Le document présente Mendeley, un logiciel de gestion de références bibliographiques qui permet aux chercheurs de gérer leur bibliothèque, de citer des sources et de collaborer avec d'autres utilisateurs. Il aborde l'installation, les fonctionnalités clés et l'utilisation de Mendeley, notamment l'importation de références, la synchronisation et la gestion des métadonnées. Mendeley est également décrit comme un réseau social pour chercheurs, facilitant le partage de travaux et la gestion de l'identité numérique.

1. Mendeley : gestion de références bibliographiques
et collaboration entre chercheurs
©Club photo et Maxime Storn
Alain Marois – Bibliothèque de l'Ecole Centrale de Lyon
alain.marois@ec-lyon.fr / www.twitter.com/amarois

2. Plan
● Les logiciels de gestion de références
bibliographiques
● Installation de Mendeley
● Gérer sa bibliothèque de références
● Citer en utilisant ses références
● Partager, collaborer, gérer son identité numérique
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3. Trop de références bibliographiques
sur une idée originale de Valentin Vivier
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4. Gérer sa bibliographie
● S'organiser
● Capitaliser
● Privilégier le fond sur la forme
● Partager des références, collaborer
● Découvrir de nouveaux travaux ?
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5. Des outils dédiés
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6. Besoins classiques...et émergents
sur une idée originale de Martin Fenner
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7. Mendeley 1/2
● Logiciel à installer + service en ligne
(http://www.mendeley.com)
● Windows + Mac + Linux
● Modèle de Last.fm (partage de musique)
● Version beta, gratuit, mais...
●...business model en évolution, mais...
●... « what is free now will remain free »
● Société basée à Londres
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8. Mendeley 2/2
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9. Installation de Mendeley
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10. Téléchargement : option 1
Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte
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11. Téléchargement : option 2
Il est aussi possible d'installer l'outil sans créer de compte à priori
Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes
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12. Installation : les plugins Word et OpenOffice
1 2
3 4
Compatibilité OpenOffice
Compatibilité word 2003 - 2007
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13. Vue d'ensemble de l'interface « Desktop »
Barre d'outils Moteur de recherche
Collections, collections
partagées, corbeille
Liste des références
Filtres (auteurs, journaux,
tag, mots clés auteur
Détails, tag et annotations,
références citées
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14. Créer sa bibliothèque de références
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15. Ajouter des références : via Mendeley Desktop
Différentes stratégies :
● Ajout d'un document ou d'un répertoire de documents
● « Watch a folder », pour l'import automatique de PDF
● Ajout de références au format EndNote, BibTeX, RIS, etc.
Ajout par « glisser-déposer » de fichiers PDF...
...et Mendeley extraira les descriptions du document
PDF automatiquement
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16. Ajouter des références : utiliser l'import web
1
Un simple lien placé dans la barre d'adresse
permet d'importer directement des résultats
de recherche à partir des sites compatibles 2
Choisir les références dans la fenêtre
dédiée, annoter, ajouter des tag
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17. Import web : installation et compatibilité
http://www.mendeley.com/import
Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer...
Les principales sources d'information scientifique
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18. Synchronisation de sa bibliothèque de références
Synchronisez votre bibliothèque Mendeley
Dekstop avec votre compte en ligne
Gestion et édition en ligne de vos références
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19. Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF
1
Indiquez le dossier à importer contenant les
PDF
3 Mendeley va chercher les informations décrivant
les documents dans les bases de données
2 d'information scientifique
L'importation se déroule automatiquement et les références
correspondant aux documents PDF apparaissent
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20. Si vous venez de EndNote
1
Sélectionner les références à exporter
Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS)
2 Dans Mendeley, choisir le format d'import
RIS ou EndNote Xml suivant le format
d'export EndNote
De la même manière, Mendeley peut
importer des listes de références aux
formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,...
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21. Gérer sa bibliothèque de références
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22. Des fonctions de gestion simples et utiles
Collection créées par défaut :
●Toutes les références
●Ajouts récents Triez rapidement vos listes en
●Mes favoris cliquant sur les en-têtes de colonne
●Références à vérifier
●Mes publications
●Publications non classées
Affichez le PDF attaché à la référence pour lecture
Créez vos propres collections
Les références peuvent être marquées
comme « à lire », « lues », « favorites »
Filtrez vos listes de références de façon aisée
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23. Recherche incrémentielle et suggestion de recherche
Recherche dans les références et
les PDF de toutes les collections
Suggestion de termes au
court de la frappe
Mise à jour de la liste de Mise en contexte et surlignage
résultat au cour de la frappe des termes recherchés
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24. Utilisation avancée du moteur de recherche
champs:terme à recherche
Exemples :
● author:harnad
● keyword:Bacteria
● publication:nature
● tag:tools
● title:« open access »
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25. PDF : lecteur intégré + et recherche de mots-clés
Outils d'exploitation avancée : notes,
surlignage manuel, lecture plein écran, etc.
Ouverture des PDF
dans des onglet dédiés
Surlignage du terme recherché dans le PDF
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26. PDF : surlignez et annotez vos documents
Annotation (avec auteur et date) Notes générales
Listes des annotations avec leurs
liens pour une navigation aisée
Passage surligné manuellement
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27. Classez et renommez automatiquement vos fichiers
Tools > Option > File Organizer
L'outil de gestion des fichiers et ses options
Classement et nommage paramétrables
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28. PDF : surlignez, annotez, ajoutez des notes
PDF (et autres fichiers) joints renommés
Fichiers organisés automatiquement en arborescence
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29. Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation
des noms de journaux, auteurs, tag, etc.
2
Mendeley modifie automatiquement
les références en conséquence
1 Les entrées d'index peuvent être glissée-déposée les
unes sur les autres pour homogénéiser leurs valeurs
Passage surligné manuellement
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30. Citer en utilisant ses références
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31. Citer dans Word et OpenOffice 1/2
Cliquer sur « Insert Citation dans la
barre d'outil Mendeley de Word
2
1
Placer son curseur à l'emplacement de
l'appel de citation dans votre texte
3
Dans Mendeley, choisir la référence à citer
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32. Citer dans Word et OpenOffice 2/2
Cliquer sur « Send Citation to Word »
4
5
L'appel de citation est intégré au format
choisi à l'emplacement du curseur
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33. Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice
Cliquer sur « insert Bibliography »
2 Choisir un style bibliographique
Finaliser son texte avec Vous pouvez changer le style :
tous les appels de citation le document se met à jour
1
Positionner son curseur à l'endroit
où doit figurer la bibliographie
3
La bibliographie est générée automatiquement
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34. Produire une simple liste de références formatées
Sélectionnez des références La liste est au format sélectionné
Déplacez les dans votre document (« drag & drop »)
Cela fonctionne aussi par copier-coller
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35. Un vaste choix de styles bibliographiques
Ooo : « Choose Citation Style »
Word : « Other citations from Mendeley »
Recherchez et sélectionnez un style
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36. Utiliser LaTeX / BibTeX : options de
synchronisation de la bibliothèque de références
Tools > Options > BibTeX
Prise en compte de caractères spéciaux
Mise à jour automatique du fichier .bib
Un ou plusieurs fichiers. On peut
imaginer le mettre sur un dossier
Clés BibTeX éditables si besoin partagé...
référence par référence
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37. Partager, collaborer, s'intégrer à une communauté
en gérant son identité numérique
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38. Rendre une collection publique
Les critères de publication des collections sont paramétrables
pour chacune d'entre elles indépendamment des autres
Rendez vos collections
publiques via « Edit Settings »
D'autres usagers pourront s'abonner
à vos collections publiques. Vos
modifications seront répercutées
dans les Mendeley Desktop des
autres membres abonnées. Les
membres abonnées à une collection
sont visibles, ainsi que l'auteur d'une
collection
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39. Créer une collection partagée pour collaborer
Une collection partagée entre membres n'est
visible uniquement que par ses membres.
Vous pouvez inviter vos contacts à partager
une collection que vous avez créée.
Les références sont alors visibles et
modifiables par tous les membres partageant
la collection.
Les fichiers PDF peuvent être mis en commun
et annotés collaborativement.
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40. Compléter son profil et sa liste de publications :
l'identité numérique du chercheur
Liste des publications du
chercheur, mise à jour via une
collection Mendeley
CV du chercheur
Statistiques sur ce
chercheur
Contacts du chercheur
Contacter ce chercheur
Collections publiques
du chercheur
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41. Mendeley : un réseau social pour les chercheurs ?
“ We define social network sites as web-
based services that allow individuals to
(1) construct a public or semi-public
profile within a bounded system, (2)
articulate a list of other users with
whom they share a connection, and (3)
view and traverse their list of
connections and those made by others
within the system.
”
Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship.
Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from
world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>.
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42. Paramétrer la confidentialité de son profil
Se tenir informé
Plusieurs niveaux de confidentialité
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43. Valoriser son travail bibliographique et son expertise
Créer par simple copier-coller
une liste de publication mise à
jour automatiquement Inclure un bouton vers son profil
dans votre signature de courriel
ou sur son blog de chercheur
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44. Trouver de l'aide
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45. Mendeley : participer, suivre l'évolution
Suggérez Suivre les mises à jour
Votez
Etat
Commentez
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46. Statistiques et sérendipité
Données globales
Articles les plus lus
Données par disciplines
>
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47. Questions ?
Alain Marois
04.72.18.64.50
alain.marois@ec-lyon.fr
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48. Ressources
● Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur
le world wide web :
<http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>.
Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS
●
Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204>
● Mendeley Teaching Presentation [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation>
● Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/>
● Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cité 31 Mai 2010].
Disponible sur le world wide web :
<http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html>
● Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327-
328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008
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