Presentation for a practical demonstration and discussion covering advanced IPT features and publication of a complex, sampling-event dataset. The emphasis will be put on the use of extensions and the core/extension relationship, but we will cover other topics such as database sources, row filtering / translation if time allows ----- Présentation pour une démonstration pratique et discussion sur les fonctionnalités avancées de l’IPT et la publication d’un jeu de données complexe (données d’échantillonnage). L’utilisation des extensions et des relations coeur de standard/extensions sera particulièrement mise en avant, mais d’autres sujets seront également couverts comme la liaison de l’IPT à une base de données, le filtrage des lignes et la traduction en fonction du temps restant.

1. August 25th, 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Advanced data publishing
using the IPT
Nicolas Noé

2. August 25th, 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Publication avancée de
données en utilisant l’IPT
Nicolas Noé

3. Content
●Cores and extensions
●Anatomy of a Darwin Core Archive
●Data Papers
●DOIs and citations
●Data filtering and translation
●Connecting to a database
●IPT Administration

4. Contenu
●Coeurs/Cores et extensions
●Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive
●Data Papers
●DOIs et citation
●Filtrage et traduction des données
●Connexion à une base de données
●Administration d’un IPT

5. Available Core and extensions: overview

6. Apercu des coeurs et extensions disponibles

7. Core and extensions: concepts
●Each dataset has one and only one Core file
●Each core file corresponds to a dataset type:
Occurrence, Checklist or Sampling event.
●Each dataset can have one or more extensions file
●The aim of an extension is to add new data fields
not present in the core.
●Each row in an extension file references one and
only one row in the core (with an ID).

8. Coeurs et extensions: concepts
● Chaque jeu de données est composé d’un et un seul
fichier Coeur.
● Chaque coeur correspond à un type de jeu de données:
Occurrence, Checklist or Evenement
d'échantillonnage.
● Chaque jeu de donnée peut avoir une ou plusieurs
extensions.
● Le but d’une extension est d’ajouter des champs, en plus
de ce qui est dans le coeur.
● Chaque ligne dans une extension référence une et une
seule ligne dans le fichier coeur.

9. Core and extensions: concepts
Implications of this relationship:
Each entry in the core file is linked to zero, one or
several rows in an extension file.
Each row in an extension file reference one and only
one core Row.

10. Coeurs et extensions: concepts
Cette relation a des implications
Chaque entrée dans le fichier coeur est liée à zéro,
une ou plusieurs entrées dans un fichier d’extension.
Chaque entrée dans un fichier d’extension référence
une et une seule entrée dans le fichier coeur.

11. Core and extensions: concepts
Examples:
●Core is Occurrence, with “multimedia” extension
●Core is Taxon, no extensions
●Core is Occurences, with multimedia and
measurement extensions.
●Core is Event with Occurrence and Measurement
extensions.

12. Coeurs et extensions: concepts
Exemples:
●Coeur Occurrence, avec extension multimédia.
●Coeur Taxon, pas d’extensions
●Coeur Occurences, avec extensions multimédia et
“mesures”.
●Coeur Event avec extension Occurrence et
“mesures”.

13. Anatomy of a Darwin Core Archive

14. Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive

15. Anatomy of a Darwin Core Archive

16. Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive

17. Anatomy of a Darwin Core Archive

18. Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive

19. Data papers
“... a searchable metadata document, describing a
particular dataset or a group of datasets, published in the
form of a peer-reviewed article in a scholarly journal.”

20. Data papers
“… un document de métadonnées référencé, décrivant un
(ou plusieurs) jeu(x) de données, publié sous forme d’une
revue à comité de lecture.
”

21. DOIs and citations
●On each registered dataset
●Also on data downloads
●Allows proper tracking/citations!

22. DOIs et citations
●Pour chaque jeu de données au GBIF
●Mais aussi sur les données téléchargées!
●Permet un suivi et des citations correctes des
données.

23. Advanced IPT features: data filtering and
translation

24. Filtrage et traduction des données

25. Advanced IPT features: connecting to a
database

26. Connexion à une base de données

27. IPT Administration

28. Administration d’un IPT

29. August 25th, 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Advanced data publishing
using the IPT
Nicolas Noé

30. August 25th, 2016
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Publication avancée de
données en utilisant l’IPT
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