Ce document est un guide pour établir une liste de références pour une thèse de médecine en utilisant un smartphone, incluant des instructions pour télécharger des outils et rechercher des articles dans des bases de données. Il couvre les compétences nécessaires pour choisir les mots clés et les banques de données pertinentes, tout en soulignant l'importance de l'aide des bibliothécaires. Enfin, il recommande des gestionnaires de références comme Zotero pour assurer la précision dans la rédaction des références.

1. se former à établir la
Liste de références
d’une thèse de médecine
avec un
smartphone
Philippe Eveillard
Version septembre 2014
Voir page
suivante le
mode d’emploi
pour télécharger
ce PowerPoint
sur votre
smartphone

2. • Inscrivez-vous sur Slideshare, le site de
stockage des présentations PowerPoint.
• Téléchargez sur votre smartphone
l’application Slideshare Presentation App
(Google Play) ou devenez béta-testeur de
l’application iOS (si environnement Apple).
http://bit.ly/1uWUS1D
• Téléchargez sur votre smartphone le
PowerPoint « se former a établir une liste… ».
COMMENT TÉLÉCHARGER SUR VOTRE SMARTPHONE LA
PRÉSENTATION « SE FORMER A ETABLIR UNE LISTE… »

3. Etablir la liste de références
d’une thèse consiste à dresser
la liste des références sur
lesquelles certains énoncés
(de la thèse) sont fondés.
Ces documents sont le plus
souvent des articles originaux
de la presse médicale.
LISTE DE
RÉFÉRENCES
Elle rassemble
des documents
en rapport avec
le travail publié.
BIBLIOGRAPHIE
Elle rassemble
des documents
sur un sujet
précis.
Contenu
Liste de références ≠ bibliographie

4. Trois questions à se poser
01 Quand et où ?
02 Quoi ?
03 Comment ?
Contenu
Dès que vous avez choisi
votre directeur de thèse et
votre sujet. La B.U. est le
meilleur endroit.
Les références sont celles
d’articles collectés dans
des banques de données.
Avec l’aide des
bibliothécaires et des
gestionnaires de référence.

5. Un sujet de thèse fictif
Au cours de cette formation, les recherches
dans les banques de données seront faites sur
un sujet de thèse fictif :
LA RESPONSABILITÉ DU TABAGISME PASSIF DANS LES
INFECTIONS RESPIRATOIRES DU NOURRISSON :
enquête sur les admissions dans un service de
pédiatrie en 2011 et 2012.
Contenu

6. Quand et où

7. Le plus tôt possible
La liste des références de
votre thèse est établie le plus
tôt possible, dès que vous
avez pris contact avec votre
directeur de thèse et
déterminé le sujet de votre
travail.
Selon le TEMPS
que vous pouvez
y consacrer
chaque jour,
prévoir entre 3 et
5 semaines de
recherche et de
LECTURE.
Quand ?

8. Où ?
Un impératif : la
bibliothèque universitaire
Länder und Zeiten pat Thomas Geiregger Licence CC BY

9. A la bibliothèque universitaire
La B.U. est le lieu privilégié
pour établir votre liste de
références.
Vous y rencontrez :
- une grande compétence
(celle des bibliothécaires) ;
- une richesse documentaire ;
- un environnement favorable
(le calme et la compagnie
d’autres étudiants).
Les
BIBLIOTHÉCAIRES
sont bien plus
compétentes que
vous dans deux
domaines :
- les sources
correspondant à
votre sujet ;
- la façon
d’interroger ces
sources
Où ?

10. Quoi ?

11. Un tableau et des banques
LE TABLEAU DES MOTS CLÉS est
établi à partir de la
formulation en langage simple
de votre sujet de thèse.
LA SÉLECTION DES BANQUES DE
DONNÉES est, elle aussi,
étroitement dépendante de
votre sujet de thèse.
Le tableau des
mots clés est
votre meilleur
GUIDE pour
interroger les
banques de
données qui
hébergent les
références de
votre liste.
Quoi ?

12. Deux compétences
Pour établir la liste de
références de votre thèse vous
faites appel à 2 compétences :
- la vôtre car vous êtes le plus
apte à dresser le tableau des
mots clés ;
- celle du personnel de votre
B.U. car c’est lui qui peut vous
guider au mieux dans le choix
des banques de données.
LA RÉPONSE À 2
QUESTIONS
Vous répondez à
la question :
QUELLES REQUÊTES?
grâce au tableau.
La bibliothécaire
répond à la
question :
QUELLES BANQUES
DE DONNÉES ?
Quoi ?

13. Le tableau des mots clés
est l’œuvre du thésard
DSCF1416 par rainerstropek@yahoo.com Licence CC BY

14. La partie connue de votre thèse
Votre sujet de thèse comporte
deux parties : l’une est
connue, l’autre ne l’est pas et
représente le travail qui vous
incombe.
La PARTIE CONNUE a déjà fait
l’objet de travaux et de
publications. C’EST ELLE QUE
VOUS RÉFÉRENCEZ.
Dans le titre de
votre thèse, LA
RESPONSABILITÉ DU
TABAGISME PASSIF
est la partie à
référencer alors
que L’ENQUÊTE SUR
LES ADMISSIONS EN
PÉDIATRIE est la
partie concernant
votre travail
Quoi ?

15. La formulation de votre sujet
Formuler votre sujet, c’est
TRADUIRE EN TERMES SIMPLES la
partie connue de votre sujet
de thèse.
C’est, enfin, à partir de ces
termes simples, proposer
(dans un tableau) des mots
clés, des synonymes et des
descripteurs appartenant aux
différents thesaurus.
Deux traductions
Les effets
indésirables du
tabagisme passif en
cause dans les
infections
respiratoires du
nourrisson
ou (plus simple)
Tabagisme passif et
infections
respiratoires du
nourrisson
Quoi ?

16. Le tableau des mots clés
Formulation
du sujet
Mots clés
courants
Synonymes Descripteur
MeSH
Qualificatif
MeSH
Descripteur
BDSP
Effets
indésirables
Effets
indésirables
Effets
secondaires
Adverse
effects
Effet
secondaire
du
tabagisme
passif
Tabagisme
passif
Tabagisme
secondaire
Tobacco
Smoke
Pollution
Tabagisme
passif
en cause Cause Etiologie Etiology Etiologie
dans les
infections
respiratoires
Infections
respiratoires
Infections
des voies
respiratoires
Respiratory
Tract
Infections
Infection
respiratoire
du
nourrisson
Nourrisson Enfant en
bas âge
Infant Nourrisson
Quoi ?

17. Un temps fort :
l’exploration des
banques de données
David and Jeff par Alex Barth Licence CC BY

18. Trois banques de données
Pour la partie connue de votre
sujet de thèse, les banques de
données interrogeables sont :
PUBMED/MEDLINE qui fait
figure de source majeure.
LA BASE DOCUMENTAIRE DE LA
BDSP qui est un complément
utile.
LE SUDOC qui fait partie des
sources faciles à solliciter.
LES SOURCES ne
sont pas les
mêmes pour une
thèse clinique,
sociologique,
pédagogique, ou
autre…
Le personnel de
votre BU. est là
pour vous aider
à choisir les
BONNES sources.
Quoi ?

19. Faut-il multiplier les sources ?
OUI si votre sujet le justifie
(une source majeure + une
complémentaire) ou si une des
sources est facile à interroger,
Google Scholar par exemple.
NON dans de nombreux cas
car vous allez perdre votre
temps à apprendre plusieurs
langages et syntaxes sans en
tirer un réel bénéfice.
Vous pouvez
souvent vous
contenter d’une
banque de
données majeure
(type PubMed).
Vous complétez
votre liste avec
une REMONTÉE DES
FILIÈRES et un
SITE DE PARTAGE
des références.
Quoi ?

20. PubMed
Le module SE
FORMER SUR
PUBMED AVEC UN
SMARTPHONE, à
télécharger sur
slideshare,
contient la
formulation des
différentes
requêtes sur le
sujet de la thèse.
Quoi ?
Adresse : http://bit.ly/ZctRcA

21. Les données santé publique de la BDSP
LA BASE DOCUMENTAIRE de la BDSP rassemble les
articles de périodiques, les ouvrages, les
thèses et les rapports (littérature grise) du
domaine de la SANTÉ PUBLIQUE.
La collecte des références et la RÉDACTION DES
NOTICES sont confiées à un réseau de
bibliothèques et de centres de documentation.
Les contenus sont indexés (thesaurus BDSP et
langage PASCAL) par les services de la BDSP.
Quoi ?

22. L’exploration de la base documentaire (1)
La base documentaire de la
BDSP est interrogée avec les
termes du thesaurus BDSP
dans une des fenêtres du
module de recherche avancée.
[TABAGISME PASSIF] ET
[INFECTION RESPIRATOIRE] ET
[NOURRISSON]
Cette requête ne fournit aucun
résultat.
Les REQUÊTES EN
LANGAGE COURANT
sont faites dans
la fenêtre
d’interrogation
de la base.
Les REQUÊTES EN
LANGAGE BDSP
sont formulées
dans le module
de recherche
avancée.
Quoi ?

23. L’exploration de la base documentaire (2)
En l’absence de résultat, vous
devez élargir le champ de la
requête en utilisant le TERME
GÉNÉRIQUE d’infection
respiratoire.
L’équation devient : [TABAGISME
PASSIF] ET [APPAREIL
RESPIRATOIRE PATHOLOGIE] ET
[NOURRISSON]
Dans le
thesaurus de la
BDSP, le terme
générique (de
niveau
hiérarchique
supérieur)
d’infection
respiratoire est :
Appareil
respiratoire
pathologie.
Quoi ?

24. Le Sudoc (système universitaire de documentation)
Le CATALOGUE du système universitaire de
documentation (SUDOC) contient plus de 10
millions de notices d’articles, de livres, de
thèses…
Le catalogue est réalisé par les bibliothèques
et les centres de documentation de
l’enseignement supérieur et de la recherche.
Il décrit le document et indique sa LOCALISATION
dans une des bibliothèques du réseau Sudoc.
Quoi ?

25. L’interrogation du Sudoc
Sur le sujet de la thèse, le
Sudoc est interrogé dans le
module de RECHERCHE AVANCÉE.
Premier temps : tabagisme
passif dans une fenêtre,
nourrisson dans l’autre.
Deuxième temps : tabagisme
passif dans une fenêtre,
infections respiratoires dans
l’autre.
L’interrogation se
fait en 2 temps
parce que 2 fenêtres
seulement sont
réservées à « tous
les mots ».
Le 19/10/2014, la
première recherche
affiche 2 références
adéquates (un
article et un livre)
sur 3.
La seconde en
affiche 3 sur 3 et ce
sont 3 thèses.
Quoi ?

26. Comment ?

27. 01 Avec l’aide
02 En analysant
03 En rédigeant
des bibliothécaires de votre B.U.
des auteurs (les filières)
des autres médecins (CiteULike)
Comment ?
le contenu des articles, par les
fiches de lecture et l’analyse
critique
Les références avec le concours
d’un gestionnaire de références
pour une rédaction sans erreur
et dans le bon style

28. Les bibliothécaires de votre B.U. sont les
plus compétentes pour vous indiquer les
sources et la façon de les explorer
1942 : Worthington (Ohio) library par Don O’Brien Licence CC BY

29. Les bibliothécaires de votre B.U.
La mission du personnel de
votre bibliothèque ne se limite
pas à ranger des périodiques
et des ouvrages dans des
rayons.
Elle est aussi de vous aider
dans vos recherches et de
vous conseiller quant à :
LA SOURCE pour votre sujet
et LA REQUÊTE pour cette source
Vous êtes le
maître de votre
sujet de thèse.
Le personnel de
la B.U. est votre
« maître » en
documentation
car, dans ce
domaine, ses
compétences
dépassent les
vôtres.
Comment ?

30. La remontée des filières bibliographiques
UNE FILIÈRE BIBLIOGRAPHIQUE,
c’est une cascade de
références grâce aux
« références des références ».
Exemple : à partir d’une
référence, vous analysez les
références de l’article
correspondant = vous avez
ainsi remonté le PREMIER NIVEAU
de la filière de cette référence.
REMONTER JUSQU’OÙ ?
Ne pas dépasser 2
niveaux de
remontée.
Analyser les
références d’une
première sélection
d’articles et ensuite
(si nécessaire) les
références des
articles sélectionnés
lors de la première
remontée.
Comment ?

31. Exemple de remontée d’une filière (1)
Parental and household smoking and the increased
risk of bronchitis, bronchiolitis and other lower
respiratory infections in infancy: systematic review
and meta-analysis.
Jones LL, Hashim A, McKeever T, Cook DG, Britton J,
Leonardi-Bee J.
Respir Res. 2011 Jan 10;12:5. Review.
Comment ?
Ci-dessus, une des références affichées à la suite de l’interrogation de la
banque de données PubMed avec l’équation :
TOBACCO SMOKE POLLUTION/AE AND RESPIRATORY TRACT INFECTIONS/ET AND INFANT [MH]
La remontée du premier niveau de la filière consiste à analyser les
références de l’article correspondant à cette référence et à retenir celles
qui paraissent en adéquation avec le sujet de la thèse.

32. Exemple de remontée d’une filière (2)
Un EXTRAIT des références de l’article de la diapositive
précédente : la première et la troisième méritent
d’être retenues et analysées (lecture et validation).
Comment ?
Blizzard L, Ponsonby A-L, Dwyer T, Venn A, Cochrane JA.
Parental smoking and infant respiratory infection: how important is not
smoking in the same room with the baby?
Am J Public Health. 2003;93:482–488.
Braback L, Bjor O, Nordahl G.
Early determinants of first hospital admissions for asthma and acute
bronchitis among Swedish children.
Acta Paediatrica. 2003;92:27–33.
Haberg SE, Stigum H, Nystad W, Nafstad P.
Effects of pre- and post-natal exposure to parental smoking on early
childhood respiratory health.
Am J Epidemiol. 2007;166:679–686.

33. Le social bookmarking donne
accès aux espaces de stockage
des internautes qui ont les
mêmes centres d’intérêt que vous
Sans titre par nownownownow Licence CC BY

34. Le social bookmarking des références
Le social bookmarking des références (site
CiteULike) comporte 3 temps :
MISE EN PLACE de vos références dans l’espace
personnel à votre nom sur CiteULike.
REPÉRAGE par CiteULike des internautes qui ont
fait les mêmes choix que vous.
VISITE de l’espace personnel de ces internautes
à la recherche de références correspondant à
votre sujet de thèse.
Comment ?

35. Le social bookmarking (1)
Comment ?
PREMIER TEMPS : mise en place des références relatives
au sujet de la thèse dans votre espace personnel sur
CiteULike (extrait de 2 de ces références)

36. Le social bookmarking (2)
Comment ?
DEUXIÈME TEMPS : un clic de souris sur along with
(flèche rouge) affiche l’identité des internautes qui
ont fait les mêmes choix que vous (flèche bleue).

37. Le social bookmarking (3)
Comment ?
TROISIÈME TEMPS : un clic de souris sur le pseudo de l’un
des internautes (flèche rouge) vous conduit dans son
espace personnel. Vous pouvez alors l’explorer.

38. Les fiches de lecture
vérifient l’adéquation
quand l’analyse critique
s’occupe de la validité
Lecture par Dolarz Licence CC BY

39. Les fiches de lecture
Le principal objectif des fiches
de lecture est de vous obliger
à LIRE les articles
correspondant aux références
que vous avez sélectionnées
(sur titre ± résumé).
A l’issue de cette lecture, soit
vous conservez l’article et
envisagez son analyse
critique, soit vous l’écartez.
C’est vous qui
décidez du
CONTENU des
fiches.
Une SUGGESTION :
Rédigez-les avec les
éléments à prendre en
compte dans l’analyse
critique comme le type
d’étude, la population
étudiée, les critères de
jugement, les
résultats…
Comment

40. L’analyse critique
L’analyse critique des
articles est au
programme de votre
cursus universitaire.
Si cet enseignement
n’est plus très présent
dans votre mémoire
vous trouverez dans
votre B.U. des livres
pour vous rappeler
l’essentiel.
Collège universitaire des
enseignants de santé publique.
Lecture critique d’articles
médicaux.
3èd. Elsevier/Masson ; 2012.
Collège national des
enseignants de thérapeutique.
Lecture critique d’un article
médical.
MED-LINE ; 2012.
Audenet F, de Beauchamp.
La lecture critique d’articles aux
ECN.
De Boeck/Estem ; 2012.
Comment

41. Le GESTIONNAIRE DE
RÉFÉRENCE :
- place les appels
de référence au
bon endroit ;
- affiche la liste
des références
sans erreur et
dans le bon style.
No substitute par Patrick Feller Licence CC BY

42. Le gestionnaire de références
L’analyse des listes de
références des thèses de
médecine, même les plus
récentes, montre un
pourcentage élevé d’erreurs
dans la simple rédaction (le
recopiage) des références.
C’est la principale justification
du recours à un GESTIONNAIRE
DE RÉFÉRENCES.
LEQUEL CHOISIR ?
Si vous utilisez
déjà un
gestionnaire,
gardez-le !
Ne perdez pas
votre temps à en
apprivoiser un
autre.
Si vous êtes
novice, adoptez
Zotero !
Comment ?

43. Pourquoi Zotero ?
Parmi les gestionnaires de
références Zotero est l’un des
plus performants.
Il est aussi l’un des plus
simples sous réserve de vous
contenter de l’utiliser pour
établir la liste des références
de votre thèse et non pour
gérer dans le détail une
bibliothèque de références.
USINE À GAZ ?
Avec sa
débauche de
cadrans (icones)
et de manettes
(intitulés des
menus), Zotero
est une usine à
gaz ingérable
dès qu’on entre
dans les détails
de son utilisation
Comment ?

44. Zotero
Le module « se
former sur
Zotero avec un
smartphone », à
télécharger sur
Slideshare,
contient la façon
de gérer la liste
des références
se rapportant au
sujet de votre
thèse.
Comment ?
http://bit.ly/1tCiPKg

45. Parlez de la liste dans votre thèse !
Dans le CHAPITRE
MÉTHODES de votre
thèse, dites comment
vous avez établi votre
liste de références.
Cela se résume en une
trentaine de lignes.
Vous y décrivez les
mots clés, les sources
et les requêtes.
INSPIREZ-VOUS des recherches
documentaires faites par la HAS
pour ses recommandations.
Dans l’argumentaire, les
données bibliographiques
comportent 2 paragraphes et un
tableau.
Les paragraphes :
- recherche documentaire ;
- résultat de la recherche.
Remplacer le tableau par une
énumération de vos équations
de recherche successives.
Plus

46. Rappel
Plus
http://bit.ly/ZctRcA http://bit.ly/1tCiPKg
Pour établir la liste de références de votre thèse,
deux compléments sont à votre disposition (en ligne
et en accès libre). N’hésitez pas à les télécharger si
votre sujet de thèse concerne le contenu de PubMed
et si vous êtes « en attente » d’un gestionnaire.

47. Crédits photo
Länder und Zeiten Photo par Thomas Geiregger Licence CC BY
https://www.flickr.com/photos/tom-ge/13780029305/
Davide and Jeff Photo par Alex Barth Licence CC BY
https://www.flickr.com/photos/a-barth/3951906381/
DSCF1416 par rainerstropek@yahoo.com Licence CC BY
https://www.flickr.com/photos/76164541@N06/6803633878/
Lecture par Dolarz Licence CC BY
https://www.flickr.com/photos/10622799@N08/2586343832/
No substitute par Patrick Feller Licence CC BY
https://www.flickr.com/photos/32345848@N07/3493038584/
1942 : Worthington (Ohio) library par dok1 Licence CC BY
https://www.flickr.com/photos/51096110@N00/14399310106/
Sans titre par nownownownow Licence CC BY
https://www.flickr.com/photos/71415721@N07/14440159796/
Toutes les photos sont sous licence
Creative Commons « attribution »