Informed Consent
Mutually Agreed Terms
USER
of genetic resources
or associated
traditional
knowledge
PROVIDER
of genetic resources
or associated
traditional
knowledge
ACTIVITIES OF
RESEARCH &
DEVELOPMENT
Monetary and non‐
monetary BENEFIT‐
SHARING for the
conservation and the
sustainable use of genetic
resources and associated
traditional knowledge
From FRB 2017
ABS Clearing House
https://absch.cbd.int/
IRCC
internationally recognized
certificate of complianceEnsuring legal certainty
23. Le Système Multilatéral du TIRPAA
Le Système Multilatéral s’applique à une liste d’espèces
cultivées et de plantes fourragères, établie à partir du critère de
la sécurité alimentaire et de l’interdépendance des pays
(Annexe 1 du TIRPAA).
Contrat type pour les échanges de ressources phytogénétiques
(Accord Type de Transfert de Matériel = ATTM/sMTA)
Il (re)crée un ensemble partagé de ressources phytogénétiques
sans nier la souveraineté des états, puisque ceux‐ci décident
du versement –ou non ‐ de ressources dans le système
multilatéral
Il crée un fonds mondial de partage des avantages
23
29. En France : Grands principes structurant la loi pour la reconquête
de la biodiversité, de la nature et des paysages
https://www.legifrance.gouv.fr/eli/loi/2016/8/8/2016‐1087/jo/texte
Un régime général pour la faune et la flore, sous la
responsabilité du Ministère en charge de l’Environnement
(MTES)
La loi prévoit un régime général pour les RG qui ne sont pas couvertes par un régime spécifique. Il s’agit
essentiellement des RG «sauvages». Le MTES est pilote de ce dispositif, en tant qu’autorité nationale
compétente
La loi distingue trois procédures :
Une procédure déclarative pour l‘accès aux ressources génétiques sans objectif de développement commercial
(et une procédure de déclaration annuelle simplifiée pour les détenteurs de collection scientifiques)
Une procédure d’autorisation pour l’accès aux ressources génétiques ayant un objectif commercial
Une procédure d’autorisation pour l’utilisation de connaissances traditionnelles associées aux ressources
génétiques
Des régimes spécifiques (faune domestique, flore cultivée,
santé) sous la responsabilité d’autres ministères (Ministères
Agriculture, Santé)
RG des espèces végétales sauvages apparentées, des espèces domestiquées ou cultivées, des espèces objets
de sylviculture : MAA
RG collectées par les laboratoires en vue de la prévention, la surveillance et la lutte contre les dangers sanitaires
concernant les animaux, les végétaux et la sécurité sanitaire des aliments, la prévention et la maîtrise des
risques graves pour la santé humaine : un décret en CE est en préparation par le ministère de la santé