Principaux résultats du projet Méthabreed

1. METHABREED
(2018-2024)
Solène Fresco
21 mars 2024

2. Objectifs et
organisation du projet

3. Objectifs du projet Methabreed
Le projet cherche à valider les connaissances et développer les outils permettant de réduire les
émissions de méthane entérique des bovins laitiers par le levier génétique direct
Ces principaux objectifs sont :
• De prédire à grande échelle les émissions de méthane à partir des spectres MIR
• De développer des évaluations génétiques sur les émissions de méthane dans les races laitières
• D’établir les corrélations génétiques de ce caractère avec les autres caractères des objectifs de
sélection
• De réaliser des études de réponses à la sélection
→ Ces travaux sont complémentaires et plutôt en amont des travaux
du projet Méthane 2030
3

4. Organisation du projet Methabreed
4

5. Phénotypage

6. Des mesures directes couteuses et contraignantes limitées à la recherche
Les mesures directes des émissions de CH4
3 GreenFeeds
achetés dans le cadre
de
Methabreed
 Développement d’équations de prédiction à partir des spectres MIR du lait
6

7. Bases biologiques de la prédiction
3 GreenFeeds
Ration
CH4
CH4
CH4
Spectres moyen
infrarouge (MIR)
Acides gras
Proteines µ
Composition
du lait
Fermentation
ruminale
7

8. Données de calibration
5 fermes & 9 expérimentations
235 vaches
3 races
1 800 spectres MIR
26 000 mesures de CH4
Collectés entre 5 et 305 jours de lactation
Transformés pour intégrer le stade de lactation
Émissions de méthane (g/d)
moyenne = 450 g/j
SD = 123 g/j
©Le Pin
De multiples équations testées  on retient l’équation construite à partir
des mesures de méthane moyennées sur 2 semaines
(condition : minimum de 20 mesures)
8

9. Les phénotypes « méthane »
MeP direct g/j
MeI g/kg lait corrigé pour les taux
g/kg MS ingérée
MeY
A partir des spectres MIR, l’UMT eBIS dispose des
prédictions obtenues à partir d’équations Methabreed
(s’appuyant sur des données expérimentales avec
GreenFeeds)
9

10. Les phénotypes « méthane »
MeP direct g/j
MeI g/kg lait corrigé pour les taux
g/kg MS ingérée
MeY
A partir des spectres MIR, l’UMT eBIS dispose des
prédictions obtenues à partir d’équations Methabreed
(s’appuyant sur des données expérimentales avec
GreenFeeds)
MeP indirect = MeI x lait corrigé g/j
10

11. Les phénotypes « méthane »
MeP direct g/j
MeI g/kg lait corrigé pour les taux
g/kg MS ingérée
MeY
A partir des spectres MIR, l’UMT eBIS dispose des
prédictions obtenues à partir d’équations Methabreed
(s’appuyant sur des données expérimentales avec
GreenFeeds)
MeP indirect = MeI x lait corrigé g/j
A partir de l’équation Consortium GHG (s’appuyant sur des
données de chambres de respiration et gaz SF6) :
MeP GHG g/j
11

12. Prédictions sur les données nationales
Nombre de cheptels
Nombre de vaches
Nombre de spectres
Race
1 215
42 287
630 147
Abondance
1 293
14 801
168 749
Brune
586
16 231
219 139
Tarentaise
824
18 039
229 003
Simmental
10 182
756 877
12 183 188
Montbéliarde
4 173
125 660
929 638
Normande
18 991
1 306 268
13 721 855
Holstein
304
3 325
55 913
Vosgienne
Attention, ces valeurs représentent les spectres prédits, et non ceux utilisables
12

13. Evaluation génomique
Paramètres génétiques

14. Etude de la validité des équations
• Données fournies par le CEL 25-90
• 2 050 000 spectres de 200 000 vaches entre 7 et 305
jours, de janvier 2012 à juin 2017
• Analyse des GH : distance entre le spectre analysé et les
spectres de calibration, une distance trop élevée (> 3)
indique que la prédiction n’est pas fiable
 Y a-t-il des stades de lactation présentant une
forte proportion de spectres à GH élevés ?
 En moyenne, 7% sont trop distants de la
population de calibration
 Application des équations entre 70 et 200
jours de lactation
Proportion de spectres avec GH > 3
Stade de lactation
Pourcentage
14

15. Paramètres génétiques
Lactation 3
Lactation 2
Lactation 1
Race
1 179
2 541
4 840
Abondance
267
800
1 774
Brune*
412
959
2 050
Tarentaise*
660
1 520
3 086
Simmental*
56 541
101 922
174 712
Montbéliarde
165
294
468
Vosgienne*
131
4 602
15 956
Normande*
43 706
99 986
186 237
Holstein
Critères de sélection:
- 2 ans de données par cheptel
- Protocoles de contrôle laitiers : A et B
- Performance en L1 obligatoire
- Minimum de 3 contrôles par vache entre 70 et 200j
Effectifs disponibles :
1Minimum de 5 vaches par troupeau et par jour de contrôle, dont au moins 3 primipares (sauf pour les races 46 et
66, avec des seuils de 9 et 5, respectivement)
Effectifs disponibles :
15

16. Paramètres génétiques
Lactation 3
Lactation 2
Lactation 1
Race
1 179
2 541
4 840
Abondance
267
800
1 774
Brune*
412
959
2 050
Tarentaise*
660
1 520
3 086
Simmental*
56 541
101 922
174 712
Montbéliarde
165
294
468
Vosgienne*
131
4 602
15 956
Normande*
43 706
99 986
186 237
Holstein
Effectifs disponibles :
Les paramètres génétiques sont disponibles pour toutes les races
Effectifs disponibles :
16

17. Corrélations entre lactations 1 et 2
Montbéliarde
Holstein
Caractères
0.97 (0.003)
0.97 (0.003)
MeP direct (g/j)
0.93 (0.008)
0.98 (0.010)
MeP indirect (g/j)
0.98 (0.002)
0.98 (0.003)
MeP GHG (g/j)
0.98 (0.003)
0.98 (0.003)
MeI (g/kg lait corrigé)
Caractères très similaires entre lactations
17

18. Héritabilités
Héritabilités satisfaisantes & stables entre lactations
Héritabilités similaires entre les races
Lactation 3
Lactation 2
Lactation 1
Caractères Montbéliarde
Holstein
Montbéliarde
Holstein
Montbéliarde
Holstein
h²
h²
h²
h²
h²
h²
56 541
43 706
101 922
99 986
174 712
186 237
n
0.34
0.35
0.36
0.36
0.40
0.39
MeP direct (g/j)
0.18
0.14
0.20
0.18
0.26
0.23
MeP indirect (g/j)
0.38
0.38
0.42
0.37
0.46
0.42
MeP GHG (g/j)
0.33
0.31
0.32
0.34
0.32
0.34
MeI (g/kg lait corrigé)
18

19. Corrélations génétiques entre caractères
Ce sont des caractères différents
 Combiner plusieurs caractères en un index de synthèse ?
MeI
MeP GHG
MeP
indirect
MeP direct
Caractères
0.25
(0.013)
0.62
(0.009)
0.34
(0.016)
MeP direct (g/j)
0.55
(0.001)
-0.04
(0.002)
0.30
(0.016)
MeP indirect (g/j)
-0.16
(0.002)
0.25
(0.015)
0.59
(0.008)
MeP GHG (g/j)
0.23
(0.013)
0.43
(0.015)
0.30
(0.013)
MeI (g/kg lait corrigé)
Corrélations pour les Holsteins au-dessus de la diagonale et pour les Montbéliardes en-dessous
19

20. Et après ?

21. Suite des travaux
• Réalisation par l’UMT eBIS d’évaluations pilotes dans les 8 races laitières
• Potentiellement jusqu’à 4 index par animal (MeP direct, MeP indirect, MeP GHG, MeI)  index de synthèse ?
• Résultats présentés le 22/03/2024 aux OS et ES
• Estimations des corrélations génétiques avec les autres caractères en cours
• Etudes de réponses à la sélection au printemps 2024
• Transfert des évaluations pilotes à GenEval cet été
21

22. Merci !
UMT e-Bis
contact@umt-e-bis.com