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DR T.DJERBOUA
Pharmacien maitre assistant en
microbiologie
Faculté de médecine Mouloud
Maammeri
Chef de service du
laboratoire central de biologie
clinique
Hôpital BELLOUA-CHU TIZI-
OUZOU.
UNIVERSITE MOULOU-MAAMERI DE TIZI-OUZOU
FACULTE DE MEDECINE
DEPARTEMENT DE PHARMACIE
JOURNEE DE FORMATION
A L’INTENTION DES ETUDIANTS
EN 6ème ANNEE PHARMACIE
PLAN DE LA PRESENTATION
• INTRODUCTION
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• LES BASES DE DONNES
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Pour commencer !
-Ouvrir le logiciel ENDNOTE 7
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Endnote 8 disponible en
téléchargement pour 01 mois en
attendant la version craquée!
INTRODUCTION
• Endnote est un logiciel de gestion des références bibliographiques
• Il permet d’une manière simple et rapide de créer, gérer et partager une
bibliothèque de références bibliographiques ainsi qu’une multitude
d’autres fonctions utiles au scientifique pour la réalisation de divers
documents.
LES FONCTIONS DE ENDNOTE
• Après création d’une nouvelle bibliothèque (fichier dans lesquels nous collectons les références
bibliographiques) , EndNote permet en quelques cliques de :
1) Importer des références du Web des différentes bases de donnés
2) Faire une recherche de références bibliographiques directement a partir de Endnote
3) Créer des références manuellement si elles ne sont pas disponibles en lignes
4) Trier et organiser les références selon les critères désirés
5) Rechercher et actualiser les références déjà présentes
6) Rechercher les références en double, les trier et conserver celles les mieux documentés
7) Rechercher des articles Full-text
8) Insérer les citations en corps de text du document en rédaction
9) Générer automatiques ,progressivement et en fin de document la bibliographie des références cités
10) Partager sa bibliographie
Ainsi que de nombreuses autres fonctionnalités , le tout dans un esprit Userfriendly très simple d’utilisation
LES BASES DE DONNES
• Endnote est relié a de nombreuses Bases de donnés permettant d’effectuer directement une recherche en ligne a partir de Endnote,
• Dans l’autre sens aussi , les bases de donnés offrent la possibilité de télécharger directement des fichiers de citation vers Endnote.
Ex: *NLM (National library of medicine)
*Pubmed
*PMC (PubMed central)
*Google Scholar
*Scopus
*Science-direct
*ISI web of science
*un Journal scientifique : nature,
etc…
ACTIVITES PRATIQUE SUR ENDNOTE 7
1) CRÉER UNE NOUVELLE BIBLIOTHEQUE
2) IMPORTER DES REFERENCES : ENDNOTE-BASE DE
DONNEES / BASE DE DONNEES-ENDNOTE/ ENDNOTE-PDF
3) SAISIE MANUELLE DES REFERENCES
4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER,
GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES
FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE…
5) CITER LES REFERENCES DANS WORD ET CONSTITUTION
DE LA BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES
1) CRÉER UNE NOUVELLE BIBLIOTHEQUE
• FILE -) NEW-) ECRIRE LE NOM DU FICHIER -) save
1) CRÉER UNE NOUVELLE BIBLIOTHEQUE
• FILE -) NEW-) ECRIRE LE NOM DU FICHIER -) save
• Une fois la bibliothèque crée, il faudra l’alimenter en références SOIT:
*En important des citations d’une base de données vers Endnote
*En réalisant une recherche dans Endnote sur une base de données
*En important des fichier PDF
*En saisissant manuellement les références
2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE
DE DONNEES VERS ENDNOTE:
Exemple : PUBMED
a) Effectuer sa recherche PubMed
2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE
DE DONNEES VERS ENDNOTE:
Exemple : PUBMED
a) Effectuer sa recherche PubMed
b) Choisir les références intéressantes
2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE
DE DONNEES VERS ENDNOTE:
Exemple : PUBMED
a) Effectuer sa recherche PubMed
b) Choisir les références intéressantes
c) Cliquer sur Send to =) Citation manager =) EndNote =) create file
2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE
DE DONNEES VERS ENDNOTE:
Exemple : PUBMED
a) Effectuer sa recherche PubMed
b) Choisir les références intéressantes
c) Cliquer sur Send to =) Citation manager =) EndNote =) create file
d) Cliquer sur le fichier téléchargé , le fichier s’ouvre directement dans EndNote
2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE
DE DONNEES VERS ENDNOTE:
Exemple : PUBMED
a) Effectuer sa recherche PubMed
b) Choisir les références intéressantes
c) Cliquer sur Send to =) Citation manager =) EndNote =) create file
d) Cliquer sur le fichier téléchargé , le fichier s’ouvre directement dans EndNote
NB : cette meme démarche est a appliquer en cas de consultation individuelle des
fichiers.
2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE
DE DONNEES VERS ENDNOTE:
Pour les autres bases de donnés, le principe est le même, l’appellation peut être
différent : export, export to citation manager, cite, cite as, citation …
Elle peut se présenter sous forme d’un bouton ou d’un lien HyperText etc…
Parfois le site nous propose un format de fichier bien précis a télécharger Les
fichiers a télécharger sont le format EndNote ou RIS.
3) EFFECTUER UNE RECHERCHE SUR UNE BASE
DE DONNEES A PARTIR DE ENDNOTE:
• Dans la barre d’outils a gauche, en dessous de « file », notons la présence d’une
planète ! = ONLINE SEARCH MODE =) le sélectionner
3) EFFECTUER UNE RECHERCHE SUR UNE BASE
DE DONNEES A PARTIR DE ENDNOTE:
• Dans la barre d’outils a gauche, en dessous de « file », notons la présence d’une
planète ! = ONLINE SEARCH MODE =) le sélectionner
• Dans le menu « online search » cliquer sur la base de donnée désirée : ex Pubmed,
le logiciel se connecte automatiquement
3) EFFECTUER UNE RECHERCHE SUR UNE BASE
DE DONNEES A PARTIR DE ENDNOTE:
• Dans la barre d’outils a gauche, en dessous de « file », notons la présence d’une
planète ! = ONLINE SEARCH MODE =) le sélectionner
• Dans le menu « online search » cliquer sur la base de donnée désirée : ex Pubmed,
le logiciel se connecte automatiquement
• Dans les boites de saisie du milieux, choisir un ou plusieurs critères de recherche
par (auteur, année, journal etc…) =) appuyer sur entrée
4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER,
ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT,
RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE
• A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en
utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères
« auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a
volonté
4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER,
ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT,
RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE
• A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en
utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères
« auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a
volonté
• B) pour grouper les références en cas de besoin, il est possible soit :
• De créer des groupes et y ajouter des références 1 a 1
4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER,
ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT,
RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE
• A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en
utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères
« auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a
volonté
• B) pour grouper les références en cas de besoin, il est possible soit :
• De créer des groupes et y ajouter des références 1 a 1
-de selectionner les références a groupes en appuyant sur CTRL+clique =) clique
droit =) add reference to =) create custom groupe
4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER,
ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT,
RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE
• A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en
utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères
« auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a
volonté
• B) pour grouper les références en cas de besoin, il est possible soit :
• De créer des groupes et y ajouter des références 1 a 1
-de selectionner les références a groupes en appuyant sur CTRL+clique =) clique
droit =) add reference to =) create custom groupe
C) Pour éliminer les doublons : menu =) references =) find duplicates =) keep this
(garder la référence qui possèdes le plus de champs d’informations et / ou la
completer avant d’éliminer le dublon)
4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER,
ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT,
RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE
• D) pour rechercher des full texts a consulter directement dans Endnote nous
pouvons :
Soit effectuer une recherche globale des full texts de toute la bibliothèque
Pour ce faire aller a EDIT =) SELECT ALL ensuite aller a REFERENCES =) find
full text
4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER,
ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT,
RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE
• D) pour rechercher des full texts a consulter directement dans Endnote nous
pouvons :
Soit effectuer une recherche globale des full texts de toute la bibliothèque
Pour ce faire aller a EDIT =) SELECT ALL ensuite aller a REFERENCES =) find
full text
E) Rechercher dans la bibliothèque
5) INSERER LES CITATIONS DANS MS WORD ET GENESE DE LA
BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES
• Aller dans Ms WORD, après l’installation de Endnote , une barre d’outils Endnote
est ajoutée automatiquement
5) INSERER LES CITATIONS DANS MS WORD ET GENESE DE LA
BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES
• Aller dans Ms WORD, après l’installation de Endnote , une barre d’outils Endnote
est ajoutée automatiquement
• Saisir son texte et insérer une citation la ou il le faut , pour se faire, cliquer (dans
word) sur go to Endnote
• Sélectionner la/les/ le groupe de citations a insérer et cliquer dans la barre d’outils
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5) INSERER LES CITATIONS DANS MS WORD ET GENESE DE LA
BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES
• Aller dans Ms WORD, après l’installation de Endnote , une barre d’outils Endnote
est ajoutée automatiquement
• Saisir son texte et insérer une citation la ou il le faut , pour se faire, cliquer (dans
word) sur go to Endnote
• Sélectionner la/les/ le groupe de citations a insérer et cliquer dans la barre d’outils
sur INSERT CITATION
• Le logiciel Endnote bascule directement vers MS WORD tout en insérant la/les
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QUESTIONS ET REMARQUES
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EndNote : notions de base

  • 1. DR T.DJERBOUA Pharmacien maitre assistant en microbiologie Faculté de médecine Mouloud Maammeri Chef de service du laboratoire central de biologie clinique Hôpital BELLOUA-CHU TIZI- OUZOU. UNIVERSITE MOULOU-MAAMERI DE TIZI-OUZOU FACULTE DE MEDECINE DEPARTEMENT DE PHARMACIE JOURNEE DE FORMATION A L’INTENTION DES ETUDIANTS EN 6ème ANNEE PHARMACIE
  • 2. PLAN DE LA PRESENTATION • INTRODUCTION • OBJECTIFS • LES BASES DE DONNES • ACTIVITES PRATIQUES SUR ENDNOTE 7
  • 3. Pour commencer ! -Ouvrir le logiciel ENDNOTE 7 -Ouvrir un document Word -Ouvrir une page Google Endnote 8 disponible en téléchargement pour 01 mois en attendant la version craquée!
  • 4. INTRODUCTION • Endnote est un logiciel de gestion des références bibliographiques • Il permet d’une manière simple et rapide de créer, gérer et partager une bibliothèque de références bibliographiques ainsi qu’une multitude d’autres fonctions utiles au scientifique pour la réalisation de divers documents.
  • 5. LES FONCTIONS DE ENDNOTE • Après création d’une nouvelle bibliothèque (fichier dans lesquels nous collectons les références bibliographiques) , EndNote permet en quelques cliques de : 1) Importer des références du Web des différentes bases de donnés 2) Faire une recherche de références bibliographiques directement a partir de Endnote 3) Créer des références manuellement si elles ne sont pas disponibles en lignes 4) Trier et organiser les références selon les critères désirés 5) Rechercher et actualiser les références déjà présentes 6) Rechercher les références en double, les trier et conserver celles les mieux documentés 7) Rechercher des articles Full-text 8) Insérer les citations en corps de text du document en rédaction 9) Générer automatiques ,progressivement et en fin de document la bibliographie des références cités 10) Partager sa bibliographie Ainsi que de nombreuses autres fonctionnalités , le tout dans un esprit Userfriendly très simple d’utilisation
  • 6.
  • 7.
  • 8. LES BASES DE DONNES • Endnote est relié a de nombreuses Bases de donnés permettant d’effectuer directement une recherche en ligne a partir de Endnote, • Dans l’autre sens aussi , les bases de donnés offrent la possibilité de télécharger directement des fichiers de citation vers Endnote. Ex: *NLM (National library of medicine) *Pubmed *PMC (PubMed central) *Google Scholar *Scopus *Science-direct *ISI web of science *un Journal scientifique : nature, etc…
  • 9. ACTIVITES PRATIQUE SUR ENDNOTE 7 1) CRÉER UNE NOUVELLE BIBLIOTHEQUE 2) IMPORTER DES REFERENCES : ENDNOTE-BASE DE DONNEES / BASE DE DONNEES-ENDNOTE/ ENDNOTE-PDF 3) SAISIE MANUELLE DES REFERENCES 4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE… 5) CITER LES REFERENCES DANS WORD ET CONSTITUTION DE LA BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES
  • 10. 1) CRÉER UNE NOUVELLE BIBLIOTHEQUE • FILE -) NEW-) ECRIRE LE NOM DU FICHIER -) save
  • 11.
  • 12. 1) CRÉER UNE NOUVELLE BIBLIOTHEQUE • FILE -) NEW-) ECRIRE LE NOM DU FICHIER -) save • Une fois la bibliothèque crée, il faudra l’alimenter en références SOIT: *En important des citations d’une base de données vers Endnote *En réalisant une recherche dans Endnote sur une base de données *En important des fichier PDF *En saisissant manuellement les références
  • 13. 2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE DE DONNEES VERS ENDNOTE: Exemple : PUBMED a) Effectuer sa recherche PubMed
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  • 15. 2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE DE DONNEES VERS ENDNOTE: Exemple : PUBMED a) Effectuer sa recherche PubMed b) Choisir les références intéressantes
  • 16.
  • 17. 2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE DE DONNEES VERS ENDNOTE: Exemple : PUBMED a) Effectuer sa recherche PubMed b) Choisir les références intéressantes c) Cliquer sur Send to =) Citation manager =) EndNote =) create file
  • 18.
  • 19. 2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE DE DONNEES VERS ENDNOTE: Exemple : PUBMED a) Effectuer sa recherche PubMed b) Choisir les références intéressantes c) Cliquer sur Send to =) Citation manager =) EndNote =) create file d) Cliquer sur le fichier téléchargé , le fichier s’ouvre directement dans EndNote
  • 20.
  • 21. 2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE DE DONNEES VERS ENDNOTE: Exemple : PUBMED a) Effectuer sa recherche PubMed b) Choisir les références intéressantes c) Cliquer sur Send to =) Citation manager =) EndNote =) create file d) Cliquer sur le fichier téléchargé , le fichier s’ouvre directement dans EndNote NB : cette meme démarche est a appliquer en cas de consultation individuelle des fichiers.
  • 22.
  • 23. 2) IMPORTER DES CITATIONS D’UNE BASE DE DONNEES VERS ENDNOTE: Pour les autres bases de donnés, le principe est le même, l’appellation peut être différent : export, export to citation manager, cite, cite as, citation … Elle peut se présenter sous forme d’un bouton ou d’un lien HyperText etc… Parfois le site nous propose un format de fichier bien précis a télécharger Les fichiers a télécharger sont le format EndNote ou RIS.
  • 24.
  • 25. 3) EFFECTUER UNE RECHERCHE SUR UNE BASE DE DONNEES A PARTIR DE ENDNOTE: • Dans la barre d’outils a gauche, en dessous de « file », notons la présence d’une planète ! = ONLINE SEARCH MODE =) le sélectionner
  • 26.
  • 27. 3) EFFECTUER UNE RECHERCHE SUR UNE BASE DE DONNEES A PARTIR DE ENDNOTE: • Dans la barre d’outils a gauche, en dessous de « file », notons la présence d’une planète ! = ONLINE SEARCH MODE =) le sélectionner • Dans le menu « online search » cliquer sur la base de donnée désirée : ex Pubmed, le logiciel se connecte automatiquement
  • 28.
  • 29. 3) EFFECTUER UNE RECHERCHE SUR UNE BASE DE DONNEES A PARTIR DE ENDNOTE: • Dans la barre d’outils a gauche, en dessous de « file », notons la présence d’une planète ! = ONLINE SEARCH MODE =) le sélectionner • Dans le menu « online search » cliquer sur la base de donnée désirée : ex Pubmed, le logiciel se connecte automatiquement • Dans les boites de saisie du milieux, choisir un ou plusieurs critères de recherche par (auteur, année, journal etc…) =) appuyer sur entrée
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  • 35. 4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE • A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères « auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a volonté
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  • 37. 4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE • A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères « auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a volonté • B) pour grouper les références en cas de besoin, il est possible soit : • De créer des groupes et y ajouter des références 1 a 1
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  • 39.
  • 40. 4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE • A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères « auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a volonté • B) pour grouper les références en cas de besoin, il est possible soit : • De créer des groupes et y ajouter des références 1 a 1 -de selectionner les références a groupes en appuyant sur CTRL+clique =) clique droit =) add reference to =) create custom groupe
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  • 42. 4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE • A) le tri et l’ordree des références peut etre réalisé selon les critères désirés en utilisant la barre d’outils de la fenaitre de consultation, par défaut, les critères « auteur, titre, année de publication » sont présents, ils peuvent etre optimisés a volonté • B) pour grouper les références en cas de besoin, il est possible soit : • De créer des groupes et y ajouter des références 1 a 1 -de selectionner les références a groupes en appuyant sur CTRL+clique =) clique droit =) add reference to =) create custom groupe C) Pour éliminer les doublons : menu =) references =) find duplicates =) keep this (garder la référence qui possèdes le plus de champs d’informations et / ou la completer avant d’éliminer le dublon)
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  • 45. 4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE • D) pour rechercher des full texts a consulter directement dans Endnote nous pouvons : Soit effectuer une recherche globale des full texts de toute la bibliothèque Pour ce faire aller a EDIT =) SELECT ALL ensuite aller a REFERENCES =) find full text
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  • 49. 4) GESTION DES REFERENCES : TRIER, ORDONNER, GROUPER, ELIMINER DES DOUBLONS, RECHERCHER DES FULL-TEXT, RECHERCHER DANS LA BIBLIOTHEQUE • D) pour rechercher des full texts a consulter directement dans Endnote nous pouvons : Soit effectuer une recherche globale des full texts de toute la bibliothèque Pour ce faire aller a EDIT =) SELECT ALL ensuite aller a REFERENCES =) find full text E) Rechercher dans la bibliothèque
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  • 51. 5) INSERER LES CITATIONS DANS MS WORD ET GENESE DE LA BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES • Aller dans Ms WORD, après l’installation de Endnote , une barre d’outils Endnote est ajoutée automatiquement
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  • 53. 5) INSERER LES CITATIONS DANS MS WORD ET GENESE DE LA BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES • Aller dans Ms WORD, après l’installation de Endnote , une barre d’outils Endnote est ajoutée automatiquement • Saisir son texte et insérer une citation la ou il le faut , pour se faire, cliquer (dans word) sur go to Endnote • Sélectionner la/les/ le groupe de citations a insérer et cliquer dans la barre d’outils sur INSERT CITATION
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  • 55. 5) INSERER LES CITATIONS DANS MS WORD ET GENESE DE LA BIBLIOGRAPHIE DE REFERENCES • Aller dans Ms WORD, après l’installation de Endnote , une barre d’outils Endnote est ajoutée automatiquement • Saisir son texte et insérer une citation la ou il le faut , pour se faire, cliquer (dans word) sur go to Endnote • Sélectionner la/les/ le groupe de citations a insérer et cliquer dans la barre d’outils sur INSERT CITATION • Le logiciel Endnote bascule directement vers MS WORD tout en insérant la/les citations désirée et créant en parallèle une bibliographie de références
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  • 57. QUESTIONS ET REMARQUES SUPPLEMENTAIES • STYLE DE CITATION • ORDONNER SELON L’ORDRE D’AJOUT • OUBLI D’UNE REFERENCE ET AJOUT AU MILIEU DE SAISIE • SUPPRIMER UNE REFERENCE • AJOUTER UNE REFERENCE NON INDEXEE • IMPORTER UN PDF…