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Salmonella
SEROTYPAGE DES SALMONELLA
Historique: en 1880, Eberth découvre l’agent de la fièvre
typhoïde dans des coupes histologiques de ganglions lymphatiques de
malades morts de cette maladie.
Cette bactérie appartient au genre Salmonella
Les salmonelles sont responsables de pathologies sévères
salmonelloses majeures: fièvres typhoïdes et paratyphoïdes
salmonelloses « dites » mineures: gastro-entérites aiguës
d’origine alimentaire (intoxications alimentaires)
Habitat: - présentes dans le tube digestif de l’homme et des animaux.
- sont disséminées dans le milieu extérieur par les excrétas
mais ne se multiplient pas dans les conditions environnementales
ordinaires.
Taxonomie:
le genre Salmonella n’est pas simple
Il y a eu des remaniements permanents
Il ne comportait qu’une seule espèce jusqu’à l’année 2000
S.enterica avec 7 sous-espèces
Taxonomie du genre Salmonella
Le nom d’espèce S.enterica est remplacé par le nom d’espèce
S.choleraesuis
Le genre Salmonella est composé maintenant de 5 espèces
S.choleraesuis constitué de 7 sous espèces
S.choleraesuis subspecies choleraesuis
S.choleraesuis subspecies salamae
S.choleraesuis subspecies arizonae
S.choleraesuis subspecies diarizonae
S.choleraesuis subspecies houtenae
S.choleraesuis subspecies bongori
S.choleraesuis subspecies indica
S.enteritidis
S.paratyphi
S.typhi
S.typhimurium
Morphologie
- Bacilles Gram-
- Mobiles par ciliature péritriche (sauf un sérotype), non sporulés
Culture
- Facile sur milieux ordinaires (18 à 24 h)
- Bactéries aéro-anaérobies
- Intérêt des milieux sélectifs pour l’isolement à partir des
prélévements pathologiques polymicrobiens (selles):
milieu SS (salmonelles-shigelles)
milieu Hektoen
Caractères biochimiques
- Permettent l'identification de l'espèce S. enterica
Glucose +, lactose -, uréase -
Aspect de Salmonella Typhimurium au
gram
Aspect de Salmonella Typhimurium en microscopie
électronique
Les antigènes
Antigènes
Caractères antigéniques
Caractères bactériologiques
Caractères antigéniques
Servent à déterminer la formule antigénique sérovar
AgO : facteurs numérotés de 1 à 67
certains facteurs spécifiques de groupes
facteur 2 pour le groupe A
facteur 4 pour le groupe B
facteur 9 pour le groupe D
Ag Vi : Ag d’enveloppe qui peut masquer Ag O
n’est présent que chez S.typhi, S.paratyphi C et S.dublin
Ag Vi est détruit par chauffage à 100°C
Caractères bactériologiques (suite)
Ag H: Ag flagellaire (salmonelles mobiles)
Les salmonelles d’un même sérovar possédent généralement un Ag
H sous 2 phases (phases 1 et 2)
H1 H2
Ces 2 phases peuvent ne pas s’exprimer simultanément.
Ex: S.typhimurium
facteur H1: i et facteur H2: 1,2
On caractérise la première phase soit H1 ou H2
Pour caractériser la phase qui n’est pas exprimée, on réalise
l’inversion de phase
Détermination du sérotype
Goutte de sérum
Un échantillon de colonie
agglutination
Sérums O polyvalents : OMA A,B,D,E,L
OMB C,F,H,G
Sérums « monovalents »: B 4,5 C 6,7 D 9 A 2
Sérums H polyvalents ex HMA a +b+c+d+i+z10+z29
Sérums monovalents ex: i
Schéma du sérotypage des salmonella
fréquence des sérotypes rencontrés en France
O H1 H2
S.typhimurium : 4,5 i, 1,2 (groupe B)
S.enteritidis : 9 g,m (groupe D)
S.virchow : 6,7 r, 1,2 (groupe C1)
S.newport : 6,8 e,h 1,2 (groupe C2)
S.infantis: 6,7 r, 1,5 (groupe C1)
S.bovismorbificans 6,8 r, 1,5 (groupe C2)
S.typhi *: 9, d (groupe D)
S.dublin* : 9, g p (groupe D)
* Recherche de l’antigène Vi
SÉROTYPAGE DES SHIGELLA
1. QUAND LE PRATIQUER?
Un sérotypage est effectué systématiquement, pour toute souche présentant les
caractères biochimiques du genre Shigella.
2. EN QUOI CONSISTE-T-IL?
Le sérotypage des Shigella consiste à identifier les antigènes O de ces bactéries
(absence d'antigènes H chez ces bactéries qui sont immobiles), afin de déterminer
précisément l'espèce (voire le sérotype), grâce à des réactionsd'agglutination
active directe sur lame.
3. COMMENT LE PRATIQUER?
Le sérotypage des Shigella est réalisé grâce à une technique d'agglutination
active directe sur lame, mettant en jeu les bactéries à tester avec différents anti-
sérums. Il nécessite:
•Une culture pure de la souche de Shigella sur gélose non sélective
•Des anti-sérums spécifiques obtenus par immunisation d'animaux
•Un tableau simplifié des caractères biochimiques des espèces.
Antisérums
Caractères biochimiques
ONPG indole mannitol ODC
S. dysenteriae
Sous-groupe A
10 sérotypes
Sérum polyvalent A1 : sérotypes 1, 3, 4, 5, 6
Sérum polyvalent A2 : sérotypes 2, 7, 8
Sérum monovalent anti-Shiga : sérotype 1
- ou +
-
+
-
+
-
-
S. flexneri
Sous-groupe B
6 sérotypes
Sérum polyvalent B : sérotypes 1, 2, 3, 4, 5, 6 - d +
S. boydii
Sous-groupe C
15 sérotypes
Sérum polyvalent C1 : sérotypes 1, 2, 3, 4
Sérum polyvalent C2 : sérotypes 8, 10, 14
Sérum polyvalent C3 : sérotypes 5, 7, 9, 11, 15
-
-
- (sauf
sérotype
9)
-
-
+
+
S. sonnei
Sous-groupe D
1 sérotype
Sérum mixte D d - +
Technique
- Déposer une goutte d'antisérum sur une plaque ou lame de verre
parfaitement propre
- Emulsionner à la pipette ou avec un agitateur jetable un peu de culture
bactérienne prélevée sur gélose non sélective de façon à obtenir un trouble
homogène dans la goutte
- Agiter la lame par mouvements lents et circulaires
- Observer l'apparition d'agglutinats fins, granulaires et difficiles à dissocier
(s'aider éventuellement d'un fond noir pour une meilleure visualisation des
agglutinats).
Conduite du sérotypage
1ère étape: test en eau physiologique
Tester la souche en eau physiologique.
S'il n'y a pas agglutination, la souche n'est pas auto-agglutinable et on peut poursuivre
le sérotypage.
S'il y a agglutination, la souche est auto-agglutinable. Il faut la repiquer et
recommencer le sérotypage.
2ème étape: test d'un ou plusieurs antisérums
Tester:
En priorité l'antisérum correspondant à l'espèce vers laquelle les caractères
biochimiques ont permis de s'orienter
En l’absence d’orientation, tester les antisérums par ordre de fréquence d'isolement
des espèces deShigella (B puis D puis C puis A).
S'il y a agglutination nette, en moins de 30 secondes, avec un des antisérums, conclure
à l'espèce correspondante.

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  • 2. Historique: en 1880, Eberth découvre l’agent de la fièvre typhoïde dans des coupes histologiques de ganglions lymphatiques de malades morts de cette maladie. Cette bactérie appartient au genre Salmonella Les salmonelles sont responsables de pathologies sévères salmonelloses majeures: fièvres typhoïdes et paratyphoïdes salmonelloses « dites » mineures: gastro-entérites aiguës d’origine alimentaire (intoxications alimentaires) Habitat: - présentes dans le tube digestif de l’homme et des animaux. - sont disséminées dans le milieu extérieur par les excrétas mais ne se multiplient pas dans les conditions environnementales ordinaires.
  • 3. Taxonomie: le genre Salmonella n’est pas simple Il y a eu des remaniements permanents Il ne comportait qu’une seule espèce jusqu’à l’année 2000 S.enterica avec 7 sous-espèces
  • 4. Taxonomie du genre Salmonella Le nom d’espèce S.enterica est remplacé par le nom d’espèce S.choleraesuis Le genre Salmonella est composé maintenant de 5 espèces S.choleraesuis constitué de 7 sous espèces S.choleraesuis subspecies choleraesuis S.choleraesuis subspecies salamae S.choleraesuis subspecies arizonae S.choleraesuis subspecies diarizonae S.choleraesuis subspecies houtenae S.choleraesuis subspecies bongori S.choleraesuis subspecies indica S.enteritidis S.paratyphi S.typhi S.typhimurium
  • 5. Morphologie - Bacilles Gram- - Mobiles par ciliature péritriche (sauf un sérotype), non sporulés Culture - Facile sur milieux ordinaires (18 à 24 h) - Bactéries aéro-anaérobies - Intérêt des milieux sélectifs pour l’isolement à partir des prélévements pathologiques polymicrobiens (selles): milieu SS (salmonelles-shigelles) milieu Hektoen Caractères biochimiques - Permettent l'identification de l'espèce S. enterica Glucose +, lactose -, uréase -
  • 6. Aspect de Salmonella Typhimurium au gram
  • 7. Aspect de Salmonella Typhimurium en microscopie électronique
  • 8.
  • 10. Caractères bactériologiques Caractères antigéniques Servent à déterminer la formule antigénique sérovar AgO : facteurs numérotés de 1 à 67 certains facteurs spécifiques de groupes facteur 2 pour le groupe A facteur 4 pour le groupe B facteur 9 pour le groupe D Ag Vi : Ag d’enveloppe qui peut masquer Ag O n’est présent que chez S.typhi, S.paratyphi C et S.dublin Ag Vi est détruit par chauffage à 100°C
  • 11. Caractères bactériologiques (suite) Ag H: Ag flagellaire (salmonelles mobiles) Les salmonelles d’un même sérovar possédent généralement un Ag H sous 2 phases (phases 1 et 2) H1 H2 Ces 2 phases peuvent ne pas s’exprimer simultanément. Ex: S.typhimurium facteur H1: i et facteur H2: 1,2 On caractérise la première phase soit H1 ou H2 Pour caractériser la phase qui n’est pas exprimée, on réalise l’inversion de phase
  • 12. Détermination du sérotype Goutte de sérum Un échantillon de colonie agglutination Sérums O polyvalents : OMA A,B,D,E,L OMB C,F,H,G Sérums « monovalents »: B 4,5 C 6,7 D 9 A 2 Sérums H polyvalents ex HMA a +b+c+d+i+z10+z29 Sérums monovalents ex: i
  • 13. Schéma du sérotypage des salmonella
  • 14. fréquence des sérotypes rencontrés en France O H1 H2 S.typhimurium : 4,5 i, 1,2 (groupe B) S.enteritidis : 9 g,m (groupe D) S.virchow : 6,7 r, 1,2 (groupe C1) S.newport : 6,8 e,h 1,2 (groupe C2) S.infantis: 6,7 r, 1,5 (groupe C1) S.bovismorbificans 6,8 r, 1,5 (groupe C2) S.typhi *: 9, d (groupe D) S.dublin* : 9, g p (groupe D) * Recherche de l’antigène Vi
  • 16. 1. QUAND LE PRATIQUER? Un sérotypage est effectué systématiquement, pour toute souche présentant les caractères biochimiques du genre Shigella. 2. EN QUOI CONSISTE-T-IL? Le sérotypage des Shigella consiste à identifier les antigènes O de ces bactéries (absence d'antigènes H chez ces bactéries qui sont immobiles), afin de déterminer précisément l'espèce (voire le sérotype), grâce à des réactionsd'agglutination active directe sur lame. 3. COMMENT LE PRATIQUER? Le sérotypage des Shigella est réalisé grâce à une technique d'agglutination active directe sur lame, mettant en jeu les bactéries à tester avec différents anti- sérums. Il nécessite: •Une culture pure de la souche de Shigella sur gélose non sélective •Des anti-sérums spécifiques obtenus par immunisation d'animaux •Un tableau simplifié des caractères biochimiques des espèces.
  • 17. Antisérums Caractères biochimiques ONPG indole mannitol ODC S. dysenteriae Sous-groupe A 10 sérotypes Sérum polyvalent A1 : sérotypes 1, 3, 4, 5, 6 Sérum polyvalent A2 : sérotypes 2, 7, 8 Sérum monovalent anti-Shiga : sérotype 1 - ou + - + - + - - S. flexneri Sous-groupe B 6 sérotypes Sérum polyvalent B : sérotypes 1, 2, 3, 4, 5, 6 - d + S. boydii Sous-groupe C 15 sérotypes Sérum polyvalent C1 : sérotypes 1, 2, 3, 4 Sérum polyvalent C2 : sérotypes 8, 10, 14 Sérum polyvalent C3 : sérotypes 5, 7, 9, 11, 15 - - - (sauf sérotype 9) - - + + S. sonnei Sous-groupe D 1 sérotype Sérum mixte D d - +
  • 18. Technique - Déposer une goutte d'antisérum sur une plaque ou lame de verre parfaitement propre - Emulsionner à la pipette ou avec un agitateur jetable un peu de culture bactérienne prélevée sur gélose non sélective de façon à obtenir un trouble homogène dans la goutte - Agiter la lame par mouvements lents et circulaires - Observer l'apparition d'agglutinats fins, granulaires et difficiles à dissocier (s'aider éventuellement d'un fond noir pour une meilleure visualisation des agglutinats).
  • 19. Conduite du sérotypage 1ère étape: test en eau physiologique Tester la souche en eau physiologique. S'il n'y a pas agglutination, la souche n'est pas auto-agglutinable et on peut poursuivre le sérotypage. S'il y a agglutination, la souche est auto-agglutinable. Il faut la repiquer et recommencer le sérotypage. 2ème étape: test d'un ou plusieurs antisérums Tester: En priorité l'antisérum correspondant à l'espèce vers laquelle les caractères biochimiques ont permis de s'orienter En l’absence d’orientation, tester les antisérums par ordre de fréquence d'isolement des espèces deShigella (B puis D puis C puis A). S'il y a agglutination nette, en moins de 30 secondes, avec un des antisérums, conclure à l'espèce correspondante.