Examen cytobacteriologique des prelevements genitaux et des infections sexuellement transmissibles / microbiology diagnosis of genital infections and sexually transmitted diseases.
Ce fichier est destiné aux étudiants en graduation en sciences médicales et en première année de post graduation en microbiologie et biologie clinique.
il regroupe les cas les plus retrouvés en matière d'infections génitales et sexuellement transmissibles avec une approches compréhensive simplifée.
this file is destined to students graduating in medical sciences and post graduation in microbiology it regroupes the most frequent manifestation and diagnostic techniques used in genital infections and sexually transmitted diseases
La bactériologie médicale est une branche de la Biologie médicale qui consiste en l'analyse de divers liquides biologiques (parfois de tissus) dans le but d'isoler et/ou de caractériser une ou des bactéries pouvant être responsables de la pathologie suspectée à l'aide de techniques directes ou indirectes.
Dont forget that you can make a whole document translation through online translation apps ! do it and share the knowledge !
ce cours est destiné aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie. il regroupe les principaux aspect taxonomiques , bactériologiques et cliniques relatifs aux cocci a Gram positif catalase négatifs prinxipalement le Genre Streptococcus.
This course is destined to students graduating in medicine and pharmacy and regroups general data on Gram positive Catalase negative cocci mainly the Genus Streptococcus
Les milieux de culture en BactériologieS/Abdessemed
Parmi les milieux de culture, on distingue : Les milieux d'isolement qui sont le plus souvent solides et de composition simples pour permettre le développement de plusieurs espèces bactériennes. Les milieux sélectifs qui favorisent artificiellement la croissance d'une espèce au détriment des autres.
ce cours de systématique bactérienne s'adresse aux étudiants graduant en médecine ou en pharmacie. il s'interésse a la descritpion générale de la famille des Enterobacteriaceae et se focalisant sur les 4 genres les plus pathogènes a savoir : Escherichia coli , Yersinia , Salmonella et Shigella.
ce cours s'adresse aux étudiants graduant en médecine , en pharmacie et en médecine dentaire et apporte les lignes directrices en matière du pour quoi, quand et comment confirmer l'origine virale d'une infection.
n'oubliez pas d'aimer mes cours si vous trouvez qu'ils vous apportent un plus, soyez libre de laisser un commentaire , une question ou une remarque.
La bactériologie médicale est une branche de la Biologie médicale qui consiste en l'analyse de divers liquides biologiques (parfois de tissus) dans le but d'isoler et/ou de caractériser une ou des bactéries pouvant être responsables de la pathologie suspectée à l'aide de techniques directes ou indirectes.
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Les milieux de culture en BactériologieS/Abdessemed
Parmi les milieux de culture, on distingue : Les milieux d'isolement qui sont le plus souvent solides et de composition simples pour permettre le développement de plusieurs espèces bactériennes. Les milieux sélectifs qui favorisent artificiellement la croissance d'une espèce au détriment des autres.
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L’utilisation de matériel biologique est devenue courante, voire banale, dans nos unités de recherche. Prévenir un risque, c’est d’abord le connaître. Or, si les risques liés à la manipulation de certains produits biologiques sont identifiés, la plupart du temps ils restent méconnus et difficiles à évaluer.
Le diagnostic biologique du paludisme par microscopie - Conférence du 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - MENARD Didier - Madagascar - dmenard@pasteur.mg
cette conférence de travaux pratique s'adresse aux étudiants graduant en sciences médicales , il aborde les aspects élémentaires de la pratique au laboratoire de microbiologie ainsi que des aspects relatifs au diagnostic microbiologique.
Les éléments figurés du sang sont de 3 sortes : Les globules rouges ou hématie ou érythrocytes. Les globules blancs ou leucocytes. Les plaquettes ou thrombocytes
Les principales techniques sont les réactions de précipitation, les réactions d'agglutination et les réactions de neutralisation.
La plupart de ces techniques utilisent les propriétés des anticorps monoclonaux.
Leur affinité et leur spécificité de liaison à leur cible fait d'eux des outils incontournables de détection.
Ils permettent de déterminer la présence d'un épitope particulier dans un échantillon, permettant ainsi dans les techniques comme le western blot ou l'ELISA de détecter des protéines, ou des modifications particulières de protéine (phosphorylation, acétylation, etc.).
Techniques de concentration en parasitologieS/Abdessemed
les nombreux et parfois volumineux débris alimentaires, la masse des cadavres bactériens, tout cela encombra la dilution et gène l'observation microscopique. En éliminant ces éléments inutiles, en éclaircit les préparation et simultanément on augmente la concentration des parasites..
Ainsi, privés des particules sans intérêt parasitaire, les œufs et larves de vers, de même que les kystes de protozoaires éventuellement contenus dans une masse fécale volumineuse se concentrent dans un faible volume et sont immédiatement décelables
La parasitologie médicale comporte des approches différentes mais complémentaires : - les parasites et champignons microscopiques en tant qu’agents pathogènes avec leurs morphologies et leurs biologies propres.
- le parasitisme forme particulière et dépendante entre deux organismes vivant en relation étroite.
- la maladie parasitaire ou mycosique et son environnement, résultats pathologiques du contact précédent entre le parasite ou champignon et son hôte. Cette relation entre l’hôte et son parasite se situe dans un environnement influant intervenant dans l’épidémiologie et la lutte contre les grandes endémies parasitaires exotiques.
diagnostic sérologique de Salmonella typhi, de salmonella para typhi A,B et C et éventuellement de salmonella typhi –murium et Salmonella enteritidis...
L’utilisation de matériel biologique est devenue courante, voire banale, dans nos unités de recherche. Prévenir un risque, c’est d’abord le connaître. Or, si les risques liés à la manipulation de certains produits biologiques sont identifiés, la plupart du temps ils restent méconnus et difficiles à évaluer.
Le diagnostic biologique du paludisme par microscopie - Conférence du 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - MENARD Didier - Madagascar - dmenard@pasteur.mg
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Les principales techniques sont les réactions de précipitation, les réactions d'agglutination et les réactions de neutralisation.
La plupart de ces techniques utilisent les propriétés des anticorps monoclonaux.
Leur affinité et leur spécificité de liaison à leur cible fait d'eux des outils incontournables de détection.
Ils permettent de déterminer la présence d'un épitope particulier dans un échantillon, permettant ainsi dans les techniques comme le western blot ou l'ELISA de détecter des protéines, ou des modifications particulières de protéine (phosphorylation, acétylation, etc.).
Techniques de concentration en parasitologieS/Abdessemed
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Ainsi, privés des particules sans intérêt parasitaire, les œufs et larves de vers, de même que les kystes de protozoaires éventuellement contenus dans une masse fécale volumineuse se concentrent dans un faible volume et sont immédiatement décelables
La parasitologie médicale comporte des approches différentes mais complémentaires : - les parasites et champignons microscopiques en tant qu’agents pathogènes avec leurs morphologies et leurs biologies propres.
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ce cours est destiné aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie. il résume les aspects épidémiologiques, cliniques, diagnostic et thérapeutiques relatifs a l'infection par le virus de l'immunodéficience humaine
exposición hecha para el personal de citopatologia, especialmente citotécnicos, del hospital Marqués de Valdecilla, en Santander. Dpto. de Anatomia Patológica.
SYNDROME DE L'IMMUNODEFICIENCE ACQUISE/ UNIVERSITE DE GOMA (UNIGOM)William A. MAHAZI
Le virus de l'immunodéficience humaine, agent causal du syndrome de l'immunodéficience acquise est un lentivirus, trouvez ici son étude du point de vue anatomopathologique
ce document est une communication orale présenté lors des 2èmes journées internationales de pharamcie hospitalière du centre Pierre et Marie curie (Algérie). son objectif principale est de mettre la lumière sur l'état des lieux en matière d'hygiène hospitalière en Algérie
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ce cours s'adresse aux étudiants graduant en pharmacie et en microbiologie . il se subdivise en 03 parties incluant des rappels biochimiques , les méthodes pratiques au laboratoire de microbiologie ainsi que les principaux milieux de culture et méthodes utilisés en microbiologie médicale.
this document is intended for pharmacy and microbiology students. the main objective is to understand the way bacterial metabolism is used to identify clinically relevant bacteria.in routine lab practice.
(Draft) Bacterial Zoonoses and Brucellosis / (brouillon)Zoonoses bacteriennes...Dr Taoufik Djerboua
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This document is destined to graduation students in medical sciences. it adresses a very important topic : Zoonoses.
this document is a ctually a draft, yet it explains most aspects related to diseases inter-transmitted between humans and animals , also are explained the main lines on bio-terrorism and emerging disease. an example or a major zoonose is presented : Brucellosis with its epidemiology , diagnonsis and treatment.
ce document s'adresse aux étudiants graduant en sciences médicales et biologiques et est une ébauche sur les zoonoses et leurs impact majeur sur la santé humaine et environnementale.. il définit aussi lignes majeurs en matière de maladies émergentes et de bioterrorisme. enfin un exemple est étudié en détail qui n'est nul autre au la Brucellose.
this document is the same one but i translated it in turkish for my non english speaking fellow
i used whole document translation so please excuse any errors in translation
beta lactamases : structure , classification and investigationsDr Taoufik Djerboua
this is a simple introduction to the world of beta lactamase enzymes that i had the chance to present during my observership in turkey. it bears some introductive notions necessary to the unverstading of the function fo these enzymes and some tests usually used to invistigate bacteria producing these enzymes. the pictures were taken from Microbe-edu.com Bush et al classification of Beta lactamase, the EUCAST and CLSI recommandation for susceptibility testing documents.
Resistance aux antimicrobiens aux origines de l'emergence et de la propagatio...Dr Taoufik Djerboua
Cette slide a été présentée lors de la journée de sensibilisation a la résistance bactérienne aux antimicrobiens. l'objectif principal est de remettre les informations de l'audience en matière de résistance aux antibiotiques dans le contexte actuel du pays et de démontrer la complexité du processus de lutte qui ne se limite pas seulement a l'exes de prescription des antibiotiques.
This slide was presented during the antimicrobial resistance awarness day held in Nedir mohammed university hospital in 2018. my aim through this presentation was to update and most importantly o reorganise the audience's knowledge on this opic and to put in the country's contexte. also to demonstrate that fighting this global threat is more complexe then limiting antibiotic prescription.
Les eaux techniques en nettoyge desinfection et sterilisation / echnical wate...Dr Taoufik Djerboua
ce document regroupe les caractéristiques qualitatives et quantitatives relatives a la composition des eaux techniques destinés au domaine du nettoyage et de la stérilisation il cmprend aussi les caractéristiques physiques et chimiques détaillant les phénomènes liés a la vapeur d'eau. et le controle qualité fixé par la norme ISO 17 665.
this document regroups all the quantitative, qualitative physical and chemical caracteristics linked to thechnical waters and water vapor and their quality controle according to the ISO 17 665 norm. feel free to leave me any feed back.
Les tests de sensibilite aux antibiotiques / Antimicrobial susceptibility tes...Dr Taoufik Djerboua
Ce fichier destiné aux étudiants en graduation et en poste graduation en médecine et en pharmacie regoupe de manière détaillée la plupart des tests de sensibilité aux antibiotiques actuellement disponibles au laboratoire de microbiologie médicale. il aborde entre autre les différents aspects de normalisation de ces techniques.
this file is destined to graduation medicine and pharmacy students also microbiology post graduating residents.it regroups in detail the techniques used in microbiology laboratory to test the suceptibility of germs to antimicrobials. it also emphasizes the importance of standardization in this field
cette présentation est dédiée a l'autoclave, technique de stérilisation la plus utilisée dans le monde. elle regroupe les principes techniques et normatifs de l'usage des autoclaves ainsi qu'un résumé de leurs mise en fonction , controle /qualifications périodique et entretient comme recommandé par la norme ISO 17665.
this slide is dedicated to moist heat sterilization and steam sterilizers specially. it describes technical and normative/qualification aspect of the functionning of steam sterilizers according to ISO 17665 norm.
La preparation des dispositifs medicaux a la sterilisationDr Taoufik Djerboua
cette présentation décrit les étapes necessaires a la réussite de la stérilisation a savoir le nettoyage, la décontamination et l'emballage ainsi que les aspects normatifs et les controle qualité
this slides describes the steps performed prior to sterilization and necessary to it including cleaning decontamination and packaging and their quality controls according to ISO norms
ce fichier fournit les connaissances de bases sur la stérilisation et les techniques actuellement en industrie généralement et
pharmaceutique .spécialement
this file provides the basic knowledge about sterilisation in industry specially pharmaceuticals
Diagnostic micrbiologique des infections respiratoires basses et de la tuberc...Dr Taoufik Djerboua
Ce cours s'adresse aux étudiants de graduation en médecine et en pharmacie. il comporte les détails techniques sur les prélèvements et les approches diagnostiques utilisés actuellement pour le diagnostic des infections respiratoires basses et la tuberculose. dont forget to give feed back ! than you
Ce cours s'adresse aux étudiants graduant en médecine ou en pharmacie. il comporte toutes les connaissances de bases nécessaires a la compréhension de l’importance de ce groupe spécial de bactéries et son impacte en santé humaine et animale. ce cours s’intéresse aux deux groupes majeures classés cliniquement en anaérobies commensaux et sporulés environnementaux .
ce cours s'adresse aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie, il regroupe des notions de base sur la famille des Mycobactériaceae et sur la principale pathologie qu'ils causent : La tuberculose.
ce cours s'adresse principalement aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie, il résume les aspects bactériologiques, cliniques et thérapeutiques relatifs aux infections causées par ces deux germes en particulier ceux associés aux soins
ce cours s'adresse aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie . il apporte les connaissances necessaires en matière de d"marche a suivre pour indiquer, pratiquer et interpreter une hémoculture
il s'agit d'une présentation faisant partie d'une journée de formation a l'intention des étudiants en pharmacie sur le logiciel de gestion bibliographique Endnote. dans cette présentation des notions élémentaires sur le logiciel sont présentés, de sorte a permettre a l'étudiant et au future scientifique de prendre son envol en matière de rédaction
ce cours de systématique virale s'adresse aux étudiants de graduation de médecine et de pharmacie et s'intéresse a la famille des poxviridae , famille importante notamment en matières de virus émergeant et réemergeants et de bioterrorisme
ce cours de systématique virale s'adresse aux étudiants de graduation de médecine et de pharmacie et s'intéresse a la famille des coronaviridae , famille importante notamment en matières de virus émergeant
ce cours s'adresse aux étudiants graduant en médecine ou en pharmacie. il comporte les notions de base de virologie nécessaire a l'étude de la pathologie virale
ce document est destiné aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie. il résume les aspects épidémiologiques, cliniques, diagnostic et thérapeutiques relatifs a la RAGE humaine
Examen cytobacteriologique des prelevements genitaux et des infections sexuellement transmissibles / microbiology diagnosis of genital infections and sexually transmitted diseases.
1. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE DES
INFECTIONS GENITALES ET DES INFECTIONS
SEXUELLEMENT TRANSMISSIBLES
DR T.DJERBOUA
PHARMACIEN MAITRE ASSISTANT EN
MICROBIOLOGIE
LABORATOIRE DE BIOLOGIE MEDICALE
HOPITAL SIDI BELLOUA-CHU TIZI-OUZOU
ANNÉE UNIVERSITAIRE : 2018-2019
EMAIL : DRTAOUFIK123@HOTMAIL.FR
2. I.INTRODUCTION
Les prélèvements génitaux sont parmi les plus fréquemment reçues au laboratoire de microbiologie
Il en existe un grande diversité contrastant avec l’indication du diagnostic microbiologique
Les principales situations sont :
-Le diagnostic étiologique d’une infection génitale ou uro-génitale et de leurs complications qu’elle soit sexuellement
transmissible ou non
-Le dépistage d’une infection ou d’une colonisation lors des opérations d’aide a la procréation
En raison de la complexité anatomo-physiologique et microbiologique des organes génitaux, le succès de l’examen
cytobactériologique des prélèvements génitaux dépend étroitement de :
-La connaissance des circonstances exactes des étapes pré-analytiques
-La disponibilité d’un plateau technique complet, adéquat et performant,
-Une connaissance profonde de la flore normale (femme+++)
-une étroite collaboration Prescripteur-biologiste
3. II.DEFINITIONS
INFECTION GENITALE ≠ INFECTION SEXUELLEMENT TRANSMISSIBLE
Limite parfois difficile a distinguer
INFECTIONS
GENITALES
SEXUELLEMENT
TRANSMISSIBLE
INFECTIONS
GENITALES NON
SEXUELLEMENT
TRANSMISSIBLE
INFECTION
SEXUELLEMENT
TRANSMISSIBLE SANS
MANIFESTATIONS
GENITALES
Gonorrhée
Syphilis
Chancre mou
Chlamydiose
Condylomes
Donovanose
Herpes
Trichomonase.
…
SIDA
HEPATITES VIRALES (B++)
Vaginoses bactériennes
Infections associés aux soins
Complication des infections
urinaire…
IMPORTANCE DU CONTEXTE
D’ACQUISITION DE L’INFECTION
4.
5.
6. III.EPIDEMIOLOGIE DES IST: Problématique
Les IST sont un problème majeur de santé publique en raison de :
1) Leurs morbidité importante : que ce soit
➢ a court terme: douleur, absentéisme, dysfonction sexuelle, impacte psychologique, aspect inesthétique de certaines lésions,
possible infection invasives graves
➢ a long terme : infertilité , Cancers, gestation extra utérines et infections néonatales, douleurs et lésions organiques, portage
chronique…
2) Les dépenses de santé
3) Nombre élevé des formes asymptomatiques et Association de plusieurs agents infectieux (contagion +++, complications+++)
4) Gits infectieux extra génitaux (bouche, anus) favorisant la contagion
5) Augmentation du risque de transmission du VIH
6) La résistance aux antibiotiques en particulier celle du gonocoque
La portée sociale , les tabou, la stigmatisation ,l’ignorance, la négligence, l’auto-négligence et l’automédication couplés aux
manque de stratégies de prise en charge codifiée, des compagnes de sensibilisation et des centres de dépistages sont autant de
facteurs favorisant la persistance et la propagation des IST.
7. III.EPIDEMIOLOGIE DES IST: les facteurs de risque
- 357 M de nouveaux cas d’IST curables (gonococcies, Trichomonase+++, Chlamydiose, Syphilis)
- 500 M de personnes porteuses d’Herpes génital
- 290 M de nouveaux cas d’infection HPV
- 350 M de séropositifs HBV
- 33 M de séropositifs HIV
Les principaux facteurs de risque d’avoir une IST sont (selons le CDC/USA) :
-L’Age (premiers rapports sexuels entre 15-24 ans)
-Bas niveau socio-économique
-Nouveau partenaire sexuel dans les 60 jours avant le début des symptomes
-Partenaires sexuels multiples
-Antécédents d’IST
-Usage illicite de drogues
-Partenaires connues en ligne
-Admission en centre de détention pour jeunes
-Contacte avec un travailleur de sexe..
- 01 M d’IST tout type confondu/jour
- 900 000 femmes enceintes infectés par la Syphilis dont 350 000 mortinaissance
Les IST EN CHIFFRES (Données de l’OMS : estimations 2013)
8. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique des infections génitales (NOTION DE
L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
9. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique des infections génitales (NOTION DE
L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
• Appareil urinaire et génital confondues a partir de l’urètre
prostatique
• Éloignement de l’orifice anal
• Le microbiote est limité a l’urètre et au plis cutanés du
pénis, le haut appareil génital est stérile (domaine encore
mal exploré)
• Les germes retrouvés a l’état normal sont variables,
dominés par les germes cutanéo-muqueux du périnée.
• Appareil urinaire et génital séparés
• Proximité des 3 orifices : anal, vaginal et urétral.
• Activité cyclique, forte influence hormonale
• Puberté/ménopause
• Présence d’un microbiote vaginal abondant et varié et
variable dans un milieu physiologique acide (pH 4 a 4,5)
dont les Lactobacillus sont les plus dominants (Flore de
Doderline)
• L’étage génital supérieur n’est pas colonisé.
11. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
Les contextes cliniques et les symptômes incitant le patient a consulter peuvent être regroupés en :
1) Les atteintes du bas appareil génital : représentés par les urétrites (homme) et les vulvo-vaginites
Les principales entités nosologiques sont:
A) Les écoulement : retrouvés chez les 2 sexes, ils prennent le nom de « Leucorrhées » chez la femme, leurs caractéristiques
de couleurs, d’odeur et de consistance peuvent orienter vers certaines types d’agents étiologiques.
B) Les Ulcérations : ce sont des pertes de substance du revêtement cutanéo-muqueux génital.
C) Les Végétations : ce sont des excroissances cutanés anormale ayant pour origine une hyperplasie de la couche basale de
l’épiderme ou des muqueuses.
2) Les atteintes du haut appareil génital : représentés par les prostatites - orchi-épididymites chez l’homme et les endo-
cervicites et infections utéro-annexielles (endométrites, salpingites ,ovarites) chez la femme.
Les symptômes sont variables de l’organe atteint et de l’évolution de la maladie. Peuvent être totalement asymptomatiques jusqu’à
stade de complications.
L’atteinte est due a l’extension a partir d’un foyer génital bas, plus rarement par voie hématogène ou iatrogène;
13. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
Les principales étiologies des infections génitales selon le contexte
nosologique sont :
A) Les écoulement : a l’état physiologique, l’homme ne
présente pas d’écoulement. Chez la femme en revanche, il
existe des leucorrhées physiologiques par desquamation
vaginale ou par accroissement de la production (cycle,
grossesse…).
A l’état pathologique, l’apparition d’un écoulement chez l’homme ou
le changement de l’abondance, de l’aspect et de l’odeur des
leucorrhées peut orienter vers une situation pathologique particulière,
nous distinguons :
-Chez l’homme : l’écoulement peut être purulent ou non purulent,
parfois non visible mais interpelle le patient qui trouve des traces sur
ses vêtements.
-Chez la femme : les leucorrhées pathologiques prennent différentes
couleurs (blanchâtres, jaunâtres, laiteuses, caillebottées, mousseuses,
purulentes) avec dégagement d’odeurs nauséabondes.
Col utérin « propre » avec une
glaire cervicale normale
Leucorrhées purulentes
Leucorrhées mousseuses Leucorrhées caillebottées
14. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
Les principales étiologies des infections génitales selon le contexte
nosologique sont :
A) Les écoulement : les principaux agents étiologiques sont
A.1) Neisseria gonorrhoeae: responsable de l’urétrite
gonococcique chez l’homme et des infections génitales
basses et surtout hautes chez la femme. L’écoulement est
franchement purulent
La « goutte urétrale » Leucorrhées purulentes
Cette bactérie invasive est capable de disséminer rapidement (arthrite,
infection pelvienne…) et est capable d’infecter l’anus et la bouche.
La gonorrhée est le plus souvent « criante » chez l’homme, alors
qu’elle est le plus fréquemment silencieuse chez la femme
Les principales complications sont représentés par les formes
disséminés ,la sténose urétrale, l’atrophie testiculaire, la stérilité
tubaire, les gestations extra-utérines et les douleurs pelviennes
chroniques.
En plus des menacer la grossesse, la transmission périnatale de la
bactérie est a l’origine de conjonctivites graves du nouveau née
16. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
A.2) Chlamydia trachomatis « sérovar thrachoma »: responsable
d’urétrite non gonococcique chez l’homme et des infections génitales
basses et surtout hautes chez la femme. L’écoulement est le plus
souvent non purulent chez l’homme et plutôt purulent chez la femme
L’infection est souvent symptomatique chez les deux sexes
En plus des complications cités pour le gonocoque, ce germe est le
plus fréquemment impliqué dans le syndrome de Fitz-Hugh-Curtis et
Fiessinger-Loroy-Reiter
A.3) Mycoplasmaes génitaux: dont M.genitalium est la plus virulente du
genre Mycoplasma ,a l’origine non cultivable et non visible en microscopie,
dont la fréquence est mal connue, est a l’origine d’urétrites non
gonococciques et d’infections génitales hautes chez les deux sexes.
La fréquence des formes symptomatique n’est pas connue ni les
complications au long terme, semble être a l’origine d’infections graves in
utéro
Les autres espèces comme M.hominis et Ureaplasma urealyticum peuvent
être impliqués lorsque leurs nombre augmente (colonisation) M.genitalium
18. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
A.4) Trichomonas vaginalis : protozoaire responsable d’une infection
bénigne comme l’urétrite chez l’homme et de vaginite chez la femme il ne
cause pas d’infections génitales hautes.
Les formes asymptomatiques prédominent chez l’homme
Les leucorrhées sont abondantes et mousseuses, nauséabondes
Les complications inflammatoires sont exceptionnelles et la transmission au
nouveau né est possible
A.5) Candida albicans: espèce la plus impliquée dans les mycoses vulvo-
vaginales, peut aussi donner des balanites chez l’homme.
Le tableau est dominé par le prurit.
Les leucorrhées sont blanches caillebottés et grumeleuses
N’est pas considérée comme une IST
19. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
A.6) Germes non spécifiques: a partir de la flore commensale, peuvent être a l’origine
d’infections de gravité variable allant de l’urétrite jusqu’àux infections profondes. La
contamination peut être vénérienne ou non (Streptocoque B, Entérobactéries,
S.aureus…)
Un cas particulier chez la femme mais ayant une forte incidence (≥50%) est représenté
par un déséquilibre du microbiote vaginal (hygiène inappropriée, antibiothérapie, …) :
disparition de la flore de Doderline associé a une pullulation microbienne intense mais
n’engendrant pas d’inflammation, seules des leucorrhées blanches nauséabondes (odeur
de poisson pourri aggravé après acte sexuel) sont présentes
Ce type de situation est dit VAGINOSE (par opposition aux vaginites)
Les germes retrouvés sont nombreux et variés cependant Gardnerella vaginalis et
Atopobium vaginae sont retrouvés en quantité élevée, associés a des anaérobies strictes.
Les leucorrhées sont caractérisées sur la plan microscopique par la pauvreté en cellules
inflammatoires associés a une abondance de cellules épithéliales dont un type
particulier dit « Clue cells » est typique de cette situation pathologique.
20. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
B) Les Ulcérations : ce sont des pertes de substance du revêtement cutanéo-
muqueux génital. Hormis les répercussions dues a la maladie elle-même ,
l’ulcération favorise fortement la transmission du HIV et est favorable aux
surinfections bactériennes en particulier Leurs aspect et leurs nombre permet
d’orienter vers certaines étiologies infectieuses dont les principales sont :
B.1) Treponema pallidum subsp pallidum: l’ulcération est représenté par le
chancre syphilitique = syphilis primaire qui siège la ou la bactérie entre.
Cette ulcération est unique, indolore a base indurée et accompagnée d’une
volumineuse adénopathie satellite caractéristique, le tout guérit spontanément en
quelques semaines (passage a la phase silencieuse)
Le chancre peut passer inaperçu surtout chez la femme (adénopathie satellite+++)
Les complications de la syphilis tertiaire (bien que rares actuellement) sont
gravissimes par atteinte des viscères
La transmission in utéro est a l’origine d’une infections grave du fœtus et du
nouveau né (syphilis congénitale)
21. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
B.3) Haemophilus ducreyi: agent du Chancre mou (Chancroide).
Cette bactérie exigeante appartenant au genre Haemophilus.
Le chancre Mou se distingue du syphilitique par :
-une incubation plus courte
-des ulcérations multiples douloureuses
-Un aspect (sale) du chancre et son caractère (Mou) au toucher
avant la rupture des pustules.
-Adénopathies multiples
Comme la syphilis, la ou il entre, la ou la lésion apparait avec
possibles cas infracliniques internes chez la femme
Les complications a moyen et long terme consistent surtout en la
phagedenisation des ulcères , une fistulisation des adénopathies voir
des déformations de la verge.
Pas de cas mère-enfant décrits
22. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
B.3) Chlamydia trachomatis sérovar LGV : agent de la
Lymphogranulomatose vénérienne ou Maladie de Nicolas Favre.
Dans sa forme typique ,la maladie évolue en 03 phases vers la chronicité
et concerne les territoires d’inoculation ou a distance.
Cette pathologie se complique de bubons multiples , avec obstruction
lymphatique pouvant mener a un éléphantiasis.
Chez la femme elle évolue vers une destruction de structure génitales
internes et une possible transmission congénitale
Les formes extradigestives sont surtout buccales et rectales qui peuvent
mimer une MICI.
23. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
B.4) Donovanose: maladie vénérienne granulomateuse tropicale causée
par Klebsiella granulomatis.il s’agit d’une maladie chronique évoluant
vers l’abcédation des ganglions inguinaux, stase lymphatique et
mutilation des organes génitaux externes.
24. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
B.5) l’Herpes génital: principalement due a l’Herpes Simplex Virus -2
A l’échelle mondiale c’est l’étiologie la plus fréquente des ulcérations génitales.
L’infection HSV est a vie, caractérisée par une primo-infection suivie d’épisodes de récurrences en
nombre et en intensité variable. Le tout peut etre asymptomatique.
Dans sa forme typique , l’herpes génital se répartit en :
• LA PRIMO-INFECTION
-Phase prodromique : sensation de brulure, paresthésies, Fièvre>39, malaise, myalgies, adénopathies
loco-régionales douloureuses.
-Phase d’état : Inflammation muqueuse ,puis éruption vésiculeuse en « bouquet » typiques, puis
rupture des vésicules = ulcération superficielle, la douleur est intense.
-Phase de guérison : résolution des symptômes sans séquelles en 10 a 14 jours.
Une méningite lymphocytaire aigue bénigne accompagne 1/5 des primo-infections selon certaines
études.
Les formes cliniques sont plus sévères et l’évolution est moins favorable chez l’immunodéprimé
(atteintes extensives et necrotiques : atopie, SIDA, Thérapeutique, âges extrêmes…)
25. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
B.5) l’Herpes génital:
• LA RECURRENCE
-elle sont variables en fréquence et en intensité, peuvent atteindre 6 récurrence par an en altérant considérablement la qualité de vie
-leurs intensité est qualifiée de « moindre » par rapport a l’épisode initial (plus localisés, moins sévères , plus courtes)
-la fréquence des récidive et leurs intensité dépend de certains facteurs comme l’age, l’immunodépresion , l’infection HSV-2
récidive plus fréquemment, l’intensité de l’épisode initial.
L’hérpes périnatal est une forme particulièrement grave de l’infection herpétique touchant le nouveau né avec une mortalité élevé
et de lourdes séquelles chez les survivants.
(dépistage et suivi des femmes enceintes suspectes)
26. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique
des infections génitales (NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
Les verrues génitales sont surtout dues aux HPV muqueux
et génitaux a faible potentiel cancérigène (HPV 6 et 11) qui
comptent pour plus de 80% des cas des infections génitales
(faible potentiel cancérigène mais récidives fréquentes)
Cependant le risque nul n’existe pas, l’infection peut etre
causée par un HPV a haut potentiel cancérigène (16 et 18)
qui sont des oncogènes avérés (Cancer du col de l’utérus,
vulve, vagin, pénis, anus, bouche , l’œsophage …)
La maladie est transmissible a l’enfant lors du passage de la
filière génitale
C) Les végétations: ce sont des excroissances cutanés anormale ayant pour origine une hyperplasie de la couche basale de
l’épiderme ou des muqueuses. Elles sont dues a une infection par les Papillomavirus Humain (Human papillomavirus ou HPV)
Les virus est résistant, a transmission peut être directe ou
indirecte, l’incubation est longue et il existe des formes
asymptomatiques
La maladie en question est appelée « Condylomes » ou
« verrues génitales » pouvant être planes , papuleuses
mais surtout acuminés.
27. IV. Rappels cliniques, pathogenèse et contextes nosologique des infections génitales
(NOTION DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE)
En maladies infectieuses, L’approche syndromique est le principe PROBABILISTE selon lequel une /des étiologie infectieuses de
natures diverses sont retenus comme cible(s) diagnostique/thérapeutique devant un syndrome donné et ce en raison de la
probabilité élevé de leur présence face a CE SYNDROME.
Ceci reviens a dire que certains germes sont a l’origine de tableaux cliniques plus ou moins caractéristiques face auxquels leurs
présence est fortement suspectée.
Elle permet donc de répondre a deux questions sommaires :
1) A quel(s) germe(s) dois-je penser en priorité ?
2) Quelle thérapeutique dois-je envisager en première intention?
En microbiologie cette approche est utilisée au cours de la phase analytique pour fixer les moyens et les approches diagnostiques a
employer face a un prélèvement donnée.
Ex : répartition des microorganismes détectables Multiplex qPCR en panels dont le choix est basé sur une approche syndromique.
28. V. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE DES INFECTIONS GENITALES ET DES IST
1) Etapes pré-analytiques :
A) Indication des prélèvements génitaux :
Chez le sujet asymptomatiqueChez le sujet symptomatique
1) Identification des agents d’infections géniales et d’IST
2) Recherche d’agents a transmission sexuelle en cas d’IST
avérée (HIV, HBV…)
3) Recherche de l’infection chez le(s) partenaires
1) Dépistage d’une IST en cas de :
-Comportement a risque
-Contacte sexuel suspect
-Partenaire infecté symptomatique ou asymptomatique
-Avant l’arrèt du préservatif en cas de relation stable
-au cours des procédures médico-légales (Viol, IST ou
symptomatologie génitale chez l’enfant…)
2) Exploration d’une hypofertilité, menace ou antécédents
d’accouchement prématuré.
3) Recherche systématique de S. agalactiae
4) Bilan de grossesse, contraception , interruption volontaire de
grossesse.
29. V. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE DES INFECTIONS GENITALES ET DES IST
1) Etapes pré-analytiques :
B) Les prélèvements:
AUTRES (SELON LE CONTEXTE)
GENITAUX
A l’aide d’écouvillons (fins si prélèvement intra-
urétral) en Nylon ou en Dactron et de milieux de
transport (auto-prélèvements possibles.
ECOULEMENTS
ULCERATIONS
VEGETATIONS -Brossage des lésions, tissus, biopsies.
-grattage des chancres (sans faire saigner) et recueil des
sérosités
-Ponction des bubons/granulomes
-grattage du fond et bords des ulcérations (HSV)
-Biopsies
-Urétral : surtout chez l’homme, avant toute toilette et 2h minimum après la
dernière miction.
-Vaginal : avec ou sans spéculum, recueil des leucorrhées du cul de sac
postérieur, si lésions, les prélever, si absence de secrétions, balayer toute la
surface.
-Endocol : spéculum obligatoire, après nettoyage soigneux du col.
1) 1ER JET URINAIRE : avant toute toilette et avant toute
miction, de préférence le matin au reveil. L’objectif étant de
recueillir les cellules infectés et le pus urétral
NB: en cas de présence d’un écoulement urétral purulent franc,
l’écouvilloner avant de proceder a la miction
2) Sperme : permet de rechercher les germes en cas d’infection
génitale profonde (orchi-épididimyte, prostatite…)
3)Autres sites anatomiques avec ou sans présence de symptômes :
oropharynx, anus, liquide articulaire, conjonctives, dispositif
intra-utérin, produits d’avortement… le type de prélèvement
dépend du contexte.
4) Sang pour sérologie
Le transport et la conservation des échantillons doit être faite sans
délais accompagnée d’une fiche de renseignements correctement
remplie.
En cas d’usage de trousses commerciales les recommandations
sont précisés par le fournisseur
32. V. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE DES INFECTIONS GENITALES ET DES IST
2) Etapes analytiques :
A) EXAMEN DIRECT : a l’état frais (optique simple ou a fond noir) et après diverses colorations (bleu de méthylène, Gram, MGG) il constitue
un outil incontournable pour plusieurs germes (Trichomonas, N.gonorrhoeae, Treponema pallidum, Klebsiella granulomatis, Haemophilus
ducreyi, mycoses, Vaginoses) en raison de :
-L’aspect caractéristique du germe et des cellules infectés
-La difficultés/impossibilité de mettre en œuvre les techniques de culture dans certains cas.
Cependant:
-Sa sensibilité / spécificité (comme dans tout les cas pour le diagnostic direct) dépend étroitement de la qualité du prélèvement.
-il a été cependant abandonné pour C.trachomatis.
-il n’est pas praticable pour les Mycoplasmes génitaux.
Neisseria gonorrhoeae (Gram) Bacilles en chaine de vélo
Caractéristique d’H.ducreyi
Bacilles intracellulaires
caractéristiques de la Donovanose
Clue celles (pathognominique des
vaginoses)
Treponema pallidum au M;O a
fond noir
33. V. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE DES INFECTIONS GENITALES ET DES IST
1) Etapes analytiques :
B. Culture: a bien sa spécificité haute , elle n’est praticable en routine que pour
N.gonorrhoeae et les germes courants cultivables ainsi que pour les mycoplasmes
commensaux
-Elle est réservée a des centres de référence pour H.dureyi,, Mycoplasma
génitalium,C.trachomatis, T.pallidum , K.granulomatis et les virus (lignées cellulaires,
inoculation a l’animal)
-Inutile pour les Vaginoses (diagnostic microscopique)
Les milieux utilisés en routine sont :
-Des milieux enrichis (Columbia, Muller-Hinton…) au sang cuit et supplémentés en
mélanges vitaminiques (polyvites , supplément G…) SANS antibiotiques.
-Des milieux enrichis (Columbia, Muller-Hinton…) au sang frais et supplémentés en
mélanges vitaminiques (polyvites , supplément G…) SANS antibiotiques.
DIVERS MILIEUX ELECTIFS ET SELECTIFS SELON LE CONTEXTE :
-Des milieux enrichis (Columbia, Muller-Hinton…) au sang cuit/frais supplémentés en
mélanges vitaminiques (polyvites , supplément G…) AVEC antibiotiques (VCN, VCAT)
-Hektoen
-Chapman
-Lowenstein-Jensen
-Gélose pour anaérobies strictes
-Sabouraud+Chloramphénicol ..
API MYCOPLASMA
Numeration des Mycoplasmes
34. V. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE DES INFECTIONS GENITALES ET DES IST
2) Etapes analytiques :
B. Culture: l’incubation a 37° est réalisée sous atmosphère enrichie en CO2 et en athmosphère ordinaire pour les milieux de base et selectifs
pour germes bannaux. Ou selon le cas (anaérobiose stricte pour les anaérobies).
-la durée de l’incubation est variable, minimum 72h pour N.gonorrhoeae avec lecture quotidienne. Parfois l’incubation est prolongée selon le
contexte.
L’identification des bactéries est réalisé selon la conduite a tenir classique : examen direct, tests enzymatiques rapides, galerie biochimique,
Biologie moléculaire et spectrométrie de masse.
Les tests de sensibilité aux antibiotiques sont obligatoirement effectués avec recherche des mécanismes de résistance.
Neisseria gonorrhoeae a partir d’une culture (Gram)
Colonies après plusieurs jours de culture
Identification N.gonorrhoeae sur API NH
N.gonorrhoeae productrice de β-lactamase
35. V. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE DES INFECTIONS GENITALES ET DES IST
2) Etapes analytiques :
C. BIOLOGIE MOLECULRAIRE: S’impose de plus en plus comme technique de référence en raison des difficultés technique de culture et
d’identification des agents des IST. Applicable su divers types de prélèvements, applicables a l’approche syndromique.
Il existe des kits commerciaux permettant d’identifier a la fois plusieurs agents infectieux
D. Sérologie : pour certains agents infectieux comme T.pallidum (VDRL/TPHA) et certains virus (HSV, HIV…)
TPHA
36. les desequilibres de la flore vaginale = vaginoses …
Distribution qualitative de la
flore vaginale en situation
normale et dans le cas des
vaginoses
37. Prévention des IST et éducation sanitaire : the FIVE Ps
PARTNERS – PREVENTION OF PREGNANCY -PROTECTION FROM STDs-PRACTICES-PAST HISTORY
38. Conclusion
La lutte contre les IST passe par une démarche systématique de dépistage en ciblant les
populations a risque
La fréquence des co-infections justifie la recherche systématique des principaux agents d’IST
L’incidence de certaines IST est en nette augmentation, en particulier chez les populations a
risque
La résistance aux antibiotiques est une soucis mondial a court terme, le traitement des formes
extra-génital est devenu un véritable challenge.
La recherche des T.vaginalis doit etre systématiquement réalisé par microscopie le plus
rapidement possible après prélèvement.
Les infections génitales ne sont pas systématiquement des IST !