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1. iSAGE project has received funding from the European Union’s Horizon 2020
research and innovation programme under grant agreement No 679302.
Hélène Larroque, Dominique Hazard et al. (INRAE GenPhySE)
Eliel González-García, Philippe Hassoun el al. (INRAE SELMET)
Journée de restitution nationale
Mardi 4 février 2020
Maison du Lait - 42 rue de Châteaudun, Paris
Physiologie et génétique de la dynamique
des réserves corporelles chez les ovins
Tâches 5.1 & 5.2 : Caractérisation & analyse génétique de nouveaux
caractères pour améliorer la résilience/adaptation

2. .02
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Dynamique des réserves corporelles – Pourquoi ?
Objectif en
élevage :
Hypothèse = Animaux mieux adaptés ou plus résilients présenteraient une meilleure gestion
de leurs réserves corporelles
Rapport = ressources
disponibles / besoins
(entretien & production)
Adaptation des
animaux aux
conditions
environnementales
et réponses aux
challenges
Mécanisme clé
Fonctions biologiques:
- reproduction
- production
- comportement,
santé…
Utilisation
/dépôt des
réserves
corporelles au
cours du
temps:
Contribution des éleveurs
dans la gestion de ce rapport
Contribution des animaux
dans la gestion de ce rapport

3. .03
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Ovins allaitants : Romane
Domaine expérimental de La Fage
(INRAE, Roquefort sur Soulzon, sud de France)
Les unités expérimentales :
 Exclusivement à l’extérieur
 1 mise-bas/an (Avril)
 Environnent difficile: fortes variations
saisonnières (qualité & quantité des fourrages)
 Niveau faible d’intrants (1 brebis/ha)
Domaine expérimental de La Sapinière
(INRAE, Bourges, centre de France)
Ovins allaitants : Romane Ovins laitiers : Lacaune
Système intensif Système extensif Système semi-intensif
 Exclusivement en bergerie
 Niveau élevé d’intrants
 1ère & 2nde lutte = 10 & 18
mois d'âge
 Bergerie et extérieur
 1 mise-bas /an
(déc. ou janv.)
 Pâturage (6 mois : avril à
octobre)

4. .04
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Ovins allaitants : Romane
Les phénotypes
Phénotypes :
 Réserves corporelles (RC): Note d’état corporel, Poids vif,
métabolites et hormones clés associés au métabolisme
des lipides
 Suivis longitudinaux (3 à 8 points / 1 à 3 cycles de
production): lutte, début gestation (2 mois), fin gestation
(2 semaines avant mise-bas), allaitement (3 semaines
après mise-bas), lactation(OL), sevrage
Ovins allaitants : Romane Ovins laitiers : Lacaune
Système intensif Système extensif Système semi-intensif
N=~120 primi- &
multipares
N=180 primi- & multipares
N=250 multipares
N~220 primipares
N~250 multipares
Objectif: caractériser de nouveaux phénotypes des RC et analyser
leur déterminisme génétique
Génotypes :
Puces 15K and 50K SNP

5. .05
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
 Note d’état corporel :
 grille originale décrite par Russel et al. (1969)
 Echelle de 1 à 5 (unité = 0.25 or 0.1)
 Métabolites et hormones clés associés au métabolisme des lipides :
 Prélèvements sanguins (plasma)
 Acides gras non estérifiés (AGNE) : produits par le tissue adipeux pendant la
mobilisation des RC
 Béta-hydroxybutyrate (BOHB) : produit par le foie lors de l’utilisation des
acides gras pour la production d’énergie
 Triiodothyronine (T3) : hormone thyroïdienne produite pour
activer la lipolyse
Les phénotypes

6. .06
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Dynamique des réserves corporelles
Élevage en bergerie
Romane
LSMEANS
2
2.2
2.4
2.6
2.8
3
3.2
3.4
3.6
3.8
4
40
50
60
70
80
90
100
Lutte Début
Gest.
Fin Gest. Allait. Sevrage Lutte
NEC
Poidsvif(kg)
PV Prim. PV Mult. NEC Prim. NEC Mult.
dépôtmobilisation ???dépôt
 Alternance de phases de dépôt et de mobilisation des
réserves au cours d’une campagne

7. .07
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Biomarqueurs des réserves corporelles
Primipares
Élevage en bergerie
Romane
2
3
4
L DG FG A S L
BCS
??
1
2
Baisse lipolyse
Augmentation lipolyse
10
20
30
40
0.3
0.5
0.7
0.9
BOHB(mg/L)
AGNE(mmol/L)
LSMEANS
DG FG A S L
1 2
0.9
1
1.1
1.2
1.3
1.4
1.5
T3(ng/ml)
DG FG A S

8. .08
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Romane
Élevage extensif
2
2.25
2.5
2.75
3
30
35
40
45
50
55
60
65
70
Lutte Debut
Gest.
Fin Gest. Allait. Sevrage Lutte
NEC
PV(kg)
PV Prim. PV Mult. NEC Prim. NEC Mult.
LSMEANS
MobilisationDépôt Dépôt
Dynamique des réserves corporelles

9. .09
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Romane
Élevage extensif
0
10
20
30
40
50
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1
L DG FG A S L
BOHB(mg/L)
AGNE(mmol/L)
LSMEANS
0.6
0.85
1.1
1.35
1.6
L DG FG A S L
T3(ng/ml)
Biomarqueurs des réserves corporelles
Primi
Multi

10. .010
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Dynamique des réserves corporelles
Élevage semi-intensif
LSMEANS
Lacaune
Mise-Bas Sevrage

11. .011
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Mise-Bas Sevrage
Lacaune
(sous groupe n=45)
Dynamique des réserves corporelles
Élevage semi-intensif
LSMEANS
-15j Lutte-15j
Mise-Bas
-7j Sevrage

12. .012
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Niveaux versus variations d’état corporel
Élevage extensif
Romane
 Variabilité inter-individuelle du niveau et de la forme
des trajectoires de RC
(Macé et al, Animal, 2018)
 Brebis multipares (n~500, données historiques)
 2nde mise-bas
 âge = 2 ou 3 ans (2,5 ans / cluster)
 Taille portée = 2 agneaux (gestation & allaitement)
 Trois grands groupes de
brebis qui diffèrent par leur
trajectoire des RC
NEC
Cluster %
Bleu 65.8
Rouge 20.7
Vert 13.5
Lutte Gestation Mise-
bas
Allait. Sevrage Lutte

13. .013
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
Lutte Début
Gest.
Fin Gest. Allait. Sevrage
Héritabilité
PV NEC
Niveaux des RC: paramètres génétiques
 Niveaux d’état corporel sont héritables.
PV
NEC NS to 0.32 (±0.13)
 Niveau d’état
corporel peu lié au
poids vif.
Corrélations génétiques:
PV sevrage
NEC
Allait.
0.50 (±0.10)
Romane

14. .014
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
0
0.05
0.1
0.15
0.2
0.25
0.3
0.35
0.4
0.45
0.5
Mise Bas Sevrage Lutte
Héritabilité
Poids NEC
 Poids et NEC sont des caractères héritables
Poids
NEC 0 to 0.23 (±0.13)
 NEC peu ou pas
liée au poids
Corrélations génétiques:
Lacaune
Niveaux des RC: paramètres génétiques

15. .015
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
0
0.05
0.1
0.15
0.2
Perte : fin
gest. à sev.
Gain : sev. à
lutte
Héritabilité
PV NEC
Variations des RC : paramètres génétiques
 Les variations d’état corporel sont faiblement
héritables
0
0.05
0.1
0.15
0.2
Fin Gest. à
sevrage
Sevrage à
lutte
Héritabilité
PV NEC
Romane Lacaune

16. .016
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Variations des RC : paramètres génétiques
-0.8
-0.6
-0.4
-0.2
0
Corrélationgénétique
PV BCS
 La perte et le gain d’état
corporel sont génétiquement
liés en ovin allaitant
Romane Lacaune
 Pas de corrélation génétique
significative entre les variations
d’état corporel en ovins laitiers
PV écart
Mise-
bas/sevrage
PV écart
sevrage/lut
te
NEC écart
mise-bas/sevrage
0.9 (±0.31)
NEC écart
sevrage/lutte
0.65 (±0.14)


17. .017
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
Fin Gest. Allait. Lutte
Héritabilité
AGNE β-OHB T3
Niveaux des biomarqueurs des RC: paramètres génétiques
 Les niveaux des biomarqueurs des RC sont
héritables
Romane Lacaune
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
Fin Gest. Sevrage Lutte
Héritabilité
AGNE β-OHB

18. .018
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
 Variations temporelles des biomarqueurs des RC
sont faiblement héritables
Romane Lacaune
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
Perte : Fin
Gest. à sevrage
Sevrage à
Lutte
Héritabilité
AGNE β-OHB
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
Perte :
Fin Gest. à
Allait.
Gain :
Allait. à Lutte
Héritabilté
AGNE β-OHB T3
???
Variations des biomarqueurs des RC: paramètres génétiques

19. .019
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Réserves corporelles et production :
 Niveaux de production supérieurs
sont associés à un niveau de RC plus
faible (à la lutte) et des pertes
supérieures de RC pendant la gestation
et l’allaitement en OA.
Romane Lacaune
Lait
NEC lutte -0.4 à -0.6
(±0,13)
NEC  -0.45 (±0,30) (faibles effectifs)
Niveaux de production supérieurs
sont associés à:
 des niveaux inférieurs de RC
à la lutte
 des pertes de RC
supérieures au sevrage
(premiers résultats)
Poids
naissance
(portée ou
agneau)
Croissance
ou poids
sevrage
NEC NS à -0.3
(±0,10)
NS à -0.35
(±0,10)
NEC  -0.40 (±0,10) NS
NEC 
(Début Gest.)
0.34 (±0,16) NS
Corrélations génétiques :Corrélations génétiques :

20. .020
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Analyses génomiques en Romane et en Lacaune
: exemple en Romane
 Plusieurs régions génomiques associées aux RC.
Exemple : Deux régions associées à l’état corporel sur les
chromosomes 1 et 12.
Caract. Chr. Pos. Mb Gènes
NEC
Lutte/Gestati
on/Allaitemen
t/Sevrage
1 44.73 DIRAS3…
1 208.81 NAP1L1…
12 19.22 LYPLAL1, TGFB2…
DIRAeS3, GTP-binding protein Di-Ras3 ; NAP1L1, Nucleosome
Assembly Protein 1 Like 1 ; LYPLAL1, lysophospholipase-like 1;
TGFB2, Transforming growth factor-beta 2.
Fonctions biologiques: composition
corporelle, rapport tissue adipeux sous-cutané
/viscéral, régulation adipogénèse.

21. .021
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Conclusions
 Suivi de la dynamique des réserves corporelles :
 Note d’état corporel (et poids vif)
 Biomarqueurs métaboliques
 Dynamique des réserves corporelles :
 Alternance de phases d’utilisation et de dépôt des réserves au cours d’un
cycle de production
 Influencée par les facteurs physiologiques et environnementaux
 Niveaux et variations des réserves corporelles :
 caractères héritables (héritabilités faibles à modérées)
 Associés à quelques régions génomiques
 Sélection génétique des ovins pour la dynamique des réserves corporelles est
envisageable pour améliorer leur résilience
à mettre en relation avec d’autres fonctions: reproduction, résistance maladies…

22. .022
04/ 02/ 2020iSAGE – Restitution Nationale, Paris, 4 février 2020
Photos : INRAE C. Maître
Merci pour votre attention
Remerciements
Eliel GONZALEZ-GARCIA, Philippe HASSOUN, Anne TESNIERE, Tiphaine MACÉ, Sara PARISOT,
Charlotte ALLAIN, Sébastien DOULS, Christian DURAND, Julien PRADEL, David PORTES, Regis
THOMAS, Gaétan BONNAFE, Valentin COULON, Sébastien ARLES, Fabrice ROSE, Jean-Marie
MENRAS, Dominique FRANCOIS, Frédéric BOUVIER, Didier MARCON, et al.