1. ASPECTS GÉNÉTIQUES DE
L’EFFICIENCE ALIMENTAIRE EN
PETITS RUMINANTS
Estimation des paramètres génétiques de
l’efficience alimentaire durant la période de
lactation chez les brebis laitières
Coralie MACHEFERT, Hélène LARROQUE, Christèle ROBERT-GRANIE
coralie.machefert@inrae.fr
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2. Nos travaux s’inscrivent dans les objectifs du WP1 SMARTER
WP1 SMARTER - Nouveaux caractères pour améliorer l’efficience de l’utilisation des ressources alimentaires
Trouver des phénotypes pertinents en lien avec l’efficience alimentaire
Réaliser une analyse génétique de ces critères : héritabilité et corrélations génétiques
avec les caractères de production (peu documenté en ovin laitier)
Les mesurer à grande échelle, en fermes commerciales, dans des milieux diversifiés
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3. Le protocole de phénotypage
✓ 2 campagnes laitières : 2020 + 2021
✓ 15 élevages commerciaux (4 races)
3
➢ Quantité moyenne de fourrages et concentrés distribués au lot
➢ Quantité individuelle de concentrées au DAC
➢ Analyses de fourrage
4. La base de données
4
Données brutes :
Données sélectionnées :
9 549 brebis
69 868 observations
4 586 brebis (48 %)
30 298 observations (43 %)
➢ Dont 1 744 brebis suivies sur les 2 campagnes laitières
✓ Race (Lacaune)
✓ Respect des stades
physiologiques cibles (NEC)
✓ Avoir au moins 2 NEC / 5
✓ Performances laitières
complètes (lait et taux)
Sélection sur :
5. Estimation de l’efficience alimentaire
=
𝑃𝑟𝑜𝑑𝑢𝑖𝑡𝑠
𝑅𝑒𝑠𝑠𝑜𝑢𝑟𝑐𝑒𝑠
Feed conversion ratio (FCR) =
𝑃𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑖𝑜𝑛 𝑙𝑎𝑖𝑡𝑖è𝑟𝑒
𝑄𝑢𝑎𝑛𝑡𝑖𝑡é𝑠 𝑖𝑛𝑔é𝑟é𝑒𝑠
Lactation feed conversion ratio (LFCR)
LFCR > 1 : EFFICIENTE
Méthode 1 : le ratio
6. Estimation de l’efficience alimentaire
Méthode 2 : le REI (residual energy intake)
REI = Consommation ingérée – Consommation prédite
REI
SELON SES PERFORMANCES ZOOTECHNIQUES
Aliments ingérés (UFL/j) = β0 + β1 poids vif + β2 PL + β3 TP + β4 TB + β5 NECΔ + Ɛ
REI < 0 : EFFICIENTE
8. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
8
Critère d’efficience : LFCR
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0.90 ± 0.11 _
Mois 4 0.76 ± 0.13 1 ± 0.06 _
Mois 5 0.58 ± 0.15 0.91 ± 0.09 0.94 ± 0.06 _
Mois 6 0.10 ± 0.19 0.75 ± 0.12 0.66 ± 0.10 0.97 ± 0.07 _
Mois 7 0.46 ± 0.17 0.53 ± 0.14 0.54 ± 0.12 0.67 ± 0.13 0.91 ± 0.08 _
Corrélations élevées entre les mois de lactation successifs
LACAUNE
9. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
9
Critère d’efficience : LFCR
Reclassification des animaux efficients entre le début et la fin de lactation
LACAUNE
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0.90 ± 0.11 _
Mois 4 0.76 ± 0.13 1 ± 0.06 _
Mois 5 0.58 ± 0.15 0.91 ± 0.09 0.94 ± 0.06 _
Mois 6 0.10 ± 0.19 0.75 ± 0.12 0.66 ± 0.10 0.97 ± 0.07 _
Mois 7 0.46 ± 0.17 0.53 ± 0.14 0.54 ± 0.12 0.67 ± 0.13 0.91 ± 0.08 _
10. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
10
Critère d’efficience : LFCR
Changement alimentaire = mise à l’herbe
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0.90 ± 0.11 _
Mois 4 0.76 ± 0.13 1 ± 0.06 _
Mois 5 0.58 ± 0.15 0.91 ± 0.09 0.94 ± 0.06 _
Mois 6 0.10 ± 0.19 0.75 ± 0.12 0.66 ± 0.10 0.97 ± 0.07 _
Mois 7 0.46 ± 0.17 0.53 ± 0.14 0.54 ± 0.12 0.67 ± 0.13 0.91 ± 0.08 _
LACAUNE
11. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
11
Mêmes observations pour les deux critères d’efficience alimentaire
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0,9 _
Mois 4 0,76 1 _
Mois 5 0,58 0,91 0,94 _
Mois 6 0,1 0,75 0,66 0,97 _
Mois 7 0,46 0,53 0,54 0,67 0,91 _
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0,83 _
Mois 4 0,42 0,82 _
Mois 5 0,36 0,61 0,86 _
Mois 6 0,24 0,73 0,59 0,96 _
Mois 7 0,59 0,6 0,67 0,52 0,95 _
Critère d’efficience : LFCR Critère d’efficience : REI
LACAUNE
12. Paramètres génétiques
• Héritabilités sur toute la lactation
12
LACAUNE
Lait TB TP LFCR REI
Lait 0.16 ± 0.02
TB -0.50 ± 0.05 0.36 ± 0.02
TP -0.62 ± 0.05 0.65 ± 0.03 0.43 ± 0.02
LFCR 0.74 ± 0.04 0.11 ± 0.07 -0.18 ± 0.07 0.10 ± 0.01
REI -0.79 ± 0.04 0.46 ± 0.06 0.75 ± 0.04 -0.63 ± 0.06 0.11 ± 0.01
h² type LFCR : 0.16 ± 0.01 (Hurley et al., 2018)
0.20 (Parke et al., 1999)
0.25 ± 0.03 (Manafiazar et al., 2016)
de 0.09 ± 0.03 à 0.11 ± 0.04 (Kock et al., 2018) → Fermes commerciales autrichiennes
h² REI : 0.07 ± 0.02 (Hurley et al., 2018) → Alimentation basée sur le pâturage
h² RFI : de 0.01 ± 0.05 à 0.27 ± 0.12 (Brito et al. 2020)
13. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre caractères sur toute la lactation
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Lait TB TP LFCR REI
Lait 0.16 ± 0.02
TB -0.50 ± 0.05 0.36 ± 0.02
TP -0.62 ± 0.05 0.65 ± 0.03 0.43 ± 0.02
LFCR 0.74 ± 0.04 0.11 ± 0.07 -0.18 ± 0.07 0.10 ± 0.01
REI -0.79 ± 0.04 0.46 ± 0.06 0.75 ± 0.04 -0.63 ± 0.06 0.11 ± 0.01
LACAUNE
Rg lait – type LFCR :
-0.77 ± 0.11 (Manafiazar et al., 2015)
Rg 2 critères d’efficience proches :
-0.69 ± 0.86 (Vallimont et al., 2011)
-0.57 ± 0.22 (Manafiazar et al., 2015)
Rg lait – RFI :
De −0.11 à 0.07 (Veerkamp et al., 1994)
0.07 ± 0.08 (Gonzalez-Recio et al., 2014)
14. Conclusions
• Relation génétique entre l’efficience alimentaire et les spectres moyen infrarouge du lait
• Catégoriser l’efficience alimentaire des animaux au cours de la lactation
• Discriminer les groupes d’animaux efficients par le biais des spectres moyen infrarouge du lait
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Perspectives
• Estimation d’une efficience alimentaire approchée à partir d’un
contexte d’alimentation collective et diversifiée
• Cibler sur les données individuelles d’alimentation et de production
pour étudier des critères fiables
• Forte influence des effets d’environnement
• Héritabilité faible mais non nulle
15. This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Grant Agreement n°772787
www.smarterproject.eu
SMARTER PARTNERS
Remerciements