Les suivis de cohorteLes suivis de cohortedans ldans l’é’étude du paludisme:tude du paludisme:Laurence Marrama Rakotoarivo...
Place des suivis de cohorte dansles études épidémiologiquesLes études épidémiologiquesParticularités de l’étude dupaludism...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (1/13)miologiques (1/13)rechercher une ASSOCIATION entreune EXPOSITION (agent ét...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (2/13)miologiques (2/13)ClassificationÀ visée descriptive / explicativeLongitudi...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (3/13)miologiques (3/13)Types d’étudeTransversaleCohorteCas-témoin
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (4/13)miologiques (4/13)ExempleOn veut étudier la drépanocytose chez les enfants...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (5/13)miologiques (5/13)CaractéristiquesPlace dans les classificationsCritère d’...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (6/13)miologiques (6/13)Desc/explic Long/transvCas-témoinCohorteTransversaleObs/...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (7/13)miologiques (7/13)Inclusion OutputCas-témoinCohorteTransversaleType d’étud...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (8/13)miologiques (8/13)Nb exposition Nb maladiesCas-témoinCohorteTransversaleTy...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (9/13)miologiques (9/13)Paramètres mesurablesCas-témoinCohorteTransversaleType d...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (10/13)miologiques (10/13)Avantages InconvénientsCas-témoinCohorteTransversaleTy...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (11/13)miologiques (11/13)Intérêt ExemplesCas-témoinCohorteTransversaleType d’ét...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (12/13)miologiques (12/13)TransversaleCohorteExposition MaladieCas-témoinSchémat...
LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (13/13)miologiques (13/13)ExempleOn veut étudier la drépanocytose chez les enfan...
ParticularitParticularitéés de ls de l’é’étude du paludisme (1/5)tude du paludisme (1/5)Maladie à durée d’incubation « moy...
DélaiPhases (durée)IndividuIntroduction d’1vecteur infectéIntroduction d’1sujet infectéIntroduction d’1sujet infectéDélais...
ParticularitParticularitéés de ls de l’é’étude du paludisme (3/5)tude du paludisme (3/5)Maladie à durée d’incubation « moy...
1. Séparation importante ds le temps: exposition – maladie2. Exposition qui fluctue dans le temps3. Pas de marqueur/confir...
Effet limitant sur les étudesM pas marqueur nbreM plusieurs épisodesE pas marqueur indivE variableTransversale CohorteSépa...
Exemples comparés de suivi de cohorte: Dielmo & Ndiop et Gouye KoulyObjectifsPrincipe généralEquipes pluridisciplinairesPa...
Exemples comparés de suivi de cohorte: Dielmo & Ndiop et Gouye KoulyMise en placeSituation géographiqueProtocolePersonnelB...
Exemples comparés de suivi de cohorte: Dielmo & Ndiop et Gouye KoulyRésultats: données du suivi de baseRésultats: définiti...
Objectifs des suivis de cohorte (1/2)Objectifs des suivis de cohorte (1/2)Etudier, en zone d’endémie palustre, les interac...
Objectifs des suivis de cohorte (2/2)Objectifs des suivis de cohorte (2/2)Etudier, en zone de transmission saisonnière du ...
Principe gPrincipe géénnééral des suivis de cohorteral des suivis de cohorteDielmo, Ndiop, Gouye KoulySur la base d’un sui...
Equipe pluridisciplinairesEquipe pluridisciplinairesClinCliniqueMorbidité / mortalitéImmunOImmunoInfection palustreParasit...
Mise en place des suivis de cohorte (1/5)Mise en place des suivis de cohorte (1/5)DielmoNdiopMis en place en 1990 (IPD, IR...
Mis en place en 2004 - 2006Transmission strictement saisonnière démarrage de la transmissionContexte ruralProximité de Dak...
Gouye Kouly : Rayon de 30 km / ThièsMise en place des suivis de cohorte (3/5)Mise en place des suivis de cohorte (3/5)
Gouye Kouly : Cartographie centres santéMise en place des suivis de cohorte (4/5)Mise en place des suivis de cohorte (4/5)
Gouye Kouly : caractéristiques villagesBokrKabaGouye KoulyMise en place des suivis de cohorte (5/5)Mise en place des suivi...
15°14°13°16° NDAKAR17° W 16° 15° 14° 13° 12°DielmoNdiopGouye KoulyZone sahélienneZone sahélo-soudanienneZone soudano-guiné...
Protocoles de suivi des cohortes (1/5)Protocoles de suivi des cohortes (1/5)1 dispensaire (24/24h ; 7/7j) : passif1-3 visi...
1 fiche de consultation1 goutte épaisse pour diagnostic (+ 2 GE référence)1 traitement sous contrôle médical1 prélèvement ...
1 case de santé (dans le village) : passif1-3 visites/j dans concession (absence, santé) : actifCaptures entomologiques me...
Remplissage du registre de la case de santé1 fiche d’épisode pathologique1 goutte épaisse pour diagnostic (+ 1 GE référenc...
Gouye Kouly1 traitement (recom. nationales) sous contrôle médicalSuivi de tolérance : vomissement, prurit (3j)1 sous-cohor...
Personnel assurant le suivi (1/2)Personnel assurant le suivi (1/2)Dielmo & Ndiop4 médecins2 infirmiers7 enquêteurs1 techni...
Personnel assurant le suivi (2/2)Personnel assurant le suivi (2/2)Dielmo & Ndiop1 technicien entomologiste2 techniciens le...
Base de donnBase de donnéées, extraction donnes, extraction donnééeses####################################################...
Base de donnBase de donnéées, extraction donnes, extraction donnééesesProcédure Ronald suivi AP pour lire le fichier épiso...
10 - 60100 - 300Nb de piqûres infectées/anSaisonnalitéPérenneTransmission~ 450~ 350PopulationNdiopDielmoRRéésultats: donns...
Ndiop050100150200mai-94 mai-95 mai-96 mai-97 mai-98Dielmo020406080mai-94 mai-95 mai-96 mai-97 mai-98AccèsPalustresmensuels...
1 – 1,75Nb de piqûres infectéesSaisonnièreTransmission~ 500PopulationrésultatsGouye KoulyRRéésultats: donnsultats: donnéée...
RRéésultats: donnsultats: donnéées du suivi de base (4/4)es du suivi de base (4/4)Incidence des épisodes cliniques à Gouye...
Seuil parasitologique pyrogénique00,511,522,531 11 21 31 41 51 61 71 81 91 101Age en anneesTropho/leuco00,10,20,30,40,5%GR...
Principaux autres rPrincipaux autres réésultats obtenussultats obtenus (1/6)(1/6)-Nombre d’accès palustre au cours de la v...
Multiplication du risque daccès palustrependant et après la grossesse à Dielmo012345678910An -1 1er trim. 2ème trim 3ème t...
Principaux autres rPrincipaux autres réésultats obtenus (3/6)sultats obtenus (3/6)
Pas Vomissement (Vom)125 p71%Vom50 p29%Pas Vom41%Avant TTT (<30%)Pendant TTT (46%)Vom ≥ 130%Pas Vom13%Vom ≥116%Malgré un T...
● Souches (Dielmo):● Chez un même individu les accès sont déclenchés par des souchesgénétiquement ≠ au cours du temps● Les...
● Validation de candidats-vaccin: MSP1p19, MSP4, MSP5● Test fonctionnels d’activité des Ac pour essais vaccinauxInhibition...
Discussion: avantagesDiscussion: avantages ☺☺, contraintes, contraintes& limites& limites des suivis de cohorte (1/4)des s...
Intensité du suivi☺ Précision des données☺ Puissance des études / Sensibilité de la détection☺ Etude de générations fictiv...
Longueur du suivi☺ Masses de données☺ Comparaison dans le temps☺ Sujet = son propre témoinBases de données difficiles à gé...
Sous-protocoles☺ Données complémentaires, précision☺ Faible surcoût, faible surcharge☺ Elargissement à d’autres maladiesCo...
Equipes impliquEquipes impliquééesesDielmo & NdiopIPD: C. Rogier, A. Spiegel, A. Tall, F. Diene-Sarr,A.B. Ly, L. Marrama, ...
Equipes impliquEquipes impliquééeses
Prochain SlideShare
Chargement dans…5
×

Les suivis de cohorte dans l’étude du paludisme : place dans les études épidémiologiques et exemples comparés

598 vues

Publié le

Les suivis de cohorte dans l’étude du paludisme : place dans les études épidémiologiques et exemples comparés - Conférence de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Laurence MARRAMA - Institut Pasteur de Guadeloupe - lmarrama@pasteur-guadeloupe.fr

Publié dans : Santé & Médecine
0 commentaire
0 j’aime
Statistiques
Remarques
  • Soyez le premier à commenter

  • Soyez le premier à aimer ceci

Aucun téléchargement
Vues
Nombre de vues
598
Sur SlideShare
0
Issues des intégrations
0
Intégrations
2
Actions
Partages
0
Téléchargements
6
Commentaires
0
J’aime
0
Intégrations 0
Aucune incorporation

Aucune remarque pour cette diapositive

Les suivis de cohorte dans l’étude du paludisme : place dans les études épidémiologiques et exemples comparés

  1. 1. Les suivis de cohorteLes suivis de cohortedans ldans l’é’étude du paludisme:tude du paludisme:Laurence Marrama RakotoarivonyUnité des Maladies EmergentesInstitut Pasteur de GuadeloupeAtelier Paludisme ---- Institut Pasteur de Madagascar ---- 19 février au 31 mars 2007Place dans lesPlace dans les éétudestudes éépidpidéémiologiquesmiologiquesExemples comparExemples comparééss
  2. 2. Place des suivis de cohorte dansles études épidémiologiquesLes études épidémiologiquesParticularités de l’étude dupaludismePartie I
  3. 3. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (1/13)miologiques (1/13)rechercher une ASSOCIATION entreune EXPOSITION (agent étiologique oufacteur de risque/protecteur)et une MALADIE (ou infection)Objectif
  4. 4. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (2/13)miologiques (2/13)ClassificationÀ visée descriptive / explicativeLongitudinales / transversalesD’observation / expérimentaleEvaluation (représentativité +) <> Mécanisme (représentativité -)Film <> photographieContrôle exposition - <> Contrôle exposition +
  5. 5. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (3/13)miologiques (3/13)Types d’étudeTransversaleCohorteCas-témoin
  6. 6. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (4/13)miologiques (4/13)ExempleOn veut étudier la drépanocytose chez les enfants dans une population X:distribution, facteurs de risques et complications qu’elle entraîne.On réalise les études suivantes:A. Détection de la drépanocytose à la naissance et examen clinique etbiologique annuel chez les enfants détectésB. Détection de la drépanocytose chaque année dans une classe deprimaire et examen médicalC. Détection de la drépanocytose chez des enfants présentant unedyspnée d’effort
  7. 7. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (5/13)miologiques (5/13)CaractéristiquesPlace dans les classificationsCritère d’inclusion & output recherchéNb de facteurs d’exposition et de maladies étudiésParamètres mesurablesAvantages & inconvénientsPrincipal intérêt et exemplesSchématisation
  8. 8. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (6/13)miologiques (6/13)Desc/explic Long/transvCas-témoinCohorteTransversaleObs/experType d’étudeDesc/explicDesc/explicExplicativeTransversaleLongitudinaleLongitudinaleObservationObs/experObservation
  9. 9. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (7/13)miologiques (7/13)Inclusion OutputCas-témoinCohorteTransversaleType d’étudeAucun statutExposé (O/N)Malade (O/N)Malade (O/N)Exposé (O/N)Exposé & malade
  10. 10. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (8/13)miologiques (8/13)Nb exposition Nb maladiesCas-témoinCohorteTransversaleType d’étudePlusieurs1 (+/- plusieurs)PlusieursPlusieursPlusieurs1
  11. 11. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (9/13)miologiques (9/13)Paramètres mesurablesCas-témoinCohorteTransversaleType d’étudeFréquence d’expositionPrévalence (« fréquence de maladie »)PrévalenceTaux d’incidence (« débit de maladie »)DélaiFréquence d’expositionDélai
  12. 12. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (10/13)miologiques (10/13)Avantages InconvénientsCas-témoinCohorteTransversaleType d’étudeFacile/vite/éconoVrai RR++ Exposition rareRelation temporelle++ Maladie rareVite/éconoMesure simultanée de E et MMaladie en cours / passéeE: pb mémoris / M: pb labilitéMesures Individus ≠ (séries)E: variable / M: pb des PDVDifficile/long/cherEthique (observation/intervent)OR RRM&E: biais (mémorisation …)
  13. 13. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (11/13)miologiques (11/13)Intérêt ExemplesCas-témoinCohorteTransversaleType d’étudeExploratoireEffets d’1 expositionCauses d’1 maladieEnquêtes paludométriquesPaludisme et grossesseRepositivationSuivis thérapeutiquesPaludisme grave/simple
  14. 14. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (12/13)miologiques (12/13)TransversaleCohorteExposition MaladieCas-témoinSchématisation
  15. 15. LesLes éétudestudes éépidpidéémiologiques (13/13)miologiques (13/13)ExempleOn veut étudier la drépanocytose chez les enfants dans une population X:distribution, facteurs de risques et complications qu’elle entraîne.On réalise les études suivantes:A. Détection de la drépanocytose à la naissance et examen clinique etbiologique annuel chez les enfants détectésB. Détection de la drépanocytose chaque année dans une classe deprimaire et examen médicalC. Détection de la drépanocytose chez des enfants présentant unedyspnée d’effortCohorteTransversaleCas-témoin
  16. 16. ParticularitParticularitéés de ls de l’é’étude du paludisme (1/5)tude du paludisme (1/5)Maladie à durée d’incubation « moyenne »– Courte / cancers, maladies cardio-vasculaires– Longue / TIAC, intoxicationsMaladie à transmission vectorielle (cycle)Délais : événement – maladieCaractéristiques
  17. 17. DélaiPhases (durée)IndividuIntroduction d’1vecteur infectéIntroduction d’1sujet infectéIntroduction d’1sujet infectéDélais entre exposition et maladieParticularitParticularitéés de ls de l’é’étude du paludisme (2/5)tude du paludisme (2/5)Non infectéPiqûre vecteurInfectionPiqûre infectéeCliniqueRepas sanguinPonte (2-3j)Emergence (10-21j)Repas (2j)Incubation extrinsèquePhase pré-érythrocytaireIncubation0 à 3 jours14 à 26 jours7 à 35 jours8 à 15 jours8 à 30 jours1er cas :1 sem – 1 mois1er cas :2 sem – 2 mois/ PopEffet population :1 mois – 3 moisPrécis d’entomologie médicale et vétérinaire, F. Rodhain et C. Perez, éd. Maloine
  18. 18. ParticularitParticularitéés de ls de l’é’étude du paludisme (3/5)tude du paludisme (3/5)Maladie à durée d’incubation « moyenne »– Courte / cancers, maladies cardio-vasculaires– Longue / TIAC, intoxicationsMaladie à transmission vectorielle (cycle)Délais : événement – maladieMaladie induisant une prémunitionCaractéristiques (suite)
  19. 19. 1. Séparation importante ds le temps: exposition – maladie2. Exposition qui fluctue dans le temps3. Pas de marqueur/confirmation de l’exposition individuelle4. Répétition possible des épisodes palustre chez un sujet5. Pas de marqueur du nombre d’épisodes palustres passésConséquencesParticularitParticularitéés de ls de l’é’étude du paludisme (4/5)tude du paludisme (4/5)
  20. 20. Effet limitant sur les étudesM pas marqueur nbreM plusieurs épisodesE pas marqueur indivE variableTransversale CohorteSéparation E-MCas-témoinFacteursParticularitParticularitéés de ls de l’é’étude du paludisme (5/5)tude du paludisme (5/5)+++ +/- +++++ - +/-- +++ +++/- - +++++ - -
  21. 21. Exemples comparés de suivi de cohorte: Dielmo & Ndiop et Gouye KoulyObjectifsPrincipe généralEquipes pluridisciplinairesPartie II
  22. 22. Exemples comparés de suivi de cohorte: Dielmo & Ndiop et Gouye KoulyMise en placeSituation géographiqueProtocolePersonnelBase de données - extractionPartie II
  23. 23. Exemples comparés de suivi de cohorte: Dielmo & Ndiop et Gouye KoulyRésultats: données du suivi de baseRésultats: définition de l’accès palustrePrincipaux autres résultats obtenusDiscussion: avantages, contraintes,limitesPartie II
  24. 24. Objectifs des suivis de cohorte (1/2)Objectifs des suivis de cohorte (1/2)Etudier, en zone d’endémie palustre, les interactionsentomologiques, parasitologiques, immunologiques etcliniques (histoire naturelle du paludisme), afin de mieuxcomprendre les mécanismes de l’acquisition de la prémunitionanti-palustre et de mettre au point un vaccin antipaludique.Pour pouvoir comparer 2 contextes de transmission différents,le suivi de Ndiop a été entrepris dans un 2ème temps.Cohorte de Dielmo & Ndiop
  25. 25. Objectifs des suivis de cohorte (2/2)Objectifs des suivis de cohorte (2/2)Etudier, en zone de transmission saisonnière du paludisme, lerôle de la salive de moustique (réaction immunitaire à la piqûrenon infectée) et de l’allergie dans le démarrage de latransmission (production de gamétocytes) et la morbiditépalustre.Cohorte de Gouye Kouly
  26. 26. Principe gPrincipe géénnééral des suivis de cohorteral des suivis de cohorteDielmo, Ndiop, Gouye KoulySur la base d’un suivi longitudinal, prospectif et quasi exhaustifRechercher et contrôler un grand nombre de variables« explicatives »Intervenant à toutes les étapes du cycle parasitaireÉtudiées chez les mêmes sujetsMultidisciplinarité – Suivi intensif – Ajustement des analysesCaractéristiques principales sont :
  27. 27. Equipe pluridisciplinairesEquipe pluridisciplinairesClinCliniqueMorbidité / mortalitéImmunOImmunoInfection palustreParasitoParasitoPiqûre infectéeEntomoEntomoPiqûre de vecteur***EpidémiologieImmunoEpidémiologiePopulation non infectéeGOUYE KOULYDIELMO & NDIOP
  28. 28. Mise en place des suivis de cohorte (1/5)Mise en place des suivis de cohorte (1/5)DielmoNdiopMis en place en 1990 (IPD, IRD, IPP)Enquêtes paludométriques dans nombreux villagesDielmo: indices paludométriques « ANORMALEMENT » élevésChoisi car cycle présent toute l’annéePossibilité d’hébergement à proximité du villageMis en place en 1993Proximité de DielmoIndices paludométriques « moyens » pour la zoneTransmission saisonnière
  29. 29. Mis en place en 2004 - 2006Transmission strictement saisonnière démarrage de la transmissionContexte ruralProximité de Dakar (distance + axe routier) études immunologiquesPrésence d’une case de santé prise en charge des maladesCollaboration du personnel du centre médical de référenceEloignement relatif d’un poste de santé/centre de santé/hôpitalPopulation autour de 500 habitants budget de prise en chargeParticipation volontaire de la populationGouye Kouly : recherche du site (3 mois)Mise en place des suivis de cohorte (2/5)Mise en place des suivis de cohorte (2/5)
  30. 30. Gouye Kouly : Rayon de 30 km / ThièsMise en place des suivis de cohorte (3/5)Mise en place des suivis de cohorte (3/5)
  31. 31. Gouye Kouly : Cartographie centres santéMise en place des suivis de cohorte (4/5)Mise en place des suivis de cohorte (4/5)
  32. 32. Gouye Kouly : caractéristiques villagesBokrKabaGouye KoulyMise en place des suivis de cohorte (5/5)Mise en place des suivis de cohorte (5/5)
  33. 33. 15°14°13°16° NDAKAR17° W 16° 15° 14° 13° 12°DielmoNdiopGouye KoulyZone sahélienneZone sahélo-soudanienneZone soudano-guinéenneMauritanieMaliGuinéeGambieSituation gSituation gééographiqueographique des sitesdes sites
  34. 34. Protocoles de suivi des cohortes (1/5)Protocoles de suivi des cohortes (1/5)1 dispensaire (24/24h ; 7/7j) : passif1-3 visites/j dans concession (absence, santé) : actifCaptures entomologiques hebdomadairesSuivi moustiquaire mensuel (covariable)1 GE sys + 1 prélèv. capillaire mensuels (parasito / immuno)1 prélèvement veineux annuel (immunologie)Recueil des urines (contrôle des médicaments)1) Suivi systématiqueDielmo & Ndiop
  35. 35. 1 fiche de consultation1 goutte épaisse pour diagnostic (+ 2 GE référence)1 traitement sous contrôle médical1 prélèvement capillaire (parasito)1 suivi de la température pendant 7 jours1 suivi de la parasitémie (+/-J2, J4, J7)2) En cas de fièvre (≥ 38°C)Dielmo & NdiopProtocoles de suivi des cohortes (2/5)Protocoles de suivi des cohortes (2/5)
  36. 36. 1 case de santé (dans le village) : passif1-3 visites/j dans concession (absence, santé) : actifCaptures entomologiques mensuelles toute l’annéeCaptures entomologiques hebdomadaires pendant 8 sem1 GE/sem pendant 8 sem début de transmission (para/ento)1 GE 2 fois/an en transversal (parasito / entomo)2 prélèvement veineux annuels (sous-cohorte immuno)1) Suivi systématiqueGouye KoulyProtocoles de suivi des cohortes (3/5)Protocoles de suivi des cohortes (3/5)
  37. 37. Remplissage du registre de la case de santé1 fiche d’épisode pathologique1 goutte épaisse pour diagnostic (+ 1 GE référence)Si GE négative suivi fièvre (GE pendant 2j)TTT à la case de santé / référence Kaba2) En cas de fièvre (≥ 38°C)Gouye KoulyProtocoles de suivi des cohortes (4/5)Protocoles de suivi des cohortes (4/5)
  38. 38. Gouye Kouly1 traitement (recom. nationales) sous contrôle médicalSuivi de tolérance : vomissement, prurit (3j)1 sous-cohorte: suivi efficacité thérapeutique (OMS modif)1 prélèvement veineux (tests vitro, souches)GE + clinique: J1,J2,J3,J7,J14,J28,J42 + si symptTTT 2ème ligne si échec3) En cas d’accès palustre confirméProtocoles de suivi des cohortes (5/5)Protocoles de suivi des cohortes (5/5)
  39. 39. Personnel assurant le suivi (1/2)Personnel assurant le suivi (1/2)Dielmo & Ndiop4 médecins2 infirmiers7 enquêteurs1 technicien supérieurcaptureurs de moustiques+ 2 techniciens 1 sem./moisGouye Kouly1 ASC (villageoise)2 infirmières3 enquêtrices1 technicien lecteur de lamescaptureurs de moustiquesSur le terrain
  40. 40. Personnel assurant le suivi (2/2)Personnel assurant le suivi (2/2)Dielmo & Ndiop1 technicien entomologiste2 techniciens lecteurs delames1 agent technique (dépouil)1 opérateur de saisie1 technicien supérieur (base)chercheursA Dakar1 technicien lecteurs delames1 infirmière (dépouil + saisie)chercheursGouye Kouly
  41. 41. Base de donnBase de donnéées, extraction donnes, extraction donnééeses############################################################Accès terrain########################################################################Prélèvements################NFSUrines############Suivi####################################Grossesse####################Habitat####################################################################################Moustiquaire################Séjours Ant############################################################Traitements####Mensurations################################################################Episodes Pathol########################Absences####TransmissionGE########Villageois
  42. 42. Base de donnBase de donnéées, extraction donnes, extraction donnééesesProcédure Ronald suivi AP pour lire le fichier épisode patho 97 avril 2001/01Vrem:="Ronald97D"Vrem:="exporte les donnees pour certains sujets"Vrem:="cree le 22/02/02"Vrem:="P1=01/01/96 au 31/03/96"Vrem:="si AP à J1 J16 = 2AP"REGLER SERIE(12;"")$TITRE:=""$TITRE:="Code"$TITRE:=$TITRE+Caractere(9)+" Age010196"$TITRE:=$TITRE+Caractere(9)+"Sexe"$TITRE:=$TITRE+Caractere(9)+"Gpe ABO"$TITRE:=$TITRE+Caractere(9)+" Type HB"$TITRE:=$TITRE+Caractere(9)+"G6PD"$TITRE:=$TITRE+Caractere(9)+"Suivi réel P1"$TITRE:=$TITRE+Caractere(9)+"NB AP P1"$TITRE:=$TITRE+Caractere(13)ENVOYER PAQUET($TITRE)Vrem:="Sélection des villageois "TOUT SELECTIONNER([Villageois])TRIER([Villageois];[Villageois]Code;>)Tant que (Non(Fin de selection([Villageois])))MESSAGE("Villageois code: "+[Villageois]Code)VCODE:=[Villageois]CodeVDDN:=[Villageois]Dte NaisVrem:="Calcul de lâge à linclusion"VAGE010196:=Chaine(Arrondi((!01/01/96!-[Villageois]Dte Nais)/365,25;1))$TXT:=""$TXT:="c"+[Villageois]Code$TXT:=$TXT+Caractere(9)+VAGE010196$TXT:=$TXT+Caractere(9)+([Villageois]Sexe)$TXT:=$TXT+Caractere(9)+[Villageois]Gpe ABO$TXT:=$TXT+Caractere(9)+[Villageois]Tpe Hb$TXT:=$TXT+Caractere(9)+Chaine(Arrondi([Villageois]G6PD;2))Vrem:="Période du 11/08/97 inclus au 31/12/97 exclus P1"Vrem:="Suivi ind du 11/08/97 au 31/12/97 exclus"VSuiviRP1:=0VDDChoisi:=!11/08/97!VDFChoisi:=!31/12/97!PrNbjSuivi IndVSuiviRP1:=CSRELVrem:="Acces terrain du 11/08/97 au 31/12/97 exclus P1"VNBAPP1:=0TOUT SELECTIONNER([Episodes Patho])CHERCHER([Episodes Patho];[Episodes Patho]Code=VCODE;*)CHERCHER([Episodes Patho]; & [Episodes Patho]Dte exam init>=!11/08/97!;*)CHERCHER([Episodes Patho]; & [Episodes Patho]Dte exam init<!31/12/97!;*)CHERCHER([Episodes Patho]; & [Episodes Patho]Accès Pf30=1;*)
  43. 43. 10 - 60100 - 300Nb de piqûres infectées/anSaisonnalitéPérenneTransmission~ 450~ 350PopulationNdiopDielmoRRéésultats: donnsultats: donnéées du suivi de base (1/4)es du suivi de base (1/4)
  44. 44. Ndiop050100150200mai-94 mai-95 mai-96 mai-97 mai-98Dielmo020406080mai-94 mai-95 mai-96 mai-97 mai-98AccèsPalustresmensuelsRRéésultats: donnsultats: donnéées du suivi de base (2/4)es du suivi de base (2/4)
  45. 45. 1 – 1,75Nb de piqûres infectéesSaisonnièreTransmission~ 500PopulationrésultatsGouye KoulyRRéésultats: donnsultats: donnéées du suivi de base (3/4)es du suivi de base (3/4)Nb consultations 2955Nb 1ère GE diagnostic 1673Nb GE complémentaires 553Nb GE positives 210Nb cas de paludisme 179Nb de suivis thérapeutiques 73Nb décès palustres 0Nb décès autres causes 7
  46. 46. RRéésultats: donnsultats: donnéées du suivi de base (4/4)es du suivi de base (4/4)Incidence des épisodes cliniques à Gouye Kouly08/2004-08/20060501001502002508 9 10 11 12 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3 4 5 6 7 82004 2005 2006mois et annéesnombredépisodesNon febrile attackFebrile attackMalaria attack1552 épisodes cliniques → 56.8% (882) épisodes fébriles177 cas non compliqués de paludisme à P. falciparum
  47. 47. Seuil parasitologique pyrogénique00,511,522,531 11 21 31 41 51 61 71 81 91 101Age en anneesTropho/leuco00,10,20,30,40,5%GRparasitésDielmoNdiopRRéésultats: dsultats: dééfinition de lfinition de l’’accaccèès palustres palustre
  48. 48. Principaux autres rPrincipaux autres réésultats obtenussultats obtenus (1/6)(1/6)-Nombre d’accès palustre au cours de la vie :Dielmo: 44, Ndiop: 53 (x10 Nb de piqûres infectées)-rôle protecteur de l’hémoglobine AS-susceptibilité accrue pendant la grossesse et le post-partum-précision des phénotypes de prémunition (classes d’âge oùest acquis le contrôle de l’infection et de la morbidité)- morbidité (Dielmo:7 ans, Ndiop:15 ans)- infection (Dielmo:15 ans, Ndiop:30 ans)En épidémiologie
  49. 49. Multiplication du risque daccès palustrependant et après la grossesse à Dielmo012345678910An -1 1er trim. 2ème trim 3ème trim. 1-60j 61-90j 91-365jRRGrossesseRéf.* **PrincipauxPrincipaux autres rautres réésultats obtenus (2/6)sultats obtenus (2/6)
  50. 50. Principaux autres rPrincipaux autres réésultats obtenus (3/6)sultats obtenus (3/6)
  51. 51. Pas Vomissement (Vom)125 p71%Vom50 p29%Pas Vom41%Avant TTT (<30%)Pendant TTT (46%)Vom ≥ 130%Pas Vom13%Vom ≥116%Malgré un TTT anti-émétique (37%), ≈ 50% personnes vomissent pdt le TTTEn thérapeutique (Gouye Kouly)TTT = AQ+SP : 1 échec clinique lors de la 1ère année d’utilisation systématiquePrincipaux autres rPrincipaux autres réésultats obtenus (4/6)sultats obtenus (4/6)
  52. 52. ● Souches (Dielmo):● Chez un même individu les accès sont déclenchés par des souchesgénétiquement ≠ au cours du temps● Les populations parasitaires détectées pendant lors des formesasymptomatiques sont ≠ de celles des accès● Souches (Dielmo/Ndiop):Dielmo: Plusieurs souches de génotype ≠ infectent souvent 1 mêmepersonne, cette complexité ↓↓ avec l’âge (≠ Ndiop)En parasitologiePrincipaux autres rPrincipaux autres réésultats obtenus (5/6)sultats obtenus (5/6)
  53. 53. ● Validation de candidats-vaccin: MSP1p19, MSP4, MSP5● Test fonctionnels d’activité des Ac pour essais vaccinauxInhibition de croissance parasitairePhagocytose des mérozoïtes (chimiluminescence)● Protocoles de repositivationEn immunologie/vaccinologiePrincipaux autres rPrincipaux autres réésultats obtenus (6/6)sultats obtenus (6/6)
  54. 54. Discussion: avantagesDiscussion: avantages ☺☺, contraintes, contraintes& limites& limites des suivis de cohorte (1/4)des suivis de cohorte (1/4)Représentativité:☺ Pas obligatoire, il suffit que le cycle parasitaire soit complet☺ Comparaison de contextes très ≠ mécanismes ≠ ?Nécessite des études complémentaires hors cohorteMultidisciplinarité☺ Complémentarité (covariables, phénotypes, mécanismes)Inter-dépendenceMesure sur les mêmes sujets☺ Ajustement +++ ⇒ facteurs de confusion ↓↓↓↓☺ Sujet = son propre témoin (grossesse)
  55. 55. Intensité du suivi☺ Précision des données☺ Puissance des études / Sensibilité de la détection☺ Etude de générations fictivesPetits effectifsVariable la - préciseLourdeur du protocole / équipe de terrain …CoûtAcceptabilitéAvantages, contraintes & limites (2/4)Avantages, contraintes & limites (2/4)
  56. 56. Longueur du suivi☺ Masses de données☺ Comparaison dans le temps☺ Sujet = son propre témoinBases de données difficiles à gérerExtraction des données complexe / longueAnalyses complexesMaintien de la qualité nécessaireAvantages, contraintes & limites (3/4)Avantages, contraintes & limites (3/4)
  57. 57. Sous-protocoles☺ Données complémentaires, précision☺ Faible surcoût, faible surcharge☺ Elargissement à d’autres maladiesCompatibilité avec le protocole / interférencesAcceptabilitéAvantages, contraintes & limites (4/4)Avantages, contraintes & limites (4/4)
  58. 58. Equipes impliquEquipes impliquééesesDielmo & NdiopIPD: C. Rogier, A. Spiegel, A. Tall, F. Diene-Sarr,A.B. Ly, L. Marrama, P. Nabeth, J. Faye, D.Gaoussou, A. Badiane …IRD: C. Roussilhon, J.L. Sarthou, A. Touré-Baldé,O. Garraud, R. Perraut, G. Aribot, A. Dieye, R.Jambou … J.F. Trape, N. Diagne, C. Sokhna,D. Fontenille, I. Dia, L. Lochouarn, V. Robert…UCAD: L. Konaté …IPP: O. Mercereau-Puijalon, C. Behr, H.Contamin, P. Dubois, F. Ntoumi, J. Salvi-Zwetyenga, D. Schleiermacher, P. Druilhe, P.Daubersie, C. Oeuvray, L. Pereira da Silva, C.Julier …Gouye KoulyIPD: L. Marrama, F. Diene-Sarr, M. Tine,S. Senghor, R. Paul, I. Dia, M. Diallo,R. Jambou, D. AldebertMinist Santé: I. Talla, S. Ndour, K. SarrSLAP: M. Dieng SarrIPP: S. Mecheri, A. Six, S. Pied, A.Sakuntabhay …
  59. 59. Equipes impliquEquipes impliquééeses

×