Perfectionnement sur le logiciel de gestion de bibliographie Zotero, version 5. Avec travaux pratiques indiqués sur fonds jaune pour mieux s’approprier le logiciel.
Initiation au logiciel de gestion de bibliographie Zotero, version 5. Avec travaux pratiques indiqués sur fonds jaune pour mieux s’approprier le logiciel.
Zotero Standalone : un incontournable pour gérer vos références de recher...Gabriel Dumouchel, Ph.D.
Le logiciel de gestion bibliographique Zotero Standalone offre aux chercheurs et étudiants universitaires en sciences de l’éducation un outil de qualité à la fois gratuit, simple, efficace et rapide. Que ce soit pour permettre aux utilisateurs de créer des références bibliographiques en un seul clic sur le Web, de les gérer, de les employer dans leurs rédactions ou encore de les partager avec leurs collègues, Zotero Standalone représente un formidable allié en formation comme en recherche. Cet atelier présentera notamment comment un chercheur ou un étudiant-chercheur en éducation peut employer cet outil afin de concevoir et d’organiser judicieusement sa bibliothèque de références et de l’utiliser de manière optimale avec les fonctionnalités d’insertion dans un logiciel de traitement de texte.
Support de la séance Zotero avancé du dispositif Isidoc't donnée le 8 juin 2016. Voir nombreux autres support pour inspiration : Form@doct, Urfist Rennes 2, F. Flamerie, etc.
Support du cours donné dans le cadre du programme de cours du Domaine IT (DIT) de l'Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL).
http://dit.epfl.ch/cours
version de mai 2013 (première mise en ligne décembre 2012)
Initiation au logiciel de gestion de bibliographie Zotero, version 5. Avec travaux pratiques indiqués sur fonds jaune pour mieux s’approprier le logiciel.
Zotero Standalone : un incontournable pour gérer vos références de recher...Gabriel Dumouchel, Ph.D.
Le logiciel de gestion bibliographique Zotero Standalone offre aux chercheurs et étudiants universitaires en sciences de l’éducation un outil de qualité à la fois gratuit, simple, efficace et rapide. Que ce soit pour permettre aux utilisateurs de créer des références bibliographiques en un seul clic sur le Web, de les gérer, de les employer dans leurs rédactions ou encore de les partager avec leurs collègues, Zotero Standalone représente un formidable allié en formation comme en recherche. Cet atelier présentera notamment comment un chercheur ou un étudiant-chercheur en éducation peut employer cet outil afin de concevoir et d’organiser judicieusement sa bibliothèque de références et de l’utiliser de manière optimale avec les fonctionnalités d’insertion dans un logiciel de traitement de texte.
Support de la séance Zotero avancé du dispositif Isidoc't donnée le 8 juin 2016. Voir nombreux autres support pour inspiration : Form@doct, Urfist Rennes 2, F. Flamerie, etc.
Support du cours donné dans le cadre du programme de cours du Domaine IT (DIT) de l'Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL).
http://dit.epfl.ch/cours
version de mai 2013 (première mise en ligne décembre 2012)
Utiliser les fonctionnalités de base de Zotero :
Installer et configurer Zotero
Collecter des références
Gérer les références et les PDF
Exploiter les références
Fonctionnalités avancées de Zotero :
Zotero web : bibliothèque en ligne et partage de références
Zotero nomade
Support de la formation destinée aux doctorants d'Aix-Marseille Université / Tutoriel pour l'élaboration facile de sa bibliographie de thèse avec Zotero et LaTeX
Modifier un style bibliographique Zotero - CSL
A. Types de style
B. Structure d’un style bibliographique Zotero
C. Les outils
D. Modifier un style
E. Enregistrer un style et l’installer dans Zotero
Support de cours sur le logiciel de gestion et de mise en forme de références bibliographiques et de documents EndNote, et de son outil en ligne de partage, EndNote Online.
Support de la formation de l'URFIST de Rennes, animée par Marie-Laure Malingre le 7 mai 2010, pour les doctorants de l'UBS (Université de Bretagne Sud).
Comment gérer ses références bibliographiques avec EndNote
Gérer et partager sa bibliographie avec Zotero 2.0.9pascal aventurier
Zotero est un logiciel libre qui permet de collecter, gérer, publier et partager des références bibliographiques mais bien plus encore.ce diaporama présente ses principales fonctionnalités.
Utiliser les fonctionnalités de base de Zotero :
Installer et configurer Zotero
Collecter des références
Gérer les références et les PDF
Exploiter les références
Fonctionnalités avancées de Zotero :
Zotero web : bibliothèque en ligne et partage de références
Zotero nomade
Support de la formation destinée aux doctorants d'Aix-Marseille Université / Tutoriel pour l'élaboration facile de sa bibliographie de thèse avec Zotero et LaTeX
Modifier un style bibliographique Zotero - CSL
A. Types de style
B. Structure d’un style bibliographique Zotero
C. Les outils
D. Modifier un style
E. Enregistrer un style et l’installer dans Zotero
Support de cours sur le logiciel de gestion et de mise en forme de références bibliographiques et de documents EndNote, et de son outil en ligne de partage, EndNote Online.
Support de la formation de l'URFIST de Rennes, animée par Marie-Laure Malingre le 7 mai 2010, pour les doctorants de l'UBS (Université de Bretagne Sud).
Comment gérer ses références bibliographiques avec EndNote
Gérer et partager sa bibliographie avec Zotero 2.0.9pascal aventurier
Zotero est un logiciel libre qui permet de collecter, gérer, publier et partager des références bibliographiques mais bien plus encore.ce diaporama présente ses principales fonctionnalités.
Mise à jour du support de stage de l'URFIST de Rennes, sur Zotero, animé par Marie-Laure Malingre le 12 octobre 2010.
Guide d'initiation à l'utilisation de Zotero pour la gestion des références bibliographiques personnelles
Zotero & gestion de vos références bibliographiques - Master Mondes Médiévaux...Alain Marois
Support de formation pour atelier (2h) autour de Zotero pour la gestion des références bibliographiques en Master Mondes Médiévaux (Lyon, histoire médiévale)
Zotero & gestion de vos références bibliographiques - Master Mondes Médiévaux...Alain Marois
(MàJ 2022) Support de formation pour atelier (2h) autour de Zotero pour la gestion des références bibliographiques en Master Mondes Médiévaux (Lyon, histoire médiévale)
TD compagnon => https://page.hn/pobns1
Mise à jour sept 2022 :
- quelques éléments de contexte (attendus enseignants)
- slides : icônes connector (9); concraitement (10); anystyle (18); prise de note V6 (20); documentation fr (24); sauvegardes (25)
- mise à jour des liens vers ateliers des collègues en silos dans les BUs lyonnaises & Co (car on les aime bien, finalement...)
il s'agit d'une présentation faisant partie d'une journée de formation a l'intention des étudiants en pharmacie sur le logiciel de gestion bibliographique Endnote. dans cette présentation des notions élémentaires sur le logiciel sont présentés, de sorte a permettre a l'étudiant et au future scientifique de prendre son envol en matière de rédaction
Pour les universités et instituts du Sud, les bouleversements de l'IST ouvrent des perspectives nouvelles : la littérature scientifique devient plus accessible et la production scientifique de l’organisme peut être diffusée plus facilement, grâce aux mouvements du Libre Accès et de la Science Ouverte, et aux développement de technologies de l’information basées sur des logiciels libres.
Marc Goovaerts met en application ce nouveau paradigme dans différents projets de coopération Nord-Sud-Sud, en portant une attention particulière à l’interopérabilité, aux métadonnées et aux identifiants uniques.
Marc Goovaerts, bibliothécaire à l’Université de Hasselt (Belgique), coordonne depuis 20 ans divers projets de coopération financés par le programme IODE de l’UNESCO (https://www.iode.org/) et VLIR-UOS (https://www.vliruos.be/en) avec des bibliothèques et instituts du Sud. Deux récents projets de coopération avec 5 universités cubaines serviront d’exemple.
Un plan de gestion de données (PGD ou DMP pour Data Management Plan) est un document qui spécifie quelles données sont collectées ou générées, et comment elles seront gérées, partagées et préservées pendant et après un projet. Le support de ce webinaire donne les clés pour pouvoir amorcer la rédaction d’un PGD en toute sérénité en présentant les enjeux et objectifs d’un PGD, son contenu et un outil d’aide à la rédaction : DMP OPIDOR.
Claire SOWINSKI est responsable du service formation-DoRANum de l’Inist-CNRS (Institut de l’Information Scientifique et Technique).
Présentaion des outils et services documentaires offerts par le Service IST de la Délégation Régionale Occitanie de l'IRD (Montpellier), en présentiel et à distance : sites web, adresses mails, publications et ressources sur abonnement, assistance, recommandations et formations,...
Cette présentation définit rapidement le Plan de gestion de données dans le cadre du Module Doctoral Cap sur les Données Environnement 2020 réalisé pour l'Université de Montpellier par la Commission Information Scientifique et Technique Agropolis.
Cette introduction au Module Doctoral Cap sur les Données Environnement 2020 réalisé pour l'Université de Montpellier par la Commission Information Scientifique et Technique Agropolis définit rapidement ce qui fait partie des données de la recherche publique et le cadre juridique qui leur est appliqué.
Le monde de la recherche a pour partie découvert l’APA (Accès aux ressources génétiques et Partage juste et équitable des Avantages découlant de leur utilisation) avec les obligations réglementaires issues de la mise en œuvre du Protocole de Nagoya par les pays l’ayant ratifié.
A l’origine, ce mécanisme s’inscrit dans un objectif de conservation de la biodiversité.
Au-delà des aspects réglementaires, l’APA interroge les pratiques de la recherche, en particulier à l’IRD, y compris celles de la science ouverte. Les connaissances traditionnelles associées aux ressources génétiques ne sont pas la seule information sensible, comme l’illustrent les négociations en cours sur l’inclusion des données de séquençage génétique dans le périmètre de l’APA.
Jean-Louis Pham est généticien dans l’UMR Diversité, Adaptation et Développement des plantes (DIADE, Montpellier) et Référent scientifique Nagoya pour l’IRD.
Entreposer des données : pourquoi, domment. Introduction généraleà la présentation de DataSuds, l'entrepôt de données de l'IRD, par Luc Decker, administrateur des données à l'IRD
This document discusses authorship practices in scientific publishing. It describes how authorship is typically determined by contributions to writing, experimental work, analysis, and other aspects of a study. It also discusses debates around collective authorship and ensuring proper attribution for collaborative work. Guidelines from organizations like ICMJE aim to promote transparency and accountability in determining authorship. New technologies may help better track individual contributions through standardized role definitions and digital attribution methods.
Le GBIF (Système Mondial d'Information sur la Biodiversité) est un programme international, fondé à l’initiative de l’OCDE en 2001, dont le but est l'accès libre et ouvert aux données de biodiversité.
A ce jour, plus d'un milliard de données sont disponibles et téléchargeables librement via le portail GBIF.
Outre le portail et ses outils, les activités du point nodal français et ses actions au Sud ont été présentées jeudi 18/05/2019 à Montpellier dans le cadre des Jeud'IST de l'IRD par Eric Chenin.
Eric Chenin (IRD) est impliqué dans le GBIF depuis 2003 : créateur du point nodal France en 2006, responsable du GBIF France jusqu'en 2013, chef de la délégation française au Conseil d'Administration.
La Science Ouverte est à l’ordre du jour, en France et en Europe.
Après les publications, les données de la recherche sont sous le feu des projecteurs.
Ce gisement de connaissances, trop peu connu et exploité, est même souvent voué à l’oubli et à la destruction, faute de signalisation et de sauvegarde pérenne.
L’IRD, plus encore que les autres organismes de recherche, se doit de proposer une politique, des méthodologies et des outils de préservation et de partage des données recueillies dans, par et pour les pays du Sud par l’ensemble de ses équipes de recherche.
Lors de cette conférence, Pascal Aventurier, responsable du Service Information Scientifique et Technique (IST), et Jean-Christophe Desconnets, Directeur de la Mission Infrastructure et Données Numériques (MIDN), présenteront le projet d’entrepôt de données de l’IRD qui ouvrira mi 2019.
Les scientifiques font face à des défis de plus en plus complexes : changement climatique, santé, migrations. Ceci est d’autant plus vrai si l’on s’intéresse aux zones intertropicales qui sont des régions à forts enjeux (croissance démographique, sécurité alimentaire, pression accrue sur les ressources). Ces défis nécessitent l'interdisciplinarité, l’ouverture et la mutualisation des données et des compétences. Dans ce contexte, les méthodes de la recherche évoluent pour s’adapter ou tirer en profit en proposant des environnements de recherche capables de lier des données provenant de différentes sources, de nouvelles approches exploitant les données massives. Dans ce contexte et tant qu’acteur de recherche dans les pays du sud, l’IRD a démarré un projet d’entrepôt de données ouvertes. L’objectif de ce projet est d’assurer un partage ouvert, pérenne des jeux de données d’intérêt récoltées dans les zones intertropicales par l’IRD et ses partenaires. Plus précisément, les objectifs à court terme de cet entrepôt sont de mieux pérenniser et valoriser le patrimoine informationnel de l’IRD et de ses partenaires. Il s'agit également de fournir un service de d’identification, de dépôts et de découverte des données pour les scientifiques afin qu’ils puissent en maîtriser la diffusion et le partage selon les principes FAIR. A plus long terme, l’entrepôt de données vise à assurer la découverte des ressources numériques produites par l’IRD (données, support multimédia, publications) et déposées dans d’autres dépôts, bases de données, pôles de données. Il s’agit de fournir une vision la plus exhaustive possible du patrimoine de données.
"Open data repository for scientific data sharing with the southern countries" was the subject of the talk given by Jean-Chsritophe Desconnets, head of the IRD's Infrastructure and Digital Data Mission (MIDN), in Gabarone (Botswana) on 2018, november 8th during the International Data Week. It presents the IRD's data repository project that will open in 2019. This project is co-managed by MIDN, IT and IST Services.
La bibliométrie, à travers l’exploitation statistique des données issues des publications scientifiques, élabore des indicateurs qui constituent des points de repères pour situer la production scientifique au niveau national et international. Chaque indicateurs produit un éclairage différent et seule la convergence de plusieurs d’entre eux permet d’atteindre une vision globale et réaliste de l’impact de la recherche.
Cette conférence d'Isabelle Henry était programmée le 8/11/2018 dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie, mais n'a pas pu se tenir pour des raisons indépendantes de notre volonté.
Isabelle Henry est Directrice de la mission Evaluation et Programmation de la recherche de l’IRD depuis décembre 2015. Après 20 ans de recherche à l'Inserm comme généticienne moléculaire, elle a été responsable de sa politique de site puis a dirigé son département de l'évaluation et du suivi des programmes pendant 8 ans.
Les pratiques discutables en recherche scientifique, observées depuis les années 60, semblent en augmentation. Des chercheurs honnêtes peuvent dériver vers des comportements douteux pour répondre aux pressions…
La culture POP (Publish Or Perish) doit laisser place à une culture TOP (Transparency Openess Promotion), pour promouvoir une conduite responsable de la recherche...
Cette conférence d'Hervé Maisonneuve s'est déroulée le 11/10/2018 dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie.
Hervé Maisonneuve, médecin de santé publique, a été président de l’European Association of Science Editors. Il anime le conseil scientifique de l’Institut International de Recherche et d’Action sur la Fraude et le Plagiat Académiques (Genève). Il est rédacteur de www.redactionmedicale.fr
Présentation au Pôle Science de l’IRD , le 13 septembre 2018 du projet d'entrepôt de données ouvertes de l'IRD, du contexte de l'Open Science en France et en Europe et des avantages à disposer d'un entrepôt de données pour l'IRD et ses partenaires.
Ce fichier d'accompagnement de TP sur DMP OPIDOR a été réalisé par Annabelle Filâtre et Hanka Hensens pour la journée d'études Open Science Open Data du 28 mars 2017organisée à Agropolis. Il a été mis à jour pour le JeudISST IRD du 20/09/2018.
Un PGD, qu'est-ce que c'est ? Pour quoi faire ? Comment ?
Un PGD sert surtout à se poser les bonnes questions et à adopter des méthodes rigoureuses de gestion pour documenter, stocker, responsabiliser, archiver, informer, et finalement partager les données scientifiques.
Le PGD est de plus en plus souvent recommandé ou même exigé par les financeurs, les éditeurs, les organismes scientifiques.
L’exposé présente les grands principes et principales étapes d’un PGD et les aides à la rédaction.
Cette intervention d'Hanka Hensens a eu lieu le 20 septembre 2018, dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie.
Hanka Hensens, responsable du Centre de Documentation IRD Occitanie, a animé depuis 2017 plusieurs ateliers sur les Plans de Gestion de Données en direction des scientifiques d’Agropolis. Elle forme étudiants et chercheurs depuis près de 20 ans à la recherche et à la gestion de l’information scientifique.
Présentation rapide du Libre Accès aux publications scientifiques et des différentes outils de recherche permettant d'accéder à ces documents librement accessibles. Public Etudiant.
Plus de IST IRD - Service IST de l'Institut de Recherche pour le Développement (20)
7. Aller sur Anystyle.io pour créer des ref. à partir d’une biblio
« à plat » (traitement de texte, page html…)
1. Copier coller 10 ref env. de la bibliographie jointe
2. « Parser »
3. Corriger l’attribution des champs si besoin
(Si vous avez beaucoup d’autres références, lui demander d’enregistrer
pour s’améliorer)
4. Export format BibTeX => récupération automatique dans Zotero
Le résultat n’est pas parfait mais c’est mieux que de tout ressaisir quand la
bibliographie est très longue !
Récupérer des notices à partir d’une bibliographie
10. Notes
• Il s’agit de texte libre
• Vous pouvez copier‐coller des citations du PDF, en les nettoyant en
passant par un éditeur de texte
• Zotfile (à décharger sur http://zotfile.com/ ) permet de surligner le
PDF/extraire des paragraphes et de commenter des PDF/extraire
des annotations :
1. clic droit sur le fichier, ouvrir avec une visionneuse externe,
2. surligner et commenter, enregistrer,
3. Joindre une copie enregistrée du fichier par
4. Clic droit sur le fichier, Gérer les pièces jointes>Extraire les annotations
TP : décharger et installer Zotfile,
annoter un PDF, extraire les annotations
13. Recherche avancée
• Tous les champs de Zotero au choix
• Connecteurs :
– égal/différent,
– contient/ne contient pas (= SAUF),
– est supérieur/inférieur à (pour les champs date)
• + pour ajouter une nouvelle question
• Questions combinées par le choix des conditions :
– « Toutes les conditions » = ET
– « au moins à une » = OU
15. Gérer ses doublons
• Zotero repère d’éventuels doublons dans « Ma Bibliothèque »
en comparant titre, DOI, ISBN et les place dans le dossier
« Doublons »
• Vous pouvez alors
– les fusionner, en choisissant, s’il y a des différences sur certains
champs, le contenu retenu, à choisir en cliquant sur
– Les conserver s’ils ne s’agit pas du même document
16. Dossiers de gestion intéressants à créer
• Dossiers de travail : « à lire », « à citer dans… », « pas
intéressant » (plutôt que de supprimer, classer ici pour ne pas
réimporter et réévaluer), « docs à trouver »,…
• Dossier « Méthodes » avec notes méthodologiques
indépendantes : mots clés/équation de recherche, experts,
journaux, modes d’emploi (de BDD, de zotero,…),…
• Dossier « mes publications » (créé par défaut), pour ses CV,
dossiers de candidature,…
TP : Créer au moins 1 de ces dossiers,
classez‐y au moins 1 référence
19. « Tirer » rapidement une bibliographie
• Dans un document, un mail,…
• Selon le style choisi dans le Menu Edition >
Préférences > Exportation :
• Sélectionner les références
(colonne 2), les « tirer »
à la souris dans le
document ou le mail :
TP : Envoyez par mail 3 de vos références à un
de vos collègues
23. Si vous ne trouvez pas votre style
http://editor.citationstyles.org/ :
• « Search by example », pour trouver un style le plus proche
possible de ce que vous voulez, en modifiant l’exemple proposé
• « Visual editor », pour le modifier (à la marge)
• Save > Save Style puis l’importer par « + » dans Actions >
Preferences > Citer > Styles
En désespoir de cause, vous pouvez demander la création d’un
nouveau style à la communauté Zotero :
https://www.zotero.org/support/fr/requesting_styles
Et si vous voulez devenir un pro :
https://www.sites.univ‐rennes2.fr/urfist/ressources/modifier‐
personnaliser‐des‐styles‐avec‐zotero
29. Pour aller encore plus loin
• Les supports de Zotero (dont le guide de démarrage) :
https://www.zotero.org/support/
• Les super video de DoctoBib :
https://www.youtube.com/user/doctobib/videos
• D’autres videos :
https://www.youtube.com/playlist?list=PLnROkFh2gxtSo64-
B8JbmMjaezmWlRAVi (URFIST PACAC)
http://alopensource.blogspot.fr/2010/11/zotero-envideo.html
• Le blog francophone Zotero :
http://zotero.hypotheses.org/
• Et on reste en contact ! Hanka.hensens@ird.fr