Avec les interventions d’Elise VANBERGUE, Carole TOCZE et Agathe CHEYPE – idele

1. Quoi de neuf en santé et bien-
être des jeunes bovins
d’engraissement ?
Carole Toczé, Béatrice Mounaix, Aurore Wache-Duvauchelle, Elise
Vanbergue
SPACE 2023
1

2. Troubles respiratoires et
Nouvelles Technologies
2

3. Projet DECIDE
• Un projet européen multi-partenarial :
• 19 partenaires
• 11 pays (Pays Bas, Danemark, Belgique, Royaume-Uni, Suisse, Suède, France, Norvège, Espagne, Italie, Pologne)
• De multiples structures représentées (laboratoires d’analyses, écoles, instituts de recherche,
structures privées…)
• Création d’outils d’aides à la décision pour éleveurs
et vétérinaires pour la gestion de maladies via
modèles épidémiologiques et mécanistes
• diarrhées néonatales veaux
• épidémie respiratoire taurillons  la France a choisi
cette thématique
Date
Titre de la présentation
https://decideproject.eu/

4. Attentes des éleveurs français
sur la valorisation des
données et les nouvelles
technologies
4
Résultats de focus groups auprès d’engraisseurs de JB
Merci aux coopératives et
éleveurs impliqués

5. 5
Titre de la présentation
Date
Développer la prévention médicale et
zootechnique :
- Optimiser la surveillance
- Détecter précocement
- Vacciner chez le naisseur
- Favoriser le transport direct des ateliers
naisseurs aux ateliers engraisseurs
Améliorer les
performances techniques
et économiques :
- Diminuer la mortalité
Améliorer le bien-être de l’éleveur ET de l’animal
 Limiter le stress, gain de temps
Limiter le recours aux
antibiotiques
Nourrir le maximum
de gens grâce à la
production de viande
3 focus-group,
20 éleveurs,
2 principaux bassins de
production
Objectifs des engraisseurs français

6. 6
Titre de la présentation
Date
Enregistrement des traitements et
soins
Carnet sanitaire papier,
logiciel
Température
Thermomètre, demande
d’outil
Données troupeau
Mouvement d’animaux, prix des animaux
Logiciel, application de la coopérative
Connection naisseurs-engraisseurs
Données individuelles
- Boucle électronique, demande d’outil
• OUI avec personnes de confiance (autres
éleveurs, conseillers, groupements…)
• OUI pour se comparer et partager les
pratiques pour s’améliorer
• OUI si anonymisation
Données et technologies utilisées
Données sanitaires Données techniques
Données d’identification
Et le partage des données ?
Gain Moyen Quotidien
Pesée électronique, logiciel
Alimentation
Mélangeuse peseuse
Abreuvement
Compteur d’eau, pompe doseuse
Données d’ambiance
Capteurs température, hygrométrie

7. D’un outil « simple » à un outil
« intégratif en temps réel »
Outil d’Aide à la Décision incluant :
• Intégration des données animal/
environnement/alimentation en
temps réel
• Appli téléphone
• Aide au choix d’interventions
sanitaires
• Outil de prise et de suivi
de température
• Outil retraçant historique
sanitaire et filiation de
l’animal
Date
Titre de la présentation

8. 8
Titre de la présentation
Date
L’outil de demain : quels objectifs d’utilisation ?
- Détection précoce de maladies
- Aide au choix de soins
- Collecte et analyse les données, ou le facilite
- Adapté au contexte de l’engraissement
- Alertes sanitaires, techniques et économiques, en temps réel
- Proposé avec une formation pour la prise en main

9. Et au niveau européen,
quelles attentes des
éleveurs ?
Des études en bovins dans 6 pays européens
(Belgique, Irlande, Pays Bas, Norvège, Suède, Royaume-Uni)
9

10. Besoins et attentes des éleveurs
Les outils proposés devront selon les éleveurs européens :
• Tenir compte des problématiques travail : pallier au manque de main
d’œuvre, faire gagner du temps, faciliter la communication, la coordination des
salariés
• Intégrer les données environnementales : ambiance bâtiment…
• Être attractifs : support, ergonomie, facilité, informations pertinentes
Date
Titre de la présentation
Autonomie
Sécurité
Du « sens »
Compétences
Mise en
réseaux
Simplification
/Confort
Besoins des éleveurs européens

11. 11
Conclusion
L’outil Santé de demain sera pertinent, simple, rapide et fiable et répondra
aux besoins des éleveurs.
Importance de l’œil de l’éleveur, de l’expérience
« l’intuition, la vigilance de l’éleveur, l’expérience et l’observation, nous l’avons mais ça prend du temps. »
Mais besoin/utilisation de la technologie pour
• De la détection précoce et du préventif « rester le maitre dans son élevage»
• Réduire le stress « anticiper pour partir l’esprit libre »
• Réduire l’impact économique
• Gagner du temps « le temps que tu ne passes pas à observer tout le temps, tu peux le consacrer à autre chose »
Volonté de concilier bien-être de l’éleveur, de l’animal et la santé humaine
Titre de la présentation
Date
Compétence
Simplicité
Sécurité
But - Sens
Autonomie
En résumé

12. 12
60 vétérinaires interrogés
Les nouvelles technologies doivent contribuer à :
• Améliorer l’impact des vétérinaires auprès des éleveurs : but
partagé éleveur-vétérinaire, meilleure communication, volonté d’influencer
l’usage des technologies
• Développer les compétences vétérinaires : données davantage
accessibles, agir sur les facteurs de risque identifiés (ambiance bâtiment…)
• Sécuriser la position du vétérinaire dans l’élevage : évolution du
métier, valeur ajoutée de leur conseil
Titre de la présentation
Date
Attentes des vétérinaires européens

13. SEPTIME : un outil d’aide à la
décision pour gérer la santé
des taurillons
Sébastien PICAULT, Sébastien ASSIÉ, Maud ROUAULT (INRAE, ONIRIS)
Carole TOCZÉ (Idele)
Financement : Partenariat :

14. Objectifs
Modèles prédictifs des
broncho-pneumonies
des bovins
Données issues de
capteurs utilisables en
élevage
Créer des alertes
Optimiser la prise en charge des
animaux malades
Observations cliniques
⇒Expérimentations chez 10 éleveurs
volontaires
⇒ Avis d’éleveurs et de vétérinaires de
diverses structures
• Concevoir et tester un outil innovant d’aide à la décision sur la
gestion des broncho-pneumonies en atelier d’engraissement

15. Expérimentations en cours
• Suivi d’élevages :
• Examens cliniques rapprochés et à distance
• Sérologie, PCR, lactates, cytokines, échographie pulmonaire
• Caméra Copeeks et microphone (température, hygrométrie, activité, toux…)
• Colliers SenseHub (activité, ingestion, rumination)
• 500 JB suivis, dont 170 à suivi approfondi et 60 malades
• Traitements des données en cours
Enquêtes qualitatives et focus group
Prochains résultats disponibles
pour le SPACE 2024

16. Merci de votre attention
Retrouvez les diaporamas de nos conférences sur
idele.fr
Venez échanger avec nos ingénieurs sur notre
stand A39 (Hall 4)
SPACE 2023
16

17. BeBoP : la vidéo pour analyser
le comportement des taurillons
Béatrice MOUNAIX, Claire MINDUS, Anne AUPIAIS et Agathe CHEYPE – Idele
Vincent GAUTHIER et Jérôme MANCEAU – NEOTEC VISION
Quentin DELAHAYE et Xavier BOIVIN – INRAE
Laure-Anne MERLE (Ferme des Établières) – Claire DUGUÉ (France Limousin Sélection)
SPACE 2023
17
17
17
Partenariat :
Financement :

18. Que regardez-vous pour savoir si vos
animaux (ou des animaux) vont bien ?
SPACE 2023
18

19. Le comportement : comprendre l’animal
• Des comportements et des rythmes d’activité liés à l’espèce
…mais parfois impactés par le système d’élevage
SPACE 2023
19
60 à 70 %
du temps est passé en position couchée,
28 %
du temps est passé à ruminer.
10 à 15 %
de la journée à s’alimenter.
40 à 60 %
du temps est passé en position couchée,
20 à 40 %
du temps est passé à ruminer.
25 à 45 %
de la journée à s’alimenter.
Plus de 8h par jour temps passé à manger Moins de 3h par jour temps passé à manger

20. Le comportement : faire parler l’animal
• Un indicateur efficace : le comportement de l’animal traduit son
ressenti, ses émotions, mais aussi son adaptation ou pas aux
conditions d’élevage.
SPACE 2023
20

21. Le comportement : faire parler l’animal
• Un indicateur d’alerte : le premier signe visible d’un problème de
santé.
SPACE 2023
21

22. Le comportement : faire parler l’animal
• Un indicateur sensible : le comportement change dès que les
conditions d’élevage changent ; cela permet à l’animal de
s’adapter.
• Mais un indicateur difficile à observer et à mesurer !
SPACE 2023
22

23. Des comportements
spécifiques et liés au
système d’élevage
Des comportements
individuels et collectifs
Comment mesurer le comportement
des taurillons ?

24. L’analyse vidéo automatisée du comportement
SPACE 2023
24
Enregistrement de
vidéos
Annotation
des vidéos
Développement d’une
intelligence artificielle
Un processus long et méticuleux où toutes les étapes sont utiles et importantes
Calcul de la sensibilité et
de la précision
Une solution d’avenir mais qui nécessite une expertise éthologique, de la mise au point
technique, des validations scientifiques, et du développement informatique spécifique

25. L’analyse vidéo automatisée du comportement
SPACE 2023
25
• Plusieurs compétences
• Sites de collecte de vidéos
• Observations terrain et annotations
• Analyse d’image : algorithmes de
Deep Learning

26. SPACE 2023
26
4 cases avec 6 Limousins
Engraissement entre 8 -15 mois
4 cameras
8 cases avec 13 Charolais
Engraissement entre 8 - 18 mois
8 cameras
Enregistrement continu pendant toute une période d'engraissement
Extraction des vidéos tous les trois jours
L’analyse vidéo automatisée du comportement

27. SPACE 2023
27
Entrainement :
- 790 images : 4236 debout, 3232 couché, 968 ingère, 354 boit
L’analyse vidéo automatisée du comportement :
Activités statiques

28. SPACE 2023
28
Résultats :
Ajout
manuel de
comporte
ments
L’analyse vidéo automatisée du comportement :
Activités dynamiques

29. SPACE 2023
29
Boit
1) Localisation
2) Postures
3) Activités Mange
Se lève
Se couche
Se déplace
L’analyse vidéo automatisée du comportement
Couché Debout

30. SPACE 2023
30
L’analyse vidéo automatisée du comportement
Un algorithme de Deep Learning est composé de 2 phases :
- Une phase d’apprentissage : phase de développement de l’algorithme qui se
base sur des images/séquences annotées
- Une phase de validation : validation de l’algorithme qui se base sur des
images/séquences qui ne sont pas présentes dans la base d’apprentissage
Base d’apprentissage : 790 images
Base de validation : 175 images Algorithme Performance

31. SPACE 2023
31
L’analyse vidéo automatisée du comportement
Nb de JB en position couché dans la case
Algorithme

32. SPACE 2023
32
Luminosité
L’analyse vidéo automatisée du comportement

33. SPACE 2023
Bovins très proches les uns des autres
L’analyse vidéo automatisée du comportement

34. SPACE 2023
- Utilisation de plusieurs caméras par case :
L’analyse vidéo automatisée du comportement
Améliorations

35. SPACE 2023
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- Compléter les bases
d’apprentissage
- 1628 séquences d’images
annotées aujourd’hui
L’analyse vidéo automatisée du comportement
Amélioration

36. SPACE 2023
- Test des algorithmes sur des nouveaux comportements
(Lutte, frottement environnement, léchage, jeu de
langue…)
L’analyse vidéo automatisée du comportement
Perspectives

37. L’analyse vidéo automatisée du
comportement : une solution prometteuse
• S’assurer du bien-être des animaux : rythmes d’activité, expression des
comportements de l’espèce, bonne adaptation au système d’élevage
• Surveiller et repérer rapidement des situations à problème : des animaux
qui s’adaptent mal, etc….
• Pour les taurillons : un outil d’intérêt et prometteur, pour aider l’éleveur à
observer le comportement de ses animaux dans des systèmes collectifs.
• La recette de base : des compétences, de la méthode et du temps
• Éthologistes : les spécialistes du comportement animal
• Informaticiens : les spécialistes du traitement de l’image
• De la méthode : apprendre mais aussi (surtout) tester
dans un grand nombre de situations différentes
• Du temps !
SPACE 2023
37

38. Merci de votre attention
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SPACE 2023
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39. SPACE 2023
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40. SPACE 2023
40
Posture/Activité Précision Sensibilité
Détection 0.99 0.72
Debout 0.97 0.78
Couché 0.99 0.46
Se lever 0.62 0.72
Se coucher 0.64 0.70
Ingère 0.94 0.93
Boit 0.63 0.77
Marche 0.59 0.72
Précision
VP / (VP+FP)
Sensibilité
VP / (VP + FN)
Précision moyenne : 0.77
Sensibilité moyenne: 0.73
L’analyse vidéo automatisée du comportement

41. Carole Toczé – Gilles Blériot
SACOMTE 2
Mise en place d'un observatoire pérenne et fiable des médicaments en
atelier d’engraissement de jeunes bovins
Antibiotiques, vaccins, antiparasitaires

42. Objectifs
• Mettre en place un
observatoire des médicaments
en engraissement de JB
• Carnet sanitaire informatisé
• Naisseurs-engraisseurs et engraisseurs spécialisés
(repousse exclus)
• Disposer de références sur
l’usage des médicaments
Date
Titre de la présentation
43

43. Intérêts pour les conseillers et les éleveurs
Pour les conseillers
• Répondre aux attentes de la filière
allaitante
• Ex : baisse des intrants médicamenteux
• Promouvoir des bonnes pratiques
auprès des éleveurs
Ex : prévention vaccinale
• Bénéficier de références en termes
d’utilisation des traitements
• Promouvoir l’enregistrement
informatique des données
• sans travail supplémentaire pour les
conseillers
•
44
Pour les éleveurs
• Faire connaître les bonnes
pratiques existantes en
engraissement
• Prévention notamment médicale…
• Bénéficier de références
individuelles ET collectives
• Se comparer au sein de chaque
système d’élevage
• Valoriser les données sanitaires
saisies
• sans travail supplémentaire pour les
éleveurs

44. 100 à 250 élevages à recruter
 Élevages faisant de l’engraissement depuis au moins 3 ans avec sortie d’a
minima 20 taurillons par an
ET utilisant le volet « carnet sanitaire « des logiciels participant à l’étude
 ET répartis dans l’idéal comme suit :
une pondération des résultats de l'observatoire sera
appliquée selon ce qui est finalement recruté
Titre de la présentation
45 Date
Pour rentrer dans le projet : 1 document à signer
carole.tocze@idele.fr - 06 58 50 34 91
gilles.bleriot@idele.fr

45. Merci de votre attention
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