M1 BMC 2012-2013 MIS

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M1 BMC 2012-2013 MIS

  1. 1. MASTER 1 BMC 2012-2013 MAITRISE DE L’INFORMATION SCIENTIFIQUEclaire.sonnefraud@upmc.frMise à jour août 2012
  2. 2. Contenu de la formation 1 cours en salle info : 3h 1 examen : 1h Formation à distance : cours et annales disponibles sur JubilDates des examens:Semaine du 17 décembre 2012.Notes des examens : la note est sur 5 et est incluse dans la note de participation.
  3. 3. Formation à distance Ce diaporama, des annales et un mémo sont disponibles sur la page des Master sur Jubil :http://www.jubil.upmc.fr/fr/guides_recherche/maste r_sciences/master_biologie.html Pour compléter, il est conseillé de lire les supports de cours spécialisés sur : Recherche bibliographique en biologie ; Catalogue de la BUPMC ; PubMed initiation ; Web of Sciencehttp://www.jubil.upmc.fr/fr/guides_recherche/master_scienc es/tutoriels.html
  4. 4. Plan du cours1. Méthodes de la recherche bibliographique Recherche d’articles ; accès aux ressources de la BUPMC ; astuces de recherche2. Web of Science3. PubMed
  5. 5. Méthodes de la recherche bibliographique
  6. 6. Méthodes de la recherchebibliographique Jubil Guides de recherche : supports de cours Jubil ressources en ligne Recherche d’article Recherche d’article sur Jubil : liste A-Z Catalogue BUPMC. Sudoc. Trucs et astuces : traduction de mots-clés Trucs et astuces : équation de recherche
  7. 7. Jubil www.jubil.upmc.fr Le site de la BUPMC permet de retrouver les principales informations sur les bibliothèques et d’accéder aux ressources documentaires.
  8. 8. Présentation du site :
  9. 9. Informations sur lesbibliothèques Pour connaître la localisation, les horaires, conditions d’inscription et autres informations pratiques sur le réseau des bibliothèques, il suffit de naviguer sur leurs pages. La rubrique « services » récapitule les aides disponibles dans les sections : - Prêt entre bibliothèques - Prêt d’ordinateurs portables - Accès Wifi Etc.
  10. 10. Recherche d’informations : lesoutils Le nouveau site ne comporte pas de moteur de recherche intégré pour l’instant : - Catalogues = recherche sur les collections de la BUPMC + liens vers d’autres catalogues - Ressources en ligne = listes des bases de données et plateformes de revues auxquelles est abonnée la BUPMC + liste A-Z des revues @ - HAL-UPMC : lien vers le portail institutionnel de l’archive ouverte UPMC. - Jubilothèque : bibliothèque numérique de la BUPMC
  11. 11. Guides de rechercheDes tutoriels permettent deprendre en main rapidement lesdifférents outils documentairesaccessibles : catalogues, basesde données, plateformesd’éditeurs scientifiques… ouencore d’apprendre à faire unerecherche documentaireefficace ou à utiliser un logicielde gestion de référencesbibliographiques (Zotero, etc.)
  12. 12. Jubil ressources en ligneLa page donne accès à laliste A-Z des revues @accessibles par lesabonnements UPMC.Les autres rubriques(revues, e-books, bases)recensent les « bouquets »ou bases de données :Science Direct, Georef,Web of Science, etc.
  13. 13. Rechercher des articlesAttention : seule la recherche par titre de revue est possible sur le catalogue et la liste A-Z.Lire un état de collection :vol. 1, n. 3 (1965) – …vol. 1, n. 3 (1965) – vol. 10, n. 5 (1975)vol. 1, n. 3 (1965) – vol. 10, n. 5 (1975) ; vol. 12, n. 1 (1977) – …La cote : identification du livre dans la bibliothèque, son adresse.
  14. 14. Rechercher des articles sur JubilDe plus en plus d’abonnements e-onlyDes collections papier très richesVérifier la complémentarité des abonnements papier et online : avec trois outils complémentaires- La liste A-Z (support électronique, niveau revue)- Le catalogue (support papier, niveau revue)- Le résolveur de lien sur les bases de données bibliographiques (support électronique, niveau article)
  15. 15. Liste A – Z : présentation Les titres signalés sur cette liste sont tous accessibles aux membres de l’UPMC, soit sur abonnement, soit en accès libre. En avril 2012, plus de 13 000 titres sont signalés. Ce total est mis à jour régulièrement en fonction des abonnements et désabonnements.
  16. 16. Comment y accéder? http://sfxeu06.hosted.exlibrisgroup.com/33UPMC/az OU
  17. 17. Liste des revues3 types de recherche:  Recherche simple  Recherche par discipline  Recherche avancée
  18. 18. Recherche simple  Taper un titre et cliquer sur OK OU  Feuilleter les titres par ordre alphabétique
  19. 19. Recherche par disciplineAffichage des titres en fonction de la discipline etsous-discipline recherchée
  20. 20. Recherche avancéeRecherche d’un titre de revue via les champs Titre,Issn, Discipline, Fournisseur.
  21. 21. Résultats Sur la page de résultat (liste de titres) : Deux types d’affichage des titres sont possibles : Vue tabulaire / Vue abrégée  Le bouton permet d’accéder au texte intégral de la revue, ainsi qu’à plusieurs services associés au titre  Le bouton donne accès à des informations sur la revue (titre, titre abrégé, Issn, état de collection, discipline)
  22. 22. Exemples : Biologie
  23. 23. Catalogue BUPMC http://catalogue-bibliotheques.upmc.fr
  24. 24. Contenu du catalogue Le catalogue permet de chercher et de localiser :  tous les documents « physiquement » présents dans les bibliothèques : livres, revues, cartes, thèses, DVD, etc.  les livres numériques (e-books)
  25. 25. Recherche simple Recherche par : - mots - liste alphabétique Recherche de base : tous les mots de la noticePossibilité delimiter sarecherche sur letitre, l’auteur, lesujet, etc.
  26. 26. Recherche avancée Possibilité de croiser plusieurs champs Possibilités de limitation: - Par bibliothèque - Par langue - Par type de support - Par date
  27. 27. Recherche avancée Possibilités de limitation: - Par bibliothèque - Par langue - Par type de support - Par date
  28. 28. Recherche avancée Possibilités de limitation: - Par bibliothèque - Par langue - Par type de support - Par date
  29. 29. Liste de résultats Rappel de la recherche Livre Ebook Accès au texte intégralExporter ces résultats
  30. 30. Lire les résultats Localisation de l’ouvrage: bibliothèque et cote Possibilité de rebondir en relançant des recherches à partir d’informations de la notice trouvée
  31. 31. Affiner ses résultats
  32. 32. Recherche par cote Permet de naviguer, de page de cote en page de cote
  33. 33. Détail d’une notice de livre ISBN Mots-clés cliquables Rebonds Cote
  34. 34. Détail d’un livre dans une collectionTitre collection Mots-clés cliquables Rebonds
  35. 35. Détail d’un périodiqueTitre VolumeEditeur Numéro Date Eléments à prendre également en compte : -Périodicité -ISSN
  36. 36. Si le livre n’est pas dans les catalogues de l’UPMC• Consulter le SUDOC(Système Universitaire de DOCumentation)• Ouvrages de toutes les bibliothèques universitaires de France (livres, revues, thèses…)
  37. 37. Page d’accueil du SUDOC 37
  38. 38. Page de résultats SUDOC Différentes icônes suivant le type de document
  39. 39. Détail d’un résultat SUDOC
  40. 40. SUDOC : où trouver le documentLes bibliothèques quipossèdentle livre peuventl’envoyer dans votrebibliothèque
  41. 41. Le prêt entre bibliothèques (PEB) • Intérêt du SUDOC : trouver un livre, un mémoire ou une revue qui ne sont pas dans une bibliothèque de l’UPMC • Si l’ouvrage ou la revue ne sont pas dans une bibliothèque proche, on peut se les procurer via le PEB • Payant : 6 € par ouvrage, 3 € par article (50 pages max.) pour des photocopies • Quelques jours après, vous venez retirer l’ouvrage ou les photocopies dans votre bibliothèque
  42. 42. Trucs et astuces : Trouverdes traductions de mots-clés http://www.granddictionnaire.com/Grand dictionnaire terminologiqueDédié aux sciences et techniquesBilingue : français/anglaisDéfinitions précisesSynonymes et expressions dérivéesFacile à utiliserGratuit
  43. 43. Trucs et astuces : Trouverdes traductions de mots-clés Le dictionnaire TermSciences du CNRS http://www.termsciences.fr/ Portail Terminologique de santé : http://pts.chu-rouen.fr/ (traduction en français des mots-clés MeSH)
  44. 44. Trucs et astuces : Equationde rechercheOpérateurs booléens (ou logiques)- pour construire une équation de recherche- fonctionnent selon un ordre de priorité :() : associe deux termes et un opérateurSAME : recherche dans la même phraseNOT : exclusionAND : intersectionOR : union
  45. 45. Trucs et astuces : Equationde rechercheOpérateurs booléens les plus courantsAND : intersectionOR : unionNOT : exclusion
  46. 46. Trucs et astuces : Equationde recherche Troncature ? 1 caractère seulement * 0 ou plusieurs caractères $ 1 ou 0 caractèresGene* >>> Genes, General, GenerationDosto?evsk* >>> Dostoyevsky, Dostoievskii
  47. 47. Trucs et astuces : Equationde rechercheSur Internet :* : troncature« maladie d’Alzheimer » : recherche une expression+Alzheimer -maladie: exclure un mot+Alzheimer +maladie : imposer un mot
  48. 48. Exercices méthodes de larecherche bibliographique
  49. 49. Web of Science
  50. 50. Web of Science Présentation du WoS Recherche, tri par citations, affinage Résultats Liens SFX Analyser les résultats Recherche avancée
  51. 51. Présentation du Web ofScience (WoS) Base de données bibliographique multidisciplinaire qui fait partie du Web of Knowledge Outil payant (éditeur : Thomson Reuters) accessible via un abonnement de lUniversité Non exhaustif, fondé sur la sélection des revues les plus importantes Mesure de l’importance des revues en fonction du nombre de citations des articles
  52. 52. Accès depuis JubilDoctorat/Web of Science
  53. 53. Recherche simple Attention à bien être sur l’onglet « Web of Science » Sélection possible de 15 champs de recherche distincts
  54. 54. Tri par citations Tri par défaut : date de publication. Possibilité de trier par nombre de citations (Times cited)SearchTopic : extracell* ATP + de 10 450 réf.
  55. 55. Affichage et affinage desrésultats (1)* Ajout de mot-clef Possibilité d’afficher le*tri par catégorie résumé de l’articledu WOS*tri par type dedocument*tri par sujet(« Research Areas » + largeque « WoS Categories »)*tri par affiliation *etc.
  56. 56. Affiner les résultats (2) Possibilité d’inclure ou Déroulement des catégories d’exclure les du panneau critères « Refine Results »
  57. 57. Détail d’un résultat Alerte à la citation (nécessité de créer un compte) Références citantes (cet article est cité par…) Références en lien Références citées (cet article cite…) Facteur d’impact
  58. 58. Liens SFX Ce bouton donne accès au résolveur de lien : ouvre une nouvelle fenêtre avec la disponibilité de l’article - en électronique (« Texte intégral ») - sinon, en papier à la BUPMC ou ailleurs via le Sudoc (« Localisations »)
  59. 59. Analyser les résultatsAnalyze results : classer un ensemble de résultats par auteur, institution, sujet,année de publication, titre de revue, type de document, langueCreate Citation report : visualiser les citations et leur distribution dans letemps pour un ensemble de résultats (fonctionnalité inaccessible au-delà de10 000 notices)
  60. 60. Analyze results Paramètres d’analyseInclure/exclureun ensemble derésultats Exporter les données dans un fichier .txt
  61. 61. Create citation report ATTENTION : le Citation Report concerne un ENSEMBLE de résultats et non pas seule référence Lien vers articles citants Moyenne de citation par article Lien vers h-indexRetirer des articles du rapport et l’affiner par date Détails pour chaque article Doctorat/Web of Science Export possible du Citation Report vers Excel
  62. 62. ChampsRecherche avancée indexés et opérateurs Icône d’accès aux index • Advanced search : combiner des requêtes • Search history : - combiner des résultats de recherches - sauvegarder un historique de recherche et créer des alertes courriel/RSS sur des recherches en conservant les critères d’affinage (nécessite la création d’un compte)
  63. 63. Exercices Web of Science
  64. 64. PubMed
  65. 65. PubMed Présentation de PubMed PubMed Jubil MeSH Filtres additionnels Liens SFX Recherche avancée Combiner des recherches
  66. 66. Présentation de PubMed Outil d’accès à la base de données bibliographique MEDLINE (Medical Literature Analysis and Retrieval System Online) Exhaustif en sciences biomédicales Base publique gratuite, gérée et mise à jour par la bibliothèque nationale de médecine des États- Unis (NLM)
  67. 67. PubMed Jubil et SFXPour avoir les liens SFX, il faut se connecter via JubilAccès distant possible, quand on se connecte depuis chez soi ou dans son labo !
  68. 68. Interroger PubMed : utiliser MeSH• Pour avoir des résultats pertinents, rechercher en anglais• Les articles sont indexés avec un système de mots-clefs hiérarchisés : le MeSH• MeSH pour Medical Subject Headings• Intérêts du MeSH : • gère les synonymes (Trisomy 21 = Down Syndrome = Mongolism) • permet de chercher sur le sujet seulement des articles • permet de réaliser des recherches fines, en allant du général au particulier
  69. 69. Qu’est-ce que le MeSH ?● Plus de 26 000 termes, hiérarchisés entreeux, répartis en 16 grandes catégories● Mise à jour annuelle Exemple d’un terme● Traduction française par l’INSERM dans l’arborescence du MeSH (on part du général pour arriver au plus précis) Les catégories MeSH 69
  70. 70. Trouver les mots-clés MeSH enanglais Le Portail terminologique de santé propose la traduction française du vocabulaire MeSH http://pts.chu- rouen.fr/
  71. 71. Trouver les mots-clés MeSH en anglais Mot clé validé en anglais, à utiliser sur PubMed. Définition pour vérifier que c’est le bon mot Synonymes pris en compte avec ce mot-cléAutres propositions demots-clés à partir duterme recherché
  72. 72. Mesh : thème principal, sansexplosion, qualificatifs Trois fonctionnalités pour affiner les recherches liées au MeSH :  Recherche dans les termes qui se trouvent en dessous dans l’arborescence (explosion)  Qualificatifs pour rechercher sur un aspect seulement du mot-clé  Thème principal de l’article et non un thème annexe
  73. 73. L’arborescence Situation du mot dans l’arborescence MeSH : un mot peut être à plusieurs endroits de l’arborescence
  74. 74. Les qualificatifs Qualificatifs applicables au mot pour affiner le champ de la recherche
  75. 75. La recherche par thème principal Possibilité de sélectionner les ressources principales
  76. 76. MeSH sur PubMed Copier le mot clé anglais trouvé sur le PTS Chercher dans le thésaurus MeSH
  77. 77. Ce premier résultat correspond au termeMeSH sur PubMed cherché. On peut faire une recherche générale sur ce terme en cochant la case, puis en cliquant sur « Add to search builder » puis « Search PubMed ». Pour plus d’options, cliquer sur le mot clé.
  78. 78. En cliquant sur le mot clé, on arrive sur sa notice MeSH. On retrouve les qualificatifs… …le thème principal et l’explosion……les synonymes… …et la place dans l’arborescence
  79. 79. Recherche MeSH sur PubMed …puis ajouter à l’équation de recherche en cliquant sur « Add to search builder » puis chercherCocher les options de recherche souhaitées… dans PubMed en cliquant sur « Search PubMed »
  80. 80. Recherche MeSH sur PubMed Rappel de l’équation de recherche
  81. 81. Filtres et filtres additionnelsPossibilité de filtrer les résultats. Attention : lesfiltres restent actifs même si l’on change derecherche, penser à les désactiver
  82. 82. Détail d’un résultat Références de l’article Liens extérieurs, dont résolveur de lien Liens pour rebondir vers d’autres ressources du NCBI Abstract
  83. 83. Recherche avancée Choix du champ de recherche PossibilitéChoix du booléen d’ajouter ou supprimer des lignes
  84. 84. Combiner des recherches Cliquer sur le numéro dans l’historique de recherche pour choisir un booléen et ajouter la recherche au « Search Builder » L’historique de recherche est disponible sur la page de recherche avancée
  85. 85. Exercices PubMed
  86. 86. Auto-évaluation
  87. 87. Enquêtehttp://tinyurl.com/Enquete Master
  88. 88. À bientôt à la bibliothèque ! claire.sonnefraud@upmc.fr

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