La réforme de la T2A combine plusieurs modalités de financement, incluant des tarifs par groupe homogène de séjour et des paiements pour médicaments et dispositifs médicaux. Elle introduit également un contrat de bon usage pour assurer une gestion efficace des ressources et procéder à des remboursements en fonction de l'utilisation appropriée. L'application de cette réforme se fera progressivement jusqu'en 2012, avec des étapes techniques spécifiques entre 2004 et 2006.