Atelier Pubmed Décembre 2012

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Atelier sur Pubmed à destination d'internes en médecine, décembre 2012

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Atelier Pubmed Décembre 2012

  1. 1. Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBOBU Santé Medline via l’interface Pubmed Décembre 2012 Décembre 2012 1
  2. 2. Objectifs de la séance Connaître les principes de constitution de la base Medline Se repérer dans Pubmed Savoir effectuer une requête pertinente dans la base Savoir mettre en place des alertes sur un thème
  3. 3. Medline, quelques principesSpots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA
  4. 4. Ne pas confondre Medline ≠ Pubmed Le contenu Linterface(la base de données) dinterrogation
  5. 5. Bases de données  Un éditeur privé ou un organisme institutionnel  Un référencement humain  Un thésaurus organisé  Une interface dinterrogation
  6. 6. Medline Qui? National Library of Medicine Etats-Unis) 20 M de références Quoi? darticles biomédicaux, issues de 5200 périodiques depuis 1948 Thésaurus MESH Interface PUBMED (il en existe dautres)
  7. 7. Pubmed, quelques repères (interface web)Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY
  8. 8. Vos premiers pas dans Pubmed Recherche libre sur la grippe H1N1 chez les femmes enceintes http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
  9. 9. Présentation de la liste desrésultats
  10. 10. Quelques filtres Triez vos résultats pour nafficher que les articles écrits en anglais ou en français Précisez votre recherche en ne sélectionnant que les revues de la littérature
  11. 11. Types darticles : rappel Case report / étude de cas Clinical Trial / essai clinique Randomized Controlled Trial / essai clinique en aveugle avec groupe contrôle Practice guideline / recommandation de bonne pratique Review / revue de la littérature Systematic Review / revue systématique Meta-analysis / méta-analyse (Cochrane)
  12. 12. Pour des recherches fines : le MeshNeedle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC
  13. 13. Sil te plaît, dessine-moi... Vocabulaire normalisé Descripteurs Hiérarchie...un thésaurus
  14. 14. Plusieurs synonymes, un seul descripteur officielSyndrome, DownDowns SyndromeDowns SyndromeSyndrome, DownsMongolism Down SyndromeTrisomy 21Trisomy 21, Meiotic NondisjunctionTrisomy 21, Mitotic NondisjunctionDown Syndrome, Partial Trisomy 21Partial Trisomy 21 Down Syndrome
  15. 15. Le thésaurus de Medline : le MeSHMedical Subject Headings Mots-clefs uniquement en anglaishttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
  16. 16. Le MESH Descripteurs (>25 000) Qualificatifs (83) « Laffiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de linterrogation de Medline »**(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)
  17. 17. Les opérateurs booléens.
  18. 18. Recherche libre vs. Équation de recherche Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques multiple Multiple sclerosis Sclerosis/etiology"[Mesh] environmental AND factors environment[Mesh]1213 résultats – pas 378 résultats pertinents tous pertinents
  19. 19. Un exemple de recherche Articles en français et en anglais sur letoucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années
  20. 20. Un exemple de recherche Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant- soigné publiés les 10 dernières années"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh]+ Filters : English, French, published in the last 10 years
  21. 21. Correspondances Mesh français – Mesh anglais => « Mesh bilingue  de l’INSERM » : http://mesh.inserm.fr/mesh/ ou => « Portail terminologique de santé »(CISMEF) http://pts.chu-rouen.fr/
  22. 22. Bref « Une recherche bibliographique ne se fait pas dans les couloirs de l’hôpital ou entre 2 stations de métro avec sonsmartphone ou sa tablette. » Philippe Eveillard Love & Mathematics – Lost Archetype – CC BY-NC-SA sur Flickr
  23. 23. Exercices1- Rechercher les affiliationsdescripteurs/qualificatifs correspondant : à la chirurgie de l’ostéochondritede hanche à l’épidémiologie de la maladiede Crohn
  24. 24. Réponses1- Rechercher les affiliationsdescripteurs/qualificatifs correspondant : à la chirurgie de l’ostéochondrite de hanche"Legg-Calve-Perthes Disease/surgery"[Mesh] à l’épidémiologie de la maladie de Crohn"Crohn Disease/epidemiology"[Mesh]
  25. 25. 3 façons dentrer unerequête dans Pubmed1)À partir dun mots-clef MESH ( boîtedéquation de recherche et rebond)
  26. 26. 3 façons dentrer unerequête dans Pubmed 2) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced »)
  27. 27. 3 façons dentrer unerequête dans Pubmed 3) Directement dans la barre de recherche simple
  28. 28. La veille dans Pubmed : services personnalisésLow-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr
  29. 29. My NCBI : votre Pubmedpersonnalisé Ouvrir un compte sur My NCBI  « Sign in »  « Register for an account »
  30. 30. Paramétrer dans votrecompte les filtres suivants  Anglais  Français  Texte intégral gratuit  BU Santé Brest
  31. 31. Filtre « BU Santé Brest »
  32. 32. Icône UBO pour laccèsdirect au texte intégral
  33. 33. Exercice 2 - Saignement de nez et hypertension Recherche de références à partir des mots MESH et sauvegarder des références dans MY NCBI
  34. 34. Exercice3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu.Exclure les traitements médicamenteux et lachirurgie.Limiter aux recommandations de bonne pratiquepubliées ces deux dernières années
  35. 35. Exercice3-("Acute CoronarySyndrome/therapy"[Mesh])NOT( "AcuteCoronary Syndrome/drugtherapy"[Mesh] OR "AcuteCoronary Syndrome/surgery"[Mesh] )
  36. 36. Du problème de la veilleéquation de recherche ≠ équation de veille
  37. 37. Des mots MESH ?. Ne contient pas de mots MESH Contient des mots MESH
  38. 38. Exercice 4 - Trouvez les articles les plus récents sur le diagnostic de la mucoviscidose (sans utiliser les mots Mesh)
  39. 39. Solution : le champ Title/abstract ou [tiab] Équation de recherche « cystic (pour des résultats les plus fibrosis/diagnosis »[Mesh] pertinents possibles) (« cystic fibrosis »[tiab] OR Équation de veille « mucoviscidosis »[tiab]OR (pour des articles récents / pas« fibrocystic disease »[tiab]) forcément aussi pertinents) AND diagnos*[tiab]
  40. 40. Créer une alerte dans MyNCBI
  41. 41. Retrouvez le support enligne sur http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine
  42. 42. Ateliers BU Santé 2013 Inscription libre sur http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine autres ressources en Santé (parce quil ny a pas que Pubmed dans la vie...) mercredi 16 et 23 janvier 2013  Sudoc  Cochrane Library  Pascal  BDSP  Cismef  EM-Premium Zotero les mercredi 30 janvier, 13 et 20 février 2013

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