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Introduction à la mycologie
médicale
Pr M.BOUCHRIK
Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale,
Hôpital Militaire d’Instruction Mohamed V
UFR Parasitologie et
Mycologie Médicale
Généralités
• Mycologie médicale: étude des mycoses et
champignons d’intérêt médical.
• Mycoses = infections fongiques: maladies provoquées
par des champignons microscopiques
• Les champignons: Thallophytes cryptogames
cellulaires.
• Cryptogames: absence de fleurs et de graines.
• Cellulaires: absence de vaisseaux et de racines.
• Thallophytes: absence de feuilles et de tiges.
Règne des champignons
• Macromycètes: muni d’un pied et d’un chapeau, c’est le fruit.
• Micromycètes: champignons microscopiques, levures, moisissures.
• 60 000, 1 500 000 espèces ?
• 300 – 500 pathogènes /homme et animaux.
• 100 – 150 pathogènes réguliers.
Scedosporium
• Eucaryotes: organisme uni- ou pluricellulaire, dépourvu de
chlorophylle, avec noyau, membrane nucléaire, chromosome,
nucléole et appareil mitochondrial.
• Hétérotrophe: incapables d'utiliser l'énergie solaire, nutrition à partir
de matières en décomposition.
• Absorbotrophes: ils réalisent leur nutrition par absorption de
matières nutritives.
• Non photosynthétique.
• Biodégradeurs: machinerie enzymatique (protéolytique) qui permet
de dégrader les macromolécules. « Éboueurs des forêts ».
• Colonisateurs: on les voit partout.
• Pas une plante: pas de tige, de racine et de feuille.
• Pas un animal: nutrition par ingestion.
• Sa structure est constituée d’un thalle unicellulaire (levures) ou
pluricellulaire (mycélium).
• Paroi contient de la chitine et des polysaccharides (glucane).
• Membrane cellulaire riche en ergostérol.
• Reproduction par des spores mitotiques ou méiotiques, issues d'une
reproduction asexuée ou sexuée;
• Elaboration de structures de formes très variables portant ces
spores: les conidiomes, les ascomes et les basidiomes.
Aspect morphologique
• Levures:
• Candida, Cryptococcus
• Filamenteux:
• Aspergillus.
• Dimorphiques:
• Histoplasma
Les différents champignons
filamenteux
• Selon le septum:
• Filaments septés: Aspergillus, Fusarium
• Filaments non septés, coenocytiques: Zygomycètes
• Selon la couleur:
• Filament non coloré = hyalin: Hyalohyphomycètes; Aspergillus,
Penicillium
• Filament coloré (brun/noir): Phaeohyphomycètes; Alternaria,
Cladosporium
Mode de vie
• Symbiotiques: Lichens: champignon + algue
• Saprophytes: Commensaux = vie sur un hôte sans causer de
dommages. Candida albicans
• Parasites: Agent infectieux eucaryote, (animal, végétal ou
fongique), qui au cours de son cycle de développement va, de façon
temporaire ou permanente, se développer aux dépens d’un autre
être vivant eucaryote appelé hôte.
NOMENCLATURE LINNÉENNE
• Chaque être vivant animal ou végétal est désigné selon la nomenclature
Linnéenne (ou binominale):
Nom du genre suivi du nom de l’espèce
→ nom du genre avec une majuscule, nom d’espèce en minuscule (parfois
suivi du nom de l’auteur de la 1ère description)
→ Soit souligné dans le texte, soit en italique
Ex: Candida albicans
Aspergillus fumigatus, 1903
• Candida sp: Espèce indéterminée
• Candida spp: Ensemble des espèces du genre
Nomenclature des mycoses
• Nom de l'infection fongique: nom du champignon
responsable, + suffixe "ose" : candidose,
Cryptococcose, aspergillose, histoplasmose, ...
Nomenclature des mycoses
• Elle est basée sur la terminologie suivante :
• " infection à "
• suivie du nom de l'organe atteint
• suivi du nom du champignon
• Exemple : infection péritonéale à Candida albicans, abcès cérébral à
Scedosporium apiospermum, pneumopathie invasive à Aspergillus
fumigatus
Nomenclature des mycoses
- Nom de l'infection
fongique dérive de la
partie du corps atteinte:
- Dermatomycose,
- onychomycose,
- otomycose, ...
Nomenclature des mycoses
• Autres manières de
désigner les mycoses :
• Nom de l'auteur de leur
découverte :
• Maladie de Gilchrist
• Maladie de Darling, …
• Nom particulier, d'origine
diverse :
• Pied de Madura (mycétomes
fongiques ou actinomycosiques)
• Pied d'athlète (mycose des
pieds à dermatophytes ou à
Candida)
• Muguet, …
Muguet
Pied de Madura
Maladie de Darling
Habitat des champignons pathogènes
• hôtes du milieu extérieur = sol, végétaux, débris organiques
• saprophytes du corps humain
Cryptococcus neoformans Aspergillus
fumigatus
Histoplasma capsulatum
Distribution géographique des
mycoses et de leurs agents
Mycoses cosmopolites
Candidose
Cryptococose
Dermatophytie
Aspergillose
Certaines espèces ou
sérotypes ont des niches
particulières
Mycoses « continentales »
• D'autres mycoses ont
une répartition
géographique large
mais localisée
Chromoblastomycose
Mycoses régionales
Coccidioïdomycose
• La coccidioïdomycose est endémique dans
le sud-ouest des USA, Amérique Centrale
et quelques Etats d'Amérique du Sud
• La paracoccidioïdomycose: exclusivement
en Amérique Centrale et Amérique du Sud
• L'histoplasmose à Histoplasma duboisii :
Afrique Noire
Mycoses locales
Île Tokelau
Trichophyton concentricum
Mycoses d’importation
• La circulation intercontinentale
des hommes favorise
l'observation de mycoses
d'importation dans des régions
où elles n'existent pas
normalement :
• Histoplasmose (1ère mycose
d'importation en France par
ordre de fréquence)
• Pénicilliose à Penicillium
marneffei
Histoplasmose
Pénicilliose
Champignons pathogènes pour l’homme
• Certains champignons sont de vrais parasites:
directement pathogène: Dermatophytes
• Opportunistes +++: Candida sp, Aspergillus sp
Sources de contamination
• Air
• Eau: spores d’Aspergillus
• S o l : c h a m p i g n o n s g é o p h i l e s ,
Microsporum gypseum.
• Animaux: champignons zoophiles
• Animaux de compagnie (chats, rongeurs):
Microsporum canis
• Pigeons: Cryptococcus neoformans
• Chauve-souris: Histoplasma capsulatum
• Aliments: Zygomycètes, Aspergillus
• Homme: Auto-infection; champignons
commensaux anthropophiles. Candida
albicans
Sources de contamination
• La contagion interhumaine
• Dermatophytes anthropophiles:
teignes des enfants / éviction
scolaire.
• Pied d’athlète: vestiaires, douches,
tatamis.
• La contamination nosocomiale
Personnel soignant ++
• Pulmonaire ou sinusienne: inhalés (Aspergillus fumigatus, Histoplasma
capsulatum, Coccidioides immitis, ...),
• Micro-effraction cutanée: Dermatophytes, Sporothrix schenckii, agents de la
chromoblastomycose, agents des mycétomes.
• Oculaire: kératite
• Sexuelle: candidose vaginale
• Digestive: Zygomycoses gastro-intestinales
Voies d’entrée
Facteurs favorisants locaux
Altération de la barrière cutanée
Macération, hypersudation
Facteurs favorisants locaux
Rupture de la barrière cutanée
Mycétome
Chromomycose
Blessures, brûlures
Facteurs favorisants locaux
Appareil respiratoire
• Tabagisme, mucoviscidose
• Altération de la clairance mucociliaire
• Colonisation
• Emphysème, cavité tuberculeuse
préexistante
• Zones sans défense immunologique et
aérées
• Aspergillome
Facteurs favorisants généraux
• Age extrême
• Diabétique
• Altération des PNN
(hémopathies, transplantation)
• Altération de l’immunité cellulaire
(VIH)
Causes iatrogènes
• Chimiothérapie, radiothérapie, corticoïdes,
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  • 1. Introduction à la mycologie médicale Pr M.BOUCHRIK Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale, Hôpital Militaire d’Instruction Mohamed V UFR Parasitologie et Mycologie Médicale
  • 2. Généralités • Mycologie médicale: étude des mycoses et champignons d’intérêt médical. • Mycoses = infections fongiques: maladies provoquées par des champignons microscopiques
  • 3. • Les champignons: Thallophytes cryptogames cellulaires. • Cryptogames: absence de fleurs et de graines. • Cellulaires: absence de vaisseaux et de racines. • Thallophytes: absence de feuilles et de tiges.
  • 4. Règne des champignons • Macromycètes: muni d’un pied et d’un chapeau, c’est le fruit. • Micromycètes: champignons microscopiques, levures, moisissures. • 60 000, 1 500 000 espèces ? • 300 – 500 pathogènes /homme et animaux. • 100 – 150 pathogènes réguliers. Scedosporium
  • 5. • Eucaryotes: organisme uni- ou pluricellulaire, dépourvu de chlorophylle, avec noyau, membrane nucléaire, chromosome, nucléole et appareil mitochondrial. • Hétérotrophe: incapables d'utiliser l'énergie solaire, nutrition à partir de matières en décomposition. • Absorbotrophes: ils réalisent leur nutrition par absorption de matières nutritives. • Non photosynthétique. • Biodégradeurs: machinerie enzymatique (protéolytique) qui permet de dégrader les macromolécules. « Éboueurs des forêts ». • Colonisateurs: on les voit partout.
  • 6. • Pas une plante: pas de tige, de racine et de feuille. • Pas un animal: nutrition par ingestion. • Sa structure est constituée d’un thalle unicellulaire (levures) ou pluricellulaire (mycélium). • Paroi contient de la chitine et des polysaccharides (glucane). • Membrane cellulaire riche en ergostérol. • Reproduction par des spores mitotiques ou méiotiques, issues d'une reproduction asexuée ou sexuée; • Elaboration de structures de formes très variables portant ces spores: les conidiomes, les ascomes et les basidiomes.
  • 7.
  • 8. Aspect morphologique • Levures: • Candida, Cryptococcus • Filamenteux: • Aspergillus. • Dimorphiques: • Histoplasma
  • 9. Les différents champignons filamenteux • Selon le septum: • Filaments septés: Aspergillus, Fusarium • Filaments non septés, coenocytiques: Zygomycètes • Selon la couleur: • Filament non coloré = hyalin: Hyalohyphomycètes; Aspergillus, Penicillium • Filament coloré (brun/noir): Phaeohyphomycètes; Alternaria, Cladosporium
  • 10. Mode de vie • Symbiotiques: Lichens: champignon + algue • Saprophytes: Commensaux = vie sur un hôte sans causer de dommages. Candida albicans • Parasites: Agent infectieux eucaryote, (animal, végétal ou fongique), qui au cours de son cycle de développement va, de façon temporaire ou permanente, se développer aux dépens d’un autre être vivant eucaryote appelé hôte.
  • 11. NOMENCLATURE LINNÉENNE • Chaque être vivant animal ou végétal est désigné selon la nomenclature Linnéenne (ou binominale): Nom du genre suivi du nom de l’espèce → nom du genre avec une majuscule, nom d’espèce en minuscule (parfois suivi du nom de l’auteur de la 1ère description) → Soit souligné dans le texte, soit en italique Ex: Candida albicans Aspergillus fumigatus, 1903 • Candida sp: Espèce indéterminée • Candida spp: Ensemble des espèces du genre
  • 12. Nomenclature des mycoses • Nom de l'infection fongique: nom du champignon responsable, + suffixe "ose" : candidose, Cryptococcose, aspergillose, histoplasmose, ...
  • 13. Nomenclature des mycoses • Elle est basée sur la terminologie suivante : • " infection à " • suivie du nom de l'organe atteint • suivi du nom du champignon • Exemple : infection péritonéale à Candida albicans, abcès cérébral à Scedosporium apiospermum, pneumopathie invasive à Aspergillus fumigatus
  • 14. Nomenclature des mycoses - Nom de l'infection fongique dérive de la partie du corps atteinte: - Dermatomycose, - onychomycose, - otomycose, ...
  • 15. Nomenclature des mycoses • Autres manières de désigner les mycoses : • Nom de l'auteur de leur découverte : • Maladie de Gilchrist • Maladie de Darling, … • Nom particulier, d'origine diverse : • Pied de Madura (mycétomes fongiques ou actinomycosiques) • Pied d'athlète (mycose des pieds à dermatophytes ou à Candida) • Muguet, … Muguet Pied de Madura Maladie de Darling
  • 16. Habitat des champignons pathogènes • hôtes du milieu extérieur = sol, végétaux, débris organiques • saprophytes du corps humain Cryptococcus neoformans Aspergillus fumigatus Histoplasma capsulatum
  • 19. Mycoses « continentales » • D'autres mycoses ont une répartition géographique large mais localisée Chromoblastomycose
  • 20. Mycoses régionales Coccidioïdomycose • La coccidioïdomycose est endémique dans le sud-ouest des USA, Amérique Centrale et quelques Etats d'Amérique du Sud • La paracoccidioïdomycose: exclusivement en Amérique Centrale et Amérique du Sud • L'histoplasmose à Histoplasma duboisii : Afrique Noire
  • 22. Mycoses d’importation • La circulation intercontinentale des hommes favorise l'observation de mycoses d'importation dans des régions où elles n'existent pas normalement : • Histoplasmose (1ère mycose d'importation en France par ordre de fréquence) • Pénicilliose à Penicillium marneffei Histoplasmose Pénicilliose
  • 23. Champignons pathogènes pour l’homme • Certains champignons sont de vrais parasites: directement pathogène: Dermatophytes • Opportunistes +++: Candida sp, Aspergillus sp
  • 24. Sources de contamination • Air • Eau: spores d’Aspergillus • S o l : c h a m p i g n o n s g é o p h i l e s , Microsporum gypseum. • Animaux: champignons zoophiles • Animaux de compagnie (chats, rongeurs): Microsporum canis • Pigeons: Cryptococcus neoformans • Chauve-souris: Histoplasma capsulatum • Aliments: Zygomycètes, Aspergillus • Homme: Auto-infection; champignons commensaux anthropophiles. Candida albicans
  • 25. Sources de contamination • La contagion interhumaine • Dermatophytes anthropophiles: teignes des enfants / éviction scolaire. • Pied d’athlète: vestiaires, douches, tatamis. • La contamination nosocomiale Personnel soignant ++
  • 26. • Pulmonaire ou sinusienne: inhalés (Aspergillus fumigatus, Histoplasma capsulatum, Coccidioides immitis, ...), • Micro-effraction cutanée: Dermatophytes, Sporothrix schenckii, agents de la chromoblastomycose, agents des mycétomes. • Oculaire: kératite • Sexuelle: candidose vaginale • Digestive: Zygomycoses gastro-intestinales Voies d’entrée
  • 27. Facteurs favorisants locaux Altération de la barrière cutanée Macération, hypersudation
  • 28. Facteurs favorisants locaux Rupture de la barrière cutanée Mycétome Chromomycose Blessures, brûlures
  • 29. Facteurs favorisants locaux Appareil respiratoire • Tabagisme, mucoviscidose • Altération de la clairance mucociliaire • Colonisation • Emphysème, cavité tuberculeuse préexistante • Zones sans défense immunologique et aérées • Aspergillome
  • 30. Facteurs favorisants généraux • Age extrême • Diabétique • Altération des PNN (hémopathies, transplantation) • Altération de l’immunité cellulaire (VIH)
  • 31. Causes iatrogènes • Chimiothérapie, radiothérapie, corticoïdes, immunosuppresseurs • Chirurgie (digestive) • Prothèse dentaire • Cathéters, alimentation parentérale • ATB • Dialyse péritonéale